Splice junction sequence |
GATTCTCTTCTTCCACTGTTTTCACATGATCTCCTTCAACAATCTTCTTCTTTTTCTCCTTCTT CTTCTTCTCACCGTCTTCACCTTCTTCATCACTCGAagaggaagaagagctgttggatcggtga agcttttcgatgacactaggcttgttctcctcatcttcctcggtcttttcttgaagctcctcta gcagagta
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 588 Transcript exons: 7085326-7085554,7088298-7088430,7088462-7088687 AGAGGAAGAAGAGCTGTTGGATCGGTGAAGCTTTTCGATGACACTAGGCTTGTTCTCCTCATCT TCCTCGGTCTTTTCTTGAAGCTCCTCTAGCAGAGTAATCTTGTTCTCCTTCACTTCCTCGTGCT CCGCAGCTAACTCCGGTTCAGAGATCTGAGCCTTATGATCGAACTCAGACTCGAGCGTCGTTGT CTCTTGAGGTTTCACTTCCTCTTCCTTCTTCCCCAAGCTTCTCTTTGATCTTGTCCATAAATCC CTTCTTCTCCTCCGGGATGTCAGCAATCGGTGTTGCTGTTTCAACCAGCGGTGTGGTGTTGACG ACTTGTGAATCCTCTGGTTTCTTGCTGTGGCCTGGAAGCTTCCTTCTTCCTCTGGTTTGTGATC CTCTACCGAATGTGGTGCTGGCATGGTGGTGACGACTGGTACATCATCACCCCCTGGTTTCTCT CCGAGTGGAAACTTCTCCTTAATCCTGTCCATTACTCCTTGATTCTCTTCTTCCACTGTTTTCA CATGATCTCCTTCAACAATCTTCTTCTTTTTCTCCTTCTTCTTCTTCTCACCGTCTTCACCTTC TTCATCACTCGA
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Genomic sequence |
AGAGGAAGAAGAGCTGTTGGATCGGTGAAGCTTTTCGATGACACTAGGCTTGTTCTCCTCATCT TCCTCGGTCTTTTCTTGAAGCTCCTCTAGCAGAGTAATCTTGTTCTCCTTCACTTCCTCGTGCT CCGCAGCTAACTCCGGTTCAGAGATCTGAGCCTTATGATCGAACTCAGACTCGAGCGTCGTTGT CTCTTGAGGTTTCACTTCCTCTTCCTTCTTCCCCAAGAAATCAAACAATCCACGATCCGTAACC TCTGTTGTCGTCGCTGGTGATTCCTCTGTTGCGACCGTTGGTGTCTCGTGCTCGGGAACGTTGT TCTTGTACTCCTCAGCCATAGTTAATCTTGATTTGATTAAAAGTTTATATAGTAAATAGAAAAT ATGAGAAAATTTCAAGACTTGTGTAGTTGCTTTAAGATGGTTTTGTGAATGAGTAATGTTTGTG ATGAGATAAGAGAGAGTGGGGTTTTTATAGTGTCAAGAGAAGGGTCCAGGCCAACGCGGAGGTA ACGCTGTAAAGATTTAATTATTTTTAAAATGATCCAAAAAGATGGATATTTATTTCTTGAATTG TATAATGACCCCTCTTATTTCTTGAAGTCGGTAGATGAATATCATGATATCAGTATCACCACTT TTTTCTTAATTTAAACGATATATGTTTTTAATATATAGATGAAGAGTTAAACTAATATTAGATA ATCGCATAGTCATGTACTTTTATCAACAGAAGCTGTATCGAACTATGGTCTATGGTTTTGTTTT GGATTAATCAATGGTCTATGGTTACGTGGTTGAAGTACATCCTTTTAATCTATTATTGTATTGC ATTTTATCAGATTTAAAAGGATAACAGATGTATAATTTAAAGAGTTTCAATGGACTTGGCATAT ATGTTATGTAGTTGTTTGGAATTTGAATTTGATGTTGTGTCACCATCCTATTATTTCAAACTTT TTGTAACAAAAAACAACAAAACACTACATAATTTGCCCGGAAATAGAAGTTAACAATTTTTTAA AACCTTTTTCTTGATTTTTATTTTAAATCGTTTTGACATTTTACTTCACTTACTTGTTGAAAAA TATTATATAAAAAGCATATGAAAGAAATTTCAAACTTCAAAAGTGATGTTTCCAACTCTTTTAA