Splice junction sequence |
TTTGGCTGCTTGTGCTCTAGAACCAGCTATAAAGCTTTACAGTCTTCTCCATGATGTATTATCT CCAGAGGCTCAACTCAGATTATGCGGTTATTTCCAGagacttactcttgccaattgaggcttaa aagtacacctgaagatgatgttgtaccgatgcagccaggatctggtgaaacacatgtcttgtat gtagcaag
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 815 Transcript exons: 32010782-32010869,32010974-32011079,32011234-32011344,32 012027-32012190,32012744-32012864,32013465-32013689 AGACTTACTCTTGCCAATTGAGGCTTAAAAGTACACCTGAAGATGATGTTGTACCGATGCAGCC AGGATCTGGTGAAACACATGTCTTCTTCCCGGATAGCCTTGGAGATGATTTGATCATTGATGTT TCTGATTCAAAAGGAAAGCCCTGTGGACGTGTTGTTGCTCAAGTTGCTACAATGGCAGAGGAAT CTACTGACAAGCTTCGTTGGTGGTCAATATACCGGGAACCTGAGCATGAACTCGTAGGCCGCAT ACAGCTATACATACACTACACAACTGCTGCAGATGAGAACAACACGAAGTATGGCTCTGTTGCA GAAACTGTGGCTTATGATATTGTTTTGGAAGTTGCAATGAAAGCACAGCACATTCAACAACGGA ATCTCATCTTGCATGGTTCCTGGAAATGGTTGTTGACAGAATTTGCATTGTACTATGGCGTTTC AGATGCCTACACAAAGCTGAGGTATCTCTCTTATATCATGGATGTTGCAACCCCTACTGCTGAT TGGCTCAATCTGGTTCATGACCTTTTGTTACCCGTACTAATGAAGACCCAAGGCACTGCTGCAT TGAGCCATCAAGAGAACCGCATATTAGGTGAAGTTGAGGAGCAAATTGAGCAAACTTTAGCGAT GGTATTTGAGAATTACAAGTCTCTGAATGAATCTTTGCCGTCGGGTTTAGTGGAAGATTTTAGA CCTCCAACTGGTTTGGCTGCTTGTGCTCTAGAACCAGCTATAAAGCTTTACAGTCTTCTCCATG ATGTATTATCTCCAGAGGCTCAACTCAGATTATGCGGTTATTTCCAG
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Genomic sequence |
AGACTTACTCTTGCCAATTGAGGCTTAAAAGTACACCTGAAGATGATGTTGTACCGATGCAGCC AGGATCTGGTGAAACACATGTCTTGTATGTAGCAAGACCTTTCTTTGAGCACATATATCATTGT TTTGCCTGGAAATCTGAATATTATGAGATTAGTGAGGCTGAATATTTTTATGTAAATATTTCAG CTTCCCGGATAGCCTTGGAGATGATTTGATCATTGATGTTTCTGATTCAAAAGGAAAGCCCTGT GGACGTGTTGTTGCTCAAGTTGCTACAATGGCAGAGGAATCTGTATGATTTTCCAAACCAACTT GCTACTCTCTGTTTAAGTTCTTTAAATAGAAGTTATTGTAGATTTTCATACTTGCTCTAAATGG TTATTGTACAATCTATGACTTCTTCAAAATCCTTGTTCCTTACAGTATTTCTCAACTTTCTTGT GTAGACTGACAAGCTTCGTTGGTGGTCAATATACCGGGAACCTGAGCATGAACTCGTAGGCCGC ATACAGCTATACATACACTACACAACTGCTGCAGATGAGAACAACACGAAGGTACTGATTCAGT GTTCTGCAAATTCAGGTCTTATCATCTTAGGATGTTATGTATTCATGTGAATTTAATTTATTTG ATACCTGTTAATTGCAGCACTGTAACCTATTGCTCATTTCTCCCCCACACTCCTTTTGCTAGCT GTCGATTTACTGAACACCTTAAATGACACGGATGATTTTCATGGATGGCATTTTTTACCATTTG ATTGTTTCCTGTATAACATGGAAACAACAGTATATCAATCATTGATCAACTTACTTATATTTTC