Splice junction sequence |
TTCCAGTCTTGGAGACTTAGTATCTGTTCTTTCAAAGCTTTCTAGGGGTGCTCGTGTTCCATTG GAATATATGTCTCACACTGATCGTCATCGCAAGAAGgcagcatcaggtactaaaggtggttcaa gtggttctcccgtcattgattggcaaggcagggcagtagctttgaatgctggcagcaagtcgtc aagtgcat
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 810 Transcript exons: 801521-801646,802100-802189,802632-802697,802792-802848, 802972-803037,803262-803369,803689-803769,804116-804165, 804322-804487 GCAGCATCAGGTACTAAAGGTGGTTCAAGTGGTTCTCCCGTCATTGATTGGCAAGGCAGGGCAG TAGCTTTGAATGCTGGCAGCAAGTCGTCAAGTGCATCAGCCTTCTTCCTACCACTTCAACGAGT TGTTAGGGCGTTAAGTTTTCTCCAAAAAAGCATTGACTCGCGGACGGATAAGCCAAAAGCAGTT CATATTCCTCGTGGTACACTTCAGATGACATTTCTTCATAAAGGATTCGATGAGATACGGCGAC TTGGTCTCAGGAGCGAAACTGAACAGGTGGTTCGACATGCATCTCCAACTGGGGAAACAGGAAT GCTTGTTGTCGATTCTGTGGTGCCAAGTGGCCCTGCTGATAAACATTTGGAGCCGGGAGATGTT CTTGTTCGGGTGAATGGAACAGTGCTCACACAATTTTTGAACTTGGAGAATCTGCTTGATGACG GTGTTGGCCAGATACTTGAATTGGAGATTGAAAGGGGTGGACAACCACTATCTGTTAGTGTATC AGTACAAGATTTACACTCAATCACTCCAGATCACTTCCTGGAAGTAAGCGGTGCTGTAATTCAT CCGTTGTCTTATCAGCAGGCTCGCAATTTTCGTTTTCCTTGTGGCCTGGCTTATGTTGCGGACC CTGGATACATGCTATTTAGAGCTGGGGTCCCTCGACATGCTATCATAAAGAAGGTTGCTAATGA GGATATTTCCAGTCTTGGAGACTTAGTATCTGTTCTTTCAAAGCTTTCTAGGGGTGCTCGTGTT CCATTGGAATATATGTCTCACACTGATCGTCATCGCAAGAAG
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Genomic sequence |
GCAGCATCAGGTACTAAAGGTGGTTCAAGTGGTTCTCCCGTCATTGATTGGCAAGGCAGGGCAG TAGCTTTGAATGCTGGCAGCAAGTCGTCAAGTGCATCAGCCTTCTTCCTACCACTTCAACGAGT GAGCAATCTCTGTTTCTCGTATACTTGTATCGATGGTTCAGTTACGACTAGAATCGAGATGGTG TAACTTATTTAGTCACTGAAATAACCCCTGTAAATTCAGAACATTAGATTATTGTGTAGCTTCT GCTTCTGTCAAAGTTAAGAATTGATAAGTGTATAAAGCCTCCACTAGAGGGTTGTTTAATGTGC TTGGTATTCCGAAAAATAGTTCATGCTGGAAGTGTGTACAATGTTACGAATAAACTACACATCT ACTTCAGATCTCTTCTTTTCATGTATGGGATCCTGAGAATCTAGTAGGAAACACTGGGAAAGTC AGACATGGTTCTGGATCTCATTTTTTTTGTTCTTTACAAATCATTTTGTATTTCAACCCCTATA TTAATTTGAAGTTTAGTTAGAAATTTGCTTAAGACTTTTGACCAAGAATGGTTCTCTTGTTTGG AAGGTTGTTAGGGCGTTAAGTTTTCTCCAAAAAAGCATTGACTCGCGGACGGATAAGCCAAAAG CAGTTCATATTCCTCGTGGTACACTTCAGGTTTGTTTTTCCCTCTCTGATTTTTGAGACTCTTC ATAGTGCCGTTACGAAAATTTCCGCGAATATCAACTTTTGACTCTTTTTTAAATAGCTGGGTTC AGTTTATTGTCTGAAAAACTACACATACCATTACATGTACATGGTATGTCAATTAAATGTATGC