Splice junction sequence |
CCTTGATGAGATCCCAGACAAGTCCCTCAAGAGCAAAGATGGTTCAAGAGTCTGCAAAGATTTT GTTAGTTTGGTAAAAGAGTGGCTTCAAAAGATTCAGgtttgatctgtacttcaggaaaaatcca tttggtggagaattcactgtttttgctggtcttgaagaatgcattaagttcattgcaaatttta agttcaca
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 640 Transcript exons: 21313321-21313465,21313689-21313808,21313905-21314039,21 314147-21314208,21314449-21314524,21315200-21315301 GTTTGATCTGTACTTCAGGAAAAATCCATTTGGTGGAGAATTCACTGTTTTTGCTGGTCTTGAA GAATGCATTAAGTTCATTGCAAATTTTAAGTTCACAGAAGATGACATTTTGTTCCTGCAATCAG TCATGCCAATGTGTGAGGATGCGTTCTTTGATTATCTCAGGAAAACCGACTGCTCTGATGTGGA AGTGTACTCCATTCCTGAGGGTTCAGTGGTTTTTCCAAAAGTTCCTTTGATGCGAGTTGAGGGT CCAGTTGCTGTGGTCCAACTACTTGAGACACCGTTTGTAAATCTTATCAATTATGCCTCTTTGG TAACAACAAATGCTGCGAGACACCGCCATGTTGCTGGAAAATCAAAAGTTTTACTGGAATTTGG TTTGAGACGAGCACAGGGGCCTGACGGTGCAATAAGTGCTTCAAAGTATTGTTTCATGGGAGGT TTTGATGCAACCAGTAATGTTTTGGCTGGAAATCTGTTTGGCATACCACTTCGCGGAACACATT CTCATGCTTATGTTAGCTCATATATGAGCCTTGATGAGATCCCAGACAAGTCCCTCAAGAGCAA AGATGGTTCAAGAGTCTGCAAAGATTTTGTTAGTTTGGTAAAAGAGTGGCTTCAAAAGATTCAG
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Genomic sequence |
GTTTGATCTGTACTTCAGGAAAAATCCATTTGGTGGAGAATTCACTGTTTTTGCTGGTCTTGAA GAATGCATTAAGTTCATTGCAAATTTTAAGTTCACAGAAGATGACATTTTGTTCCTGCAATCAG TCATGCCAATGTGTGAGGTAAGCTGTTACATAAAATTATCTTTCTGTCTTAAAGTGGCATATGG TTCTGATATAAGCTGCTATACTATCTAAAATCCTATTAATTTGCCATATTTATAGAAAGGCTTG TTAGCATAGTCTACAAAAACATTGCCATTTCAAATGTCAGATCTTTAATGTATCACTTGTTAGT TGTTTGCCATGATAAATGTTCATTTACTGATGTGATATGCGATTCTAGGATGCGTTCTTTGATT ATCTCAGGAAAACCGACTGCTCTGATGTGGAAGTGTACTCCATTCCTGAGGGTTCAGTGGTTTT TCCAAAAGTTCCTTTGATGCGAGTTGAGGGTCCAGTTGCTGTAAGTACAGAGTCCCTTAACAAT TGTTGTACCTAAAACATGTTGATCATGAACTTCTGGTTTGAACATTAACCAGAACTTTGCATGG TTCATCAGGTGGTCCAACTACTTGAGACACCGTTTGTAAATCTTATCAATTATGCCTCTTTGGT AACAACAAATGCTGCGAGACACCGCCATGTTGCTGGAAAATCAAAAGTTTTACTGGAATTTGGT TTGAGACGAGCACAGGTGTGATCTTGAACCATCCCATTTACACTGCCATTTTGATTTTTGTATG GTACACAAGTATTTGGTATTTCTGTGCATGAAACATAGCTGTGGATTTGTATTGACAGGGGCCT GACGGTGCAATAAGTGCTTCAAAGTATTGTTTCATGGGAGGTTTTGATGCAACCAGGTGGTAGT TCTTCCATGGTTCCATTTACAAATTTACATATCTTTAAAAAATTTATAAATTCTGCATATCCAT GTTACCTCTTTGCAACTATACTTTCACAAGAAGTATATTTTGAATCATGCTTGCCTTGCTTAGT CCTTTTTCCCTCCTTAACAAAATTTTTGTTTTTCGTCCTCAGAATGTGAAAAACTACTGTTGTA AACCATTTATTTAATTCATCGTCCTCTCATTATTTTGCAGTAATGTTTTGGCTGGAAATCTGTT TGGCATACCACTTCGCGGAACACATTCTCATGCTTATGTTAGCTCATATATGGTCAGTAAATAC CTTTTTGTGTCACCGCAAAAGAAAAATTCTTTTTGTCAACAAACATAATCCAGTATTTTCTCCT CTATCATTGGAGCACTTTATGTCTCTATTGAAGTTTGTATGCTGTGGTTGCATTGACTAAACAC AACTTTTAGTTCTTCTCCACATCAGTAGATGAGCCCAAATGTTGTGTCAGTTTCAAGTTGAAAG ATGTGGTTTTTCTTCACTCAAATTATCTAGTTGACAGTTGAGACTGCCTAGTGTTACAAAATGT TGCAGAACACAGTTTTGTTGTTGTGGCAATTGAATCCAGATTATAATCGATGAAAAAAAAAGGC ACCAGAGTCTATGTTTTGTTGAATAACCTGCACTTGCTTTGTTTTTTATCCTTTGTTAGCCATG CTAGTTATTTTTATGCTCACTCCTAGCTTGCTGATCTACTGAGTTTTTCCTGTCTTTGCTTGAT ACTTATCTGAGGTACATAGATAATCATTTTATCAACATAGCAACTATTTTTCTTTCTGCCATTA ACGTGTGATGTGCATGACAGTTTGTATTATCCCTTGTATTTGCAATAATAGAGAGTTATATTAG ATATCATACATTCTGGAGACTTTTTCTATTTTTATACCACTTGTTGCTAGTTGTTGCCTGAGCT AACAATCTTTTCAACCCTTTCAGAGCCTTGATGAGATCCCAGACAAGTCCCTCAAGAGCAAAGA TGGTTCAAGAGTCTGCAAAGATTTTGTTAGTTTGGTAAAAGAGTGGCTTCAAAAGATTCAG |