Splice junction sequence |
CCATCTTTTTTTGTTTTGCTGTTCGAAAAAAGTTCACTTGTCATATGGAGCAGCCTTTCCCTCG AGTGGATCCTCATGCTAAGTTGCAATAATTAGCCCAgtgtcgatgtcaagaagaatgttattgt agccattacctctgacaagggtctttgtggtggtatcaactcaacgtcagttaaagtcagcaaa gcactcca
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
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Transcript length: 308 Transcript exons: 8693803-8693916,8696351-8696453,8696880-8696970 GTGTCGATGTCAAGAAGAATGTTATTGTAGCCATTACCTCTGACAAGGGTCTTTGTGGTGGTAT CAACTCAACGTCAGTTAAAGTCAGCAAAGCACTCCACAAGTTGACTTCTGGAGAATGCATGCAG TGAGCTTGGAGCACGTATGTCTGCCATGGACAGCTCCAGCAGAAACGCTGGTGAAATGCTTGAT CGACTCACCCTCACATACAACAGGTTTTGTTTTGCTGTTCGAAAAAAGTTCACTTGTCATATGG AGCAGCCTTTCCCTCGAGTGGATCCTCATGCTAAGTTGCAATAATTAGCCCA
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Genomic sequence |
GTGTCGATGTCAAGAAGAATGTTATTGTAGCCATTACCTCTGACAAGGGTCTTTGTGGTGGTAT CAACTCAACGTCAGTTAAAGTCAGCAAAGCACTCCACAAGTTGACTTCTGGTAATACTTTGCAT GGTTATTTTTGTTATCATTTAAACATTAGAAGATACTAAAACAAAGTTTTTGCACCTCAAATCA GGACCAGAGAAAGAAAGCAAGTATGTCATATTAGGAGAAAAGGGTAAAGTTCAACTCATTCGTG ACTCCAAGGATAACATCGAGATGACAGTATCTGAGTTGCAGAAGAACCCTATCAACTACACACA GGTATGTTGTTTTCCTGAGCTTTTACTATGCTATGGGTGCACCTTTTATTATGAAATGCTATTC ATTATTTGTGAATTTGTTTCTGAATTAAGTCTAAAGTTTGGCAATTGAAAACTGTTTTGTAGTT TCTTATATTGTCAGTGAATTTTGCTCTCGAATTTTGAATTTTGCAAGAGAAGCATTCCTAATGT AAAAGGAATTCTGTCATGTCACATTGGACTTCTGATTTGGAACACATTTCAATTTGTCAATGAC TAATCTCTGTTATTATAGCCAAAATATATATACTGATTTATCAATCTAAAATTTTACCAAATCA GACTCACTTCAGCCCACTCCGACTGTACCTTCCATTCCTTTTTCTCCATACTTTCTCCTGTTGC TGGCAAGCTGGGGCTAAGACTTGTTACAGAAAATCACTCTTTGAGATACTCGAATGAGACATAG ACATGATTGATCATCAAATGATGTGTTCCTCTTGTGTTTTAATAGTAACACTAGTTAGGGACTA GGAATAAGGCAATGATGTTGGAGCTATTGCAAGCAATGAGGCAGGGGAAGGGAGCCTGGTGCCA TCTTGGGAGGCTCCCTGTTTCAATATTTCCTTAAGCCAGCCACCACTACCTGGGTTCTCTAAGG CTGTCACCTGTCCTGTCCTGCTGATGTGTCCACCTGTGCCACTGAATCACAGCTGCTATGTTGG GGGCTGACACAGCTGCCATATTGGATCTGACTTGGTTTTGCTGGCCCTAGTTGGTGGGGAAAAA GGTCTGATAAGGGGATGGAGCATCAACCTGTGCTGAAAAAGTGGGAGGAGGGTACGGTAGTCAA GTTGCATGGCTAGTCATGGACCAATTGACAAGTCAGCCACAGAGCACGACTTGAGGGCTACAAT