GATATGAATGTTGTGTTCAAATCCTAGAGGGAAAATATATACGTTGAAAATCGTGAATATTACT TGATATCTGAATGACCATGGAACTTTGATCTGGACTACTGTGGCTGGTGATAGAAAGAATATCC TTGGGATCTGAAATAGTTCATGGTTTAATTTCTATTCACTTTCCAACGATTGTTAGATTTGAGA TTCAGAGGAAGTTCAATATCTCTTACTTAATTATTAGTTCTGGGGTTTTCTTATGTAAGCTTTT ATCTGTTTTCTTGTGTACTTTAGATGACATTTCTTCATAAAGGATTCGATGAGATACGGCGACT TGGTCTCAGGAGCGAAACTGAACAGGTACATACTATTCCTTCTTACCATCATTTAGGGCATCAG CTTTCCTCGTGATGCTCACTAACACCTTACAAAATGCTATCTCTTGATCGTGTAGGTGGTTCGA CATGCATCTCCAACTGGGGAAACAGGAATGCTTGTTGTCGATTCTGTGGTGAGTGCATTGCTTT ATTAATAACATTCAATACAATAATTATTTTCAAAGAATATGGCTATTGTTTAAGTGATGGTTAA ATTCGAAACTTTTTATCCTAAATTTGATATGTCGTGATGGTAGGTGCCAAGTGGCCCTGCTGAT AAACATTTGGAGCCGGGAGATGTTCTTGTTCGGGTGAATGGAACAGTAAGTTGTCTTGATTGCA TCTTCTTAGTGAGAATTTAAATTTTTTTTGCCTCAAGTAATCGAGAATTGTGATATCTTTTGCG GCAACATTAGTAAAGAAACGTATTGTTTAGAGATTGGTTATTACCTGGCCACAGAACGTATTAA TCAGTGCACTTAGATTGTCTAGTTCCTTTTTCCTCAGTTTGCTAAATCTTCCTTTATGCGTTTG ATTGTTATTACAGGTGCTCACACAATTTTTGAACTTGGAGAATCTGCTTGATGACGGTGTTGGC CAGATACTTGAATTGGAGATTGAAAGGGGTGGACAACCACTATCTGTTAGTGTATCAGTGAGTT CCATTCTTCTATTTCTAACTTTGGTTTTATGTTCCTCGTAGTCTTCTAGGATCTTGTGTTTAGT TTCTGCCCTGTCACATACTGACTAGAAAAGCAGGAGACTATGCAAAGACTAGAAGTAAAATATA TGTAGCCGTCTCTTCTCTTTTATTTTGGTCATTAAATTTGTTCTTGTAGCTCTTTTCGTTTCCC CTGATAGATGGAGTTCCTCAATACTTAATTTGCATTTAGAATTCTGCCTTAATGTGATTTATAC TTCCTATCTATCATAAAAATCAAGAGCCTTATGTGTTTGTGTATTTCCTGCCACAGGTACAAGA TTTACACTCAATCACTCCAGATCACTTCCTGGAAGTAAGCGGTGCTGTAATTCATCCGTTGTCT TATCAGCAGGTAACTTAACTATGACTTGAAAAGATATTATCTGGAAATTTCTGTGCCTGCATGC ATGATATTCTTGTGTCGTACAGGTGGAACTGTTGTGTTTAATTATGGCTTGTAACTATTTAATG TTCTATTAGTTGGAGAATCATATCAACATGCTAGATATTTTATTCATAATAAATGCTGTGGATC CACTTTATCCCCCACACTGTCTTGCTAGATCTGATTATGGAAGCATAACTAAGTGAAATAGTGA TGTGACTACACTACCTCCTGCTAATAAAGAAGCTTACACGTATTTCACTGACACTTTCTTATTG GCATTAGCTGATCTTAAAATATTGTGATTTAACAGGCTCGCAATTTTCGTTTTCCTTGTGGCCT GGCTTATGTTGCGGACCCTGGGTAATTCCCTCTACTTCCGCCATCAAAATTTTCACGTTTTCTT GATTTATTTTTGACTGATGTGTCAATATTCTGACATGTGAGCTTATTGTTAATGTAAATGATTA CGTGTCTCTGTATTTCTGGATTTACTTTGAAGAGCTCTTTTCTATTCAGATACATGCTATTTAG AGCTGGGGTCCCTCGACATGCTATCATAAAGAAGGTTGCTAATGAGGATATTTCCAGTCTTGGA GACTTAGTATCTGTTCTTTCAAAGCTTTCTAGGGGTGCTCGTGTTCCATTGGAATATATGTCTC ACACTGATCGTCATCGCAAGAAG |