Splice junction sequence |
AAGAGAAAGATCCATGGCTGATAATTGTATCAGACTTCTTCACTCAGCCTCTGTTTTCTTCTGT TTAGGGCTTCTAATTTCATCCTTCAACTTGTTGCAGggtattgcagcggaaaatctttccaagc agaaactgacctcactgattcttcaggttttgatcttaatccacacaattatctgtattgtttt cgtctctt
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 409 Transcript exons: 453594-453632,455242-455423,455715-455902 GGTATTGCAGCGGAAAATCTTTCCAAGCAGAAACTGACCGATGGTTACTTCAAGATCAGGAGAG GAACGAACGAATGTGGCATTGAACAGAGTGTTGTAGCTGGTTTACCTTCAGAGAAGAACGTATT TAAAGGTATTACCACTTCAGATGATCTTCTGGTTTCCTCAGTCTAAACAAGACGATGTGTCCCT ACTTCTGTAATATATCATTTGCAACTGTGAGAAAACTTTGTACCTTTTCCAAAGTCTAAGCAAA TCATTGTTTTTGATTACTGGAACTCGTTGAGGGATTGAGAAAAAAATAATCAGAAGAGAAAGAT CCATGGCTGATAATTGTATCAGACTTCTTCACTCAGCCTCTGTTTTCTTCTGTTTAGGGCTTCT AATTTCATCCTTCAACTTGTTGCAG
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Genomic sequence |
GGTATTGCAGCGGAAAATCTTTCCAAGCAGAAACTGACCTCACTGATTCTTCAGGTTTTGATCT TAATCCACACAATTATCTGTATTGTTTTCGTCTCTTTTAGATTGCCTAAACGTTGATGATCAAC TTTTGCAGAATGAGATTGTAAAGGAAGTCAATGAGAATCCAAACGCTGGTTGGAAAGCTGCTTT CAATGATCGGTTTGCAAATGCCACCGTGAGTTTATTATCACCTCCATGCTCTTATCTCTTTAAG AGCTACGTTACTTATCATTGTTCCTGAAAGTTTGTGTTTTTGTGTATGTATGTGCAGGTTGCAG AGTTTAAGCGACTCCTCGGTGTTATACAAACACCAAAGACGGCATACTTAGGTGTACCTATTGT AAGACATGATTTATCGTTGAAGCTTCCTAAAGAATTTGATGCTAGAACCGCTTGGTCACATTGC ACCAGTATTCGAAGGATCTTAGGTCGGTTTTAATCTCTTAGCTTCCACTATCTCTGTCATTAAC CCAATGATTTACTGACTCTTCTTATGTTTTGTTTCAAATTATCTCCCTCTTTATTGCACTAAAG ATCAGGTGAAACATCATTTCATTTGAGTGGGTTATATATTGAACAATGTGTTACTCTGGTCGAC GATAACTTTATGGTTTTGGTTTCTTTTGGGTCATTGTGGTTCTTGCTGGGCATTTGGTGCTGTT GAATCACTGTCCGACAGGTTCTGCATCAAATATAACTTGGTAACACAACTTTCTCCATCAAGCC AAGATTGACGATTGCTACAGCTTTTTAATGTAATTGCTCTTCTTCCCTTGCAGAATGTTTCCTT ATCTGCCAATGATGTCATAGCATGTTGTGGATTACTTTGCGGTTTTGGTTGTAATGGTGGTTTC CCAATGGGTGCATGGTTGTACTTTAAGTACCACGGTGTAGTAACCCAAGAGGTAAATTCTCAGC AAAGAACAAATAATAATGGCAATGTGGTCAAAGTGTATTGAACTTTTGTAATGCTGTTGGTTCT TCAGTGTGATCCATACTTTGACAATACTGGTTGCTCTCACCCGGGATGTGAACCCACTTACCCT ACACCAAAATGTGAGAGGAAATGTGTAAGCAGAAACCAGCTATGGGGTGAATCAAAACACTATG GTGTCGGCGCATACAGAATCAATCCTGACCCTCAAGACATTATGGCTGAGGTTTACAAGAATGG ACCTGTCGAGGTTGCTTTTACCGTTTACGAGGTAATGAAAAAGATTTTTGATTGATCAAACCAT ATTGATTATATCTTGGTGAAGTCCACATTTTCATGTATCTTTTTGTTCTTCAGGACTTTGCACA TTACAAATCAGGAGTATACAAGTACATAACGGGTACTAAGATTGGAGGTCATGCAGTTAAGCTC ATTGGCTGGGGAACTTCTGATGACGGCGAAGATTATTGGGTATGAATTCTCTGGATTTTGATTC AGATCAAGCTGAAAAAGTAATAACATTTTCTTGTTCGTTGTTGCAGTTGCTTGCAAATCAATGG AACCGAAGCTGGGGTGATGTAAGTTCTTCTTTTCTCCAATCAAAACTTTTAAATTAGACCTTCC AAGTAAACAAAAGCACAGAACCTGAGATAGAAAATGTGAAAATCTCAGGATGGTTACTTCAAGA TCAGGAGAGGAACGAACGAATGTGGCATTGAACAGAGTGTTGTAGCTGGTTTACCTTCAGAGAA GAACGTATTTAAAGGTATTACCACTTCAGATGATCTTCTGGTTTCCTCAGTCTAAACAAGACGA TGTGTCCCTACTTCTGTAATATATCATTTGCAACTGTGTTGTAAGTTTAATATACCATTGAAAG AATCACCTTCAATCAAAACAAAAGTATGTATAGCTTCTGTTAATATTCAATTTTACATGTTACC ATGCAAGAGGACTGTTACAGTGTTTATTTGGTTTTGGTAAATTATAGCCACCTAAAAGTAACGC CTTAATTAATCATTTTAAATTATGATTAACAATCAAGTAAGTGGAACAAATCAACGGTCAGGAT CTTATCCTCGCAGTAATATGATCTGTCATTCTCTAACTAAAAAGATAAGCCTCTCTCTGTCTCT TCCTAGAAAAGAAAACTTTGTACCTTTTCCAAAGTCTAAGCAAATCATTGTTTTTGATTACTGG AACTCGTTGAGGGATTGAGAAAAAAATAATCAGAAGAGAAAGATCCATGGCTGATAATTGTATC AGACTTCTTCACTCAGCCTCTGTTTTCTTCTGTTTAGGGCTTCTAATTTCATCCTTCAACTTGT TGCAG |