Splice junction sequence |
GCTTGTCTGTGCAGGAAAACTTGATCCATGACGACCAGAAACTGATATTGTTGGCTTCTCTTAG TGACTCATTGGAATATTTAGCAGATTCAGTTGAAAGgtccagcagcatttagaccacgtgtaca tgcaacatcagcatatagttcatcggtggaacttggacgccctgtgcttcaagggcttctcgcc attgatat
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 499 Transcript exons: 179027394-179027506,179027598-179027705,179030437-179030 628,179031451-179031536 GTCCAGCAGCATTTAGACCACGTGTACATGCAACATCAGCATATAGTTCATCGGTGGAACTTGG ACGCCCTGTGCTTCAAGGGCTTCTCGCCATTGATATAATAGCCAAAGAGGTTCTTGGATGGGTT CAATTGATGCCAAACTATGCGACTGAGCTTGTGGAGTATGTACGCACATTTTTAGAACGTGCTC ATGAGAGATGTCGTGCATCATATATGGAGGCTGTCCTTGAAAAGCAAAGTTATATTCTCCTTTC AAGGAATGACATTGAGAGTTTAATGCGCCTGGAACCAGCAAACATTTCTTTGCAAAATTCTACT GGTGAACATGATAACAATGCAACAGGTGCAGAGGCAGTCGAAGTAGAGATTGAACTAAGTGATC TCTTATTAGATATGTGCCCAATAAAACAGGAAAACTTGATCCATGACGACCAGAAACTGATATT GTTGGCTTCTCTTAGTGACTCATTGGAATATTTAGCAGATTCAGTTGAAAG
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Genomic sequence |
GTCCAGCAGCATTTAGACCACGTGTACATGCAACATCAGCATATAGTTCATCGGTGGAACTTGG ACGCCCTGTGCTTCAAGGGCTTCTCGCCATTGATATAATAGCCAAAGAGGTAGTTTCCCCGCCC ACCCGCCCAAAAAATCTTGTCTATTCCTTCTAATTTTGATTTTATTTATCTGTTGAAATTTCTT CCTTCTTCCTAGGTTCTTGGATGGGTTCAATTGATGCCAAACTATGCGACTGAGCTTGTGGAGT ATGTACGCACATTTTTAGAACGTGCTCATGAGAGATGTCGTGCATCATATATGGAGGTATTTGA TACACTTTGTTTGAGATATGTATAGACATGTATATCTTTGTACTCACCTTATTTGTACACCAAG CCATACAACCTATATAAATATATAATGGAAGGTGAACCCCCACACAATGGGTGTGTGGTATTTT CCTAATTCTTTACATGGTATCACGAATCCGGCCCTAACCCTGGATCCTCTCCTCTGTAGCCCCA ACCCCTAGCCGTCGGCCCTTACCCTAGGGCTTCGTCGACTCCCTCCCCTCTCTGTTCGTTGGAC AAACCCTAGGGTGCCAGGCTGCCAGCGGCCTCTCCCTCCACCCTGCTACATCTCTTGTCGAAGC CGCTAGTCTTCTCTCATGGGTACTAATAGTCGCTGCTTCTCCTCATGGTCGCCCTTGGTCTGAT GGTGTCACCAAACTCTCGCGGCTACAGCGGCGGGTAGCCCCCTACGCATGGGCAGGTCTGCCCC AACGACCCTTGGTTTTGCTTCAACCCCGGTCCCCCCAACCTGGCACCGGTGGCGGCAGAAGATG GCGTCCTCCCACAATCGACCTTCTTGGGGTAGGTTCTCATGCCAACACCAACTTCGCTCCACTT TAGGTGCCCCAACCGTTCCAGGCGGGGGATCAGGCAGGGCTGGTTGCTCAATTAGCTCTCTGTA GAACCCTGGGTCATGGGTGATGGGCTCTGGTGCCTCCAGCCATATGACGTCTGATGATGGTATA CTTCTCTCTTGCCATCTCCCCTCTCATCTTTCCATCACAGTTGAGCAGCCAACCTCAGAGGAGG AGGTGTGGAATACCATCAAACAGCTTCCTCCGGACAAAGCCCCGGGGCCTGATGGGTTCACAGG TCGTTTCTATAAGGCCTGCTGGTCAATCATCAAAAAAGACATTATGGCTGCTATCCTGGCTGTC TGGAACAAGGACTTCCGGAATTTCAGATACCTCAACACAGCCTTCATCACTCTTTTACCTAAGA CAGCATACCAACGTTTCTTGGCTGGTTCTGTGGATTTTGAGCCGGGTGAAAGGATATGGAAGAG TTGGGCGCCCCCTGAGTGCAAATTCTTCATCTGGCTTGCTTCTCTTAATAGGTGCTGGACGGCG GATCGTCTAGCACGTAGAGGTCTTGACCACCCGGGGAAATGCGTTCTTTGCGATCAGCAGCAGG AGACAATTCAACACATCTTGATTTCATGTGTCTTCTCCAGGAATATATGGTGGCAGATCTTAAG TAGAGTGGGGCTGCAGCTTGTGTCACCAGGGCTGGAGGTATCTATGTTCCAAGATTGGAGTGTG