Splice junction sequence |
TGGTGTTGATTTTTATTTCACATTTTGTTATCTCATGATGCAGAATATGTATAGGAAAGCAGCT GAATTTTGGGCCGAGTTGCGTGTTGAACTCCTTTCAttatttttgtaacttatagcagcttgat agcatcctctgagaaaggccgttcccgtttgcagcaattgatagagtggtgtgggtctgagttc gatggtct
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 527 Transcript exons: 7494293-7494408,7494531-7494608,7496155-7496287,7497952- 7498012,7498203-7498284,7498485-7498541 TTATTTTTGTAACTTATAGCAGCTTGATAGCATCCTCTGAGAAAGGCCGTTCCCGTTTGCAGCA ATTGATAGAGTGGTGTGGGTCTGAGTTCGATGGTCTTCTGGTGTTTGATGAGTGCCACAAAGCA AAAAATCTGATTCCTGAGGCAGGGAGCCAGCCCACTCGAACTGGTAAAGCAGTTCTTGAGATCC AGGAAATGTTACCTGAAGCTCGGGTGGTTTACTGCTCAGCAACTGGTGCATCAGAGCCTCGAAA TCTGGGTTATATGGTTCGCCTTGGTCTCTGGGGAGATGGAACATCATTTCAGAATTTTCAGAAA TTTCTAGGTGCTCTTGAGAAAGGTGGTGTGGGTGCTCTTGAACTTGTTGCTATGGACATGAAAG CCAGGGGTATGTATGTTTGCAGAACGCTAAGTTATAAGGGTGCTGCTTTTGCTACCGTGGAAGC TCCTCTAGAGGAAAGAATGATGAATATGTATAGGAAAGCAGCTGAATTTTGGGCCGAGTTGCGT GTTGAACTCCTTTCA
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Genomic sequence |
TTATTTTTGTAACTTATAGCAGCTTGATAGCATCCTCTGAGAAAGGCCGTTCCCGTTTGCAGCA ATTGATAGAGTGGTGTGGGTCTGAGTTCGATGGTCTTCTGGTGTTTGATGAGGTAAAGAAGACT CTGGTATAAATATTAATCGATTGTGCTAGGCATCTTCTAGTTAGCATGCAATTTTCTATTCAAT CCGCTGCAAATTAATCTGGTATGCTTAAATGATGTGTTTCTTGCAGTGCCACAAAGCAAAAAAT CTGATTCCTGAGGCAGGGAGCCAGCCCACTCGAACTGGTAAAGCAGTTCTTGAGATCCAGGTGT GTGACTATATATATATTTTGGGTTGATTAGATACGTGCCATTAAAAAATTGTGGAAATATGCCA TTACTATTTGCGTATTTGTAACGATGCCACTGCTACTTGTTGATAATCTTAGTGGTGCCACTGA GATACATATTTTGCTTGTATTGGACGAAATGCCCTTATCTTCTACCTCTCTCTTCCCTCATCTT CTACCTCTCTCTCTTCCCTCATCCTTTCCCATCTCTCTGACCCGAATCGACGCCTCACCGCTAC TTCTCGACTAGGTTGGCCCGTCAACGTCACGTCAGGTGCCGAGGTGGCAGAGAGCACCGGACAG GTCCCCACGGCTCTTCACGAAGGCGATCCTCGCCGCGTCAGGTGCCGAGGTGGTCGGCGGCGGG GAGGTGGAGAGCGTCAGGCGGCTGCTCGCTCCTCGGTCCTCGTTTCTTCGTCGCCTAGGGACTC TTCGTGGTGAGGAGAGGTGACCGGATTTGGGACTCATTGGCCTCCCTCTTTCCCGACTCCGCCT TGCCAGCCGCGTAGAGGGATAAAGGGAGGGAGGAGATATGCCATCGGCGCCGGTGACCGTGAGC CTTGCAGTGACATCGTCGTCGTCAGTGTGGAGCTCTACAGGAGATGGTCGGCGGTGGCGCGAGG TGGAGGGAGACATAGGTGTCGTGGATGAAGAGCGCCAGAAAGGGAGGCGGCGGCGACTGCGGTG GTCATGTCCATTGACAGCTGTGCTTGTGGTCGCCGCTGTCAAGCCATCGCTGTCTCAGGTTGTC GAAGAGAAGAGGGGGAAAGGGGAGGAAGGAAGAAGAAGGGCAATTTTGTCCAATCTTTTTTTGT ACATGCATCCAAGGGGTAAATAGTGGCATGTCTCAAATATGTCTAAAATTATAATGGCACGGTT CCAAATACTTGAATACTAGTGGCAAATTTCAAAACCAGCATATTTTTAATGGCATGGATCTAAT TAACCCTTTTTTTCTTGCTCTGGTCTCCCTATGATCAACAGAACATTACTAGTATACATTTATT GCGGTCATCTTATGTAGCCGACTTTTTGAATATAAATTCTTTGGCCCTGGAAAGCAAACACTTT CCTAGAGTGATAGCATATACTTCCTCTGTCCATGAATATAAAGCACTTTTGGAACAGTGCTAAG TAATTTTTTTTTAACTTTTGTCTATCATCAATAGCACAAAAATTATAACAATTGACTACATAAG AATAATGTTTCTAGATCTATCGTGAAACAAAATATCATAATATGCAACTCTTTGTATTTAAAAT