Splice junction sequence |
GCCTAATGCAAAGAAAATGCGTCTTGGAATTTCGGCTGAAGTTATCACAGAACTCACAGATTGT AATGCTGCTCTTTCTCAGCAGCGTAAAAAGAGACAGgaatgggacagtttgatgctatcaaatt ttgctttggaacaacaactgcatactgcgaggcaagagctaagtcacgctttgtatcaggtaat tatggtta
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 351 Transcript exons: 1227580-1227666,1227816-1227957,1228046-1228167 GAATGGGACAGTTTGATGCTATCAAATTTTGCTTTGGAACAACAACTGCATACTGCGAGGCAAG AGCTAAGTCACGCTTTGTATCAGCATGATGCTGCTTGTCGTGTGATTGCTAGGCTTAAAAAAGA AAGAGACGAATCACGACAATTGCTTGCAGAGGCTGAAAGGCAGTTGCCTGCAGCCCCCGAAGTT GCCACATCGAATGCTGCTCTTAGTAATGGTAAACGAGGTATCGATGATGGTGAGCAGGGGCCTA ATGCAAAGAAAATGCGTCTTGGAATTTCGGCTGAAGTTATCACAGAACTCACAGATTGTAATGC TGCTCTTTCTCAGCAGCGTAAAAAGAGACAG
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Genomic sequence |
GAATGGGACAGTTTGATGCTATCAAATTTTGCTTTGGAACAACAACTGCATACTGCGAGGCAAG AGCTAAGTCACGCTTTGTATCAGGTAATTATGGTTAGGTGCATTTGCCACCACCTTATCAGACT ACATGAATTACAAATATCTATTATGTATTCTAGTTTCTTTTCCTGGATGTTTCCATTTATTTCT TGTGATAAAAGGTGATTGATGGGGGATACACTTTTCCTTTGCAGCATGATGCTGCTTGTCGTGT GATTGCTAGGCTTAAAAAAGAAAGAGACGAATCACGACAATTGCTTGCAGAGGCTGAAAGGCAG TTGCCTGCAGCCCCCGAAGTTGCCACATCGAATGCTGCTCTTAGTAATGGTAAACGAGGTATGC TTGCACGTTTGCTTCTCAATGTAAGTTGGCTATGTGGTAATTTCTCTTATAACAAGCTACTATG TTTTTGGTTGCAATATAGGTATCGATGATGGTGAGCAGGGGCCTAATGCAAAGAAAATGCGTCT TGGAATTTCGGCTGAAGTTATCACAGAACTCACAGATTGTAATGCTGCTCTTTCTCAGCAGCGT AAAAAGAGACAG |