Splice junction sequence |
AGGAGGTGAGCTGCATTGTACAAACTTAATAATGCCCTTGGTTCATCAGCTATTGTATTGATGA ACCTCCCATCCTCTCCTTTGAATTTTTCGAATACATctcttttttcatgcaggtcacccggtat ttgtcactggcctctacttgagcttcagtctccctgaagtaattcagcagtgcacggtagaact ttttcatg
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 734 Transcript exons: 16061603-16061738,16064346-16064564,16065833-16066211 CTCTTTTTTCATGCAGGTCACCCGGTATTTGTCACTGGCCTCTACTTGAGCTTCAGTCTCCCTG AAGTAATTCAGCAGTGCACGGTAGAACTTTTTCATGTACTCTGGTAGTAATGAGATAGCACTTT CATCCCATCTTTGTATGGCTTCATTCAGCTTCCTGCATTCCTCGATGGTGGCATGATCATCATA TGTGTCATCCATAAGGACAATGAATACAATTATCTTGGCAAGGATCATCCGTGTGAGTGTTAAG TTTTCTTCATAGAACAGCGCATAGGACCAAAGATATGACTCCACTGCACGATCTCTAACATGAC TTAGCTCGACATATCCATAAAGATCTTTCCACCACTGAGAAAAAGCTTTGAGCTCCTTCAAGTG GACATGCTGCAGAAGGTTAAATTCCAGCTTTGCAAGATCTAAAAGAACAACAATACATTCTTCC TCCTGTCCGTACTCCAGCATGTAATGCAACATTTCAACTCTCTTGTAGGTTCTCGGTAATGGTA AGTGTAGGGCACGGTTGATTTGATTATCTAGAGGGGCCTTGAGCCTACTTCCGTCCCTCATTGA TTCGAGGTGGTGCCTTGCAAAAGACATAGCTTCTTCAAGTTCTGGCTCATCATGGACAAGGAGG TGAGCTGCATTGTACAAACTTAATAATGCCCTTGGTTCATCAGCTATTGTATTGATGAACCTCC CATCCTCTCCTTTGAATTTTTCGAATACAT
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Genomic sequence |
CTCTTTTTTCATGCAGGTCACCCGGTATTTGTCACTGGCCTCTACTTGAGCTTCAGTCTCCCTG AAGTAATTCAGCAGTGCACGGTAGAACTTTTTCATGTACTCTGGTAGTAATGAGATAGCACTTT CATCCCATCTGTCCAATAGGCCAATTGGGAATTTTTATGAAATTACTTAATTAGGCAAGTGTAA ATAAATCTAGCCGAAAAAGATAGTTTGACAGGGATGTATCGCGTTGAAACCACAAATAAATGAA TGAAATACTTTGTAAATTATGCTCAAATGGACACGCCATGTACCAGTGACGAATAAAGTGGTTT GATGATGTTTAATATTTCTCGAATGAAAGACTTGTTAACATTGTGTGAAACGCGTGACCATAAT TAATTGAGATGTATAGTGATCGATAAATTCGATGGTAACTGTACAACAAATTTATTTAGTTAGA GGATCAACATGGTTTTTCAGTTGTGCTTTACTCAGATTAATTGTTTAGGTGCATTAAACATCAA AAGGTAAAATAAACAATTTCTTTTTTATTTGCTCTAAGTAGCTCGGGTTCATGGAAATTGTTGG TTCATATCATGCTGGCAGCAACAGCTCGGTAACAAGAATACTGATGCCAGCTACCTTTGGTAGT TGTAGCTAGCTCTACCTCCAGTTGCACATCTCTGTTTTAATTAACTAAAAGTTGGCCTTAGCTG TTTCTTGATAGAATGACAGTAGAATATATGTGTATGCATGAGCGGTACTCTGCTTGGTCATTGC