Splice junction sequence |
AGATACTACAGTTTTAAGAGACTTCGAAGGTGCAACAGCACTGTCTGCTAATGCTTCATTGGCT GAGCGTGCTATTGAGCCTGCACTTGTCATGTTTGAGgttgttagggcgttaagttttctccaaa aaagcattgactcgcggacggataagccaaaagcagttcatattcctcgtggtacacttcaggt ttgttttt
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 1161 Transcript exons: 802100-802189,802632-802697,802792-802848,802972-803037, 803262-803369,803689-803769,804116-804165,804322-804487, 804889-805365 GTTGTTAGGGCGTTAAGTTTTCTCCAAAAAAGCATTGACTCGCGGACGGATAAGCCAAAAGCAG TTCATATTCCTCGTGGTACACTTCAGATGACATTTCTTCATAAAGGATTCGATGAGATACGGCG ACTTGGTCTCAGGAGCGAAACTGAACAGGTGGTTCGACATGCATCTCCAACTGGGGAAACAGGA ATGCTTGTTGTCGATTCTGTGGTGCCAAGTGGCCCTGCTGATAAACATTTGGAGCCGGGAGATG TTCTTGTTCGGGTGAATGGAACAGTGCTCACACAATTTTTGAACTTGGAGAATCTGCTTGATGA CGGTGTTGGCCAGATACTTGAATTGGAGATTGAAAGGGGTGGACAACCACTATCTGTTAGTGTA TCAGTACAAGATTTACACTCAATCACTCCAGATCACTTCCTGGAAGTAAGCGGTGCTGTAATTC ATCCGTTGTCTTATCAGCAGGCTCGCAATTTTCGTTTTCCTTGTGGCCTGGCTTATGTTGCGGA CCCTGGATACATGCTATTTAGAGCTGGGGTCCCTCGACATGCTATCATAAAGAAGGTTGCTAAT GAGGATATTTCCAGTCTTGGAGACTTAGTATCTGTTCTTTCAAAGCTTTCTAGGGGTGCTCGTG TTCCATTGGAATATATGTCTCACACTGATCGTCATCGCAAGAAGTCTGTGTTAGTCACGATTGA TCATCATGAATGGTACGCTCCTCCTCAGTTGTATACCCGTAATGACAGTTCCGGTTTATGGGAT GCGAAACCTGCAATTGAACCTGCTTCTGTTTCACCATCTATTGGTAATAATGGCTTTCCTATAA GCCAAGATATTTCTCTATGCCATCACGATACGGAACCCATGCATGAAGTGAATGTTCGTGGGGT TACTGATATTGCAGCGATTATGGAAACTTCTAGTGGGGATGGTTCTCAGAATGATTTTGGCTCA GAAGCAAAGAAACAAAGAGTTGACGAGGATTCTTCAGATGGGATTGCTGCAAACGGTTCCTTAT ATGGCAGTGAATTTAAATCTGATGATGCAATGGAAACAGATACTACAGTTTTAAGAGACTTCGA AGGTGCAACAGCACTGTCTGCTAATGCTTCATTGGCTGAGCGTGCTATTGAGCCTGCACTTGTC ATGTTTGAG
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Genomic sequence |
GTTGTTAGGGCGTTAAGTTTTCTCCAAAAAAGCATTGACTCGCGGACGGATAAGCCAAAAGCAG TTCATATTCCTCGTGGTACACTTCAGGTTTGTTTTTCCCTCTCTGATTTTTGAGACTCTTCATA GTGCCGTTACGAAAATTTCCGCGAATATCAACTTTTGACTCTTTTTTAAATAGCTGGGTTCAGT TTATTGTCTGAAAAACTACACATACCATTACATGTACATGGTATGTCAATTAAATGTATGCGAT ATGAATGTTGTGTTCAAATCCTAGAGGGAAAATATATACGTTGAAAATCGTGAATATTACTTGA TATCTGAATGACCATGGAACTTTGATCTGGACTACTGTGGCTGGTGATAGAAAGAATATCCTTG GGATCTGAAATAGTTCATGGTTTAATTTCTATTCACTTTCCAACGATTGTTAGATTTGAGATTC AGAGGAAGTTCAATATCTCTTACTTAATTATTAGTTCTGGGGTTTTCTTATGTAAGCTTTTATC TGTTTTCTTGTGTACTTTAGATGACATTTCTTCATAAAGGATTCGATGAGATACGGCGACTTGG TCTCAGGAGCGAAACTGAACAGGTACATACTATTCCTTCTTACCATCATTTAGGGCATCAGCTT TCCTCGTGATGCTCACTAACACCTTACAAAATGCTATCTCTTGATCGTGTAGGTGGTTCGACAT GCATCTCCAACTGGGGAAACAGGAATGCTTGTTGTCGATTCTGTGGTGAGTGCATTGCTTTATT AATAACATTCAATACAATAATTATTTTCAAAGAATATGGCTATTGTTTAAGTGATGGTTAAATT