Splice junction sequence |
TTCTGTTTTGCTTCTCAGGTGTCTGGACTTAAATCAATTACATCTAAGCATTTAGCTCTGGCGA GTCAAATCATTAGTTTTATACATTCTTTAATTCCAGggctgatgtcttgagagaaaacactgaa gcagttttcgcggcttgtgatgctgcccatggacgatgggctaagctactaggtgttcgtgctg gattacat
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 836 Transcript exons: 101422294-101422465,101422561-101422644,101423601-101423 944,101424214-101424367,101425951-101426032 GGCTGATGTCTTGAGAGAAAACACTGAAGCAGTTTTCGCGGCTTGTGATGCTGCCCATGGACGA TGGGCTAAGCTACTAGGTGTTCGTGCTGGATTACATCCCAGGTTAAGGCTTGAAGAATTCTTGA TCATCTACAGCATAACAGAAGAATTTATAGCTGCTACAGAAAAGATTGGAGGCAGGTTGGGTTA CAACATTCGTGGAATCCTACAACAACAATCAAAGCAATTTGTTGATTATCAGCATAATGTTCGG ATGACAAAAATCAAGGCAGTTCTTGACCAAGAGACGTGGGTTGCTGTGGATGTTCCTGAAGAGT TTCAAGCAATCGTTCTTTCACTTTCATCCACTTACTCTTCTGTTAATGGCATGGAGATGCCTAG CACTGATGATAACTCAAAGTTCAGTGATCATCAGCCTACAAGTCAAGAACTGACATATTCTGCT GAAAATAATGCTGATAATGGCAAAGTAACATCCGGGACTGGTGAAAACCAGGTTGAATCCACTT CTCAGAGTGCAAATAATGTTGCCGGGAATCTGAAATCCACCTTGCAAACAATTGTACATGGAGG TGTTGGCTATCATATGGTAAACTGCGGTTTGATACTGTTGAAGATGTTATCTGAATATGTTGAC ATCAGTAAATGTTTACCATCACTATCTTTGGAGGTGGTCCAACGTGTTGTGGAAATATTGAAGC TTTTCAACACTAGGACTTGCCAACTTGTTCTCGGTGCAGGGGCCATGCAGGTGTCTGGACTTAA ATCAATTACATCTAAGCATTTAGCTCTGGCGAGTCAAATCATTAGTTTTATACATTCTTTAATT CCAG
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Genomic sequence |
GGCTGATGTCTTGAGAGAAAACACTGAAGCAGTTTTCGCGGCTTGTGATGCTGCCCATGGACGA TGGGCTAAGCTACTAGGTGTTCGTGCTGGATTACATCCCAGGTTAAGGCTTGAAGAATTCTTGA TCATCTACAGCATAACAGAAGAATTTATAGCTGCTACAGAAAAGGTTACATCTTCTTGTTTGGA ATAAATACACAAAATCAGCTGCATTAATTGCATATAAGCAAGTTGTAATGTTATCTTAGCCTCT TATTCTTGTAGATTGGAGGCAGGTTGGGTTACAACATTCGTGGAATCCTACAACAACAATCAAA GCAATTTGTTGATTATCAGCATAATGTTCGGGTCAGTAAAACAATGTTACAGTTCTATTGTCGA AGTTAAACCCTATTATTCAAATTTCACCTATTTGATTAGAAGCTTCCAAAATAATCATTGATCA TCATTATTGGAAGGAACAAAAAGCACCCAACTTTCCCTTCTTAATTAGGGATGACTGGTTGTCC ACCAAGCTGAATACAGCACATATGTTCAATTCAAGTATAACTTTGTACCCTTTTTTTACATTAA CAGTAGTTGATCTTTACTGAAACTCCCCCTATTACAAATTATGAGTCATTCTAATTTTATAGGT ATATAGTTTTGTTATTCTTCTAGATATATACTATGTCTAGATACTACTACCTCCGTCTTGAATA TTTGTCGCCCTCTAATTTATTTTTGAACTAAAACGCGACAAATAAAAAAGAACTGAGGGAGTAG TTTTTATTATGTATCTAGAAAAGCCAGAATGACTTATGACTTATAATTTGGAACAAATGGAGTG TTTCTGAGATCAAAATGGTGGTGGAATGAAAGATTTTAATTAATGAAGTTCATCTTCTCTAGAT ACTCAAATTATGTGAGTTTTGGATTATCCAAGGTTGCGAAAGGGCCTCCAGCCGAGTTGGTTAG GTGGTCTGAGTAACACTCCTTAGGTCCTGGGTTCGACTCCCCGTAGGAGCGAATTTCAGGTTGC GGTTAAAAAATCCCCTCGTCTGTCCCACGCCAAAGCACAGGTCTAAGTCTCAGCCCCGGTCGCG GTCGTTCTCACATGGGCTTCGATGCCGCAGTGTATGGGTGAGACAGGGGTTCGGGGGTCCTTCG ATCTGTGTGAGAAGGTCTTCTTCTTAATACAATACTCGGGGGCTGTCTTACCCCCCGCAGTTTT