Splice junction sequence |
TGTAAGAAAAAAACCTTGAGCGTCTCTTCTTCAGCTTCATTGAAGTTGCACATGGCCTCTACCT TGAACGATCTCCTTGCTTTGATTCTAGGAACCGAAGctgtcttgattttccatcatctagcttt tgccttttgatggcttgattttcttgaatcagattggtagtgctagctatgttgttaagattcg tttccctg
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 557 Transcript exons: 950404-950500,950582-950794,950881-951041,951126-951211 CTGTCTTGATTTTCCATCATCTAGCTTTTGCCTTTTGATGGCTTGATTTTCTTGAATCAGATTG GTAGTGCTAGCTATGTTGTTAAGATTCGTTTCCCCTTTCACACTTTTCTGATGACTGCCTTTGG CTTGAGACTGGTTTTTAGGCCTTAGTGTAGATGGATTCTTCAGCAGACTAGCTATCTTTCTAGC AGTTTGCTGCTTCTTAAGATCCACCGACTTTGCCCCTAGAGAAAACTGCATTGGTGGTTTGGGT GTGCAAGCAGGAGCAATGTTCTCCTTGTCTTCTATTGGCTCAGTCGTCGGATCGCTGGCATCTA CGGTCTTGTTGTTGACCTCTGCGTCCTTGGAACTGATGCGAGACGGCTTAACAGTGCTTGCTTT AGAAGGAGCAACTTCTGCTTTCTTGGCCTGAGAAGGCTGCGATTGTAAAGAAACAATTGGAACT ACTGGTTCTAACGGCTCTTTATCCTTGAGCGTCTCTTCTTCAGCTTCATTGAAGTTGCACATGG CCTCTACCTTGAACGATCTCCTTGCTTTGATTCTAGGAACCGAAG
Transcript length: 901 Transcript exons: 950404-951211 CTGTCTTGATTTTCCATCATCTAGCTTTTGCCTTTTGATGGCTTGATTTTCTTGAATCAGATTG GTAGTGCTAGCTATGTTGTTAAGATTCGTTTCCCCTTTCACACTTTTCTGATGACTGCCTTTGG CTTGAGACTGGTTTTTAGGCCTTAGTGTAGATGGATTCTTCAGCAGACTAGCTATCTTTCTAGC AGTTTGCTGCTTCTTAAGATCCACCGACTTTGCCCCTAGAGAAAACTGCATTGGTGGTTTGGGT GTGCAAGCAGGAGCAATGTTCTCCTTGTCTTCTATTGGCTCAGTCGTCGGATCGCTGGCATCTA CGGTCTTGTTGTTGACCTCTGCGTCCTTGGAACTGATGCGAGACGGCTTAACAGTGCTTGCTTT AGAAGGAGCAACTTCTGCTTTCTTGGCCTGAGAAGGCTGCGATTGTAAAGAAACAATTGGAACT ACTGGTTCTAACGGCTCTTTATCCTTGAGCGTCTCTTCTTCAGCTTCATTGAAGTTGCACATGG CCTCTACCTTGAACGATCTCCTTGCTTTGATTCTAGGAACCGAAGCTGTCTTGATTTTCCATCA TCTAGCTTTTGCCTTTTGATGGCTTGATTTTCTTGAATCAGATTGGTAGTGCTAGCTATGTTGT TAAGATTCGTTTCCCTGGCATCTACGGTCTTGTTGTTGACCTCTGCGTCCTTGGAACTGATGCG AGACGGCTTAACAGTGCTTGCTTTAGAAGGAGCAACTTCTGCTTTCTTGGCCTGAGAAGGCTGC GATTGTAAAGAAACAATTGGAACTACTGGTTCTAACGGCTCTTTATCCTTGAGCGTCTCTTCTT CAGCTTCATTGAAGTTGCACATGGCCTCTACCTTGAACGATCTCCTTGCTTTGATTCTAGGAAC CGAAG
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Genomic sequence |
CTGTCTTGATTTTCCATCATCTAGCTTTTGCCTTTTGATGGCTTGATTTTCTTGAATCAGATTG GTAGTGCTAGCTATGTTGTTAAGATTCGTTTCCCTGCAGTGAGACAATCAACACATTAAAACAA CTATCACAAGAGAAACGTGAACCAGATTGGTTATTAAGAATGTGAGGTACCCTTTCACACTTTT CTGATGACTGCCTTTGGCTTGAGACTGGTTTTTAGGCCTTAGTGTAGATGGATTCTTCAGCAGA CTAGCTATCTTTCTAGCAGTTTGCTGCTTCTTAAGATCCACCGACTTTGCCCCTAGAGAAAACT GCATTGGTGGTTTGGGTGTGCAAGCAGGAGCAATGTTCTCCTTGTCTTCTATTGGCTCAGTCGT CGGATCGCTGTTAAATGAAAAAGAAGAAAGATCATTAGAATTGCCTCTTACTCACTTAACAGCG ATACAATCTCCCAAAGAACGATGGAGAACCTGGCATCTACGGTCTTGTTGTTGACCTCTGCGTC CTTGGAACTGATGCGAGACGGCTTAACAGTGCTTGCTTTAGAAGGAGCAACTTCTGCTTTCTTG GCCTGAGAAGGCTGCGATTGTAAAGAAACAATTGGAACTACTGGTTCTAACGGCTCTTTATCCT GCAATAATCAGAATGATTAAAAAATGATCTTTCCTTGATCTTGTAATGGATGATAAATCAGTGT TGATTGTAAGAAAAAAACCTTGAGCGTCTCTTCTTCAGCTTCATTGAAGTTGCACATGGCCTCT ACCTTGAACGATCTCCTTGCTTTGATTCTAGGAACCGAAG |