Detail information of BGIOSGA015327_circ_g.1


General Information
CircRNA Name BGIOSGA015327_circ_g.1
ID in PlantcircBase osi_circ_014248
Alias Chr04:16279254_16283863(ZS97RS2)
Organism Oryza sativa ssp. indica
Position chr4: 13376031-13380640  JBrowse»
Reference genome Oryza_indica.ASM465v1.42
Type   ei-circRNA
Identification method CIRCexplorer2
Parent gene BGIOSGA015327
Parent gene annotation NA
Parent gene strand -
Alternative splicing NA
Support reads NA
Tissues root, leaf, panicle
Exon boundary   No-Yes
Splicing signals   CT-TA
Number of exons covered BGIOSGA015327-TA:3
Experimental Information
Sanger sequencing for BSS   NA
PCR primers for BSS    NA
Sanger sequencing for FL    NA
PCR primers for FL    NA
Sequences
Splice junction sequence   AGGAGGTGAGCTGCATTGTACAAACTTAATAATGCCCTTGGTTCATCAGCTATTGTATTGATGA
ACCTCCCATCCTCTCCTTTGAATTTTTCGAATACATcctcttttttcatgcaggtcacccggta
tttgtcactggcctctacttgagcttcagtctccctgaagtaattcagcagtgcacggtagaac
tttttcat
Assembled circRNA sequence   NA
Full-length trsnacripts NA
Genomic sequence CCTCTTTTTTCATGCAGGTCACCCGGTATTTGTCACTGGCCTCTACTTGAGCTTCAGTCTCCCT
GAAGTAATTCAGCAGTGCACGGTAGAACTTTTTCATGTACTCTGGTAGTAATGAGATAGCACTT
TCATCCCATCTGTCCAATAGGCCAATTGGGAATTTTTATGAAATTACTTAATTAGGCAAGTGTA
AATAAATCTAGCCGAAAAAGATAGTTTGACAGGGATGTATCGCGTTGAAACCACAAATAAATGA
ATGAAATACTTTGTAAATTATGCTCAAATGGACACGCCATGTACCAGTGACGAATAAAGTGGTT
TGATGATGTTTAATATTTCTCGAATGAAAGACTTGTTAACATTGTGTGAAACGCGTGACCATAA
TTAATTGAGATGTATAGTGATCGATAAATTCGATGGTAACTGTACAACAAATTTATTTAGTTAG
AGGATCAACATGGTTTTTCAGTTGTGCTTTACTCAGATTAATTGTTTAGGTGCATTAAACATCA
AAAGGTAAAATAAACAATTTCTTTTTTATTTGCTCTAAGTAGCTCGGGTTCATGGAAATTGTTG
GTTCATATCATGCTGGCAGCAACAGCTCGGTAACAAGAATACTGATGCCAGCTACCTTTGGTAG
TTGTAGCTAGCTCTACCTCCAGTTGCACATCTCTGTTTTAATTAACTAAAAGTTGGCCTTAGCT
GTTTCTTGATAGAATGACAGTAGAATATATGTGTATGCATGAGCGGTACTCTGCTTGGTCATTG
CATAGTAGTTGGAAAAACTCGCATGTTTTGCTGCTCTAGAATTAGAGGTGGAATGTTGAATGCT
CGGAAAACTACTTTTATAGGCAGTTACAATATAATTGGTACCCCCATTTTTGGAAGTGTTTAGC
CAACCAAATGTTACATAGGGCCTATAGAAATCGACAGTTTTGTGCTAGTGGATTGCACAACTGC
