Splice junction sequence |
TGTAAGAAAAAAACCTTGAGCGTCTCTTCTTCAGCTTCATTGAAGTTGCACATGGCCTCTACCT TGAACGATCTCCTTGCTTTGATTCTAGGAACCGAAGctttctgttttccttcggagtgtgctta gtgactgaagggcataagttgaaaccagtgttaacaagaccatttcttgtcttgtggagcagag ttgctggt
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 671 Transcript exons: 950198-950311,950404-950500,950582-950794,950881-951041, 951126-951211 CTTTCTGTTTTCCTTCGGAGTGTGCTTAGTGACTGAAGGGCATAAGTTGAAACCAGTGTTAACA AGACCATTTCTTGTCTTGTGGAGCAGAGTTGCTGGTTTTGGATTGAGAATCTGTCTTGATTTTC CATCATCTAGCTTTTGCCTTTTGATGGCTTGATTTTCTTGAATCAGATTGGTAGTGCTAGCTAT GTTGTTAAGATTCGTTTCCCCTTTCACACTTTTCTGATGACTGCCTTTGGCTTGAGACTGGTTT TTAGGCCTTAGTGTAGATGGATTCTTCAGCAGACTAGCTATCTTTCTAGCAGTTTGCTGCTTCT TAAGATCCACCGACTTTGCCCCTAGAGAAAACTGCATTGGTGGTTTGGGTGTGCAAGCAGGAGC AATGTTCTCCTTGTCTTCTATTGGCTCAGTCGTCGGATCGCTGGCATCTACGGTCTTGTTGTTG ACCTCTGCGTCCTTGGAACTGATGCGAGACGGCTTAACAGTGCTTGCTTTAGAAGGAGCAACTT CTGCTTTCTTGGCCTGAGAAGGCTGCGATTGTAAAGAAACAATTGGAACTACTGGTTCTAACGG CTCTTTATCCTTGAGCGTCTCTTCTTCAGCTTCATTGAAGTTGCACATGGCCTCTACCTTGAAC GATCTCCTTGCTTTGATTCTAGGAACCGAAG
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Genomic sequence |
CTTTCTGTTTTCCTTCGGAGTGTGCTTAGTGACTGAAGGGCATAAGTTGAAACCAGTGTTAACA AGACCATTTCTTGTCTTGTGGAGCAGAGTTGCTGGTTTTGGATTGAGAATCTAGATAAATCAAT GATAAGAAGGAAAAAGTTTCAGTCATGCAGTGAGGTATGGAGTGAATGACATGCTGATTTTAAA ACAATTTGGCTCACCTGTCTTGATTTTCCATCATCTAGCTTTTGCCTTTTGATGGCTTGATTTT CTTGAATCAGATTGGTAGTGCTAGCTATGTTGTTAAGATTCGTTTCCCTGCAGTGAGACAATCA ACACATTAAAACAACTATCACAAGAGAAACGTGAACCAGATTGGTTATTAAGAATGTGAGGTAC CCTTTCACACTTTTCTGATGACTGCCTTTGGCTTGAGACTGGTTTTTAGGCCTTAGTGTAGATG GATTCTTCAGCAGACTAGCTATCTTTCTAGCAGTTTGCTGCTTCTTAAGATCCACCGACTTTGC CCCTAGAGAAAACTGCATTGGTGGTTTGGGTGTGCAAGCAGGAGCAATGTTCTCCTTGTCTTCT ATTGGCTCAGTCGTCGGATCGCTGTTAAATGAAAAAGAAGAAAGATCATTAGAATTGCCTCTTA CTCACTTAACAGCGATACAATCTCCCAAAGAACGATGGAGAACCTGGCATCTACGGTCTTGTTG TTGACCTCTGCGTCCTTGGAACTGATGCGAGACGGCTTAACAGTGCTTGCTTTAGAAGGAGCAA CTTCTGCTTTCTTGGCCTGAGAAGGCTGCGATTGTAAAGAAACAATTGGAACTACTGGTTCTAA CGGCTCTTTATCCTGCAATAATCAGAATGATTAAAAAATGATCTTTCCTTGATCTTGTAATGGA TGATAAATCAGTGTTGATTGTAAGAAAAAAACCTTGAGCGTCTCTTCTTCAGCTTCATTGAAGT TGCACATGGCCTCTACCTTGAACGATCTCCTTGCTTTGATTCTAGGAACCGAAG |