Splice junction sequence |
GGAGGAGGTTGTCATGCGATTCTTCAAGGATCCTGTAGTTCCTATTGTTGATGACTGGGGAAGC TGCGTGGGTATTGTTCACCGACAGGATTGTACCAAGgggctctttgcatttttggtgagataat aaagcaggctggcaacaacaaagacttgagacccaaacctcatctttatctttcaattatgaga gcttttgc
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 557 Transcript exons: 15795524-15795756,15797468-15797545,15798727-15798795,15 798884-15799060 GGGCTCTTTGCATTTTTGGTGAGATAATAAAGCAGGCTGGCAACAACAAAGACTTGAGACCCAA ACCTCATCTTTATCTTTCAATTATGAGAGCTTTTGCTACCATAGGTGATTTAGATATGGTCAAG AGACTGAACAAACGCATGTGGCCAGATTCAGTTGGATCAATTAGCCGTTCGGCAAAAGAAGAGG CAGATGAACTACTAATGGAAGCTGCCCTCAATAATAATCAGATTGACATGGCTAGAGGACTTCT AAGAAGAATACTGAATGAGAAGGAATGTTTCTCTTGGACAAGTAGAGTAGGCATGGTGGCAGTT AAAGTTGAAACCCTGTCTGGATTCACCAACTCTCTTCTTAGACCTCATGTTTTTCCACAGATTG TCTTGAATGATCCTGTTGAGAAGTATATGATTCCATTTCAAGAAACCCAGCCATTGCATGCTGA CTTAATCTTGGAGGAGGTTGTCATGCGATTCTTCAAGGATCCTGTAGTTCCTATTGTTGATGAC TGGGGAAGCTGCGTGGGTATTGTTCACCGACAGGATTGTACCAAG
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Genomic sequence |
GGGCTCTTTGCATTTTTGGTGAGATAATAAAGCAGGCTGGCAACAACAAAGACTTGAGACCCAA ACCTCATCTTTATCTTTCAATTATGAGAGCTTTTGCTACCATAGGTGATTTAGATATGGTCAAG AGACTGAACAAACGCATGTGGCCAGATTCAGTTGGATCAATTAGCCGTTCGGCAAAAGAAGAGG CAGATGAACTACTAATGGAAGCTGCCCTCAATAATAATCAGGTAGACATGAAATTTATTTATTT GATAATATGATTCGGATTATTAACCATGAAATACTTTGGTCATCTTACTCCTAACTTCACTAAA TTTTGACTAGGATGGGTAAATAGCATCATCTTCTGTTTTGAGGTGCATACTAGGTAGGAAAACA GTAGTGCCTTTTGTGTAAATTTAGTCTAAACTATTGACACCCCTGTCAAGAATGTGAAAATGCT AAAATGTATTTAGTATTAAAGGGATCAAGGAACAATTTTCATCCAATAAATCAACTTATTCCAA CATGCACCCTTTTCAATGTCTTTGATTTTTTTTAGCAAGAACAGAAAACTTTATTTTCTTTTCT TGTGATTTCAAAGGTCCATGATGTTTCATTATTTGACTACAAGTATATTCTTCCCATTTTTCAT ATTATAATAGATGGGTATGCATTGTGATTTGTGGAAAACATATGTGGAACCCGGGGAGCTGGTG TTTTCATCAACGAAAACACAATAAAGTCATAAAGTTTATGAACCTTCCAAATCCTCTCTAACTT TATAAGTTAGAGGTCACTAATTCCTAAAGCTTAACATGCAAAGATGTCACATTATCATCTACGA ACAATTATTACATTTAAGCATCATGCAAGCATGCTATATTATCTATAATTAATAATTTATTAAA TTTTAGAGATTTAAAATGTAAGCATGTTAAATCATTCCACATAATTCACATAAATTTCAATATA TCTCTCTTATCAATTTTAATATCCTATATACCTATATAGTTTTTTTATGAAATATATACCTATA TAGTTCATCATCACTTAGTTCATATTATTTTTCTTTTATCTCATTAAGTCATATCACATCAATT GTTTTTAGCCCTTAGATGATTAATCTATGGTTTAAATTACCTTTGTTCTTTTGTTCTCTCATTA AGCCATATCATCTCAATGTTTTAGCCCTTAGATGTATGGTCTAAATTATCTTCTTTCTTTTGTT CTCTCATAAAGTCACATCATCGTACTTTTACATTTGAATCATCATTCTACATACTATTTAAATT