Splice junction sequence |
TTGTGAAGTTATAAGCTTGGAGAGTTATTATAAGCCTGAACAAGTTAGGGATTATAAATATGAT GAGTATAGCTCATTGGATATAGGTTTGCTTACTAAGgttggacgtacaactctgggaggattgt tggccttaggatatagtgttgttgttagcttcaaacgtacatgcacatctgtcagcagagatca gttattaa
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 747 Transcript exons: 11874023-11874187,11874973-11875057,11875135-11875338,11 875885-11875976,11876060-11876102,11878215-11878372 GTTGGACGTACAACTCTGGGAGGATTGTTGGCCTTAGGATATAGTGTTGTTGTTAGCTTCAAAC GTACATGCACATCTGTCAGCAGAGATCAGTTATTAATTGCAGCAGAGACTATTGACACCCTAAA TGAAACATTTCTGGTGCTAAAAGGTCCAAGTAGGAAGATTGTTGCAGCAGAAGCTAGAAAGCTC GGTATAAAGGGGCCATGGATTACGAAGTCATACCTTGAAATGATCCTAGAGAGCAAAGGGGTCC CACGACTTAATACGCCACCACCAATCTCAAGGAAATTACTGACTGAAAGTCAAGAAAAAAAAAT TGTTGCACCAAAGCCAATTCGTGTTTCGACCGAAAATGTTGCAAATTTTGATGACTTTGCACAA CCATGGACGAGGTCTCCACCCAAAAAGTTTGACCAGGAGCCTGTTATGGGAAAATGGCAGTTCA ATCAAGATTCTTCTTCAGGAAGTAACATCCAGTTAGCTCCACTGCCAGACTCCTATGACTTAGA TAGGGGTCTTCTCCTATCAGTTCAAGCAATTCAGGCATTGTTGGAGAACAAAGGATTTCCTGTC ATTGTTGGGATTGGTGGCCCTAGTGGATCAGGCAAGACAAGTTTAGCTCAGAAGATGGCCAATA TAATTGGTTGTGAAGTTATAAGCTTGGAGAGTTATTATAAGCCTGAACAAGTTAGGGATTATAA ATATGATGAGTATAGCTCATTGGATATAGGTTTGCTTACTAAG
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Genomic sequence |
GTTGGACGTACAACTCTGGGAGGATTGTTGGCCTTAGGATATAGTGTTGTTGTTAGCTTCAAAC GTACATGCACATCTGTCAGCAGAGATCAGTTATTAATTGCAGCAGAGACTATTGACACCCTAAA TGAAACATTTCTGGTGCTAAAAGGTCCAAGTAGGAAGGTATACACTTTCGGATAGCACATATTT ACCTATATGTTGTGGCAAGAGTCAAATTTTTATGATGACCCAGTTCTCTGTCTTGTACTTTAGT TTACTCTGCAATATTTAAACTGTTAAATTTAGTTTCTAAGTTAACTGAACGTTGTCTCCAGTTC CTGTAATTGTTCACTCTATCTCCTCGTCATTGTAATATGCATATGCACACTTTTCTATTGTACC AAAAGATATTGTTTTGCTATTGCAATGATGCAAACTGTTGATTTCCAAGGATGTGGATGAAGTT TTCATAAACAACTTTGGTTACTTCTGGCTTCTATTGAATGTGCACTAACGGATCAGTGTTCCTC ATTTTATTTTCACCTTTTCATATAAAGCATATTGCAGACTGAGGTGTATCAGATCACCCTTCTG CGACATTGATTAGAAGAATTGTCTTCAATTCATTCAATTCATTAACATACAATGGAGTTATGTA