AGTTTATTTTTATAGATGTTATTAGTCAAAGTAGCATATCGAAGACCGTGTTGATGCCCAAAAG TGCTTATATTTGTGGATGGAGGGAGTATTTTTCAAATATCAAACCAGAAGTCAATGACCTTATG TTGTATGTTGTGATGTTATAGTATTATTCCTCATTCCTCAATTTGATAGATTATGTGGTATCTG GGATGGGATGATTCTTTCAAAGAAATTCTACTGATGATCTGTTCTTAATTATTGTCACCAAACA TTGCAGGAAATGTTACCTGAAGCTCGGGTGGTTTACTGCTCAGCAACTGGTGCATCAGAGCCTC GAAATCTGGGTTATATGGTTCGCCTTGGTCTCTGGGGAGATGGAACATCATTTCAGAATTTTCA GAAATTTCTAGGTTTATTTTTGTTCCTTTATACTTATATTTTATTTTTTTATATACCTTTCCAT TTGTGTTTGCATGTTATCGTAATTCATACAAAAATTTCAAATAATTATTTCCAATGCCGACCAG CTACCATCATAATAACAATTTCAATATATAAGGGCATGAGCAGTAGTAGACTAGTAGTTGTCTC TTATCAAAGCATAGCAGTAGTTGTCCACTTTCCCTGCAAAATGCGAATCAGAAGCAGGTCAATA GGCTAAGAGACGAAATGAGCAGATCTTTTTGCTGCATTATTTCCTTTTTCAACAGATAGTAAAG TACTATCCGCTGTCTGTGTTCGGTAAAGTTATCTTGAAAGGCTTAGTGATCACCACTGTCGAGC ACTTTTTTTTTTTCTTTGGGAGAAAAAATATATACCAAGAGCTGTTTACAACTAGCACTGGTAT TAGTGGAAGAAGAATTTCCTCCATTCACTATTGATGGACCTGGCAATTTTGCCCACAAGTTACC CATAGTACAACATATCCTTTATGTTATTTTTTGTGCTTAAATAACTATGATGAGAAACGGCACT TGTGAAATCCAATAGAAAATTAAGACAAAGTTCACTTTCAACTCTGAATTTTCATTTTTTGGCC TTGGTTCACTTTCCCCCTGAACTGCACAGGTCACCACCCTTCATCCGATCTTAATTTTCTATTG GATTTCACAAGTGCCATTTCTCATCATAGTTACTAAAGCATAAAAATAACATAAAAGGACATGT AGTCCACTTCTTAACTCTGAAATTTTCATTTGGCCATGGTTCACTTTTGCCCTGAACTTCACCC TTGATCCAATCCACTCTTGTGAGCCATGTGTAAGTTTTGAGTGTGGATGTCGAGGCAATGAAAT GACTTTGACAAATTAAACTTCAAAATGTTGCTTACACGGGAGGCCCACATGTAAGTGGAAATAA GCTTCTTTGTTATCTATTAGCTTCCTTTCTAACCTTCTCTCCTCTCCCCACTTCAATGAGTCTC CCCTGTACAAACTGTTTGCCGGGCACTTGTGTTGGACGCACTAGATCAGCCAGTGGTCCAGCCT GGGAGACTTTGTCATGCTGTAGGCATACCTCTAGTCGAAACACACTTTTCAGAACCTCAAAAAG GATCTCAACTTCTTGATTCAATTTTGGTTCTTGGAATTAGTATCTGCTGAGATGCAACTCGTGA TGAGCATTTTTTTTTTGTTTTTTTCTTTGGGCTCTCCTTTTTGTTCAGTATTCGAAAATTTTAG TTTTCTAACAGTGCAAACCAAAATTCATGTCGAGGAAATAAACCACACTAAAAATACAAATTGG TTCAGTTTGCGGTTAAAACCATATATTGATGTTAGCAATTCATCAGTTCTGCAAAGAAATGAGA AGAGGATGAGGAGAGATGGGGTGAGGATGACATGTCCATGGGGATCCAATAATTTTTTTCATTC TGTTTTCTGAGTATTTGCCATTCCAACAAAACCACTGATAAGTCATAAAAGATCACCATAATTT GGCTGGGGGTAAAGTGGACAGTTTTGATAGTTAAAAGGTTGTGTAGTAGACATTTTAAGTTTAG TTTTGATAAATGAACTTATTTACAGTTTAATAATGATGTTTGCCATCCTTTACAAGCTATGGTA ACCTTTCTCAGGTGCTCTTGAGAAAGGTGGTGTGGGTGCTCTTGAACTTGTTGCTATGGACATG AAAGCCAGGTTAGCTCTTCCTGGAACTTCTCGGTGGTTCGGTTCTACCTTTTACACACATCGTA GTTGACATGAAGAGCCCTTATGCATTGGGTGTATATACAAATTGCTCTTTCTGTACATAGGTAA GCCAATTACCTCGTTGATACATTTCCTCTTCTAATAATGATTGGTATACCTCTTGTTCAACTTG TCCCAGGGGTATGTATGTTTGCAGAACGCTAAGTTATAAGGGTGCTGCTTTTGCTACCGTGGAA GCTCCTCTAGAGGAAAGAATGATGGTAAGATTGATGCTCCTTATTTTCTGCTTTTATTTTGGTG GTATGATTAGTTTACTTTGAACCATTTTAAAAATCTTTATAGTTTACAATGTGATTTCACATAA CATTAAAAACCAATGTTATGTTTAGCCTTTTCTAATCATTTTTTGTGTAGTGCTGGTGTTGATT TTTATTTCACATTTTGTTATCTCATGATGCAGAATATGTATAGGAAAGCAGCTGAATTTTGGGC CGAGTTGCGTGTTGAACTCCTTTCA |