Splice junction sequence |
TATCTTGAAGATACACTCAAGGAAAATGAATTTGATGCGTGGAATCGATCTGAAAAAGATTGCA GAGAAGATGAATGGTGCTTCAGGTGCTGAGCTGAAGgctgtgtgcacggaggcgggaatgtttg ctctgcgtgagaggagagtacacgtgacacaagaagactttgagatggcggtggccaaggtaat gaagaaag
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 1228 Transcript exons: 6754778-6754951,6756930-6757116,6757498-6757599,6757688- 6757916,6758000-6758066,6758143-6758312,6758666-6758828, 6758935-6759035,6759296-6759330 GCTGTGTGCACGGAGGCGGGAATGTTTGCTCTGCGTGAGAGGAGAGTACACGTGACACAAGAAG ACTTTGAGATGGCGGTGGCCAAGGTAATGAAGAAAGACACGGAGAAGAACATGTCTCTGCGTAA GCTGTGGAAGTAGGAATCTCTCATGGAAAGACTTTCTTTACTTTACGTGGAGGCGAGACCTCCT GTGACAGCGATGGAGGAAACCTGCAACGTTAAGGGAGCGGCGGCGAAACAAGGAGAAGGGCTTA ACAAGTACTACCTCCAGCATCTCGATGAGCTCCAGCGCCTGCAACGCGAAAAGTCGTATAACCT TAATCGTCTTGAAGCTCAGAGGAATGAACTCAATTCTCGAGAGTACGAATGCTCAGAGAAGAGT TACAGCTCCTTCAAGAACCTGGGTCCTATGTGGGTGAAGTGGTAAAAGTGATGGGAAAAAACAA GGTCTTGGTTAAGGTAGGTTCATCCAGAGGGGAAGTATGTTGTCGATATTGACAAAAGTATAGA CATAACGAAACTCACTCCATCAACGAGAGTTGCTCTCCGTAATGATAGCTATGTTCTCCACCTG GTTCTGCCAAGTAAAGTAGATCCCTTGGTTAACCTTATGAAAGTTGAGAAGGTTCCAGACTCCA CATATGACATGATTGGTGGTCTTGACCAGCAAATCAAGGAAATAAAGGAGGTAGGTCATTGAAC TGCCAATCAAGCATCCTGAATTGTTTGAGTCTCTTGGAATTGCGCAGCCAAAGGTTAAGGGTGT GTTGTTGTACGGTCCACCTGGAACTGGGAAGACACTATTGGCTCGGGCTGTGGCACATCACACT GACTGTACTTTCATCAGAGTTTCTGGTTCTGAGCTGGTCCAGAAATACATTGGAGAAGGTTCTA GAATGGTCAGAGAACTTTTTGTGATGGCAAGGTCAGGGAGCATGCACCATCAATCATCTTCATG GATGAAATCGATAGTATCGGGTCTGCTCGTATGGAATCTGGTAGTGGAAATGGTGACAGTGAGG TGCAAAGGACTATGCTTGAGCTTCTCAATCAACTTGACGGATTCGAGGCGTCAAACAAAATCAA GGTAAGGTTTTGATGGCTACAAATCGTATTGATATTCTGGATCAAGCTCTTCTCCGGCCTGGAA GGATTGATAGGAAAATTGAATTTCCTAATCCTAATGAAGAGAGAAGATGAATGGTGCTTCAGGT GCTGAGCTGAAG
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Genomic sequence |
GCTGTGTGCACGGAGGCGGGAATGTTTGCTCTGCGTGAGAGGAGAGTACACGTGACACAAGAAG ACTTTGAGATGGCGGTGGCCAAGGTAATGAAGAAAGACACGGAGAAGAACATGTCTCTGCGTAA GCTGTGGAAGTAGGAATCTCTCATGGAAAGACTTTCTTTACTTTACTGTTTGTTGTTTGATTCT GAAACCTTTTTTCGGTTGTCTCATGAAAACATTTTAGAACAAAGTTTTTACTATCTAGACACGA GTTTATCTAGTATGCGATTTGAGGTCAATGGAAGGAAATTCCCAAAACTCAAGAACCTGAGCTT ATAAGACCAAAACAAGCAGAACCTTCACATGTTAAGAGTTCTTCTGTCCGAAACTGTCATATTC