Splice junction sequence |
TGGACCAAACTATCTGCAACTACCTGTTAATGCCCCTAAATGTGCTCACCACAACAATCACCAT GATGGTTTTATGAACTTCATGCACAGGGATGAGGAGatcaattactacccctcaaagtttgatc ctgtccgctgcgctgagaaagttcccacccctacaaactcctacactggaattcgaacaaaggt ccgattcc
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 747 Transcript exons: 7145691-7145798,7146010-7146042,7146127-7146369,7147892- 7148061,7148237-7148265,7148852-7149015 ATCAATTACTACCCCTCAAAGTTTGATCCTGTCCGCTGCGCTGAGAAAGTTCCCACCCCTACAA ACTCCTACACTGGAATTCGAACAAAGGTCCGATTCCTGCCATGCTCCGCGGCATCTGGATCTCT TACTGGTCTCAGGCTCTCAGGCTGATCGATCCTTGGGACAGAAACTTGCAAGCCGTCTGAACGT GAGGCCAAGCATCTAGAGGCCAATCTCCATATAAGCTCAGTCTATGTGAGGTACAATCAATCTC ATCGATCTATCATCGCTTGGTCGTTAAATCCGTCAAAAAGATAATCACATGTGTTGTTGTTTCT TGTCTATATAATAATAATGCTTGTAATCCCAAAAACTCATGTTTCCTTCCTTTCTACTCTCACT CTTTGAAGTCACTCATGACATTACCCAACTTACTTCTGCTGATTTTCTTCGAGGACCTGGTGTT CAGACTCCTGTTATCGTTCGTTTCTCAACTGTCATCCATGAGCGTGGCAGTCCCGAGACTCTCA GAGATCCCCGTGGTTTTGCTGTTAAGTTTTACACCAGAGAGGAGGGGAACTTTGATCTTGTTGG GAACAACATTCAGATGATAAGCTACTCCAGACCCGGATCTTCTCCTACGCTGATAGTCAGAGAC ACCGTCTTGGACCAAACTATCTGCAACTACCTGTTAATGCCCCTAAATGTGCTCACCACAACAA TCACCATGATGGTTTTATGAACTTCATGCACAGGGATGAGGAG
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Genomic sequence |
ATCAATTACTACCCCTCAAAGTTTGATCCTGTCCGCTGCGCTGAGAAAGTTCCCACCCCTACAA ACTCCTACACTGGAATTCGAACAAAGGTCCGATTCCTGCCATGCCTTCTCTAAATCTTCAAATC CTAAACTCAAGTTTATTAGAATATTGGTGCTAAGAAAACCTTTTAATTGCTAATGTTGCAGTGC GTCATCAAGAAAGAGAACAACTTCAAACAGGCTGGAGACAGGTACAGATCATGGGCACCAGACA GGCAAGACAGGTTTGTTAAGAGATGGGTGGAGATTCTATCGGAGCCACGTCTCACCCACGAGAT CCGCGGCATCTGGATCTCTTACTGGTCTCAGGTCAGAACAAAAAAACACTCGGTCAAATTTCTA CGTCCTTTTTACCAAGTTTCAGCAAACTAAAACATTATTTATCTCTCTGTATCTCTCAGGCTGA TCGATCCTTGGGACAGAAACTTGCAAGCCGTCTGAACGTGAGGCCAAGCATCTAGAGGCCAATC TCCATATAAGCTCAGTCTATGTGAGGTACAATCAATCTCATCGATCTATCATCGCTTGGTCGTT AAATCCGTCAAAAAGATAATCACATGTGTTGTTGTTTCTTGTCTATATAATAATAATGCTTGTA ATCCCAAAAACTCATGTTTCCTTCCTTTCTACTCTCACTGTCTTTGTAATCTCTTTTTACAATA AATCAATGTTTCTTGAAGCAGTAAACAATTTCTAAGATTTATGGTGGTCGTTATACATATTATT AATTCAGGAAAAAAAAGAGAAGATACCGTAATTGAACATGTATTATTTTAAGGAGAATCCTGAA ATGGATCAACAATTGTCTAATTATGGTATAGTATCTGGCGAAATCAAAGACGATATCATCCACA CGTAATTAGTTTGACTATTAATACGAGGATTATCATTTGGATAAGGATTAACAAAGACAAAACA CATACGTGTTTTGGTGTTGAGCTAAAATAAGATATTTTGGCTCTCGCTATAAAAAAAAAATCGA