Splice junction sequence |
GCACGTAAGAGACGTAGAGAACATACTTGTTGGAGCATCAAATGATTTCCTCCAAAGAAATTGA TTAGATTGGGAAGACTAGTGTCTCGCGGCTGAATAGtagttttaattgttcagggtttgactca aaccgtttgagagcttggtgtttacttgcaaccacattcttggattctctaacacaaggttgta aggctgaa
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 163 Transcript exons: 15517280-15517360,15520934-15521015 TAGTTTTAATTGTTCAGGGTTTGACTCAAACCGTTTGAGAGCTTGGTGTTTACTTGCAACCACA TTCTTGGATTCTCTAACGAACATACTTGTTGGAGCATCAAATGATTTCCTCCAAAGAAATTGAT TAGATTGGGAAGACTAGTGTCTCGCGGCTGAATAG
Transcript length: 197 Transcript exons: 15517280-15517390,15520930-15521015 TAGTTTTAATTGTTCAGGGTTTGACTCAAACCGTTTGAGAGCTTGGTGTTTACTTGCAACCACA TTCTTGGATTCTCTAACACAAGGTTGTAAGGCTGAATATCGTGTGAATAGAGAACATACTTGTT GGAGCATCAAATGATTTCCTCCAAAGAAATTGATTAGATTGGGAAGACTAGTGTCTCGCGGCTG AATAG
Transcript length: 199 Transcript exons: 15517280-15517396,15520934-15521015 TAGTTTTAATTGTTCAGGGTTTGACTCAAACCGTTTGAGAGCTTGGTGTTTACTTGCAACCACA TTCTTGGATTCTCTAACACAAGGTTGTAAGGCTGAATATCGTGTGAATCAGATGAACATACTTG TTGGAGCATCAAATGATTTCCTCCAAAGAAATTGATTAGATTGGGAAGACTAGTGTCTCGCGGC TGAATAG
Transcript length: 207 Transcript exons: 15517280-15517385,15520915-15521015 TAGTTTTAATTGTTCAGGGTTTGACTCAAACCGTTTGAGAGCTTGGTGTTTACTTGCAACCACA TTCTTGGATTCTCTAACACAAGGTTGTAAGGCTGAATATCGTGGCACGTAAGAGACGTAGAGAA CATACTTGTTGGAGCATCAAATGATTTCCTCCAAAGAAATTGATTAGATTGGGAAGACTAGTGT CTCGCGGCTGAATAG
Transcript length: 1593 Transcript exons: 15517280-15521015 TAGTTTTAATTGTTCAGGGTTTGACTCAAACCGTTTGAGAGCTTGGTGTTTACTTGCAACCACA TTCTTGGATTCTCTAACACAAGTGGCATAAGTTGCTGGAAGAACTTGCACGATAGAGTAAAACA AGAATATCAACTAGCCACGAACTCCTACTTCTTAAAAATGGGTGTGTTCGGCATTCTAAATCAA TGTCACAAAGGAGACAAGCGGTAAGAACCACCAAACCCCATTGACGAAGATGGTCTCCTGGAAG ATTTGGCACGTAAGAGACGTAGAGAACATACTTGTTGGAGCATCAAATGATTTCCTCCAAAGAA ATTGATTAGATTGGGAAGACTAGTGTCTCGCGGCTGAATAGTAGTTTTAATTGTTCAGGGTTTG ACTCAAACCGTTTGAGAGCTTGGTGTTTACTTGCAACCACATTCTTGGATTCTCTAACACAAGT GGCATAAGTTGCTGGAAGAACTTGCACGATAGAGTAAAACAAGAATATCAACTAGCCACGAACT CCTACTTGAGACAAGCGGTAAGAACCACCAAACCCCATTGACGAAGATGGTCTCCTGGAAGATT TGGCACGTAAGAGACGTAGAGAACATACTTGTTGGAGCATCAAATGATTTCCTCCAAAGAAATT GATTAGATTGGGAAGACTAGTGTCTCGCGGCTGAATAGTAGTTTTAATTGTTCAGGGTTTGACT CAAACCGTTTGAGAGCTTGGTGTTTACTTGCAACCACATTCTTGGATTCTCTAACACAAGGTTG TAAGGCTGAATATCGTGTGAATCAGATAAGGAATAACTATTTTAACTTATCTTGAATCAATATA CAATTATATTAATCGAAATAAGCTAGAGAAAGGTTTATTTGTCTGTGGTATAAGCAGTGGCATA