Splice junction sequence |
TGTAAGAAAAAAACCTTGAGCGTCTCTTCTTCAGCTTCATTGAAGTTGCACATGGCCTCTACCT TGAACGATCTCCTTGCTTTGATTCTAGGAACCGAAGctgaaattctggcagatgtggtgtactt ctttgaggtgcaggcaaagctggagctgccaaaatctgcatcaaataatataatgcattggatt cttttagt
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 977 Transcript exons: 949734-949796,949883-950125,950198-950311,950404-950500, 950582-950794,950881-951041,951126-951211 CTGAAATTCTGGCAGATGTGGTGTACTTCTTTGAGGTGCAGGCAAAGCTGGAGCTGCCAAAATC TTCTTGTTCACAGGTCGAGCTTTAAACTTGGGAATCTTTGCCAACATCTCTTCCTCAAGTTCTG CACTGCTCTTAACTCTCAAAGGACGAGCTCGTTGGGACGTCACAAATTCGGGTTCCTTTGGTCT TGTCAGTGTCAGCTTAGGTCGATTCTGGACGAATAGGTCTCGCGTGCTTGTTTGGAACTTCTTC ATCAATTCAGCAGTTGAAACAAAAGGTGCAATTTGCTCACGAACATAAACCTTTCTGTTTTCCT TCGGAGTGTGCTTAGTGACTGAAGGGCATAAGTTGAAACCAGTGTTAACAAGACCATTTCTTGT CTTGTGGAGCAGAGTTGCTGGTTTTGGATTGAGAATCTGTCTTGATTTTCCATCATCTAGCTTT TGCCTTTTGATGGCTTGATTTTCTTGAATCAGATTGGTAGTGCTAGCTATGTTGTTAAGATTCG TTTCCCCTTTCACACTTTTCTGATGACTGCCTTTGGCTTGAGACTGGTTTTTAGGCCTTAGTGT AGATGGATTCTTCAGCAGACTAGCTATCTTTCTAGCAGTTTGCTGCTTCTTAAGATCCACCGAC TTTGCCCCTAGAGAAAACTGCATTGGTGGTTTGGGTGTGCAAGCAGGAGCAATGTTCTCCTTGT CTTCTATTGGCTCAGTCGTCGGATCGCTGGCATCTACGGTCTTGTTGTTGACCTCTGCGTCCTT GGAACTGATGCGAGACGGCTTAACAGTGCTTGCTTTAGAAGGAGCAACTTCTGCTTTCTTGGCC TGAGAAGGCTGCGATTGTAAAGAAACAATTGGAACTACTGGTTCTAACGGCTCTTTATCCTTGA GCGTCTCTTCTTCAGCTTCATTGAAGTTGCACATGGCCTCTACCTTGAACGATCTCCTTGCTTT GATTCTAGGAACCGAAG
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Genomic sequence |
CTGAAATTCTGGCAGATGTGGTGTACTTCTTTGAGGTGCAGGCAAAGCTGGAGCTGCCAAAATC TGCATCAAATAATATAATGCATTGGATTCTTTTAGTTTTCTATTTCTGAAGTACAAATATACCT CGGTGAAACTAGATGGATTACCTTCTTGTTCACAGGTCGAGCTTTAAACTTGGGAATCTTTGCC AACATCTCTTCCTCAAGTTCTGCACTGCTCTTAACTCTCAAAGGACGAGCTCGTTGGGACGTCA CAAATTCGGGTTCCTTTGGTCTTGTCAGTGTCAGCTTAGGTCGATTCTGGACGAATAGGTCTCG CGTGCTTGTTTGGAACTTCTTCATCAATTCAGCAGTTGAAACAAAAGGTGCAATTTGCTCACGA ACATAAACCTGAAAAGTGAAAACAAGGTTTGAGAGGGTCTGACAGAAAAAGTATACAAGCAACC ATGAAGCACAACACACCTTTCTGTTTTCCTTCGGAGTGTGCTTAGTGACTGAAGGGCATAAGTT GAAACCAGTGTTAACAAGACCATTTCTTGTCTTGTGGAGCAGAGTTGCTGGTTTTGGATTGAGA ATCTAGATAAATCAATGATAAGAAGGAAAAAGTTTCAGTCATGCAGTGAGGTATGGAGTGAATG ACATGCTGATTTTAAAACAATTTGGCTCACCTGTCTTGATTTTCCATCATCTAGCTTTTGCCTT TTGATGGCTTGATTTTCTTGAATCAGATTGGTAGTGCTAGCTATGTTGTTAAGATTCGTTTCCC TGCAGTGAGACAATCAACACATTAAAACAACTATCACAAGAGAAACGTGAACCAGATTGGTTAT TAAGAATGTGAGGTACCCTTTCACACTTTTCTGATGACTGCCTTTGGCTTGAGACTGGTTTTTA GGCCTTAGTGTAGATGGATTCTTCAGCAGACTAGCTATCTTTCTAGCAGTTTGCTGCTTCTTAA GATCCACCGACTTTGCCCCTAGAGAAAACTGCATTGGTGGTTTGGGTGTGCAAGCAGGAGCAAT GTTCTCCTTGTCTTCTATTGGCTCAGTCGTCGGATCGCTGTTAAATGAAAAAGAAGAAAGATCA TTAGAATTGCCTCTTACTCACTTAACAGCGATACAATCTCCCAAAGAACGATGGAGAACCTGGC ATCTACGGTCTTGTTGTTGACCTCTGCGTCCTTGGAACTGATGCGAGACGGCTTAACAGTGCTT GCTTTAGAAGGAGCAACTTCTGCTTTCTTGGCCTGAGAAGGCTGCGATTGTAAAGAAACAATTG GAACTACTGGTTCTAACGGCTCTTTATCCTGCAATAATCAGAATGATTAAAAAATGATCTTTCC TTGATCTTGTAATGGATGATAAATCAGTGTTGATTGTAAGAAAAAAACCTTGAGCGTCTCTTCT TCAGCTTCATTGAAGTTGCACATGGCCTCTACCTTGAACGATCTCCTTGCTTTGATTCTAGGAA CCGAAG |