Splice junction sequence |
TCATCACAGTTACGCATTACTGATCTGTAACATATTCCATTAATTGTTGTCTTTCAGGCATTGT TGGAGAACAAAGGATTTCCTGTCATTGTTGGGATTGctttattgagatgtaccttaggccacct tttgcttccgaggaaataaaaattgatgattggattaaagttaggcaatgtggaataagatatt acttgtct
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 584 Transcript exons: 11872954-11873113,11874973-11875057,11875135-11875338,11 875885-11875976,11876060-11876102 CTTTATTGAGATGTACCTTAGGCCACCTTTTGCTTCCGAGGAAATAAAAATTGATGATTGGATT AAAGTTAGGCAATGTGGAATAAGATATTACTTGTCTCTTGGGGATCAGAGGATTGTGGACAAAT ACTTTATTATCCGTCCAAAAGCTGAGTTTGAGATTGTTGCAGCAGAAGCTAGAAAGCTCGGTAT AAAGGGGCCATGGATTACGAAGTCATACCTTGAAATGATCCTAGAGAGCAAAGGGGTCCCACGA CTTAATACGCCACCACCAATCTCAAGGAAATTACTGACTGAAAGTCAAGAAAAAAAAATTGTTG CACCAAAGCCAATTCGTGTTTCGACCGAAAATGTTGCAAATTTTGATGACTTTGCACAACCATG GACGAGGTCTCCACCCAAAAAGTTTGACCAGGAGCCTGTTATGGGAAAATGGCAGTTCAATCAA GATTCTTCTTCAGGAAGTAACATCCAGTTAGCTCCACTGCCAGACTCCTATGACTTAGATAGGG GTCTTCTCCTATCAGTTCAAGCAATTCAGGCATTGTTGGAGAACAAAGGATTTCCTGTCATTGT TGGGATTG
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Genomic sequence |
CTTTATTGAGATGTACCTTAGGCCACCTTTTGCTTCCGAGGAAATAAAAATTGATGATTGGATT AAAGTTAGGCAATGTGGAATAAGATATTACTTGTCTCTTGGGGATCAGAGGATTGTGGACAAAT ACTTTATTATCCGTCCAAAAGCTGAGTTTGAGGTACACAAGTGATCTTATTATCTTGAAATTTG GGGTTTTACATACAAGTGTAATGTTTGGACGTAACCAAAAACAATAAGGGTGTGCTGATGTGTT TTGCATATGTACTTTTAGTTTCCTTGCATTTCTCTGCTACTACATATTCATTGACTACAGTACA ATTCTTACTCCATGTTGCTTTTACCTCCTTAAATATTAATATTTTTTATATTCTGATACTTTGG GGATAAATCAGCTACTATTGCATAATGTAAATAAACCTATTCGACTTTTCATCATCATGAATCC ATTTGTTTCTGATCTATCATCTATGAAATTCTTCAAACTAATTCTATACTGATGATAGCGTGTA GGATCGAATAATTTTCCTGCATTGTAGTTGAAGTGCAGAACCATGCAGTTTATTTCTGTTAACA AGCAAAAACTGGTAGACAATTCTTTGGTTATGTAATGAAGCTGAAGTACTGCTGGAAACACAAA TTACAGGGCCAAATACCTGGTGTTCATTGTTGTAGATCCTTTTCAATTTCCCTAGAAACCAATG CATTTAATCTGTATCTTATGGGGCTTGATGTTACCAGTTGAGCTCATTGCATTTGAAACAAAAG ATCATACACACAAGACTGTAAGATGAAATCTGAATATTAGTGTTCTATTGGAGTCAAGTTTGTG CTAGATGTCCCTTTTCCATGGAGGCTGGGTGGGGATCATCTTCTGATAATGTCACTTGGGATGT ACTACTTCAGTACCTCCGTCCCAAAATGTTGCTATTTCTAGCTATTCACTTGGACAGGTGCATA TCTAGAAATAGGTACATTTTGGGATGGAGGTAACCTTGTGCTACACAAAAAGTACAATACTGAC