Splice junction sequence |
CAACTTTTTGGAACCACTATGATCCTGATCTTGGTGGGCTTTATCCTCGTTGCTGCAACCGGTG TGCTTTCCAGTGTTTGCCACCTTCAGTTTCTTTTTTctctttcaattgttctttggctttctgt ctaagttgtcttttgagtttcttacgccgagcacttctagatacctggtaaaacacaggacagc aaagtgaa
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 325 Transcript exons: 11068450-11068521,11070534-11070603,11072835-11073017 CTCTTTCAATTGTTCTTTGGCTTTCTGTCTAAGTTGTCTTTTGAGTTTCTTACGCCGAGCACTT CTAGATACCTTTTTAATATCGCTTTGAGTGTTACAATCATCCTCCTTTGTTTCGCTATTCAACT TGGTTTGGTTGTCCCTCTTTGATATCTGCTCTTTCTCCAAGGTAACATCGGCTTCAGCTAGCAT CACCTTCTTGGCATCATCGATACATGGTGACTTCAACTTTTTGGAACCACTATGATCCTGATCT TGGTGGGCTTTATCCTCGTTGCTGCAACCGGTGTGCTTTCCAGTGTTTGCCACCTTCAGTTTCT TTTTT
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Genomic sequence |
CTCTTTCAATTGTTCTTTGGCTTTCTGTCTAAGTTGTCTTTTGAGTTTCTTACGCCGAGCACTT CTAGATACCTGGTAAAACACAGGACAGCAAAGTGAACTTTATGCATGTGATAACTAAAATAAAA TGCACATGCAGAAAAGCATGACTTGTTAATTGAGTCCTATATATCATAATATCACAGGTAAATT TGAGTGTTGCTACACTGCACGTGAAGTGTGAAATGTCAATTATAGGAAATTATACTTGTGGCGT GGTCAGCAGTCAGAATTGTGCATGGAGCTTGCTTTTTCAAAGAATTTCTTTATGCCCTTTTTTC TATAGACTAAAATTGGCAAACAACTACTTCAGAATGAAACAGAAGAAGCTCATTAAATTTTCTG TGGTTTTCTTTAACTAACTATTCCATAAAGACAACTGCAAAACAGTCCAATTCTAAACAATAAG TTAGCCAATGGATACATTAAGGTGAGCTTGACATTAGAGCAGCCCTTTTAAAAGCACTGAATTA ACTTTTTACTATAAATCAATTAAACAGGAAAATACATTTTAACTCCAATTCATGTGATTGTAAT GCTTGGTACTTCTTTTAATTTGTTGTGCACATCGTACAATTTCCATTCTTGTTCTCATGATTTG AGTGGTTCTGGTACTTGAAATAAAAATCAATGAAAAATTACAAATCTTATACAAGCACCAACAT CACTCAATAGATGAATCAGTTACACAAAGATTGACAAAATTATTTTTGTAGCAATCAAAGTGTG CCCATTCCCGTTGCTATCCCTAACCAATAGGGCAGGAGGAGAAGAGGGAGCCATAGGAGGAGTT GGGATCAACGAGTAGTTGCAGAGTGAAAAATAGTGCTGTATTTAATCATGTGCCCTCCAAAATC ATCGATTCGTCATACTGAACACAACCACAAAGAGCCCAAACCAAATTGCTAATCCAAATCATTC CAATACCAACCGAATGGAGCCCAAACCACAAGACAGTCCAAATCCAACACAGTAGCACGTGTGA GTTGGCAAGGAGCTGAGGGGACAGAGAAGCTGCAGGTGCAAGAAGTAGCCACACCAGTGAGGAT GACAAAAATGAGAGCAAGGGGTGAGCATGTAGGAGTTGTGAGGAGCTACAGCAGCGCAATGGCA TGTAGCAATGGTGGAGGTGGTGGGGAGATGCAGATGACACGATTTCCACCAGTAAAAGGGCGCA GGATGATTCGGTTTCAGACATCCAGATGAGCCAGTGTAGGGATCTATCACAAGGTAAGGATAAT AAGGTCACATGTAACATGAGTCGGCATTAGTGACAATGACAGAAGTGATAAATACAGGGATGGA CACACCTTTTGGAGCTAATAAAGTGATTATGTCATTTTGGTGCTACAAATCTAAAATCGTGGAC TTTCAACACCACATATCAATTTGCCTTAAAGATCTTAAACATATACAGAATAAAAAAAACACGA GAAATAGTGTTCACGTGCGTTATTGATGGCGTATTTGCATGTGAACATAACTCAAAGCAGTTGC AAACTATTTCAACAAAATGATACATGAGAGGGCATTTGAAGGTCAGGAAGTTATATGGTTTTTG TCCCATTAAAAAATCCTTTTTAGCCAAAGCAGATAATTAACTAACTAGGTTCAGCACCACGCAG CAATGCAAAACAGGTCTGGTACTGGGCATTAATCACTATGATAAGAAATAAAAGCATGCAAAAA CAAAGAGAGAATTGATAAATACTACCTCCATCCTCCGTCCCAAAATATAAGGATTTTTAGGGTT GGACATGGGTATTGAGTAGGTGGAATTAAATGGGGAAGGTTGTGATTGGTTGACAAGAGGAAGT ACATGGAGAATTGGATGGTGGAAGGTTTCGATTGGTTGAGAAGGGAATGTAGCTGATCAGCTGC