CGAAACTTTTTATCCTAAATTTGATATGTCGTGATGGTAGGTGCCAAGTGGCCCTGCTGATAAA CATTTGGAGCCGGGAGATGTTCTTGTTCGGGTGAATGGAACAGTAAGTTGTCTTGATTGCATCT TCTTAGTGAGAATTTAAATTTTTTTTGCCTCAAGTAATCGAGAATTGTGATATCTTTTGCGGCA ACATTAGTAAAGAAACGTATTGTTTAGAGATTGGTTATTACCTGGCCACAGAACGTATTAATCA GTGCACTTAGATTGTCTAGTTCCTTTTTCCTCAGTTTGCTAAATCTTCCTTTATGCGTTTGATT GTTATTACAGGTGCTCACACAATTTTTGAACTTGGAGAATCTGCTTGATGACGGTGTTGGCCAG ATACTTGAATTGGAGATTGAAAGGGGTGGACAACCACTATCTGTTAGTGTATCAGTGAGTTCCA TTCTTCTATTTCTAACTTTGGTTTTATGTTCCTCGTAGTCTTCTAGGATCTTGTGTTTAGTTTC TGCCCTGTCACATACTGACTAGAAAAGCAGGAGACTATGCAAAGACTAGAAGTAAAATATATGT AGCCGTCTCTTCTCTTTTATTTTGGTCATTAAATTTGTTCTTGTAGCTCTTTTCGTTTCCCCTG ATAGATGGAGTTCCTCAATACTTAATTTGCATTTAGAATTCTGCCTTAATGTGATTTATACTTC CTATCTATCATAAAAATCAAGAGCCTTATGTGTTTGTGTATTTCCTGCCACAGGTACAAGATTT ACACTCAATCACTCCAGATCACTTCCTGGAAGTAAGCGGTGCTGTAATTCATCCGTTGTCTTAT CAGCAGGTAACTTAACTATGACTTGAAAAGATATTATCTGGAAATTTCTGTGCCTGCATGCATG ATATTCTTGTGTCGTACAGGTGGAACTGTTGTGTTTAATTATGGCTTGTAACTATTTAATGTTC TATTAGTTGGAGAATCATATCAACATGCTAGATATTTTATTCATAATAAATGCTGTGGATCCAC TTTATCCCCCACACTGTCTTGCTAGATCTGATTATGGAAGCATAACTAAGTGAAATAGTGATGT GACTACACTACCTCCTGCTAATAAAGAAGCTTACACGTATTTCACTGACACTTTCTTATTGGCA TTAGCTGATCTTAAAATATTGTGATTTAACAGGCTCGCAATTTTCGTTTTCCTTGTGGCCTGGC TTATGTTGCGGACCCTGGGTAATTCCCTCTACTTCCGCCATCAAAATTTTCACGTTTTCTTGAT TTATTTTTGACTGATGTGTCAATATTCTGACATGTGAGCTTATTGTTAATGTAAATGATTACGT GTCTCTGTATTTCTGGATTTACTTTGAAGAGCTCTTTTCTATTCAGATACATGCTATTTAGAGC TGGGGTCCCTCGACATGCTATCATAAAGAAGGTTGCTAATGAGGATATTTCCAGTCTTGGAGAC TTAGTATCTGTTCTTTCAAAGCTTTCTAGGGGTGCTCGTGTTCCATTGGAATATATGTCTCACA CTGATCGTCATCGCAAGAAGGTGATATTTCTTGTTTAAACAATCTTTTTGCTTAACTTCCTAAC CCACTGTAAGCATATACTTGTCAAAATTTGATGCTAGCATTTATATATGATATTTTCTTAGGCT ACTCCATATCAGCATCTTCATTCTTGCAAACAGTTTGTTGATTCTGTGATAATATTACCTCTCT ACTCGGTGTTCCTAGTGTGTGAAATTTTGTGCTACTGCAGTGCTGCTAGATCTCTGTGATCACT TTTTACGGAAAACCGTTATCTTTAAGACTATAATTTTCACAACTGTGGATCTTTTTGCGTTAGC AACGTTCCTGTTATTAACATGCTTGCTTGTCCACGTTTCGTTTTGAACTCTATGTTAATACTCA AACGAGAAGTACTTATTGTCGGGTTCCATTCCTGCAGTCTGTGTTAGTCACGATTGATCATCAT GAATGGTACGCTCCTCCTCAGTTGTATACCCGTAATGACAGTTCCGGTTTATGGGATGCGAAAC CTGCAATTGAACCTGCTTCTGTTTCACCATCTATTGGTAATAATGGCTTTCCTATAAGCCAAGA TATTTCTCTATGCCATCACGATACGGAACCCATGCATGAAGTGAATGTTCGTGGGGTTACTGAT ATTGCAGCGATTATGGAAACTTCTAGTGGGGATGGTTCTCAGAATGATTTTGGCTCAGAAGCAA AGAAACAAAGAGTTGACGAGGATTCTTCAGATGGGATTGCTGCAAACGGTTCCTTATATGGCAG TGAATTTAAATCTGATGATGCAATGGAAACAGATACTACAGTTTTAAGAGACTTCGAAGGTGCA ACAGCACTGTCTGCTAATGCTTCATTGGCTGAGCGTGCTATTGAGCCTGCACTTGTCATGTTTG AG |