Splice junction sequence |
AAGCGGCACTATGGACCTGATGTATGCTTTAAAGGACAAGCTAGGAAACTCGCAAAAATGGAAG ATGAAAGTGATGATGGAACTGATGAATATTCTCTACgaaatgttacctgaagctcgggtggttt actgctcagcaactggtgcatcagagcctcgaaatctgggttatatggttcgccttggtctctg gggagatg
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 766 Transcript exons: 7496155-7496287,7497952-7498012,7498221-7498284,7498485- 7498613,7498852-7498995,7499444-7499546,7499724-7499855 GAAATGTTACCTGAAGCTCGGGTGGTTTACTGCTCAGCAACTGGTGCATCAGAGCCTCGAAATC TGGGTTATATGGTTCGCCTTGGTCTCTGGGGAGATGGAACATCATTTCAGAATTTTCAGAAATT TCTAGGTGCTCTTGAGAAAGGTGGTGTGGGTGCTCTTGAACTTGTTGCTATGGACATGAAAGCC AGAACGCTAAGTTATAAGGGTGCTGCTTTTGCTACCGTGGAAGCTCCTCTAGAGGAAAGAATGA TGAATATGTATAGGAAAGCAGCTGAATTTTGGGCCGAGTTGCGTGTTGAACTCCTTTCAGCAAT TGAATATTATGCAGAAGACAAGGGCAATTCATCTCAGATTTGGCGGTTATACTGGGCCAGCCAT CAGCGTTTCTTTAGGCATATGTGTATGTCGGCTAAAGTACCTGCTGTTGTGAGATTAGTGAAAG AAGCCTTAGCAGAAGAAAAATGTGTGGTGATTGGTCTTCAAAGCACTGGAGAAGCTCGAACAGA GGAAGCTATCAGTAAATATGGTGTTGAAATGGAAGACTTTGTTTCTGGTCCAAGGGAGTTGCTT CTTAAGCTGGTAGATGACAATTATCCTTTGCCTCCGAAACCTGATTGCTTTCAACAAGTAGGTG ATGAAAAAGTTGCAGAGGTTCAGCGTAAGCGGCACTATGGACCTGATGTATGCTTTAAAGGACA AGCTAGGAAACTCGCAAAAATGGAAGATGAAAGTGATGATGGAACTGATGAATATTCTCTAC
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Genomic sequence |
GAAATGTTACCTGAAGCTCGGGTGGTTTACTGCTCAGCAACTGGTGCATCAGAGCCTCGAAATC TGGGTTATATGGTTCGCCTTGGTCTCTGGGGAGATGGAACATCATTTCAGAATTTTCAGAAATT TCTAGGTTTATTTTTGTTCCTTTATACTTATATTTTATTTTTTTATATACCTTTCCATTTGTGT TTGCATGTTATCGTAATTCATACAAAAATTTCAAATAATTATTTCCAATGCCGACCAGCTACCA TCATAATAACAATTTCAATATATAAGGGCATGAGCAGTAGTAGACTAGTAGTTGTCTCTTATCA AAGCATAGCAGTAGTTGTCCACTTTCCCTGCAAAATGCGAATCAGAAGCAGGTCAATAGGCTAA GAGACGAAATGAGCAGATCTTTTTGCTGCATTATTTCCTTTTTCAACAGATAGTAAAGTACTAT CCGCTGTCTGTGTTCGGTAAAGTTATCTTGAAAGGCTTAGTGATCACCACTGTCGAGCACTTTT TTTTTTTCTTTGGGAGAAAAAATATATACCAAGAGCTGTTTACAACTAGCACTGGTATTAGTGG AAGAAGAATTTCCTCCATTCACTATTGATGGACCTGGCAATTTTGCCCACAAGTTACCCATAGT ACAACATATCCTTTATGTTATTTTTTGTGCTTAAATAACTATGATGAGAAACGGCACTTGTGAA ATCCAATAGAAAATTAAGACAAAGTTCACTTTCAACTCTGAATTTTCATTTTTTGGCCTTGGTT CACTTTCCCCCTGAACTGCACAGGTCACCACCCTTCATCCGATCTTAATTTTCTATTGGATTTC ACAAGTGCCATTTCTCATCATAGTTACTAAAGCATAAAAATAACATAAAAGGACATGTAGTCCA CTTCTTAACTCTGAAATTTTCATTTGGCCATGGTTCACTTTTGCCCTGAACTTCACCCTTGATC CAATCCACTCTTGTGAGCCATGTGTAAGTTTTGAGTGTGGATGTCGAGGCAATGAAATGACTTT GACAAATTAAACTTCAAAATGTTGCTTACACGGGAGGCCCACATGTAAGTGGAAATAAGCTTCT TTGTTATCTATTAGCTTCCTTTCTAACCTTCTCTCCTCTCCCCACTTCAATGAGTCTCCCCTGT ACAAACTGTTTGCCGGGCACTTGTGTTGGACGCACTAGATCAGCCAGTGGTCCAGCCTGGGAGA