ATAGTAGTTGGAAAAACTCGCATGTTTTGCTGCTCTAGAATTAGAGGTGGAATGTTGAATGCTC GGAAAACTACTTTTATAGGCGGTTACAATATAATTGGTACCCCCATTTTTGGAAGTGTTTAGCC AACCAAATGTTACATAGGGCCTATAGAAATCGACAGTTTTGTGCTAGTGGATTGCACAACTGCA TGTTAACAAATCTATTTTTTTGTATTTTAAGTTCGACTTTCAAGTCTTTAATTATTGTAGGCGC AAAAAGTATTTCATATTTTAATTATCACAAGTTCGCAATTTTTTCACACAAAATATGCATCTAG TATGTAGGATTCAAATCCGGGATCTCTCCCTTCATGTGTATCTTACTTATTACCATCTTACATA TGAAGCACTTTGTTAATTACTATGAAATAGACGTTGGTCTTCTAATTTAAACTCTCCTAAACTT GTAACACATATTAAAACCTTAAAGATTTATGTAGTGTTCATTTGAAGTGCGATTGAGGTGAACT AAAGTTATATATGATCCCAACAATTTTTTCATTAAATTTGTAAGGTCCATATTTTGGTAATATC CTTGTTCACTTATGTCAAGTTCCCATTGTATGTTTTGATGTGTTATGCAACTTGACATTTGTGA ATGTTCATAATAAAGGAAATATCAAAAAAAAAATTGACTAGGCCATATTTGAGGAAATATTGTA AGGATCTCATAGAACTTTGGATTAACTCAATTGGACTTAAGGTGTATTTTCTATGAATTTTAAA ACTTTAGACTTCATAAAGATCTGTTTGTAAAATCATCCTATTTTAAAAAGTAGATTCCGAATTT GTAACGAATATTTCGGCACCTAAATGTTCTTAAATGAAATAACTTTGACTAGAAAGTTACAAAC CTTGTCGAGCGCTATATTGTTTTATAGAAATTGTACCCGTCAACGTATGTAACAAAAAATTCTA ATGTAGACCTTAAAGCTTCTTATAATGAACTTTTGATCCCATTAACTACCTAAAATAGAAAAAC ATTAACTACAACATCTCAACAAGAACTATAATTGTCACATAACATTTGTCATTAGGCGACATCA TAGGAAAGAGTTACAAGTGGTTTCCTAATAGAACTGCCCTTAAAAATCAATTTTATTGATTTTT TCTTATGAGATCCGTATATAAAAATGACCCCACCTTTCAAATTACGCGACCCATTTGTGTTAAT AGACCTATTTTCACATGCAATTTTTCATAAGGAGCTATCTGTAAAAATAGTTTTCTTTTGTTAT ATGACCCTGGGCGGCATTAGTCATCTTCATAGGGACACGGAAATGGTTTGTAGTGGTTACGATG AAAAATGTGCATGTGCCTATTATTGAAATAAAAAGACTGCCAGCTTTTGGCCATCTAGACAATG CGTCAGAGACAACCATCCCAATCTATCCCCTCCCCATCCCATCTAGAAGTAAAAGTATAGGTAG GGTCTTCCAAAAATACACAAAATATTGAATCTGCATGGGAGGGGCAGAGGGTAGCTAATGAAGG GGTGGGAGAGGTGCAGAGGATCGATGGGCACGCGTGTGACACATTGCTTAGTTAAACAACATGC TACGTGTTAGGCAATAGCACGTTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTATCTATCTCTGTATATTTTTC CATAGAAATTACTTTAAGTATATGAGGTTATATCACACGGTCATGCATAGCGTTTAGAAGTTTC AATTGATTCAGATTTACAGGTATAGGGGTAGAATAGTTAAATTTTGATTTATTTTTGGGCTTCT GATTTGATCATCTGTACCTTTCAATTTTGAAAAGCCTGATCTTTAACATATTATAATATTCTGT GAAACTTTAGAACTTTTAAATATAATTTGTTGTGCGGTTTTCTTGATTTCTCTTACAATTGGTG