Splice junction sequence |
GTAGGAATCAACTATTACACATCAGTGTTTGCATTGCACGACGAAGAGCCAGATCCTTCGCAAC CAAGTTGGCAGAGTGATTCTCTCGTGGACTGGGAACataaatgtaattatcacaatgccgacgt tgctgtcgatttctaccatcgttacaaggtattaatcatgttatttacccctaccttatatgtg cttgtgaa
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 897 Transcript exons: 28511681-28511736,28511826-28511901,28512014-28512091,28 512186-28512273,28512353-28512617,28512726-28512841,2851 2920-28513137 ATAAATGTAATTATCACAATGCCGACGTTGCTGTCGATTTCTACCATCGTTACAAGGAAGATAT CAAGTTGATGAAAAATCTGAACACTGATGGCTTTAGATTTTCCATTGCATGGCCCAGAATATTC CCCCATGGTAGGATGGAGAAAGGAATAAGCAAAGCAGGTGTGCAGTATTACCACGATCTGATCG ATGAGCTCCTCGCAAATGGTATAACACCATTAGTAACTGTTTTTCACTGGGACACTCCTCAAGA CTTAGAAGATGAATATGGTGGCTTTTTAAGCGACCGCATAATAAAGGATTTTACGGAGTATGCA AACTTCACATTCCAAGAGTACGGAGACAAAGTGAAGCATTGGATCACATTTAACGAACCATGGG TGTTCAGTCGAGCTGGCTACGACATTGGGAACAAAGCACCGGGACGTTGTTCTAAGTACATCAA AGAACATGGAGAGATGTGTCACGATGGACGGTCAGGACACGAAGCTTATATCGTTAGTCATAAC ATGCTCTTGGCACATGCCGATGCCGTTGATGCCTTTAGGAAATGCGACAAGTGCAAAGGTGGTA AAATTGGGATTGCTCACAGTCCAGCTTGGTTTGAGGCTCATGAGCTCTCGGATGAAGAGCACGA AACTCCTGTAACTGGCCTGATTGACTTCATATTGGGATGGCATTTGCATCCGACCACATATGGA GATTATCCACAATCAATGAAGGATCACATCGGACATCGACTGCCGAAATTCACAGAGGCACAGA AAGAGAAGTTGAAAAATTCAGCTGATTTTGTAGGAATCAACTATTACACATCAGTGTTTGCATT GCACGACGAAGAGCCAGATCCTTCGCAACCAAGTTGGCAGAGTGATTCTCTCGTGGACTGGGAA C
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Genomic sequence |
ATAAATGTAATTATCACAATGCCGACGTTGCTGTCGATTTCTACCATCGTTACAAGGTATTAAT CATGTTATTTACCCCTACCTTATATGTGCTTGTGAAGCGATCTCTTGAAATTACGTTAATGTTT AAATTTATATTCAACAGGAAGATATCAAGTTGATGAAAAATCTGAACACTGATGGCTTTAGATT TTCCATTGCATGGCCCAGAATATTCCCCCGTAAGTTATTAAAAATCTCAACAAATTATATTTCA CTGGTTGATCATAACATTAGTTGATTATAATAAAAGTAAGGAAATAATAACATTTTTTAAATAA ATTAAAATAACAGATGGTAGGATGGAGAAAGGAATAAGCAAAGCAGGTGTGCAGTATTACCACG ATCTGATCGATGAGCTCCTCGCAAATGGTAATTTTTGTTTTTCACTACTTAAACTTCAGAAACT CTAAATTACATCAAAAACATTACTAATGCTACCTCTAAATTTATTTTCAAAATTCAGGTATAAC ACCATTAGTAACTGTTTTTCACTGGGACACTCCTCAAGACTTAGAAGATGAATATGGTGGCTTT TTAAGCGACCGCATAATGTAAGAATTTTTTATTAATTTCTACAACTTTATCGTCTACAACTCAA ACACGATTAACCTTTTCTATATATAAATTCAGAAAGGATTTTACGGAGTATGCAAACTTCACAT TCCAAGAGTACGGAGACAAAGTGAAGCATTGGATCACATTTAACGAACCATGGGTGTTCAGTCG AGCTGGCTACGACATTGGGAACAAAGCACCGGGACGTTGTTCTAAGTACATCAAAGAACATGGA GAGATGTGTCACGATGGACGGTCAGGACACGAAGCTTATATCGTTAGTCATAACATGCTCTTGG CACATGCCGATGCCGTTGATGCCTTTAGGAAATGCGACAAGGTTTCTATATAAACATAAACTAG CCTCATTTAAATTCTATTGTGAATATTTTTACGTAGTTTAATGAACGAGTACTACTTATAAACA TTTATTTCTAATTGTTTCTAGTGCAAAGGTGGTAAAATTGGGATTGCTCACAGTCCAGCTTGGT TTGAGGCTCATGAGCTCTCGGATGAAGAGCACGAAACTCCTGTAACTGGCCTGATTGACTTCAT ATTGGGATGGTAAAAAATATCATTTACTATTTTACCCTTTAGTATCAAAATTTAAAATATATGA CAAATACTATTCTGACTCCACAGGCATTTGCATCCGACCACATATGGAGATTATCCACAATCAA TGAAGGATCACATCGGACATCGACTGCCGAAATTCACAGAGGCACAGAAAGAGAAGTTGAAAAA TTCAGCTGATTTTGTAGGAATCAACTATTACACATCAGTGTTTGCATTGCACGACGAAGAGCCA GATCCTTCGCAACCAAGTTGGCAGAGTGATTCTCTCGTGGACTGGGAAC |