CAACAGTGCAGACACACGCCGATTTGCGAGATACACACAGTCTCACCTAAAAATCGCAAAAGAA GAAAAATTCGGATCAAAATTGTCTTCAAGCATCATGGATCCATACAGGGTACATCGATTGATTC TCTTTTTTTGTAATCTGTGATTTTACCTTACTTGATTTCGTATCGATTTGGTGTGATTTCGTGT TGAATCCAAAGTGTATGAATGATCTCTCTCTCTCGGTTAAAATGATGCAAAATTGGGGTGATTG TTCGACTTGTTGAGGTTTTTTTGTGTGAATCGATTTCTTTATTATATAGTGGAGATTGGGTTTC GATTTGCATGCGTTGAAGATTCCACTGGAAAATTCAACATGTTTTTCCGTCTATTGATTGTTTA TTTGTCAACATGCTCATGCTCATGCTCATGTTCTAATACACAAGTCTTAAGGCTGACGTGATCT GTCAATATCGTTGTACATGTTTTAAGGTTTCTTTACGATTTTTTTAAAGTTATTTTAATCACTG TGTTCAATTGTGAATATCATTGTTGCTTGTATCGTATTTTTTTAATTGATCATATATACTTATG TGGAATTGTTATGTATCAAGTATCAATGTATCATTATTTGTCATAGACGTTTCTCCAATCTATG GAAATTTGGTTAATTTTTTTGTGATCCAGTTCTTCTGAATTTATTTGTTGGTGTGCAGGTTCGT CCTTCAAGCGCTCATGATTCCCCTTTCTTCACTACAAACTCGGGTGCTCCTGTCTGGAACAACA ACTCTTCTTTGACTGTCGGAACTCGAGGTCCGTTTCTCTTTCTTATCTCTTGAATACAAATTAT AACAAATATGTTGAACCAGTGGTTGTTAGAAATGCCCTTAAAGCTAGAGTAGTGGAAGCCAAAT AATTTTATAAACGTTTGGATAATAATGTCATTAGTGTTTTTGTTGTGGACTTGCGTAAATCACA TTTCTTCCTTCAGTTTTATGCCAAATCTGATATAATTCCTCAATGTTGATTCTGTCTCAGTTGC TTGGATTTTTAGATATGTTAAGCGATGGTTTTATATATTGTCAGGTCCAATCCTTCTGGAGGAC TATCATCTGCTTGAGAAACTCGCTAACTTTGACAGGGAGCGGATTCCTGAGAGGGTTGTTCATG CCAGGGGAGCCAGTGCTAAGGGTTTCTTTGAAGTCACTCATGACATTACCCAACTTACTTCTGC TGATTTTCTTCGAGGACCTGGTGTTCAGACTCCTGTTATCGTTCGTTTCTCAACTGTCATCCAT GAGCGTGGCAGTCCCGAGACTCTCAGAGATCCCCGTGGTTTTGCTGTTAAGTTTTACACCAGAG AGGTTAGCTTTTTGTCTTATCCTTCCATTGTCTCTCTATTTTCTATAACCGATATCGATGTGTT TGCTGATATTCAAACGTTTATTTGCTTATCTATTTCGTTTCACCACCTATATGATTACTTGCAA ATCATATCATACTATACTGATGATTCCTCTTACCCTCTGTTTGCAAACTCAGGGGAACTTTGAT CTTGTTGGGAACAACTTCCCTGTATTCTTCGTCCGTGATGGAATGAAATTCCCTGACATGGTCC ATGCATTGAAACCGAATCCCAAGTCTCACATTCAGGAGAACTGGAGGATACTGGACTTCTTCTC CCACCACCCAGAGAGTTTGCACATGTTTTCATTTCTCTTTGATGATCTCGGTATCCCACAGGAC TACAGGCACATGGAAGGCGCTGGGGTCAACACTTACATGCTAATCAACAAAGCTGGAAAAGCTC ACTATGTGAAATTCCACTGGAAGCCGACTTGTGGGATCAAATGCCTGTCGGATGAGGAAGCTAT CAGAGTTGGAGGAGCCAATCACAGCCATGCCACCAAAGATCTCTATGACTCGATCGCAGCCGGG AACTATCCGCAGTGGAATCTCTTCGTTCAGGTGATGGATCCTGCCCATGAAGACAAATTTGACT TCGATCCGCTTGATGTCACAAAGATCTGGCCTGAAGATATCTTGCCTTTACAACCTGTTGGTCG CTTGGTCTTGAACAAAAACATCGACAACTTCTTTAATGAGAACGAACAGATTGCATTCTGTCCT GCTCTTGTGGTTCCAGGCATCCACTATTCAGATGATAAGCTACTCCAGACCCGGATCTTCTCCT ACGCTGATAGTCAGAGACACCGTCTTGGACCAAACTATCTGCAACTACCTGTTAATGCCCCTAA ATGTGCTCACCACAACAATCACCATGATGGTTTTATGAACTTCATGCACAGGGATGAGGAG |