GCTGAAGGTCTTGTGCCAGTTTTGCACAGAAATGGGTTCAACACATTGGTTATTCTTGTGGCTT GGTGGATCTAGAAGCACAGAAATGCTTGTGTTTTTTATGGTGTTTCTCCAAACACGAGTTCAGT TCTACAGCATATCCATGAGGATGCCAGGCTTTGGGAATTGGCAGGTGCTAAGGCCCTGAGAAGG TTGTGGCCTTGATTTGGGGATGTCTTAGTTGTTTCCCTAGGAGTGGTGGTAGTTTCTGTTTGTG GGGTTGCTCTATTTTCAAGGCTCCTAAAGCCTCTTTCCTTTTTTGTATAGTCCTTTGTTTCGTT TGTTTTGGTTTTTTCCCTACTTTCTTTGGGTATTTGTCACCTTGTACGTGGTCTTCTTTATACC TTTTCTCTCTACTTAATATAATGATGCGCAGTTCTCCTGCGTGTTCGATAAAAAAACAATTTGT GCTGAGTGCTGACAGATGCTCGTTCCTTGTTAGCTAATTCCGGCCGCCACTTCCTCCTAGCTAG CCTTACCTGCAACCAGCTACTAGTAAACAGAAGCTACTAGCTAGCCTAAGGATTGTTTATCTAT GCACTGAATGCTAGGACGACGACTCGACGAGTTGATCATTGTCCTATTGTGGTTTGCTGCATGC ATGCAAGCCCATGGCCCTGCTGGCCGGCCAGCCGGCGGCCGAGTGGTGATGTGGAGATGGGCGG CGCGAGTGGCATGGAGGGAGGCAATGTGATGGGCGGCAGATGCGCAGAGCACATGTGATGGCGG CGCGCCTAGCTGCTCAGGTTTTGTGCGTAATGGGCTACTGGCGTTCGGGTGGGCTCAACTCTCG GCTCATCGGCCGGACCTCAAATGAGTTATTGCACTGTGGCGAGTTGTTCCCGAATTGCCAAATG CGGAACAAAAAACGGGATCATCCCGATTTAAAACGGGATCCCGGTTAAACGGTCAGGAAAACAG CTCTACCGTTTTAGTTTTCGATTACCATTTTTGCATCCTGATTTCGTTTTTTAAAATCGGGTTC GAAAACAATCGGGACAAAATTAACAAAATCAGTTATACGATAACGGTCTGTTCAGGATTTTCCC ATCCTACTTTCATCCCTAGATATATTATGCAATCGTACTGCCATGTACCTTTGTAAAACAATGA CACAGCTCTCCTGCCTGTTTGAGGAAAACAAAGTGATACATTATGCCAGCTGAGCTAGCAGACT CTGCCTTGGGTTGGGATATTTCAACTCTGTCAGTTCCGCTTCCGATATTTTTGATAGTTCTATT TCTGGAATTATATTTTTATTCCAGTTTTGAGAAGAAAAAAAGAGTCTGAAAGTGGTTTAAGGCA CAGATGGACTCCAATTGTTATCACCCTTACCCATAAGTACACTGTTTTCTTGTGTCTCTTGCAA GTTTTTGATTCTTGTATTATATGTGAAAATTGTAGGCTGTCCTTGAAAAGCAAAGTTATATTCT CCTTTCAAGGAATGACATTGAGAGTTTAATGCGCCTGGAACCAGCAAACATTTCTTTGCAAAAT TCTACTGGTGAACATGATAACAATGCAACAGGTGCAGAGGCAGTCGAAGTAGAGATTGAACTAA GTGATCTCTTATTAGATATGTGCCCAATAAAACAGGTATTTTTTTATTATTTACAAATTTGTGA ATACTTTTATTTGTGTTGGTAAGTTCTATTCCTATATTTGTTTTATTTTGAATTTGTATGATAT TTCATTTGAATCAATGACCAACCATGTTGTCGTTCTTCAAGATATACTGGACATTTGATAATTG GTTCAGCTGTTTCTTTTGTCACAATTTCTTGATTGTGTCTGCAAAATGTAATAATGTAATTTAA AGATCTGGTTTGTATATGTTACAGCCAAATATAGAATCAATATGAGCCTGTTTTGTTTTAGCTT GGCTCAAGTGGCGTACTGCCTTCAATTTGTTTTTTCTCACTAGGATTTTAAAGAAATCGAAGCA GCGCAATGGCTGTGTATTTGACAATAAGAGCCCCAGTATTGCTGATGCTATTAGAAGAGTTGGG TTGGAGGTTGACCTTTGGGAGATGGCTGGTGCAAAGAAGTTGTCTTTGCTCACCGCCCCCATTC CGGGCCTCCCTGCTAGTTAGCTAGCATTGTGGTAGTTCTTATTAGTTTTTTAGTCATGGATGAG TTTTTGTATGCCTGTTATTGGCCGCCGTAGGGGCCTCCAGTTTGTTCTTGTATCTGACCCTCTT CTTTAATATATTATCGCGCAGTTCTCCTGCACTTTCAAGATTTTTTTTTAAAGAAATCGATACA ACACCCAAATAGAAAAATAAGGTCAATAACTGTACAGACTGGAAAATGACATGCAGTTTAATGC CTTACAGCGACAATCTGATGTTAGTTATCAATTTGTAAGACATTCTGTGTTGCTGCTTGTAACT TCTGTGCGTGTGCTTGTCTGTGCAGGAAAACTTGATCCATGACGACCAGAAACTGATATTGTTG GCTTCTCTTAGTGACTCATTGGAATATTTAGCAGATTCAGTTGAAAG |