ATGTTAACAAATCTATTTTTTTGTATTTTAAGTTCGACTTTCAAGTCTTTAATTATTGTAGGCG
CAAAAAGTATTTCATATTTTAATTGTCACAAGTTCGCAATTTTTTCACACAAAATATGCATCTA
GTATGTAGGATTCAAATCCGGGATCTCTCCCTTCACGTGTATCTTACTTATTACCATCTTACAT
ATGAAGCACTTTGTTAATTACTATGAAATAGACGTTGATCTTCTAATTTAAACTCTCTTAAACT
TGTAACACATATTAAAACCTTAAAGATTTATGTAGTGTTCATTTGAAGTGCGATTGAGGTGAAC
TAAAGTTATATATGATCCCAACAATTTTTTCATTAAATTTGTAAGGTCCATATTTTGGTAATAT
CATTGTTCACTTATGTCAAGTTCCCACTGTATGTTTTGATGTGTTATGCAACTTGACATTTGTG
AATGTTCATAATAAAGGAAATATCAAAAAAAAAATTGACTAGGCCATATTTGAGGAAATATTGT
AAGGATCTCATAGAACTTTGGATTAACTCAATTGGACTTAAGGTGTATTTTCTATGAATTTTAA
AACTTTAGACTTCATAAAGATCTGTTTGTAAAATCATCCTTTTTTAAAAAGTAGATTCCGAATT
TGTAACGAATATTTCGGCACCTAAATGTTCTTAAATGAAATAACTTTGACTAGAAAGTTACAAA
CCTTGTCGAGCGCTATATTGTTTTATAGAAATTGTACCCGTCAACGTATGTAACAAAAAATTCT
AATGTAGACCTTAAAGCTTCTTATAATGAACTTTTGATCCCATTAACTACCTAAAATAGAAAAA
CATTAACTACAACATCTCAACAAGAACTACAATTGTCACATAACATTTGTCATTAGGCGACATC
ATAGGAAAGAGTTACAAGTGGTTTCCTAATAGAACTGCCCTTAAAAATCAATTTTATTGATTTT
TTCTTATAAGATCCGTATATAAAAATGACCCCACCTTTCAAATTACGCGACCCATTTGTGTTAA
TAGACCTATTTTCACATGCAATTTTTCATAAGGAGCTATCTGTAGAAATAGTTTTCTTTTGTTA
TATGACCCTGGGCGGCATTAGTCATCTTCATAGGGACACGGAAATGGTTTGTAGTGGTTACGAT
GAAAAATGTGCATGTGCCTATTATTGAAATAAAAAGACTGCCAGCTTTTGGCCATCTAGACAAT
GCGTCAGAGACAACCATCCCAATCTATCCCCTCCCCATCCCATCTAGAAGTAAAAGTATAGGTA
GGGTCTTCCAAAAATACACAAAATATTGAATCTGCATGGGAGGGGCAGAGGGTAGCTAATGAAG
GGGTGGGAGAGGTGCAGAGGATCGATGGGCACGCGTGTGACACATTGCTTAGTTAAACAACATG
CTACGTGTTACGCAATAGCACGTTCTCTCTCTCTCCCTCTTTCTATCTATCTCTGTATATTTTT
CCATAGAAATTACTTTAAGTATATGAGGTTATATCACACGGTCATGCATAGCGGTTAGAGGTTT
TAATTGATTCAGATTTACAGGTATAGGGGTAGAATAGTTAAATTTTGATTTATTTTTGGGCTTC
TGATTTGATCATCTGTACCTTTCAATTTTGAAAAGCCTGATCTTTAACATATTATAATATTCTG
TGAAACTTTAGAACTTTTAAATATAATTTGTTGTGCGGTTTTCTTGATTTCTCTTACAATTGGT
GGCTTGAGATGAAGGATATTAATTTCTGTTGTTTTTGACCTATTAATTAATCGTACCTTTGTAT
GGCTTCATTCAGCTTCCTGCATTCCTCGATGGTGGCATGATCATCATATGTGTCATCCATAAGG
ACAATGAATACAATTATCTTGGCAAGGATCATCCGTGTGAGTGTTAAGTTTTCTTCATAGAATA
GCGCATAGGACCAAAGATATGACTCCACTGCACGATCTCTAACATGACTTAGCTCGACATATCC
