Splice junction sequence |
TCATTTAATGGTAGCCTATAAGGGAAGGAAATTTTATTATCCAGCCAAAGGTTGATTTTGACAT TAGTGCCAGCACTGTCGCAGGACTTCTTAAGCTTGGgtggccctagtggatcaggcaagacaag tttagctcagaagatggccaatataattggttgtgaagttataagcttggagagttattataag cctgaaca
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 820 Transcript exons: 11878215-11878372,11879008-11879118,11881204-11881272,11 881402-11881545,11881669-11881743,11881818-11881994,1188 2086-11882171 GTGGCCCTAGTGGATCAGGCAAGACAAGTTTAGCTCAGAAGATGGCCAATATAATTGGTTGTGA AGTTATAAGCTTGGAGAGTTATTATAAGCCTGAACAAGTTAGGGATTATAAATATGATGAGTAT AGCTCATTGGATATAGGTTTGCTTACTAAGAACATTATGGAGATCAGAAAGAATCACAAAGCAG AAGTTCCTTGCTTTGACTTTGAGAAGTGCAAAAGAAAGAAATTCGAGGAGCTTCAAGTCTCTGA GGAATGTGGAGTGGTAATCTTCGAAGGTGTCTATGCTTTGCATCCTGCTATAAGGAAATCACTG GATTTATGGATTGCAGTTGTTGGTGGAGTACATTCTCATCTTATTGCAAGAATACAGAGAGACA AGAATCGTGCAGGCTTTTCTATTTCTCAGAGTGAAATTATGACTACCGTGTTTCCGCTATTTCA GCAATACATAGAACCACATCTTATCGATGCTCATCTTAAGATTCAAAATGACTTTGACCCTGTG CTCTCTCCTGAAAGCTCACTTTTCGTACTAAAAAGTAAAAAACAGGTATCTTATCAAGACATAT TGAAAGTACTCGATGCTAGTAAAGCCTGCAGCTGTGTCCAGAATTTTACTGATGTGTATCTAAG ACTTCCTGGCATACCGTTGAGTGGACAGCTGACAGAAGGCGAGTGTATTAGGGTCCGAATATGT GAAGGAAGATTTGCACTGTTAATACGAGAGCCTATAAGGGAAGGAAATTTTATTATCCAGCCAA AGGTTGATTTTGACATTAGTGCCAGCACTGTCGCAGGACTTCTTAAGCTTGG
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Genomic sequence |
GTGGCCCTAGTGGATCAGGCAAGACAAGTTTAGCTCAGAAGATGGCCAATATAATTGGTTGTGA AGTTATAAGCTTGGAGAGTTATTATAAGCCTGAACAAGTTAGGGATTATAAATATGATGAGTAT AGCTCATTGGATATAGGTTTGCTTACTAAGGTGATTCCTTTTTATATTGATTCCTTTTCTGTAT TATCATGTGAATTACAAATTCCTGTGCATAACTACTAGAATCTTAAATATTTCAAGCATGCTTC CAAATTTCTATCTTGTTCTAAAAGTCGATGCAAGGCGCCGCCTAGGCACTTGGTAGCTGCCACG ATTAGGCATTAGATAGTGCATTAGGAGGCTAACCTACTTTGGGCGCTATTGTGTTGCTATTTTT CTCTATGTAATATGCTTGATAATTTCTTGGATTCTATGATTGGTATGTCCTAGGTGCCCGCTAG GCACTAGGCACCAGCTCTGCTGACCCTCTAGCACCTAGCGCCTTCTTGAACCATGTTTCTATCT ATACGAGATCACTTGAATTTAGGGTTCAAAATCTGGTGGTGAACAACCACATTACCAGATAATT CTTGTATTTACAAAACTGATTTTAATTCAACAGAGACAGAAAATTATTATGTGACATTAATTTG CCAGAAATATGTATTGGTTATATTAAGCATTCAATAGTGGTGATAAAATTATTCTTACTCCACA GCATTTTGCATGCTGCCTTTTCTTTTCTGGAATCATATGGTTGGGTTCTATAGTGCCTGTTAAA TGACGATTCTCTTATCGCCCCGCAGAACATTATGGAGATCAGAAAGAATCACAAAGCAGAAGTT CCTTGCTTTGACTTTGAGAAGTGCAAAAGAAAGAAATTCGAGGAGCTTCAAGTCTCTGAGGAAT GTGGAGTGGTAAAATACATAACCATCTTTCTCTTTCATATTTTCATTGACATACATTTTGTTAT GGTTCAGAAGGGACCCAGTATTTTTCATTTCTGGGTAATATTCTTGGTTTGGTAACTACCATGT CACATATGGAGGGGGGTTATTTTTATACTACAATATTCGTTGTTGCTTAAGAAGCTGTAATCCC ACATGATGTAATACATACTATGTTACTTGGACTGTCCATTTTTCTGTCCCCTTTCTCCTCCCAA CTCATCATCTCCTTCACTGTCTATTGAAACCATACCTCTCCTCTTATGGTGTCCTAATACTCTA TCAGCCTTCCTCAATCACTTTTGACCTCACTAGGGATCACCATGACTCCATGAGAATGTACACA ATCAAGGTGTGCGAAAGCAGAATCTTGTGATGGAGTTCTTGGGCTACTTGGAAACATCAATTTA