Splice junction sequence |
GTCATTCTTTATCTGGTGGAGCATGGAATCCACATGATGTGAATTCTGTTGCAGCAACTTCTGA ATCATCTATCCAGTTTTGGGACTTACGTACTATGAAgcgactcatatggagcagcaatatggca gattcctgagccatatggtcaatcgaattcttcaacattggaatgtgttgcttcccttgatgca catgttgg
|
Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
|
Full-length trsnacripts |
Transcript length: 340 Transcript exons: 28610922-28611033,28611170-28611269,28611385-28611512 GCGACTCATATGGAGCAGCAATATGGCAGATTCCTGAGCCATATGGTCAATCGAATTCTTCAAC ATTGGAATGTGTTGCTTCCCTTGATGCACATGTTGGTAAGATTAATTGCGTTCTTTGGTGTCCC TCTGGAAATTCTGACAAGTTAATCAGCATGGATGAACAAAATCTTGTCTTCTGGAGTTTAGACT CTTCAAAGAAAAGTGCGGAGGTTTTATCTAAGGAGTCAGCTGGTATGCGTCATTCTTTATCTGG TGGAGCATGGAATCCACATGATGTGAATTCTGTTGCAGCAACTTCTGAATCATCTATCCAGTTT TGGGACTTACGTACTATGAA
|
Genomic sequence |
GCGACTCATATGGAGCAGCAATATGGCAGATTCCTGAGCCATATGGTCAATCGAATTCTTCAAC ATTGGAATGTGTTGCTTCCCTTGATGCACATGTTGGTAAGATTAATTGGTGAGTTCATTGTTTA CAGTTTCAGCAGTCTATCTACTGGGTGTGCTTATAAGTGCGGTGGTTTAAAAAGTCTTAGAACT TGTAACTTTCTTATCTTCACTTTCATGAAGACTCTCTATACCTCTTGTGGAAACAGCGTTCTTT GGTGTCCCTCTGGAAATTCTGACAAGTTAATCAGCATGGATGAACAAAATCTTGTCTTCTGGAG TTTAGACTCTTCAAAGAAAAGTGCGGAGGTGATTGTTGCTACAACAAGAGAAAGGATAAACCCA TTAAATCATTTTTGCCTCCTGTGTTTTTAGACCACCTTTGAGGTACTTTCCGCTTAATCATCTT TTTTGCTAATTATAGGTTTTATCTAAGGAGTCAGCTGGTATGCGTCATTCTTTATCTGGTGGAG CATGGAATCCACATGATGTGAATTCTGTTGCAGCAACTTCTGAATCATCTATCCAGTTTTGGGA CTTACGTACTATGAA |