Splice junction sequence |
GTCTCGTTGTTCTGTCTGAAAGTTTTGGCCATTCTGTATTTAAAGATTCCTTTAAGAGGATGTT TGAAGATGGCGAGCACTCTCTTGGTCTCTGCTTCAActtttggatgagctccaatcagaccagt ggcctgttcagccaggtcatcgtccccaacgatgcacaggggttgcattgagtgtagctgcagg attgcttg
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 479 Transcript exons: 8168487-8168660,8168772-8168933,8169645-8169787 CTTTTGGATGAGCTCCAATCAGACCAGTGGCCTGTTCAGCCAGGTCATCGTCCCCAACGATGCA CAGGGGTTGCATTGAGTGTAGCTGCAGGATTGCTTGGAGCTTGCTTACCTGGAACTGGTGCTAG AATTGTAGCTTTGGTTGGAGGTCCATGTACAGAGGGCCCTGGAACGATTATCTCAAAGGATTTG TCAGATCCTGTGCGCTCCCACAAAGATCTAGATAAAGATGCTGCTCCTTATTATAAAAAAGCTG TAAAGTTTTATGATAGTATTGCAAAGCAGCTTGTCGCTCAGGGTCATGTGTTAGACCTTTTCGC TTCTGCACTTGATCAGGTCGGGGTTGCTGAAATGAAAGTAGCCGTTGAAAGTACCGGTGGTCTC GTTGTTCTGTCTGAAAGTTTTGGCCATTCTGTATTTAAAGATTCCTTTAAGAGGATGTTTGAAG ATGGCGAGCACTCTCTTGGTCTCTGCTTCAA
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Genomic sequence |
CTTTTGGATGAGCTCCAATCAGACCAGTGGCCTGTTCAGCCAGGTCATCGTCCCCAACGATGCA CAGGGGTTGCATTGAGTGTAGCTGCAGGATTGCTTGGAGCTTGCTTACCTGGAACTGGTGCTAG AATTGTAGCTTTGGTTGGAGGTCCATGTACAGAGGGCCCTGGAACGGTTAGTGCTTATTGATTC CTCGGTTGATGGCACTCTCAAGTTTTATCGCTCCATATTTTGAACCATATTTGTTATATTCTGA ATCAAATTTTCTTTCTTTTGTCTTTTCAGATTATCTCAAAGGATTTGTCAGATCCTGTGCGCTC CCACAAAGATCTAGATAAAGATGCTGCTCCTTATTATAAAAAAGCTGTAAAGTTTTATGATAGT ATTGCAAAGCAGCTTGTCGCTCAGGGTCATGTGTTAGACCTTTTCGCTTCTGCACTTGATCAGG TATTAATTGTCGTGATTATAGTTTGCTTGTTGGCATGATGCCCAACCTCTGGTTTTGTTCTTCA GGTATAAATGTGTAGTTTCTTGCAATGCTTGATTTTTCAATTTTGTCTATGTCGCTGTTATATT TTAGCTAAAATGAATGCCATGCCTCATTAACTCTCTGAAAGTGTTGTTTTATGTGTATGATCTT GAATATGTATTCTTAGTTACTAAATTGTTAGGTGAATTTGACATTGTTGATGCACACCAATTGT GAAAGCTCTTACTTGTACTCGAGTTGTTTAACTAACCTGTGATCACCAGTTTCTATTCTTTTCC TTCTGATTATTTTTGCAGATGTTAGTAGTTGCGCACGAAAGAGCGTCCATTTGTAGATATCTGT TACATACATTTTGAAATTTTGAAGGGCAATCTATGTGATTGTTTTAGAACATCCCTTTAATCTA GAAATCAGAATTGTTTCTTTTAACACTATAGAAAATATGCTTTCCCAAGCCATATCAGAAACCC CCGCTTTTCTATTCACATTGTTTTCCTTTGCCTCATGAAAGACGTATTATATCAATACCATGTT TTCTTTTTAACTTCAGTGTTGATAGGCTTTGCTTGTTGTATCTATCAAAAAATTCCACTTTAGC TATCATTTCCATCACATGATACGATACCTAACTATAATTGTTTCTGCTGTTGCATTTTGGGTAT AGTTAGGTCGGGGTTGCTGAAATGAAAGTAGCCGTTGAAAGTACCGGTGGTCTCGTTGTTCTGT CTGAAAGTTTTGGCCATTCTGTATTTAAAGATTCCTTTAAGAGGATGTTTGAAGATGGCGAGCA CTCTCTTGGTCTCTGCTTCAA |