CATTAGAGAGAAAAAGCCTATAATGTAAATGTTATGATAATTTATTTCAATTACAAATTTTACG CACGAATTTGGTTTATTCGGTATGGTTTAGCTCGGTTACCAAAGTTTTGGTGTATGCTTAAGTT GTGGTTTTGGACTTTTTGTATTGCAGACTTATAAAATAACAAAACCAAGCGGTTTATAAATTTT GTTAATTTTGGGTTGGTTCCGTCATTCCATTTTTTATTTTTCTCCCAAATAAAAAATCATATGA AATTAAACTTAAAAAGAGCAAGATCTTTAATACAAGATCTTTAATACAAGTTTAGCAAAAAAAA GATCTTTAATACAAATGATAACATAGTTACAAAATTATACAAAACATATGATATTAATGAATTA TATAATACACAATAAGCAATGGAAAAGAAAAATACAATAGCTTATATCTTGTTCTCTGGACATT TTGCACCTTTCTTATGTTTCCAGTTATTACGTTTAAACTTTGTGCACAGAAACGAAAATATTTG ATATGCGTGAGAGGAGAGTACACGTGACATAAGAATACTGAGATGGCGGTGGCGAAAGTAACGA AAAACACACACAAAGAAGAACAAGCCTCTGAGTAAGTTCTGGAAGTAGGAATCTCTTTGTTATG TAATTCAAGTCAATGGAAAACCACATTTTCATTTCGGATATGACAAATTAGAGTTTCTTTACTT TGCTGTCGATTGCTGGTTTTGAAACCCTTTTTCGGTTGATTCATCAAACATTTTTAGATTAAGT TTTTATGACCTAAATATTTTTTTTTTATATCTAAATGTGTCTTTAAAACGAACACATGTTCAAA GTTTTTATGTCCAAATCAGTTATCATATTTGATTAGAGAGAAAAAAGCTATAAAGTTAATATTA TTATAATTTAATTAATATGACTATTTTAGTAATAAAATCCTTCAACTAAAGATGAATCGTGAGA AAACCTATCAATTATTTATTTAGTGAAAAAACTCTAAACTTAAAATTTGTTAATGTAAATCCTC ATCCATCTATATTGTCGTGAAAATTGGACGGATTACAATTAAAATAAAATGTAATATTTTTCAC AAATTGAAAAATAATAAATATACACTTAAACAATAAAAATTGTAAATAAAAACAACAAAATGTT CTTATTTATACCGAATCTAAATTTTCTAATTTATTTAAGCTCTAAAATTTAGAAAGTGAAAAAT GAGATTTTTATAAGGTTTGTGTGTTGTCGAAGTCGATTCATTTTAATTTGACCCTAACCCGTCT AATTTTTATTACTAAAAATGAAGAGAGAATTGTATTAACAGAATTTAAATTAAAGGGTATTTTT ACAATCATCTTTAGTCGAGTGGTTTTATTACTAAAAACTTTTTTTTAAAATACAAATGTTTATG CAATAATATGGTTTATTCGGTGTGGTTTTAGTTGGGTTACCCAAAAAAGTTTTAATAATAGGCT TTAGTTGTGGTTTTGGTATTGCAGACATTAAAAATAACAAAACCAAGCGGTTTATAGACTCGGT TTATTTTGGGTCGTTCGTTTTCCATTTTATTCTCACAAAATAAAAAATAGTAAATTGAACTTAC AAAAAAAAAAAAGATGTCTTGTTGGATAATCCAAGGTTCTTTTCTATATAAAGGTTCTTTGCTC ATGATCTTAGTCCCTGTGATCTATCTTTGAATCTCAAAAGCATACTTGAGAGAGATCTGTTTCG ATAATTTGCTTCAATCACCGTGTTAATGGCGGCCGTAGGAGTGGAGGCGAGACCTCCTGTGACA GCGATGGAGGAAACCTGCAACGTTAAGGGAGCGGCGGCGAAACAAGGAGAAGGGCTTAACAAGT ACTACCTCCAGCATCTCGATGAGCTCCAGCGCCTGCAACGCGAAAAGTCGTATAACCTTAATCG TCTTGAAGCTCAGAGGAATGAACTCAATTCTCGAGGTCTCTTTTTCCTTCTCTAACTCTAATTT TCATTGAATTTCTTTGCAAAGTTGGATCTTTTGATCATCTTCTTAAGTTTAGTAATCTCGAATT