Splice junction sequence |
TTGATGCTGAAGAAGTCCTTCCTCCATGCTTCTATTCTCCTCCTCCACCACCATTCCTAAAGAC TAATCCTTCAATCCACCTTATTTTCTCCCAAGAAATctggtttgaagcagtaaatgcgccacga acatgttttggagtgatttccgcaatatagactgggaccttttatgaatataaaaatgttggtt ttaagaaa
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 532 Transcript exons: 1460810-1460875,1460980-1461045,1461145-1461204,1461364- 1461453,1462441-1462503,1462597-1462783 CTGGTTTGAAGCAGTAAATGCGCCACGAACATGTTTTGGAGTGATTTCCGCAATATAGACTGGG ACCACGTAGCTAATCAAGCCGACTCCTATGCCCAAGGAAATTCTTCCCAAGTCCAGCCAGAAGA CATTCTTTGCGAAAGCAATGGAGAGCCAGCCAAAAACGCAGAAAAAATCGCATGCCCACAACGT TCGTCTTCTGCCGAGGATGACTGCCAATTGACCGCTGAACAAGGCCCCCACCGCACCTCCCACA TTCAGAAAGGAGCCAAACGCTGAAAATTGTGCCATAGAAAGGTCTAACTCCTTCATGATAGCAG TCTCAGCGCCTGAAGTATAACCAGCGGCACATCCGTAGCTGAAGGCACTACAAACAGCGACAAA AGTGCTGAGGATGACACAAGCTGTGATACGACGATCATCTCTGTCGTTTTGATGCTGAAGAAGT CCTTCCTCCATGCTTCTATTCTCCTCCTCCACCACCATTCCTAAAGACTAATCCTTCAATCCAC CTTATTTTCTCCCAAGAAAT
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Genomic sequence |
CTGGTTTGAAGCAGTAAATGCGCCACGAACATGTTTTGGAGTGATTTCCGCAATATAGACTGGG ACCTTTTATGAATATAAAAATGTTGGTTTTAAGAAATGTGAACTAAAACAATAAAAATGTAGAT GAGATTACCAAATGTAATTGGTGTAAATATTTGTTCAATTACCACGTAGCTAATCAAGCCGACT CCTATGCCCAAGGAAATTCTTCCCAAGTCCAGCCAGAAGACATTCTTTTTGTTTCCACATTTAT TCAAATATATATATTAGATATTTCTACGAGCAAAATTATTTTAATCGAAAAATAATTTAGGATT TCTGTGGATTTACACCTTTGCGAAAGCAATGGAGAGCCAGCCAAAAACGCAGAAAAAATCGCAT GCCCACAACGTCTTTAATCGTTAATAACCACCCAAAAAAAAAAGATATATATCAATCAGAATCT ACGAAAATCATTGCAAAGAAACAAGTATTAAAAATAAACAAGTGCATAATTTGATGTACTAATT ACTAGTAGTATGATTTAAGAAATATGGTAAAATGGCAATTACTCGTCTTCTGCCGAGGATGACT GCCAATTGACCGCTGAACAAGGCCCCCACCGCACCTCCCACATTCAGAAAGGAGCCAAACGCTG AAAACTGATTTAGAAAATGTGATTTAGTTATTGAGAAAAATTAGCCTTAAAATACTTATCGATT ACATAAAATGGTGGAAAAAAGTTAGCAGTAAGTTGTGTGGTAAAGAGTTACTAATCACAAATAC TTAATTTTTAAGAATTAAATACCTCAACTTTTTTTCAAAAATTCCAACAGTAGTACTTAAAAAG CTTTTGTAAACATTTCTAAGTACTTCGTATACTATTTGATTATTATAAAATTAATTCAAATTAA AATGCTATGCTGTTTGCTAACTTTTTTTTGTTAGGTAAGTAAATCGTGTGATCTTTTGATTAGT TTACCTATCATATTAAAATTTGTCAGAAGAACTATATTCGATAACTGAAATAATTATTAATATA ATTGAAAATACAGCTATATACAACATTTTAATATTGCTCATGTTCAAATATGACATACGGTGTC GGCGTCACATATGCATGAATGCATCTCTGATCTCTCCAAGTACAAAACAGCTATCATATCGCAT TTTCATAATATTCACTTTTGTTTTTTTAAAAATATAATACTTTATATATGGGAAAATATTCATT TTCCAATATTAAAATACGTATCTCTCTAATATTCACATACGCATCTCTCAGAACGTCTGTACAT GTGGTCTCTCAATATAGTTAACTTTGGACCGCAATAAAATAAATAATTCGTAAGATAATATTTA TTATAGAATAATAGTAATAAATAATAATAATTCACTTTCAGTAGCGAAGCTATAATTTATCAAT GACGTCTTTACACGTAATTGCGTATGATTATCCATTTGATTTTCTTCATAACCGACCTGGTTAG GTCTGATAGTTTAGTAATCCATACAAGAAGATTTACAAGCAGCTGATGTTTTAGTTCATAAACA GGTGTAATTATGCATTTTAAGCATAATTAATTAGGGATTAATTGAGTATTTATAGTGATAAAAG CTAAGAAATGAAAAAAAAACAAATTACATACTTGTGCCATAGAAAGGTCTAACTCCTTCATGAT AGCAGTCTCAGCGCCTGAAGTATAACCAGCCTATCAAATCCAAGAAATTATAATGATTATTGTT CGAATAATTAAGAAGAAATTAAGAGATTAAGACTAAAGTAAGAAGTTTTAGAAACTGACGGCAC ATCCGTAGCTGAAGGCACTACAAACAGCGACAAAAGTGCTGAGGATGACACAAGCTGTGATACG ACGATCATCTCTGTCGTTTTGATGCTGAAGAAGTCCTTCCTCCATGCTTCTATTCTCCTCCTCC ACCACCATTCCTAAAGACTAATCCTTCAATCCACCTTATTTTCTCCCAAGAAAT |