AGTTGCTGGAAGAACTTGCACGATAGAGTAAAACAAGAATATCAACTAGCCACGAACTCCTACT TCTTAAAAATGGGTGTGTTCGGCATTCTAAATCAATGTCACAAAGGAGACAAGCGGTAAGAACC ACCAAACCCCATTGACGAAGATGGTCTCCTGGAAGATTTGGCACGTAAGAGACGTAGAGAACAT ACTTGTTGGAGCATCAAATGATTTCCTCCAAAGAAATTGATTAGATTGGGAAGACTAGTGTCTC GCGGCTGAATAGTAGTTTTAATTGTTCAGGGTTTGACTCAAACCGTTTGAGAGCTTGGTGTTTA CTTGCAACCACATTCTTGGATTCTCTAACACAAGTGGCATAAGTTGCTGGAAGAACTTGCACGA TAGAGTAAAACAAGAATATCAACTAGCCACGAACTCCTACTTATCGCTGCTTGACATTGTTTGA CAATCCACTGGTCGACTCTCTTCACACAACTTACAATGAGCTCAAGCTTAAAAATGGGTGTGTT CGGCATTCTAAATCAATGTCACAAAGGAGACAAGCGGTAAGAACCACCAAACCCCATTGACGAA GATGGTCTCCTGGAAGATTTGGCACGTAAGAGACGTAGAGAACATACTTGTTGGAGCATCAAAT GATTTCCTCCAAAGAAATTGATTAGATTGGGAAGACTAGTGTCTCGCGGCTGAATAG
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Genomic sequence |
TAGTTTTAATTGTTCAGGGTTTGACTCAAACCGTTTGAGAGCTTGGTGTTTACTTGCAACCACA TTCTTGGATTCTCTAACACAAGGTTGTAAGGCTGAATATCGTGTGAATCAGATAAGGAATAACT ATTTTAACTTATCTTGAATCAATATACAATTATATTAATCGAAATAAGCTAGAGAAAGGTTTAT TTGTCTGTGGTATAAGCAGTGGCATAAGTTGCTGGAAGAACTTGCACGATAGAGTAAAACAAGA ATATCAACTAGCCACGAACTCCTACTTGTAAGTTGCCATTTCCAAATCTCAAGATAATTCTATT GGATCGGACAATTTGCCTTTGGTTATGTATGTATTGCTGGTCTTGTATACATTTGCACTGATGG AACACTGTTATTTGTAAACCGTTTTGGATTTTGTTAGCTTAAAGCACCGCAATCCGTAGCTGTG AAAAAATGTGAGAGATCAAGTTCTAGAGAAAAACCAAAAGCTAAGCAAGATTCAGATTTGTGGA AGTAAAGCTTTTGCATGATAATTCAATAAAATCATATTCAGGTCTTGGTTTCTTTCTATGGTTT GGAACTTATATAGTATGTTCTACTAGTTTTTGTTGTCTTCTCAAATCGGACGCAAATAATGTCT CGGCGTGCCTCTCTTATATGGATACACCATTCTGCTTATTTCAGATCTATCGCAATGGAGCATT AAAATGGTCGTGCGTCATATTTGCGTATGTTTCTTCAATCTTTCTTATTTCTTTTATGCTTAGT CTTTCGACTTACTTTCTCTTCTCTTCTTCAGACGTAGAAGATTATATTAGTCTCTCAAAAACAA ATATTTTGTTTGAGTACTGTACTGATCAAACACCCATTGGTTTGCTTCACTTTTCACATTTCAT TTTACTTTGATGCAGCCATTCGAGTCCAAAGTCAAGATCTATTTAGAGCAATCAAAATACACAT TTTGAAAAGAAGTAATTGTTTAATTTTGTTATTGAGAATTTACTTGAAGTTTTGTGTTTTCTTG AATTGGGAATTTTTTTTTTGCAGGTCTTCTTTCATCCTTGCACGGTGAAGAACAAAGACTCTGC TTCCCTTTCCAGGTTTCACTTTGATTTTTATCAGATATTTGTCTTTGTGCTAATATATGGTTAT GAAGTTCTACTGTTTCAGATGGATTTCGTTAATAAGTGTTCATGGGATTAATACAACAATCTTC AGCATTAATACAATTTTTCTTTTCTTTCACTATAAAGGATTCTTATTCGTTTGGTTGTTGAAAG ATACCAAGAACTCTCATCAAAACTAGAGTACAATTTTCCATTGAAGTAGCAAGAGTAGATCTAT GGAGGTGCTTTCCAGGCATGTTTTTACTATAACTTAATTTCATTTGTTTGATCCAACTTCAAAG CTTCATTGCTATAACTAATTTTTTCAAAACATTTCAGGATTTTGAAGTAACGTGAAGCTGAATA