TATATTTTGGGACGGAGGGAATAGATTTTTATTTCTTTTTAAAAGAAAGACTCTCCTTTTGGTT TACATACAAAAAGAATCATCATCCATAGAGAAAAATAAGCCCAAAAGATTTCAGATTGTTAAAA CAGTAATCATGCAGTAATTATGACTCAAGCAGAAACCTTTTTAATATCGCTTTGAGTGTTACAA TCATCCTCCTTTGTTTCGCTATTCAACTTGGTTTGGTTGTCCCTAAGAAATTTCACACATAAAA TCTGTTACATATTAGAATAAAGAAATCAATACTTTAACCTGAATCATTGCACAAGATGTGAATA CTTTCATGCAATGCTGCATGTAGAGGCAAGAAGTGAGTAATACAATAATACATCACATACAAAA TTTTGAATATACTCAATTATTGTCAGCATTATGTTGAATTTATATATAGAATAAACAACATAGC TTCAAATGAGTTCGAAGGATGGCATAGAAGACATAATATGAATGCCTAATCGTATTCAAGAAAA AAAATCTGAATGCCTAATTATTGACTTAAATATATATGGGACGTTGTTATGGTCTACACCGATG TCCTCAGCCTCTCACCATATATGAAATATCATAACATAAGTAATCACTTATCGTGACGTGGACG CGGAGTTAGCTAAACAAATCCACACATCTTAAATGCACAGAAAAAAAAAAGGAGAAATGTTATA GTTTATACTTCTAGACCTTTACTAGCATTCATTAACTTCATAAGACATGTGCTACTACATGAAA GGATTAGAACATTAAAACAAGAGTAGTGCAACTTCACATATGTAAACATGGATTGATTTTGCTT ACAAATTAATAGTGTCATTTTTCAGTGATAATCACCCAGTAATTATATGTAAACTGGCATGGGA TTATGCAGCCAACCTTTTGCAGTCTTAGCCATTATTATAGGCAATAACAAACGATATCACTTGA CAACAAGTATATTAGTTGTCTTGAAAAATACGTTCCAAAAGTATATTTCAGGTTGTTTTACAAA TAGATTATTACGAAAATCAAAGTTTTGCAATCAAGACAAGAAGTAATATATTTAGTGATCAAGT GGTACAATCAGAAAATTGCCATTTTTTTACTACTAGCATAGCGCTCATCTTAAGTATCCTCAAC TCTAAAAATTATATACATACTACGAGATAGGAACCAGATTCACATGTGCATTGCATGCAACTTT ATTTAAAAAAAAACTTATAGACGACATACACATTACTACAAATGCCCCAAAAGATTACGAGTGA AAGATAGGGGTAGAGCTAGGGATGGTAAAGGGCCCAACATTTTAGCCTAGAAAATTTGAGGGTT GGGTCTAAAATGGGGTGGGTTGAACTTTTATACATTTTCACCTAGAAATATAAGGGCTAGGTAG GATTGTGAAAGAACCCATGGGAATTGACCCATTACCACCCCTAAGTAGAGCACAAAATCACACC CAATTACTCCAATTAAAAGGACTAAATATATTTTATGCAACCTTTCTATTTTAGTTGATTACTA TAATTTGCAACAGTGCAGTGTTTAGAAGTTTTTGTAGACACTTGTAATTGCTTATATTAAATAT TAGCATTTAGCAGTATGCTAACAACACACTTCACATCGAGGAAATCCATAGTAAGTTGAAAGTA ACTTAACTGCAGAAACACTAAATGTCTAATTTGAACTATGAATGTGACAAAACTATTGCAGTTA ATTGTTTCCTTTCTAAAAGTAACATAGTTGATAACCGAAAAAACATCATGTATAAGAAAAAAAG TGAATTGCAATCTGGGTCATCTTTTATTGCCAAAATTTCACTTTGGACCATCCTTTCCCCAATC TTTTTGCTTTGCATTAGCAAATTTTATGTTTGTTGCACTTTGGACCACCCCAACTATCTTCCTG GCATTCCTCTGGCATCTTGTATGGCCTGGTGGAGGGAAGACGCCAGGTCACCAGCATGCCAGAG CCGATGTGCTCGAGGTCATTGATGTGATAAATAAGTGGTTTGGGGTGGTCCAAATTGCAAAAAG GTAAAATTACCTAGCCCAAAGTGGAAAGATTAGGCAAAGGTGGTCCAAAGCAAAACTTTGGCTA TGAAAGGTGGATCAAACTCACTCGTAAGAAAATTATCATGCTAAAGGTAAGAATCATATGGCAT CATATATAAGATATAAAGATAGTAGTTAAAGTGTGGTTTTCATTTGTTATAAATCATGGTCACA TTAAATCAATCTGAATTGAAGGAAGAAAATAAAGGGTGCTCAACAACTACAGTTTGCAGACTAC AAGTATCAGATCCTGGTATGCCAGATGCATTAGAATATGAAATATTTGCAGCCAATTACAGAAA GTAGTTTTATTAGCTTGTATAGATACTTTGCTGGCCAGTATTCATGTTCGTCACAGATAAAACA GTTTACCTGATTGAAGTGGCATAGTTAACATACCTCTTTGATATCTGCTCTTTCTCCAAGGTAA CATCGGCTTCAGCTAGCATCACCTTCTTGGCATCATCGATACATGGTGACTTCAACTTTTTGGA ACCACTATGATCCTGATCTTGGTGGGCTTTATCCTCGTTGCTGCAACCGGTGTGCTTTCCAGTG TTTGCCACCTTCAGTTTCTTTTTT |