TAAATTACATCAACTTATGTAAACTTATGTTTATGTAAGCTTATATTGTTTAAGCTATCTTACA CATTATACTTATTATTATCATAGTAAACTCCCACAGCAATGCGCGGGGTTTCACCTAGTTTAAT ATATGTCCCTGTTGTGAATAATGAAAGAAAACAAACAATACTTTAATATGAGCTGTGCATGACT GACTTGTTGCCCTTTTATGTTGTTTATATAATGGATGAATTTACATTGAAATTTTTTCATGATT ACATAAATTTATGTGCATTATTTCTATGAAATTTTAGGTATTTTACTATTTTGGAACAGTAAAA TGTACATTATGCTGGTTTCACAAAATGGCTCCCCTGAGCTCAAAGAATTTTTTTCCAATTATAT TTTATTGCTTAATTGAATATTTATATGAGCTTAGTGTTATGTGTTCACAATATCTTGAGAAAGC AGAATTATTTTAAAATAAGGTCTGCTTTAAATGCTAAACTGCCACTTAGCCTATATATTAGTAC CAAATATAACACAGCAGTGCAATGTTCATGAGTTTGCTTCTCTGTCTAGGATTTCTGTTATTCT TTTTTTCCTTGGATGTGTTTGCTTTTCTTTGTTAAATAGACTTCAAATTTTCATGATTCTACCA CTAAAAGACTCTTTTTTCCCCCAGATTGACATGGCTAGAGGACTTCTAAGAAGAATACTGAATG AGAAGGAATGTTTCTCTTGGACAAGTAGAGTAGGCATGGTATTCTTCTTTCGATTGTGTTCTTA AATAGTATTTCACTTCATTGATTATAAAGGTTAGCTACATCATGGACATGGAACAATTATCTTG AAATCCTAACTTCTTATGTGAACCTACATGCTCTTGGCATGTTTTGATCTTACAATGCAAAACT GAACGCTTCCAGTCTGGCTGCGCCCGCCCTATTATATATTTCTGAACACATTATGTATGCTTGA ATAATTTGTTCTTGAATATAATTTCATTTACCTAGATTTTTTATATTTTAAGATTCATTAGTAT TACACGGGTGAACTACATAATTCTTGTCAGCATAGTCTCTGATGTTTCTGAACTCACTATTGTG CATTATTGTAGCCATACAACAAATACTGCAAATTTTCTGAAGAGTATAATTGGTTTCAGCAAAC TGTACCTTAAGGCTTCCCAAGTGGTGTGAAATTGCATATCTAGTTTATAAGATATTCATAATAT TATGTAGAAAAAAAAAGTTTCAAGCCTGTGCAATCTTGTTATGGCCTTATTTTTAAGTGAACTA TCCTGTCAATGTCTTATGAAAATCTATTTGGTTGTAACAGTAAAAAAATAGGAAGACCTGTGAA CTATATCTTTTCTTTTCCTGATGCCTAAAAGTTGAATATTTTCATGTTGTTCTGAATGGGTGAA ACTGCGGGTTTAGTTTGAAGTTGGGACCTGGTTCCAGAAGCATGTAGAAAATAACCAAATGTTC ATTGCAAAATAAAGTCAAACGTTCTTTTCTGTTCTGACAGTTCTATTAAGGCCTGGTTTAGTTC CCAAATTTTTTTCCCAAAAACGTCACATCAAATCTTTGGACACATGCATGGAGCATTAAATATA GATAAAAACAGAAACTAATTGTATAATTTGCATGGAAATCGCGAGATGAATCTTTTGAGCCTAA TTAGTCCATGATTAGCCATAAGTGCTACAATAACCCACATGTGCTAATGATGGTTTAATTAGGC TCAAAAGATCCATCTCGTGATTTCCAGGCGAGTTATGAAATTAGTTTTTACATTCGTGTCCGAA AACCCCTTCCGACATCCGGTCAAACATCCGATATGACACCCAAAAATTTTCTTTTTGCGAACTA AGCACACCCTAATGTAATGTGTAAAGCACCACCCCTTTTTAAGTTTATTTTATTCTGTTTGTAC CAGGTGGCAGTTAAAGTTGAAACCCTGTCTGGATTCACCAACTCTCTTCTTAGACCTCATGTTT TTCCACAGGTTGGTGCCTGCTGTGTTCATATTTTTCTACCCCTTTCTCCACTGCACTCTGCTTG CCATATCTGAAGTATGTCTATTGGCATCACAGATTGTCTTGAATGATCCTGTTGAGAAGTATAT GATTCCATTTCAAGAAACCCAGCCATTGCATGCTGACTTAATCTTGGAGGAGGTTGTCATGCGA TTCTTCAAGGATCCTGTAGTTCCTATTGTTGATGACTGGGGAAGCTGCGTGGGTATTGTTCACC GACAGGATTGTACCAAG |