GACTTTCAGGTTGTATCTGTAAAATATACTATAAATAAAGGGGCAAATTAAAAGGGAAGAATTA TAACCGAACTATTAAGTATTAACAGAATTATCTAGCCAAAGGATCAGTACTAAATGGAAAGACT AATTATACAATAGAAGTTAGGACGAATTAGAAGAAAAACAGAATAATGTAGAAGGCATGAATTG AACCAATAATTTACTGACACGTATTAAAAGAGGTGGGAACGGGCCCACACATGGAGCTGAATGG TCGGCTTTGATTGGCTTTAAGCATAGATGTCGGTCATGTGGGCCATTAGACACGTCGGCTAAAG CTAGATTGCAGATATTTTTCGGGTAAATTACTAACATGCCATTACTCCTCTAATCCTTTTTTTT TTTTTTTTTTTTTTTGTCACTCCTCTAATCCTTTTTAAGAATTAAGACGTTACCAAAAGAATGT ACATGCAGCATAGCAGATTTTAATTTTGAAATCAATTTGTTTTTATAAGTATAACAGTTTAGGT AAGGGATGTCGTTTTGTGCCTTGTATGATAACAGACGAAAGCTTTTTCCTTATAAAATTTAACA GATGGGGCATTTGAGAACGCACAATTTCGGATTTTGCTTAAATTCATTAAATTATATGAATCGT GCTCGGTTGAAAGATTTAAGACGTTGTGCCACTTGATAAATTGAGACGTTTCATGAACACGCAA CCCGTAATTAACAGACCGAATTTTAAAAAGTTTAGGCATTGGGGTGGTCACTCTACCGACACAT GATACCAAACAAAGCAATCGTTTTCGTTTGCTACATTGATTTAATTAATCTGTTACGTTAAACT TTACAACAAATATTTTTGTGCACCACATGTAAACTTACCTGAGCTTAAAAGGAAAAAACAAAAA CGAAAAAATCTAGTTTTCTTATAGAAATGTCAAATGTTACTGTATATGACTAAAAACAATATTA AACTGAATCTAAAGTTCTAAATCATTATCAAACCGGTTTCTATTTATTTTAAACTGAAAATCTA TAAAATTGACCCCAAAATATGATAATGTTATGTGCCAAGAATTTACCAATTAGACTATCGAAAC TCTTTCTTTTAATAATTGAAAAGTCCATTGCCTAGTTCACTACTATGAAGAAGTAATCACTACT TTCGTTTATGAACAAATATACTATAGATTCATAAATGTGATATTGAACCGGTCTATTGTTATGA CTTATGAATATAGCTATATTCACTGAAATCTATATATTTCAAATGGTAAAAGAATTTTCATACT ATAAAATATTATAGCTCTATTCACTGAAATCTATATATTTTAAATGGTAAAAACATTTAAATTT AGCATATAATTTGGTTAACTGAAATCCATTAAAAAAAAGAGAGGTTCATACAGTAATCTTACTA TCCCCATGAGGCCATGACTTGTGGCGGAACGGACTAATTTCAGGTGAAATTATTGAATCACCAT ATATTTAATCTAACTCTTGCATGCTTTTTTCATCAAAATTTCTGATTTTCTTTACATAAAAACT TTTCATGAGAATTTATCCATTGAAGCTCCATTGAGTAAACAAGTGTTTCCCCATAGATAAAATA ATTTTATAGATTTTAGACACAAATGATCTAACTCTAAACACAAACTTGGAGAACAGCTAGAAAG ACAAAATAAAAGAGACAATGATCAACAAAAAACAAAAAACAACATAAGTCCCACTCCCACATCA TTATTATTCACTCTTATCATATTTTTCTCTTAATCAGACACTTTTTCTTTCTTCTCTTCCTCTC CAGTGGTCTTGGCGTGATAACCTGGAAGCTTCTCTTTGATCTTGTCCATAAATCCCTTCTTCTC CTCCGGGATGTCAGCAATCGGTGTTGCTGTTTCAACCAGCGGTGTGGTGTTGACGACTTGTGAA TCCTCTGGTTTCTTGCTGTGGCCTGGAAGCTTCTCCTTGATCTTATCCATAAACCCTTTCTTCT CTTCTTCCTCTGGTTTGTGATCCTCTACCGAATGTGGTGCTGGCATGGTGGTGACGACTGGTAC ATCATCACCCCCTGGTTTCTCTCCGAGTGGAAACTTCTCCTTAATCCTGTCCATTACTCCTTGA TTCTCTTCTTCCACTGTTTTCACATGATCTCCTTCAACAATCTTCTTCTTTTTCTCCTTCTTCT TCTTCTCACCGTCTTCACCTTCTTCATCACTCGA |