GCTCTGAGATCATTTATTGGGTTCAACAGAAGTCAGAATATCAGAGCACGCCGTTTGAGCAGGA TGCTGGTGCATAATAGAAAAAGGGCGGACCGGCTGACCTGCTTTGCCAGTCAGCTGGATACTGC AGGACTGGATGTTTATGTTGTATGCATATTTCCTTTGAACACATCAGCGTAGTAGTTTAGATGG CCATTGAAACAAGTGGGAAAACCATTTTTTCGCATATATTTGGAACACTGTGCTCTTGAGCCTT AGCAAGAGGCGTTTCTAGACCCAACGGCCATATCTTAGCTGGACTCCAAGAGAACTGCGGCCTG TGTGTTCTCAATAAGTTGCTGGAATTCCATCGGAAAACGTCTGTTTCTTTTGGTTCAATTGCGT GAACAATTCTTACAGTCAACCGAACCACTAAGGTTGTTGGTTCCGGCTTTTTCCAGTTTAACCT CTGGCCTGGACTGGTCTATTATACTATGTGCCGGTGGCGGCGTTCTCTGATTCACACCAAGTCA CTCTCTTTGGTGCTGTAAGGCGAGCATCCGCCTTTGTTCACTTGTATGGTGCTACAGGCACTAT ATTTTTCATTGTCTCTGGTGGGCAGAAGATCTTCAAAGTGTGATTAGGTGTCCTGTGGCCACTC TCAGATATGGGGTCTCACTGGTCATTTCATGATTAGCTTATGATGGTCCATAATGCCTTCCCCA ACCTTCGGCAACCCGCTTCTCTAGTTGGTAGTCCAAGGTGGTCAAGGAGACGAAGAAAGGATTG AACTCCTTGATTATCCTAGTGGCATGGGAAATTCGGAAGCACCAGAATGATTGTCTTCAATAAG GCCATGCCCAGCGCCGTGGTTGTCTTGCAAGCAATAGCAAGAAAGAGTGTTCTTTGGTGTACGG CTTGTGCCAGGGTTCTCAATGAGTTCCTGTATCGGTCACTTCCTTTGGTTGGTTAGCTGCTCCT AGGAGTAATCTGTTGCGCGTCGCTTTTTGTGATGCCTTTTTCTTTCTAGAGGGTTCCTTCTTCG TGGACCGCTTTGTTGTACGTATTTCTGCTTCTTAATGAAATGAAGCATTTTCGAGAAAAAAAAA TGAAGAACTGGGAGGGAAAATCTAGTGCCAACTAAAAATAGTGGCATATAGTCAATGGAATTCC ACCTGTTTGGTGAATAATGTTGTTTTGGTGTTGTGACCTTTTCCTAAATATGCGATAATAATAT CTTATGTTGAATCGCGGTGTTAAATGAATTCCATATGCAAAATATTCTATACGTAGCAAACAGA ATATCAGAGTGAGGTACATGTTTAAAACTTCAAACGGCTTCTTCAAATCAAGAATTAGTGAGGG CATCTTTCTTTTTGTAGTAAGCAACTCTATTGAAGATAACATAAAATTGTAAAAACAGGGTATT GTAGTTAGTTATTTTAATTCTTCTACTTATTCTGTACTGGAAACTATATGATGTGGTTGATAGC TGTTATACTTGACTGTGAGTGCTGTACAAGAAAAAAAATCAATTAGATTTGATGTAGCGAATAC ACATATAAAATTTGATTTGATATTAACCTTTATTTTGGGTATTTTGAACCAATCAACCTCAAAT TTCAGTGATAACATTGTTTCTTATCTTACTCTTTTGGACTACTAGGTAATCTTCGAAGGTGTCT ATGCTTTGCATCCTGCTATAAGGAAATCACTGGATTTATGGATTGCAGTTGTAAGATTTTTTAC CCTCAAAAAAAAGTTGTAAGATTTTATTCAAATCTTGAAAAAACTGTTTATCTAGTTTGATTTT TTTTTACATCATAAATATCTCCCTGGAAATTTACTGCATTCTGTCTAGTAGGTTGGTGGAGTAC ATTCTCATCTTATTGCAAGAATACAGAGAGACAAGAATCGTGCAGGCTTTTCTATTTCTCAGAG TGAAATTATGACTACCGTGTTTCCGCTATTTCAGCAATACATAGAACCACATCTTATCGATGCT CATGTTGGTACAAGAAACATGAATTTGACCTATTTGATATATATTTATCATTTATGGCTTTCCA TTATCATGTATTTAGTAACTTGTTTGGACTCACGCAATGTTCCTTCTCCACGTGCTTTGCAGCT TAAGATTCAAAATGACTTTGACCCTGTGCTCTCTCCTGAAAGCTCACTTTTCGTACTAAAAAGT AAAAAACAGGTAAGTTTGAGCTTTATATTGTTCATCTTATTATTACGTTGGTGATTATTTATCT ATTTTTGTTTCATGAATAGGTATCTTATCAAGACATATTGAAAGTACTCGATGCTAGTAAAGCC TGCAGCTGTGTCCAGAATTTTACTGATGTGTATCTAAGACTTCCTGGCATACCGTTGAGTGGAC AGCTGACAGAAGGCGAGTGTATTAGGGTCCGAATATGTGAAGGAAGATTTGCACTGTTAATACG AGAGGTTAGTTTACCTTTTGCATACCATTTATCTTTGTGTTTTCATGAGACAGTCAATGACAGG CTACGTTTTTCCTTTGTTCATTTAATGGTAGCCTATAAGGGAAGGAAATTTTATTATCCAGCCA AAGGTTGATTTTGACATTAGTGCCAGCACTGTCGCAGGACTTCTTAAGCTTGG |