Splice junction sequence |
CAACTTTTTGGAACCACTATGATCCTGATCTTGGTGGGCTTTATCCTCGTTGCTGCAACCGGTG TGCTTTCCAGTGTTTGCCACCTTCAGTTTCTTTTTTctttttaatatcgctttgagtgttacaa tcatcctcctttgtttcgctattcaacttggtttggttgtccctaagaaatttcacacataaaa tctgttac
|
Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
|
Full-length trsnacripts |
Transcript length: 253 Transcript exons: 11070534-11070603,11072835-11073017 CTTTTTAATATCGCTTTGAGTGTTACAATCATCCTCCTTTGTTTCGCTATTCAACTTGGTTTGG TTGTCCCTCTTTGATATCTGCTCTTTCTCCAAGGTAACATCGGCTTCAGCTAGCATCACCTTCT TGGCATCATCGATACATGGTGACTTCAACTTTTTGGAACCACTATGATCCTGATCTTGGTGGGC TTTATCCTCGTTGCTGCAACCGGTGTGCTTTCCAGTGTTTGCCACCTTCAGTTTCTTTTTT
|
Genomic sequence |
CTTTTTAATATCGCTTTGAGTGTTACAATCATCCTCCTTTGTTTCGCTATTCAACTTGGTTTGG TTGTCCCTAAGAAATTTCACACATAAAATCTGTTACATATTAGAATAAAGAAATCAATACTTTA ACCTGAATCATTGCACAAGATGTGAATACTTTCATGCAATGCTGCATGTAGAGGCAAGAAGTGA GTAATACAATAATACATCACATACAAAATTTTGAATATACTCAATTATTGTCAGCATTATGTTG AATTTATATATAGAATAAACAACATAGCTTCAAATGAGTTCGAAGGATGGCATAGAAGACATAA TATGAATGCCTAATCGTATTCAAGAAAAAAAATCTGAATGCCTAATTATTGACTTAAATATATA TGGGACGTTGTTATGGTCTACACCGATGTCCTCAGCCTCTCACCATATATGAAATATCATAACA TAAGTAATCACTTATCGTGACGTGGACGCGGAGTTAGCTAAACAAATCCACACATCTTAAATGC ACAGAAAAAAAAAAGGAGAAATGTTATAGTTTATACTTCTAGACCTTTACTAGCATTCATTAAC TTCATAAGACATGTGCTACTACATGAAAGGATTAGAACATTAAAACAAGAGTAGTGCAACTTCA CATATGTAAACATGGATTGATTTTGCTTACAAATTAATAGTGTCATTTTTCAGTGATAATCACC CAGTAATTATATGTAAACTGGCATGGGATTATGCAGCCAACCTTTTGCAGTCTTAGCCATTATT ATAGGCAATAACAAACGATATCACTTGACAACAAGTATATTAGTTGTCTTGAAAAATACGTTCC AAAAGTATATTTCAGGTTGTTTTACAAATAGATTATTACGAAAATCAAAGTTTTGCAATCAAGA CAAGAAGTAATATATTTAGTGATCAAGTGGTACAATCAGAAAATTGCCATTTTTTTACTACTAG CATAGCGCTCATCTTAAGTATCCTCAACTCTAAAAATTATATACATACTACGAGATAGGAACCA GATTCACATGTGCATTGCATGCAACTTTATTTAAAAAAAAACTTATAGACGACATACACATTAC TACAAATGCCCCAAAAGATTACGAGTGAAAGATAGGGGTAGAGCTAGGGATGGTAAAGGGCCCA ACATTTTAGCCTAGAAAATTTGAGGGTTGGGTCTAAAATGGGGTGGGTTGAACTTTTATACATT TTCACCTAGAAATATAAGGGCTAGGTAGGATTGTGAAAGAACCCATGGGAATTGACCCATTACC ACCCCTAAGTAGAGCACAAAATCACACCCAATTACTCCAATTAAAAGGACTAAATATATTTTAT GCAACCTTTCTATTTTAGTTGATTACTATAATTTGCAACAGTGCAGTGTTTAGAAGTTTTTGTA GACACTTGTAATTGCTTATATTAAATATTAGCATTTAGCAGTATGCTAACAACACACTTCACAT CGAGGAAATCCATAGTAAGTTGAAAGTAACTTAACTGCAGAAACACTAAATGTCTAATTTGAAC TATGAATGTGACAAAACTATTGCAGTTAATTGTTTCCTTTCTAAAAGTAACATAGTTGATAACC GAAAAAACATCATGTATAAGAAAAAAAGTGAATTGCAATCTGGGTCATCTTTTATTGCCAAAAT TTCACTTTGGACCATCCTTTCCCCAATCTTTTTGCTTTGCATTAGCAAATTTTATGTTTGTTGC ACTTTGGACCACCCCAACTATCTTCCTGGCATTCCTCTGGCATCTTGTATGGCCTGGTGGAGGG AAGACGCCAGGTCACCAGCATGCCAGAGCCGATGTGCTCGAGGTCATTGATGTGATAAATAAGT GGTTTGGGGTGGTCCAAATTGCAAAAAGGTAAAATTACCTAGCCCAAAGTGGAAAGATTAGGCA AAGGTGGTCCAAAGCAAAACTTTGGCTATGAAAGGTGGATCAAACTCACTCGTAAGAAAATTAT CATGCTAAAGGTAAGAATCATATGGCATCATATATAAGATATAAAGATAGTAGTTAAAGTGTGG TTTTCATTTGTTATAAATCATGGTCACATTAAATCAATCTGAATTGAAGGAAGAAAATAAAGGG TGCTCAACAACTACAGTTTGCAGACTACAAGTATCAGATCCTGGTATGCCAGATGCATTAGAAT ATGAAATATTTGCAGCCAATTACAGAAAGTAGTTTTATTAGCTTGTATAGATACTTTGCTGGCC AGTATTCATGTTCGTCACAGATAAAACAGTTTACCTGATTGAAGTGGCATAGTTAACATACCTC TTTGATATCTGCTCTTTCTCCAAGGTAACATCGGCTTCAGCTAGCATCACCTTCTTGGCATCAT CGATACATGGTGACTTCAACTTTTTGGAACCACTATGATCCTGATCTTGGTGGGCTTTATCCTC GTTGCTGCAACCGGTGTGCTTTCCAGTGTTTGCCACCTTCAGTTTCTTTTTT |