AGGTTTAAGTTTCTGACCTGCTTCATATATTTGAATTTGTCTCAGGTTGGACGTACAACTCTGG GAGGATTGTTGGCCTTAGGATATAGTGTTGTTGTTAGCTTCAAACGTACATGCACATCTGTCAG CAGAGATCAGTTATTAATTGCAGCAGAGACTATTGACACCCTAAATGAAACATTTCTGGTGCTA AAAGGTCCAAGTAGGAAGGTATACACTTTCGGATAGCACATATTTACCTATATGTTGTGGCAAG AGTCAAATTTTTATGATGACCCAGTTCTCTGTCTTGTACTTTAGTTTACTCTGCAATATTTAAA CTGTTAAATTTAGTTTCTAAGTTAACTGAACGTTGTCTCCAGTTCCTGTAATTGTTCACTCTAT CTCCTCGTCATTGTAATATGCATATGCACACTTTTCTATTGTACCAAAAGATATTGTTTTGCTA TTGCAATGATGCAAACTGTTGATTTCCAAGGATGTGGATGAAGTTTTCATAAACAACTTTGGTT ACTTCTGGCTTCTATTGAATGTGCACTAACGGATCAGTGTTCCTCATTTTATTTTCACCTTTTC ATATAAAGCATATTGCAGACTGAGGTGTATCAGATCACCCTTCTGCGACATTGATTAGAAGAAT TGTCTTCAATTCATTCAATTCATTAACATACAATGGAGTTATGTAGGTTGCTGGAGTTTTACCA AGAAAATTTTGAAATTGGAGTTGAAATTGTTTTTTTTTTAATTCAGTTGAGTTATGTATTTGCA GTGAAATTGACTGATGCATAATTTATATTGATCTTGGTTGATAAGTTTATAGCTATGTAAATTT TCTACCCTTATCTTTTGAAGTGAATAATATGTTTATGAATTCCAAATGATCTTGTTCTGTTCTC GATAAAACTTCTATGTTGCAACCTTTAGGTTTATTTTGATGTTTGTTGTCATTGAACTTTGGAA AAAAAATGAATATGTAACTGGCTTGCATAATTTAGATTGTTGCAGCAGAAGCTAGAAAGCTCGG TATAAAGGGGCCATGGATTACGAAGTCATACCTTGAAATGATCCTAGAGAGCAAAGGTGCAACA TTTTTTGTTTTCAATGTTTTTTATTTTCAATAATTTCTATCCACTAATAAGTTTCATGTTGGTT GTCAGGGGTCCCACGACTTAATACGCCACCACCAATCTCAAGGAAATTACTGACTGAAAGTCAA GAAAAAAAAATTGTTGCACCAAAGCCAATTCGTGTTTCGACCGAAAATGTTGCAAATTTTGATG ACTTTGCACAACCATGGACGAGGTCTCCACCCAAAAAGTTTGACCAGGAGCCTGTTATGGGAAA ATGGCAGTTCAATCAAGGTTTTAAACTTGTGCTTTCATTTATGATTTTTGCCTTGCATATTCTG TTCTTTAATGCTAAAACAAAGGGCATTTTCTCTTGTCATTGGATATCATGTGCAGCCCATTAGG GCCCATAGAGTGGTCTGCCTCTCTAGGGCTGGTGGTACTGTGCATTAATAGTACCTACTTGGTT AATTTTCGTGCGTGGATAGTTCATGTCAGGTGGTCTTATTAGAGATAAGGTTAGACTTATAAGT TAGTTATTTTCTTAATACTAGGGATAGGTTTCTTAATGGTCAAGCTAACACATCTATATGACGG GGTTTGTATTTTACTCATCAAGCAAGTAATAAACAAGAGTATTTAGTCTTCCCCTTCTCTCCTG CCCTTGTGGCGTGGCTGCCTCAATGGCACCGCTGCCACTTGGGTCCAGGGATACACAACTAGAA ATAGGCGCAAGTGCCCTAATCCCAACCATGCCTATTACGGAGTACATTGGAAACCATATTTATT TATTATTTTTTCTGTAGAAAATCCATTGAATATATTCTTACACTTTTGCAGATTCTTCTTCAGG AAGTAACATCCAGTTAGCTCCACTGCCAGACTCCTATGACTTAGATAGGGGTCTTCTCCTATCA GTTCAAGCAATTCAGGTAAATGAAACCACATTCTATTTTTTTCATCACAGTTACGCATTACTGA TCTGTAACATATTCCATTAATTGTTGTCTTTCAGGCATTGTTGGAGAACAAAGGATTTCCTGTC ATTGTTGGGATTG |