TTGATTTGGGAAACTTGGAATACGAGATAAGAGGAGAGCTGTTCAGTTTTCTCCTCCATATATG ATTAGAGGTAGCCACCGGAGTCTGAGTAAGATTAGAGGGAGCACCAATAGTTGCACACCTGCTT TCCTCATCTGCTCCCTGTTTTTTCTGACCTCACTTCTAATGTACCAACTCAAAGGCTTGTCTTT GACTAAGTCATGATTAGTCCTCAAGTTGGTTTAGGTCTTGAGGGATGACTAGACTGACTGTGCG ACTAACAACCATGGCTGAAGAATAGCACATCGGCATGGAGAAATGTGAAATATAGTGATGGATC TCATTGCTGTAGGATAAGGAATGGCACTGGTGGTGGCGCAAAGTTGTGCAGTTAGCAGAATTAG TTTCAGCTGTGTTAATTACGTTGCAGCAGAAGTTCACGGATGTGGTATATTTCAATGAAACAAG AGAGGATTATGGTACTAGATGATGTGTGAGAAGAAAGTGTTTTTTAGATTTAAGCTTCTAGTTA TGCTGTAGGTTGAAATATCTCATTTTCCTTTGCAAAGAAAGATGATCTGGATCATATTCATCTT TTGTTATGTGTGCACGCATTGCAATATATCATAGCAGCTGGTATGATTTGAACAAAATTTGCTA ACAAACCCTGAACTGTAAAAAGTCTTATGTTGTCTGACTTCCTTGAAATGTCTTCAGGGAAGTT TTTGTTCAGTCGATTATTATTTGGTGGCTAAAGCAGATTTCAAAAACCTAATGTGCCTATTGGA TTGAATAGATCTCCACTGTTTTCTTTGATGATGTTTCAGATTGCTGTGCTGGCAGATGATATCT TGAAAAATGTTGAGTATGATGCTCTAAGGGTTGTTTTTAACAAGTTCCACTCGGTCATATCATT CAAGCCCACAATGACAACCATACTTTCCCCAGAGGTAAATATCGGTGCTGAGGACATGAATTTG TGCTCCTATAAAGTAATATGAATGATGTGACGTTAATACTAGTGGTTTGAATTGTTTTATAGGT TATGGAGAAAGAATCGGAATCTGGTAAGGTTGGTGACCTGGATTCATATGAAATTGAAGGAGGT GAAACTAAATCAGAAATTCTTCAGAATCTTACCGAGTTCCAGTTTTCTTGTGTAAGTTTGTCTT CATTAATCATATATACCTCTCAATAGATGAATTAGCTACAACTATTACAGCCACAAAATCAAGT CGCATCCATAAGGGTAAACGTTCCCTTTGTAGAGAGCGCAATCATTCTTTTTTCAAGGTATCCT AGTGGTATCTTATGTTTTTGCTTTGTGGCAGGTTATGTATAATGCTGCTCTAGAGAATGCATGC AGTGAGCTTGGAGCACGTATGTCTGCCATGGACAGCTCCAGCAGAAACGCTGGTGAAATGCTTG ATCGACTCACCCTCACATACAACAGGTATGGTCGTCTTACCTTCTCCATCTGTTTATGTGTGTC GACTGCATAACGGTCGGAAATGGTCGGAAACGGTATCATTATTTTATTATTTTCTCGAAACGAA CGGAAACGGTCGGGAAATTTCCATATTTATGAATTTATCTATTTAGTGTCAACTTCAATGCCAC GCCGACATAAATTAAAAAAACTAAATTTTGAATACGGTAACCATCGGTTAAAATATTATTATTA TATTAGTTTTGCGGAAATGGTATCGGTACGGTCGGGAAATTTCCATACCGTTTTCACCCCTATT CACATGAAAGAACTGATACATTCGATTTCATCCCCGCAGGACACGTCAAGCATCTATCACTACA GAGCTCATTGAGATTATCTCTGGCGCTTCTGCCCTTGAGGGATAATGATGAAACTTTTGCCCAT CTTTTTTTGTTTTGCTGTTCGAAAAAAGTTCACTTGTCATATGGAGCAGCCTTTCCCTCGAGTG GATCCTCATGCTAAGTTGCAATAATTAGCCCA |