ATAAAGATCTTTCCACCACCTGAAAATTAAAATGATCGATTGTTTTAGGTGCTTGTTTTGAAGT
ATATTTAAGATATATATATTAGATCATTAGAAGCAATGAGTATTAATTGATTTATGATAGTAAT
AATATGTACATAGCATATCAGGCATACCGAAAACACTAACAACATGAAGAGCCATATTGCTAGT
TATTTCAGTATATGTCACTAGTTATTGGATGTTTAAAGCCGCATAAAAGCCTCTAGTGTATTGC
TGCTGCAAATGCTGAGACAAAGATTGATAAAATATTCGGATATTCCTTGAAGGCTAGCTGTCCT
TCTTTTTTATCTGAGAGTGGACAAATTATATAGTAGTATAAACCTTAATTTTCTATTGTTCAAT
ACTTGAAACTACAGATAAAGCGATACCTAAACTCGGATACACTAACTACCTCATTAACATGACA
TATATTGACTACTTCTGGACAAAACATAAAGTTGTACATGTATTTTGTGATTAATTAACATTAA
ATTGGTTGCACAAACAAAGCGTCAATTTGTCTAAAACGAGGTACACATTTTATGTATTTACCAT
TCAGTACATCGAAGGAACACAACGTCTCTCCAGAATTTTGCACTTATCTATATCTGTCTATCCT
ATATAGTCAGAGCTAAAATATCCACATGTATTGATTAAGTTCATCTGAAATACAACAGCCTTTG
GATTCCTCCTTTACTTTGATCATAGCTACCCACATGTCATGTGTATTCAGAATTAACCACTTAG
TATAATTGCTTTAGAGCTCAAGATGTATTGAGCAACATCTCACCTAGAAAGTAAAAGCCATCGA
ATCCCTCTCATACTTGTCATAACTATTCATGAGTTGAAATTACACATCAACTTCTACGTAGCTC
AAATTATAGTCCTTTTAGGTATGACGAGTAAATAATTTCCAATAGGTTTTTATCAAGCTTTCCT
AGAAAACAAATACTTCTAAATTCTCCACTGTAACGCACGGCCCATTCACTAATAACTAAATATT
CTCTAAATTATCTTTACTAACTGTAGAGCGAAGATCGAAAAACATATTTTGGTAGTTGTATCGT
GCACATACACAGATTTGAGATTATTACAGTGGTTTGTTTCTGTCCTAAAGGGCACAATCAATTA
CTTTCATGGTATATATTTACTTATTATATATATAAATATCAAATAAATACTCTTTTTTTAGATA
AAGGAAATGAATAAACCTGGTATCTACATCCACAAGACATGTACAAAGACAAAGCAAAGAAAGA
CTCTTACTGAGAAAAAGCTTTGAGCTCCTTCAAGTGGACATGCTGCAGAAGGTTAAATTCCAGC
TTTGCAAGATCTAAAAGAACAACAATACACTCTTCCTCCTGTCCGTACTCCAGCATGTAATGCA
ACATTTCAACTCTCTTGTAGGTTCTCGGTAATGGTAAGTGTAGGGCACGGTTGATTTGATTATC
TAGAGGGGCCTTGAGCCTACTTCCATCCCTCATTGATTCGAGGTGGTGCCTTGCAAAAGACATA
GCTTCTTCAAGTTCTGGCTCATCATGGACAAGGAGGTGAGCTGCATTGTACAAACTTAATAATG
CCCTTGGTTCATCAGCTATTGTATTGATGAACCTCCCATCCTCTCCTTTGAATTTTTCGAATAC
AT
Conservation Information
Conserved circRNAs osa_circ_023451 osa_circ_023462
PMCS
Functional Information
Coding potential N
Potential coding position NA
Potential amino acid sequence NA
Sponge-miRNAs NA
circRNA-miRNA-mRNA network  VISUALIZATION
Potential function description NA
Other Information
References Zhou et al., 2021