Splice junction sequence |
TTTGAGCTGAATTGACTTTATCTTCTGCATAATATTCAATGGCTGATAGGAGTTCAACACGCAG TTCAACCCAAAGTGCAGCTGCCTTTCTATACATATTgtggaggatactcatcacccccatcttc actcacgtcttccttttttccaagtttactaactcgtccttttaaggacatgtcagatccataa tgccgctt
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 505 Transcript exons: 64846885-64847013,64848357-64848459,64848589-64848732,64 849451-64849579 GTGGAGGATACTCATCACCCCCATCTTCACTCACGTCTTCCTTTTTTCCAAGTTTACTAACTCG TCCTTTTAAGGACATGTCAGATCCATAATGCCGCTTGTGCTGAAACTCCTGGACTTTTTCTTCA CCTTGCTCAAAACAATCAGGCTTTGGAGGCAAAGGATAATTATCTTCTACCAGCTTAAGAAGAA GCTCTCTAGGACCAGAAACGAAATCTTCCAATTCAATGCCATATTTAGCAACAGCTTCCTCTGT TCGAGCTTCTCCAGTGCTCTGAAGACCAATCACCACACATTTTTCTTCTGCTAAGGCTTCTTTT GCCAATCTCACGACAGCAGGTACCTTTGCAGACATACACATATGCCTAAAGAAACGCTGATGAC TTGCCCAGTATAGCCGCCAAATTTGAGCTGAATTGACTTTATCTTCTGCATAATATTCAATGGC TGATAGGAGTTCAACACGCAGTTCAACCCAAAGTGCAGCTGCCTTTCTATACATATT
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Genomic sequence |
GTGGAGGATACTCATCACCCCCATCTTCACTCACGTCTTCCTTTTTTCCAAGTTTACTAACTCG TCCTTTTAAGGACATGTCAGATCCATAATGCCGCTTGTGCTGAAACTCCTGGACTTTTTCTTCA CCTGCAACAGCATATGTAAATAAAGAAGTCAGCAAGCAGGATTGCATAGACTAAAATGATATGC CATCATCATATCTCTTCTAAATCAAAGTCAACGGAGTGCTAAAAGTCACTTTCTTCAATGCAAA TGGTTAAAAAACTCAAAGAGGATTTTTTTTGGTAAAAGTTACAGTAGCTTGATATGTGGCCACA CAAGGAGAGATCGAGTCCGGAATGATGATATACGAGAGAGCGTAGGAGTGGCGTCAATTGAGGA GAAGCTTATGCAACATCGTTTGAGATGGTTTGGACATATCCAACGAAGACCTGAAGAGGCACCA GTGCATATCGGAATAATTAGGCGTCCCGAGAATGTGAAGAGAGGTAGAGGTCGACCAACCTTGA CGTGGACAGAGGCTATGAAGAGGGACCTGAAGGAGTGGAATATTGATAAAGAGCTCGCCGTGGA TAGGAAGGGGTGGAAGTGTGCAATTCACGTGCCAGAACCCTGATTTGTAGTTTTGCTTTTCCTC CTTAATCGTTTGACATTTTCTTGTGCCCCTTTAGATCTTGCTGGATCTTGTGGGTTTTATCTCT TTTTATGTGTTTCCCCGTTTCGTCGTTTTTCGGTTCTCATTTGCCTTTGTCTCCCTTTTCTTTT CTTTGGGGGTTGAGCTCTGAGGTTTTCATATGGGGTTTCATCTCTAGCCTACCCCAACGTGCTT GGGACAAAAAGGCTTTGTTGTTGTTGTTGTTGTAAAAGTTACAGCAGCTGACAACATATGAGAC ATTGAAATTTAGATTAAAAACCACAAGTCCTGATTTTTTTCCCCAGAGAATATGTCTGTGATAG TGGGGGCGCTATGAAACCAATACAGGGAACACTATTGTACTGTTCCAACAGTGGGAAAAAAGTA GATTTAAATGTGATGTGCTACAACAGTTAATTGTGATGTAGAGGTAAGGTATGTGATCTTATAT CAGCACAGCAGAATATGGGCTTGGAACTACTAGATAAAAAAGTCACCTTCATCTGCAGCAAGCC AGAAACCAAGAAAACCCAAAGTTCATTAGTTATTTATTGTCTAGTGTACTACATTATCTGAGTA TATACAAACACAAAACTCACCATGGTTTGAGCACAAAACTAACAACACCCAGAAAAAATTAAGT GATTACTAATACTAATAACAAAACACCAATTAATTTTTTTTCATGTATTTTTGGAAGAAATAAA AAGGGAGAGTAAATTTTGCAAAACTACAGATACTTCAGCAAACTAATCACAAAACTACAGATAC TTTGGCAAACTTATCACAAAACAACAGATTTAAACTGGAGCATAAAGTTTGTGCCAATGCAAAC CTTGCTCAAAACAATCAGGCTTTGGAGGCAAAGGATAATTATCTTCTACCAGCTTAAGAAGAAG CTCTCTAGGACCAGAAACGAAATCTTCCAATTCAATGCCCTGCCACATACTTTTAATTTAAGAA ACAAAATTTTGTAATGTTAACGCCATACATCAGTTCACCTTCCTAGCCACAGAAATACACTAGA TGGGAAGAAAAGAATTAGTAGTCTTAGATGACAAGCGCACATATTTAGCAACAGCTTCCTCTGT TCGAGCTTCTCCAGTGCTCTGAAGACCAATCACCACACATTTTTCTTCTGCTAAGGCTTCTTTT GCCAATCTCACGACAGCAGGTACCTTTGCAGACATACACATATGCCTAAAGAAACGCTGTGAAA AAAGAATAAACATAATGTACTGTTATTAAACTGTTAGCCACATAGGCCATAGAGTTAAGAGTAT ATGAAGCACATAATCTGCTGTGTCATTATATATTAAGAATAATGCATCAGAATTATCTCTGATC CCATATCTGAGTTGAGAACATCAAAGAGTTATAACTTATATGTCTTTCGGATTGTTATTTGATT TGCAAATGAACGAGAATGCAAGGGCCTGTTTGGTTCCTTTAGTACAAGGACTAAAGTTTAGTTA GGACTTAGGACTAAAGTTTATCCCTACTCTGTTTGTTCTAGGGACTAAAAATACTCAGAACGCA TTAAATGAATCATAACAAGTTCAAAATAACCCTTAGCATTCTCCCGCCATTAGTGCAACTGAAA TAAACGAGGAGTAAAAAGTGAAATTAATATGATTTAGTCCCTTTTAGTCACCCCTTAAGAGACT AGAGACTAAAGCAGTTTACTCTCTATTTTAGTCTCACCGTTTGGTAATTTAAGGACTAAAATGG AGGGACTAATCTTTAGTCCCTCAAACCAAACGGGGCCTAACTACCAAAACAGTTGTTCCATGTA ACAAACTATTTCCACTTCGTAATGCAACACTCGCAGTTCTCATACATGTTTGAGGGAAAAAACA CTTTTGGAGAAGCTACGAACACCCCTATTGACCAGTATGTTTTCAGTTGCATAAAATGAAAATG AACCACCTGATGACTTGCCCAGTATAGCCGCCAAATTTGAGCTGAATTGACTTTATCTTCTGCA TAATATTCAATGGCTGATAGGAGTTCAACACGCAGTTCAACCCAAAGTGCAGCTGCCTTTCTAT ACATATT |