GGTTGCTGGAGTTTTACCAAGAAAATTTTGAAATTGGAGTTGAAATTGTTTTTTTTTTAATTCA GTTGAGTTATGTATTTGCAGTGAAATTGACTGATGCATAATTTATATTGATCTTGGTTGATAAG TTTATAGCTATGTAAATTTTCTACCCTTATCTTTTGAAGTGAATAATATGTTTATGAATTCCAA ATGATCTTGTTCTGTTCTCGATAAAACTTCTATGTTGCAACCTTTAGGTTTATTTTGATGTTTG TTGTCATTGAACTTTGGAAAAAAAATGAATATGTAACTGGCTTGCATAATTTAGATTGTTGCAG CAGAAGCTAGAAAGCTCGGTATAAAGGGGCCATGGATTACGAAGTCATACCTTGAAATGATCCT AGAGAGCAAAGGTGCAACATTTTTTGTTTTCAATGTTTTTTATTTTCAATAATTTCTATCCACT AATAAGTTTCATGTTGGTTGTCAGGGGTCCCACGACTTAATACGCCACCACCAATCTCAAGGAA ATTACTGACTGAAAGTCAAGAAAAAAAAATTGTTGCACCAAAGCCAATTCGTGTTTCGACCGAA AATGTTGCAAATTTTGATGACTTTGCACAACCATGGACGAGGTCTCCACCCAAAAAGTTTGACC AGGAGCCTGTTATGGGAAAATGGCAGTTCAATCAAGGTTTTAAACTTGTGCTTTCATTTATGAT TTTTGCCTTGCATATTCTGTTCTTTAATGCTAAAACAAAGGGCATTTTCTCTTGTCATTGGATA TCATGTGCAGCCCATTAGGGCCCATAGAGTGGTCTGCCTCTCTAGGGCTGGTGGTACTGTGCAT TAATAGTACCTACTTGGTTAATTTTCGTGCGTGGATAGTTCATGTCAGGTGGTCTTATTAGAGA TAAGGTTAGACTTATAAGTTAGTTATTTTCTTAATACTAGGGATAGGTTTCTTAATGGTCAAGC TAACACATCTATATGACGGGGTTTGTATTTTACTCATCAAGCAAGTAATAAACAAGAGTATTTA GTCTTCCCCTTCTCTCCTGCCCTTGTGGCGTGGCTGCCTCAATGGCACCGCTGCCACTTGGGTC CAGGGATACACAACTAGAAATAGGCGCAAGTGCCCTAATCCCAACCATGCCTATTACGGAGTAC ATTGGAAACCATATTTATTTATTATTTTTTCTGTAGAAAATCCATTGAATATATTCTTACACTT TTGCAGATTCTTCTTCAGGAAGTAACATCCAGTTAGCTCCACTGCCAGACTCCTATGACTTAGA TAGGGGTCTTCTCCTATCAGTTCAAGCAATTCAGGTAAATGAAACCACATTCTATTTTTTTCAT CACAGTTACGCATTACTGATCTGTAACATATTCCATTAATTGTTGTCTTTCAGGCATTGTTGGA GAACAAAGGATTTCCTGTCATTGTTGGGATTGGTAATAACATCTTTACCGTTAATAAAGTAGCA GTAGTTTTGTGTTTACTAAGACCAAGCATCTGCTTGCTGTGAATGATAAATAACTAAAACAACT CACTCTACTTTGCTGGGGCAACTTAAAATCATTTAGTCAGACATCTGCACCAGATATCCCTTGT GACAAGTCTCACTTGCAATGACTACCAGTTTCATTAAAGTGATATCAGAGCATCTATATCTCCA AATTTCACATGATCCAGTTTTTAATGTGCTATAATGGTATGCTTGCTGTGCAAAAAAGAGTGCC TGATAGGTTGTGCCTAATCTATTCCTATACACCTGTTATTTTAGGATTAACTTGTATTACAATT CTCTGTGGGTTTGTTGTACCAGTTGCTGGGGCTACATGTCATGCCTTTTTTGTAATATATTTAA