CCATATTAGGACTTTAGATTTCGTCTGGGTGCTTTAAATTTATAAATTGTTGCGGTGATTGTTT GGATTGAGGGTTTCTGATCTTTTCCAGAACTGGATCTAAACTATGCTGCGCCTTGATTTTTAGC ATCACTAAGTTACCCTATTGAGATTTCTTCTTGATTCTGTTTGTGTTGAGTATGAATCAGCTTC TGTCAATATTTGATTGTTTAGCAAAGTATGTAGTGATTGATACAATCGATGTATACTGCTGAAC ATTTTAAACCTTGTTGTCATTGTAAACTGAACAGTACGAATGCTCAGAGAAGAGTTACAGCTCC TTCAAGAACCTGGGTCCTATGTGGGTGAAGTGGTAAAAGTGATGGGAAAAAACAAGGTCTTGGT TAAGGTATGAATGTTTTTATCGTATTATCTAGATTGGTTTTTGAATTGTTTGCAATCATATGAA CATTGATAGAATAATACTTTCCCATGTTTCAGGTTCATCCAGAGGGGAAGTATGTTGTCGATAT TGACAAAAGTATAGACATAACGAAACTCACTCCATCAACGAGAGTTGCTCTCCGTAATGATAGC TATGTTCTCCACCTGGTTCTGCCAAGTAAAGTAGATCCCTTGGTTAACCTTATGAAAGTTGAGA AGGTTCCAGACTCCACATATGACATGATTGGTGGTCTTGACCAGCAAATCAAGGAAATAAAGGA GGTATGCATAGTGAAAGAAACAAACGATACTAAAAGTCACTGGTTTCATGCTTTTAAATTTTAT ATAATATCTTTACTGGTTTATCAGGTCATTGAACTGCCAATCAAGCATCCTGAATTGTTTGAGT CTCTTGGAATTGCGCAGCCAAAGGTACACTTGAATTTCAAAGCTTATCTATATTGTGACGCTGC TAAGTGGATTTCGAACTGATTGCTTCTCCCTCTCTTTTAAGGGTGTGTTGTTGTACGGTCCACC TGGAACTGGGAAGACACTATTGGCTCGGGCTGTGGCACATCACACTGACTGTACTTTCATCAGA GTTTCTGGTTCTGAGCTGGTCCAGAAATACATTGGAGAAGGTTCTAGAATGGTCAGAGAACTTT TTGTGATGGCAAGGTTTGTACATGCTAGTCCTTATTTAATATTTCAAGCATGGTAAAAGTGGTA GGTTGGAAAAGATGGAACTTTTGACACGATAAATCTTTTACATGCCCGTGCTTAGTAGCTGTAG TGGACATGTGGAGTAAAATAAATTGAGTAAATTGTTCTCTGTTCCTGCTATGAATATGGTTTCA ACATGTATACGATCTCAAGCATAATGATCTTTACAAGTAGTCTCGATGCCTAGCATTTAGGCCA CAGTAATAGTCTTTTGTAATGAGCAAAGTATACACCATTAATCATCTTCATTGTGCTGAAAAAT ACTTATTCCAGCTAGCTTACCTTTCTAGTACCTCTGGCTTATGGTTTTCAGGGAGCATGCACCA TCAATCATCTTCATGGATGAAATCGATAGTATCGGGTCTGCTCGTATGGAATCTGGTAGTGGAA ATGGTGACAGTGAGGTGCAAAGGACTATGCTTGAGCTTCTCAATCAACTTGACGGATTCGAGGC GTCAAACAAAATCAAGGTATGCCTTATGTTGTGAATGAAAAAATAGTCATGAAGCTGAAAAGGA TAACTCTGTGTTACTCTGAATTTCGCAGACAAAGTTGTTAATTCTCTTAAATGACTGTTGCAGG TTTTGATGGCTACAAATCGTATTGATATTCTGGATCAAGCTCTTCTCCGGCCTGGAAGGATTGA TAGGAAAATTGAATTTCCTAATCCTAATGAAGAGGTAATGCTTGTGTTTCTTAGGACATGATAT TAGAAATAACTTTAAACTTGAAGTAGCAACTTTGCTCACTCCGTTGTTTTTGGTAAACTATCAT TTACTGCGTAAAATACTTTTCTCCATACTTATTGTACCCAAAGTGAGGCAGGACGGTTTGGCTA ATGTATATTTCTAATATGTGTTGCAGTCACGTTTTGATATCTTGAAGATACACTCAAGGAAAAT GAATTTGATGCGTGGAATCGATCTGAAAAAGATTGCAGAGAAGATGAATGGTGCTTCAGGTGCT GAGCTGAAG |