CTTTGTCATGCTGTAGGCATACCTCTAGTCGAAACACACTTTTCAGAACCTCAAAAAGGATCTC AACTTCTTGATTCAATTTTGGTTCTTGGAATTAGTATCTGCTGAGATGCAACTCGTGATGAGCA TTTTTTTTTTGTTTTTTTCTTTGGGCTCTCCTTTTTGTTCAGTATTCGAAAATTTTAGTTTTCT AACAGTGCAAACCAAAATTCATGTCGAGGAAATAAACCACACTAAAAATACAAATTGGTTCAGT TTGCGGTTAAAACCATATATTGATGTTAGCAATTCATCAGTTCTGCAAAGAAATGAGAAGAGGA TGAGGAGAGATGGGGTGAGGATGACATGTCCATGGGGATCCAATAATTTTTTTCATTCTGTTTT CTGAGTATTTGCCATTCCAACAAAACCACTGATAAGTCATAAAAGATCACCATAATTTGGCTGG GGGTAAAGTGGACAGTTTTGATAGTTAAAAGGTTGTGTAGTAGACATTTTAAGTTTAGTTTTGA TAAATGAACTTATTTACAGTTTAATAATGATGTTTGCCATCCTTTACAAGCTATGGTAACCTTT CTCAGGTGCTCTTGAGAAAGGTGGTGTGGGTGCTCTTGAACTTGTTGCTATGGACATGAAAGCC AGGTTAGCTCTTCCTGGAACTTCTCGGTGGTTCGGTTCTACCTTTTACACACATCGTAGTTGAC ATGAAGAGCCCTTATGCATTGGGTGTATATACAAATTGCTCTTTCTGTACATAGGTAAGCCAAT TACCTCGTTGATACATTTCCTCTTCTAATAATGATTGGTATACCTCTTGTTCAACTTGTCCCAG GGGTATGTATGTTTGCAGAACGCTAAGTTATAAGGGTGCTGCTTTTGCTACCGTGGAAGCTCCT CTAGAGGAAAGAATGATGGTAAGATTGATGCTCCTTATTTTCTGCTTTTATTTTGGTGGTATGA TTAGTTTACTTTGAACCATTTTAAAAATCTTTATAGTTTACAATGTGATTTCACATAACATTAA AAACCAATGTTATGTTTAGCCTTTTCTAATCATTTTTTGTGTAGTGCTGGTGTTGATTTTTATT TCACATTTTGTTATCTCATGATGCAGAATATGTATAGGAAAGCAGCTGAATTTTGGGCCGAGTT GCGTGTTGAACTCCTTTCAGCAATTGAATATTATGCAGAAGACAAGGGCAATTCATCTCAGATT TGGCGGTTATACTGGGCCAGCCATCAGGTGGTTCTCTTTCATTTTACGTAACAATATGTTTATA ACCATAACACCCTAGCCAATTATGAGATTATGGTTCCCCAGAAATCATATTGCTTCCTTTTGGT ATAATATATGATCTTTGATTGGGGATTAAATTCTGATTCAGTGGATTTGAACATGGCAATTTGT TTGACCTTCTGAAAAACTACTACATATGATTAATAACTAAATAACAGTATGCTATGTATATATA TTTTTGCAGCGTTTCTTTAGGCATATGTGTATGTCGGCTAAAGTACCTGCTGTTGTGAGATTAG TGAAAGAAGCCTTAGCAGAAGAAAAATGTGTGGTGATTGGTCTTCAAAGCACTGGAGAAGCTCG AACAGAGGAAGCTATCAGTAAATATGTGTGTTTTTCATGCATAGCACTTTCATCCTGTATACCT AAAGAGTGAACTTCACAATACTACAACTTTTTTTTTTTTGTCAAAACCATCTCTTCGCTGCAAC TTTAGCCAGACATTTCACAAAACTGCAATCATAGCACAATATTTTGTCAGAAAATCACCACTGT CCCTTGTGTGTATTTAACATGAGTGTCCAACTTGTAGAAGTGAGTCTGACTAGTGGGCCTGACC TATCGGACAGGCCCTTTCTGACGAAGTTGCAGTTATTTTTTGGTTAAATCATCAGTTGACTTTT CTGTTTTCTGAAATGTTCAACAAAAATTGCAGCAAACCGATGGTTTTGATGAGCAAAATAGTTG CAATTCAGTGAAATTTACTCTATTCTAAAACCTATTTTGGTGAATTGATTCTTGGAATTATTTT CCTGTTTACTGAATGAATGTGGTAGGGTGTTGAAATGGAAGACTTTGTTTCTGGTCCAAGGGAG TTGCTTCTTAAGCTGGTAGATGACAATTATCCTTTGCCTCCGAAACCTGATTGCTTTCAACAAG GTTTGCATCTAGACAAACTTTGTAGATGGATCAAAATGCTAATATTTTGGTGTTTGGGAAGCTG GCCTCCAATCTAAACAAACATAGCATGTATTTGTCATGTAGAACTTGTGTTTGATTGGCTGGTA ATTAAAGCATTTCTAATTTTTTGTTGTTTCTTATTTATGCATGCTGTAGTAGGTGATGAAAAAG TTGCAGAGGTTCAGCGTAAGCGGCACTATGGACCTGATGTATGCTTTAAAGGACAAGCTAGGAA ACTCGCAAAAATGGAAGATGAAAGTGATGATGGAACTGATGAATATTCTCTAC |