GTTATGGGGCAATTGCACGTTTGACGCTGTTTTGAAAGCTAACTACCAGTTTGACTATTTTCTC AACTTTGCTTATTTGACCCCGCTTTTCAAAAATGAACATTAGCTATGACCCTATTCTATCAGGC CAACCTAACGGTGTTAACTTAGGGGCCAAATGCCGTTTATACCCCTGCTCATTTTGAGTATACT CTCTGAGTTTTTATTTATTTGGCTTAGTTTTGTGTACTCGGTGTATGTGATGAAAGTTTTAATA AATTTGACTTGGAATTGACAAATTGTGTGTGAATTTGAGTTAGATTTGATAACTTAAGCAAAGA TGACTGAATTTTAATAAAACTTTGGAAATATATTATCCATCCAATTGCACGCTGAAGAAAGAAA AGCATATATGCTATTTCACATCCAACAATTGCCCCAAGCAAATCACGAAGCTCAAATTTGTGTC GACCCCAAAGCAAAAAAAAAAAAAAGTGTGAAATTAATACATGTAAAACAAGAGAGATTATTCA ATCAGATCAGCAAAACAAGAGCAAAGCAACTTCCAGATCTAGTAGAACAAGGTATAGAGAGGAG GTGTGGGTAGAGCAAGAGCGAGCAAGGATGTGGGCCACATGAGCGCCTCACGCAGGACCTGTGC CTCCGGCTGAGCCAGGCAAGCGTTGCACGCTTCCGTCCACACGGCCACGCACTCCATCCACACA GCAAGCGCCGGCCCGCGCGTTTCCCCATCAGCGCCGCACCATCCGCTGCTTATCCACGCATCGC CACCACCGCCTCTACACGCGCCCGCGCCGCTGCTCCTCTTCCCTCTGTGCGCCGGCGTCGCCGC TCCTCCTTCCGCGCGCCGGAGCTGGCCCTCCCTCCCTTCCTCCCTCCACACGGCAGCAGCCGTC GCCGCCCATCCCTCCTCCCTCCACGCGGCAACAGCCGGCGCCAGCTCCGCTGCTCCTCCTGCCA CGTGCTGGAGCCGTCCCTCCCTCAGCGCGGCAAAAGCCGGCGCGCTGCTCCTCCGCGAACAGGC GCCGCCGCCTGTCCGCGCGCCGGCGCTGCCCCTCCCTTCCTCTCTCTGTGCGGCAGAAGCCGCC GCCGCTGCTCCTCCATACGCTGGCGCCCACTGCCGTCCCTCTCTTTGCTTGCCAGCACCGCTGC TCACCTGCTCCTGGTCCCTCCACGCGCCGGCCAGCCACGCCAATGTGGGATAAAGGTTGGGATG AGGGGTATTTTGGTCAGTTCATGCGAGTAAAATTATTTTTTTTTCTTTTTCTAACTGAAACCCT AACGGACTAGTAAAAACAGGGTCAGATGGTGGCTTCGCTTTTGAAAAACAGGGTCAAATGAGCA AACCTGAAAAAGTAGGGTCAATTTGGTAGTTCGGCTTCTAAATATAAGCAATTGTCCCTTATTT ATGGCGAACAACCATCTATTGTGAAAATGTGTGCTAAAGCAGACAATAAACATAAATGGGCCTT CTGGCAGATTACTGAGCGATTATTTGCGCCCCATCTGTTTTTTTACTAGTCCATGTATGTGAAT ACAAGAATTCTTCTAAGAATTTTATATTGTATGGAATAGATTGATTCTGTAATAATAATTCTGT TAAACTTGTGCAAAAATGATATGACCCACACACCCAGCAAATTACATTTACTGACTATGCTGTC GCTGTTTAAGTTGATACACTGTTTATTTGTAGGTGGCCCTAGTGGATCAGGCAAGACAAGTTTA GCTCAGAAGATGGCCAATATAATTGGTTGTGAAGTTATAAGCTTGGAGAGTTATTATAAGCCTG AACAAGTTAGGGATTATAAATATGATGAGTATAGCTCATTGGATATAGGTTTGCTTACTAAG |