GCTCGAGATGAAGGATATTAATTTCTGTTGTTTTTGACCTATTAATTAATCGTACCTTTGTATG GCTTCATTCAGCTTCCTGCATTCCTCGATGGTGGCATGATCATCATATGTGTCATCCATAAGGA CAATGAATACAATTATCTTGGCAAGGATCATCCGTGTGAGTGTTAAGTTTTCTTCATAGAACAG CGCATAGGACCAAAGATATGACTCCACTGCACGATCTCTAACATGACTTAGCTCGACATATCCA TAAAGATCTTTCCACCACCTGAAAATTAAAATGATCGATTGTTTTAGGTGCTTGTTTTGAAGTA TATTTAAGATATATATATTAGATCATTAGAAGCAATGAGTATTAATTGATTTATGATAGTAATA ATATGTACATAGCATATCAGGCATACCGAAAACACTAACAACATGAAGAGCCATATTGCTAGTT ATTTCAGTATATGTCACTAGTTATTGGATGTTTAAAGCCGCATAAAAGCCTCTAGTGTATTGCT GCTGCAAATGCTGAGACAAAGATTGATAAAATATTCGGATATTCCTTGAAGGCTAGCTGTCCTT CTTTTTTATCTGAGAGTGGACAAATTATATAGTAGTATAAACCTTAATTTTCTATTGTTCAATA CTTGAAACTACAGATAAAGCGATACCTAAACTCGGATACACTAACTACCTCATTAACATGACAT ATATTGACTACTTCTGGACAAAACATAAAGTTGTACATGTATTTTGTGATTAATTAACATTAAA TTGGTTGCACAAACAAAGCGTCAATTTGTCTAAAACGAGGTACACATTTTATGTATTTACCATT CAGTACATCGAAGGAACACAACGTCTCTCCAGAATTTTGCACTTATCTATATCTGTCTATCCTA TATAGTCAGAGCTAAAATATCCACATGTATTGATTAAGTTCATCTGAAATACAACAGCCTTTGG ATTCCTCCTTTACTTTGATCATAGCTACCCACATGTCATGTGTATTCAGAATTAACCACTTAGT ATAATTGCTTTAGAGCTCAAGATGTATTGAGCAACATCTCACCTAGAAAGTAAAAGCCATCGAA TCCCTCTCATACTTGTCATAACTATTCATGAGTTGAAATTACACATCAACTTCTACGTAGCTCA AATTATAGTCCTTTTAGGTATGACGAGTAAATAATTTCCAATAGGTTTTTATCAAGCTTTCCTA GAAAACAAATACTTCTAAATTCTCCACTGTAATGCACGGCCCATTCACTAATAACTAAATGTTC TCTAAATTATCTTTACTAACTGTAGAGCGAAGATCGAAAAACATATTTTGGTAGTTGTATCGTG CACATACACAGATTTGAGATTATTACAGTGGTTTGTTTCTGTCCTAAAGGGCACAATCAATTAC TTTCATGGTATATATTTACTTATTATATATATAAATATCAAATAAATACTCTTTTTTTAGATAA AGGAAATGAATAAACCTGGTATCTACATCCACAAGACATGTACAAAGACAAAGCAAAGAAAGAC TCTTACTGAGAAAAAGCTTTGAGCTCCTTCAAGTGGACATGCTGCAGAAGGTTAAATTCCAGCT TTGCAAGATCTAAAAGAACAACAATACATTCTTCCTCCTGTCCGTACTCCAGCATGTAATGCAA CATTTCAACTCTCTTGTAGGTTCTCGGTAATGGTAAGTGTAGGGCACGGTTGATTTGATTATCT AGAGGGGCCTTGAGCCTACTTCCGTCCCTCATTGATTCGAGGTGGTGCCTTGCAAAAGACATAG CTTCTTCAAGTTCTGGCTCATCATGGACAAGGAGGTGAGCTGCATTGTACAAACTTAATAATGC CCTTGGTTCATCAGCTATTGTATTGATGAACCTCCCATCCTCTCCTTTGAATTTTTCGAATACA T |