TTGAAAATATGCAAAGACAAAAAGGTAACATATAGTTTTGACATGATATCTCTAACGATTATGC CACTTACATATCCATTAATTAGTATTCAATAAGTAACTTTGCATCCGAAACGTATATAACCATC CTAGTACTATGTTACAACTTCTTAACTAACAATTGGAGTTCAGGGTGTAAAGAAAGATCAATCC TTTTATTTGGGATGCTTACTGTCCCTTTTCGGTTCGAATTACATAGTTTCAATGAGCGTCCAAG AAATTTGATTGGGATTTTCGCAGGCTCGAGCGGGAATCAGGGAGGTTCACTTCCATTGACTTAC ATCGACAGCAGAAGGCAGTAGTCAAGGTGCTCTCCTGATTAGGTGATGAATCTTCAACCTTACC AACAAATGTCTTTTTTACCCTTTCTCTTTATACTAATTTTATTTTCCCAACAATGACCTTATCA AAAAGGTGGTGCTCTCGATAATTGACAAGTGTGGTCTTAGGTTGTTGGCTGTTGCTCTCGTTTG ACATCGATACTCATAGTTTCAGTCTTCTTTTGTTTTTCTTTACTGCGTGGAAACAAATGTTCAT TTGTTAGTGTTTTTATTTCCCTCCTTAGGTGGTGCTAGAGAAAACGAAGGAAAGCCTAGGTGCA TGGTGCAACATATGGTAATTTGTTGGATTGTTGCCCCCAAGACATGAAAGTACTGAAACCATTG GAAGGGCTTTGACTCTCGGTGTTAACATCAAGATGATCACTGGTGAATTTGCTCACCCATTGAT CGTGTTGTAATAATAATACACCTTTGCCATTTTCCACTAACATTCTATTGGACGACGTAGGCCA GATAACCAGTTGTAAACTTGGAATGGGAATAAACATGTATCCATCTTCGGCTTTTCTTGGTACG CACAAGTGGTAGGAACCAACAAACCCCATGGATGAATATGTCTCTCAAGTCTCAATGGTACATG TCATGAATATCTTTCAGTTGTCTTTGCGAGAACCAAATTGTCCTAAAATAGAGTTTCTGACACA GGTTGTAAGTTTTGTCACGTAAGAGACATGGAGAACATACCTGGCAGAGAATCAAGTGAATTCC TCCAAAGAACTGATCAGATTAGAAAGAGCTAGTGTCTTGCGGCTGAATAGGTAAACATTCTTAG AATAAAACTACTAGCAAATTGGAAATATGTTATACCCATCTTTCTCAGATTTTTTCAGAATGGG AGATATGTAAAGGAAGGAACAAATACTTTTGACAAACTATTTAGGCCATCGTCAAAGATTTTGC AACATACACATCCATTAATTAGTATTCAGTAAGTAATCTTGCATCTATATAAATAACCAACCTA ATACTTTGTCAGTAACAATCTCACTAAATGTTTGTATAATTGTGTATGGTAGGTAGACAGTGGA AAGAAGTGTCTAAAGGAAACTTGAACCCAGATGTCTGCATAGAGGTAAATCCACATAAGATCTC ACACCCTCGGCCAAGTTCACATCACACATTAGAATTATAGAACCTTGGTAAGTAGAATAAACCT ACTTAACTACCTATGATAGTTTTCAACTTAAAATCTGTGTGCATCGTGATTGAATTCTATAAAC TCAATTTGATACATGCCAAAACGTTGATGTGAAATATGCAGACGTGTCTTTATTCGGTGGAGCA TGGAATTCTTCTCATTGTAGATCGCTGCTTGACATTGTTTGACAATCCACTGGTCGACTCTCTT CACACAACTTACAATGAGCTCAAGGTAGGTTAATGAACTCGAGCTATGATTGTTATCAGCTTCT TGCATATCCACATATACATCAATAAATTCCTTCATTCGTTGAACATATGTAGTTACAGAAAGAA TGCAAGAACCAGAGTAAGAAACCGATTTCTGGAAAAGATAATTCAAAGAATCTATACAGGTATC GTATCTTCGTCTGTAGAGATTTAATATTTTGACTTTTCTCTTATAGCTTAAAAATGGGTGTGTT CGGCATTCTAAATCAATGTCACAAAGGAGACAAGCGGTAAGAACCACCAAACCCCATTGACGAA GATGGTCTCCTGGAAGGTAACTGTCCTAAAACAGAGATTAGCATGTTTCAGAAGTTTTTGTGAG AACCTTACTGTCCTATAACAGACAATTTATTTTGCCACATGTTGTAGATTTGGCACGTAAGAGA CGTAGAGAACATACTTGTTGGAGCATCAAATGATTTCCTCCAAAGAAATTGATTAGATTGGGAA GACTAGTGTCTCGCGGCTGAATAG |