TTTGGATTATCCAAGGTGCTTGATAGTTAGGGCTAGTTAAACTAAATTGTGTTTCCCCTATTGT TTCAAACTGAAACCTTTTTTTTTCAAGATGACAAAAATCAAGGCAGTTCTTGACCAAGAGACGT GGGTTGCTGTGGATGTTCCTGAAGAGTTTCAAGCAATCGTTCTTTCACTTTCATCCACTTACTC TTCTGTTAATGGCATGGAGATGCCTAGCACTGATGATAACTCAAAGTTCAGTGATCATCAGCCT ACAAGTCAAGAACTGACATATTCTGCTGAAAATAATGCTGATAATGGCAAAGTAACATCCGGGA CTGGTGAAAACCAGGTTGAATCCACTTCTCAGAGTGCAAATAATGTTGCCGGGAATCTGAAATC CACCTTGCAAACAATTGTACATGGAGGTGTTGGCTATCATATGGTAAACTGGTTAGTCATCTAT ATTTACCTTCCAATAATTTGAAACTTGGTCTCTACTTATGAATTTTGCACTGCTGAAATGAAAT GTGTTCAGTAGCCATCAATCTGTAAATTTAGTTTAAATAAAATAAATGTAGTATTTGATGCAGC CATGTCTTTTATTGATTTGTTCTTGTTATTTTTAGAGTTCATTATTCTAAGTTATTACATTAAT ATAAAGCATATTTATTCTTTTGGAATCCATGCCTCTCTCTTACAATGCTTTATTGGTTCTGCAG CGGTTTGATACTGTTGAAGATGTTATCTGAATATGTTGACATCAGTAAATGTTTACCATCACTA TCTTTGGAGGTGGTCCAACGTGTTGTGGAAATATTGAAGCTTTTCAACACTAGGACTTGCCAAC TTGTTCTCGGTGCAGGGGCCATGCAGGTACATTAGCATGCCATTTCAGTTATTATCAATGCCTC TTTATTTCATTGGCAACTGTATGCAAATGTTTAATGTGATTTTCACTTGATGTTAGTAATGTTT GCTTGCATTTTTAAAGAACCTGAGCTGCATACATTGATTGAACCACATGCATCAGTGCATGAAG CAACTGTTTGCAAAATAAGCTGTTCCTATATGGACACTATTTTAATCATTTTTTTCTCGAACGC GCAGGAGAGCTGCACATCATTTACTTAAGAGGAGAAAAAGGTCCAAAATGGACCTAGATACAAA GCCTACAAAAGGCAATAGAAAGCACACCCACTCACAGTCTGGCCTGCAACTATACTGCAGCACC ACTACTAGATGGTTACAGCGAAAAAACTGCAGGCAGACCCCCAAACACTACAAACACTACGCCC CGACTCTATTAAGGGCGACCTCTAGGTCTAAAATCTCAAGATGTTTAGCTCCAGCCTTACTCCA ACATACCAACTCATCTAAGAAAATCCATCGAACTGTGGTTAAAGAAGAGTTCTCTCCATTAAAG ACTGCCTTGTTACGGTGAGTCCAAAGGCACCCGGCCCCTAGAATGATGACGCCACTCAATCCCT TTCTCTTGCTTTTGTGCACCTTCTTACATACCTTTCTCCACCATTCTGCAAAAGAGATCTCATC CCCAGACGGAGAGAGATTGCCAAATCAAGAGTAAAAGGTCTCTAACTTCAGAACCCAAAAGATT GGAAAAGAAACCATCCAACACCTCCTGCATTTGCTCATGATTGGTGACAATCCTCCCATCATCT TCTAATTTAGAAATAAAATTCCTCTTCTTGCGGAGACAAGCCTGCATGTGAAAGAATTTTGTGT TGGCGTCATCATCCTTCAAATAATGAACCCGCGGCCTCAAGCGTGCAACTGGTCCAAAGAAACA AGGACAAGGCAGTGCTGCTTCAGCTTTCTCAGTAACCAACCTTCCTCTACAGACAATACCCTGC TGTCTTGAGCTATCTCCAATTTATGTAGCACCTCACGAGCTAATCCCAATTGGAACCCAATATT GCCTACCAGTTTGTGCCCCAAGACTGCAGCCTTCTGGATAATCTTTTAAGCTTCAAAGACACAT CCTCAAGAGGGCAGGAGCCTTGAATCGGCTGGTTCCAAGAGGCAGCAACCTCTTCCAAGAACCC AGGGAACTTGGGCCAGAAACTTTCGAAATGGAATCTGCGCTCCCCCCTGAGATCCACTCTGAGC TTGAGGATCAGAGGACAGTGGCCAGAGATTTCAGTTGCACTGCTACAAAACATACAGTCAGGAA AGAAATCTTCCCAGCTGCTAGTACAGAAAATATGGTCCAGCTTAACAAGAGTGGGATCCTCCCT GTTAGCGTATCTGTGTATATGGGCCTGGCCCACTAGGGTTCTATATACTTGTACCCCTGTAGCT GCTAGGGTTTCATTGTATTATACTCTATCACACTCCCTTTGATCAACCTCAAGAGCTTATTTCA TTTAGAAGCCCAGTATTCTTTCTTGCAATAGTTCTAACTTGTTGGCATTTTTTTTTTCTGTTTT GCTTCTCAGGTGTCTGGACTTAAATCAATTACATCTAAGCATTTAGCTCTGGCGAGTCAAATCA TTAGTTTTATACATTCTTTAATTCCAG |