CTGTCATGGTTGTCACTTAAAAAAAAGAGTGTAAAACAGCCTTTATCATGTATTTAGACTGTAG ACTTTGTTCTTGCCAGACATATCATGATTCGACTGAAGTTTTCTTTTATTTATGTTACTATGAA TTCCAGCATGTCAGCAAAGGAAATGTTTCCTAAATCTTCATTCTGATGGAATAACATGAAACAA GAGTGATTTTACATTGTAGATTTGAATTTGTCTGAACAGGGTAGTCTGTTTATCAGGATCTAAG TCATATAAACATGATTTAAAAGTATACCTTTCTTTCGTAGCTGCCTGATTCGAAATGGCCTATC CATTTTGAGATTAAAAATGTGCTCTATTGAGTGGAAGGGATACTTGACTAATTGACATCTATTT AATTTTCATGGCCGTGATTTTCTTTGCAGTATGGCTCTGTTGCAGAAACTGTGGCTTATGATAT TGTTTTGGAAGTTGCAATGAAAGCACAGCACATTCAACAACGGAATCTCATCTTGCATGGTTCC TGGAAATGGTTGTTGACAGAATTTGCATTGTACTATGGCGTTTCAGATGCCTACACAAAGCTGA GGTATTTGGCTATTACTATAGGACCAATAACCATCACTTTTACTTAGGCTGCGTTCGTGAGCAT GGGTTGGGAACCCTCCCTCCCATGCACGCAAAACGAAGCGACTGTTTAATGCATGATTAATTAA GTATTAGCTAAAAAAACTTGAAAAATGGATTAATATGGTTTTTTAAAACAACTTTCATATAGAT TTTTTTTTGGCAAAAAACACACCGTTTAGCAGTTTGAAAAGCGTGCGCGCGTAAAACGAGGGAG GTGAGTTGGGAAAGTTGGGGAAAGAACTCAGCCTTAGCATATAGTTGTTGGCATGACGTTGTGA CTTAACTTGCTTAAGTCTTGCCATATGTTCCCTTTTCTTGATCTGTCTAGATGCAAGAAATATT TACAATACCTGATGAGATTATTTAAGTCTGACTCACAAGGCTGTTCTAGCAGTTGATTAGAACC TTTAAATTTTTCTATCATATCATAATTTTTTTTCAAATATCTGTCATCTTCCCTCATTTCCTTT CCTTTGCTATTGCTGAGTGCTAGCCCTTGACTCCTTGTTCAGGTATCTCTCTTATATCATGGAT GTTGCAACCCCTACTGCTGATTGGCTCAATCTGGTTCATGACCTTTTGTTACCCGTACTAATGA AGACCCAAGGCACTGCTGCATTGAGCCATCAAGAGGTACTGTTCTTTTCTTCAGATATTTCCCC TGGAACAGCAAGTTCTGTTGCACATCTGATAGCAAATGCCATGATTTAATGTTAATGCTATATA GTATATTATCCAAGAAATTCCCTTCCTTACACCCAATAATGTGTGGGAGCTTTCAGCACTGGGT GTACCCTTGTTTGTGTTGATGTTATGTTATCCTTGTGTGCAATAGCAGTACTGCACCTATATGC TAACTGTTTACAAATGAATGTGTATTTTATATGTTCTAATATTAAAAGAAATGCTAGAATAATT ATCTTCAGATGTAAAACTAAAGAAATTTGTATCAACCGACTATCTATATGTAAGCACATATACG GTATGGAATTATTTTAAATCTTACAAATGGTACACAATTGTATACATGTATCAATCTATAGAAG ATCACCATAGAGCACACCAACACCATCACCAACTCTTCTTATGTTGTAGAGATAACAGGCAAAT TAATCTAGTTACGTGGAATAAATTATATTATGCTTTATTGGCTTATTTTGTTTTTTCTTTCTGA AATTGCTTATGTAACATTAACATCTTAACTGTGCTGCTTCACTGGAATTGTATCATCAGAACCG CATATTAGGTGAAGTTGAGGAGCAAATTGAGCAAACTTTAGCGATGGTATTTGAGAATTACAAG TCTCTGAATGAATCTTTGCCGTCGGGTTTAGTGGAAGATTTTAGACCTCCAACTGGTTTGGCTG CTTGTGCTCTAGAACCAGCTATAAAGCTTTACAGTCTTCTCCATGATGTATTATCTCCAGAGGC TCAACTCAGATTATGCGGTTATTTCCAG |