Splice junction sequence |
TGCCCTAATTTTTGTTTTGTAGTCGAACTTGATCAGAAATGCTGCACGAAACTATCTGTTGGAT TATGGGATTCACTGGGGAGCAGCACCAGCAGTAAAGgttatctggagaggtttggaggggaact agctcagaacagatcaaataaagaaaacaaccatacccaaaatggatatgtaaatggtactaac agtgaaac
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 398 Transcript exons: 20869036-20869261,20869426-20869519,20870406-20870483 GTTATCTGGAGAGGTTTGGAGGGGAACTAGCTCAGAACAGATCAAATAAAGAAAACAACCATAC CCAAAATGGATATGTAAATGGTACTAACAGTGAAACATCTGCTGGCATGGATGGGGACTTGTAC AAGAAGCTGTTGGTTGTTCTGAGTAACATTGGATATTGTAAAGCTGAACTTTCAGATGAACTGT ATACCAAATACAGGCACATTTGGTCCCCAGTCAGGGATAATGATGAGCGTAGTGCTGACATGCG AGATCTGATGACTTCTTTCTCAGCACTTGAGGAGAAAGTCCTGGAACAGTATACATTTGCAAAG TCGAACTTGATCAGAAATGCTGCACGAAACTATCTGTTGGATTATGGGATTCACTGGGGAGCAG CACCAGCAGTAAAG
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Genomic sequence |
GTTATCTGGAGAGGTTTGGAGGGGAACTAGCTCAGAACAGATCAAATAAAGAAAACAACCATAC CCAAAATGGATATGTAAATGGTACTAACAGTGAAACATCTGCTGGCATGGATGGGGACTTGTAC AAGAAGCTGTTGGTTGTTCTGAGTAACATTGGATATTGTAAAGCTGAACTTTCAGATGAACTGT ATACCAAATACAGGCACATTTGGTCCCCAGTCAGGTACCCGATCATCTTAGCTTATGTTCCACT AACATTGTCTTACTGTCCTTTATAATTTTTGGTGCGAGTCGTTATCCCTGAATAGATTGATTGA AAGCTTGTTATTTCATCTAAAAGCAATGCTTTGATACATTTGCTTCACTCAGTTAGTGTTCCTC TCTCAGGGATAATGATGAGCGTAGTGCTGACATGCGAGATCTGATGACTTCTTTCTCAGCACTT GAGGAGAAAGTCCTGGAACAGTATACATTTGCAAAGGTATGGTAGAAAATCCAGAATTGTTGAT TAATCATTATTGGCCAAAAGATTTAGTTATAACCATGTTAGCTTTAATCCTTTCGTGTCTTGGT GTGCAAAGTTACAAGTTTGAAACACCTGATTTAGCCCACTATTTGTTCTTCAGTAGTGGTATGC CCAAAAAGGCCTTAATGGAAGTAATGATCACTTCTTTTTCTGAAGTTGTTCTATGGGAATATCT GCGTAGACATGCACATGCCTCTATGCGTCTACTGGTTGATCTGATGTGAATCAAATGAAGCATT TAACTTATTGCATGTTTATTCAAGATCCGTTGCAATATGTAGTCCTAAATAACTAATAGCTAGA TCAAAATGTGCATAGTTCTATTTTCTGTGACTGAAGCATTTTATTATTGATACCCTAGTTAATG TGCTAGTTTTGGATTTATTACTACCTCCATATTTTAATGTATGACGGCGTTGACTTTTTGACCA ACGTTTGACCATTCATCTTATTCAAAAAATTTATGTAATTATCATTTATTTTATTATGACTTCA TTCGTCATCAAATGTTCTTTAAGCATGACATAAATATTTTCATATTTGCACAAAATTTTTGAAT AAAACGAATGGTCAAACGGTGGTTGAAAAGTCAACGGCATCATACATTAAAATACGGAGGGAGT ACTAGTTATTACTCTGGAATATGTCAGATGTTTGTCCACTTCATAGATTATTATATTGTTTGAT GACTAGGATAACTTTAATTCAAAATTGTTTGGAATGCCTACAGTGGAAGTTCATATATCATGCT TGATAGTAGCATGATTTTTGGGGCTATAAATTCGGAGTCTATGCACATTTTGCTATCTTCCTTT GCTTTGCCCTAATTTTTGTTTTGTAGTCGAACTTGATCAGAAATGCTGCACGAAACTATCTGTT GGATTATGGGATTCACTGGGGAGCAGCACCAGCAGTAAAG |