Detailed infomation of each circRNA
Conservation Information | |
---|---|
Conserved circRNAs | NA |
PMCS | 0.09987582 |
Functional Information | |
---|---|
Coding potential | Y |
Potential coding position |
11872965-11879115(+) |
Potential amino acid sequence |
MYLRPPFASEEIKIDDWIKVRQCGIRYYLSLGDQRIVDKYFIIRPKAEFEVGRTTLGGLLALGY SVVVSFKRTCTSVSRDQLLIAAETIDTLNETFLVLKGPSRKIVAAEARKLGIKGPWITKSYLEM ILESKGVPRLNTPPPISRKLLTESQEKKIVAPKPIRVSTENVANFDDFAQPWTRSPPKKFDQEP VMGKWQFNQDSSSGSNIQLAPLPDSYDLDRGLLLSVQAIQALLENKGFPVIVGIGGPSGSGKTS LAQKMANIIGCEVISLESYYKPEQVRDYKYDEYSSLDIGLLTKNIMEIRKNHKAEVPCFDFEKC KRKKFEELQVSEECGVLPDGHNLYFFNQNEGETENFIEMYLRPPFASEEIKIDDWIKVRQCGIR YYLSLGDQRIVDKYFIIRPKAEFEVGRTTLGGLLALGYSVVVSFKRTCTSVSRDQLLIAAETID TLNETFLVLKGPSRKIVAAEARKLGIKGPWITKSYLEMILESKGVPRLNTPPPISRKLLTESQE KKIVAPKPIRVSTENVANFDDFAQPWTRSPPKKFDQEPVMGKWQFNQDSSSGSNIQLAPLPDSY DLDRGLLLSVQAIQALLENKGFPVIVGIGGPSGSGKTSLAQKMANIIGCEVISLESYYKPEQVR DYKYDEYSSLDIGLLTKNIMEIRKNHKAEVPCFDFEKCKRKKFEELQVSEECGVLPDGHNLYFF NQNEGETENFIEMYLRPPFASEEIKIDDWIKVRQCGIRYYLSLGDQRIVDKYFIIRPKAEFEVG RTTLGGLLALGYSVVVSFKRTCTSVSRDQLLIAAETIDTLNETFLVLKGPSRKIVAAEARKLGI KGPWITKSYLEMILESKGVPRLNTPPPISRKLLTESQEKKIVAPKPIRVSTENVANFDDFAQPW TRSPPKKFDQEPVMGKWQFNQDSSSGSNIQLAPLPDSYDLDRGLLLSVQAIQALLENKGFPVIV GIGGPSGSGKTSLAQKMANIIGCEVISLESYYKPEQVRDYKYDEYSSLDIGLLTKNIMEIRKNH KAEVPCFDFEKCKRKKFEELQVSEECGVLPDGHNLYFFNQNEGETENFIEMYLRPPFASEEIKI DDWIKVRQCGIRYYLSLGDQRIVDKYFIIRPKAEFEVGRTTLGGLLALGYSVVVSFKRTCTSVS RDQLLIAAETIDTLNETFLVLKGPSRKIVAAEARKLGIKGPWITKSYLEMILESKGVPRLNTPP PISRKLLTESQEKKIVAPKPIRVSTENVANFDDFAQPWTRSPPKKFDQEPVMGKWQFNQDSSSG SNIQLAPLPDSYDLDRGLLLSVQAIQALLENKGFPVIVGIGGPSGSGKTSLAQKMANIIGCEVI SLESYYKPEQVRDYKYDEYSSLDIGLLTKNIMEIRKNHKAEVPCFDFEKCKRKKFEELQVSEEC GV(+) |
Sponge-miRNAs | NA |
circRNA-miRNA-mRNA network | VISUALIZATION |
Potential function description | NA |
Other Information | |
---|---|
References | Chu et al., 2017 |