Splice junction sequence |
TATTTTGTTCTCTTTTGCAGGTGGAAGGTATATAATCTCTTGTGTTTTGTTGATTTTGCAACTC CTTCTGAAGCTCGTGCTGCTCTGGAGACTCTGCAAGatatgccttctggaacagggaaatggcc tcttccatgaatgaatgagccccctctatagccatcacttgaatgatcaggtagcatattgatt ataagttt
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 1013 Transcript exons: 20619376-20619453,20619588-20619694,20619821-20619882,20 619976-20620054,20620489-20620748,20620819-20621165,2062 1253-20621332 ATATGCCTTCTGGAACAGGGAAATGGCCTCTTCCATGAATGAATGAGCCCCCTCTATAGCCATC ACTTGAATGATCAGATATTCAGTGGGCATGGACAGTGGAATCCATGGCGCTACAAGAACTGAAT CAAGAACTCTCTATGTGGAAGGACTACCTTCGAACTGCACAAAGAGAGAGGTTGCACATATTTT TCGCCCCTTTTCTGGTTTTCGTGAGGTGAGATTGGTCAACAAGGAGTCTAGGCATGCTGGAAGC TGTAACCTCTTGTGTTTTGTTGATTTTTCATCTCCTCCTGAAGCTCGTGCTGCTCTGGAGACTC TGCAAGGCTATAAGTTTGATGAACATGACCATGAGTCTTCCAACCTGCGCACACAATTCTCTCT CACTCCTCGCAGGAGGTCAATTGGTGGGCCTTGTGTTAGAAACTAAGTTTCTTGGGTGGAGTTG AATTAATAATGCAGAGCAAAATTTGTGGAGAATCTCTAGGGAGACTTGTATACAATGCTAGACC AAACTTGACTCTAGGGAAACAGCCTCTTCCACGAAGCAATGAGCCCCCATTATGTCCATCGCTT GAACAATCAGATGTCCTATGCTGCTGGTGCTAACCAAAGTGCTATTCCACTTGGTGGGATGGCC ACATATTCAGCGGGCATGGACAGTGGAAACCATGGCGCTACAAGGACCGAATAAAAAACTCTAT GTGGAAGGACTACCTTCGAACTGCACAAAGAGAGAGGTTGCACATATCCTTTTTATGCCTGTAA ACTAAAATCACATTTTCCTAGCTATAATTAGTCTAGGTATCTTTTGCGATGTAATTCATGTTAC ACCTCCTAGGTGCTTTTGCCCTTAACCCTGTCTTCTTCAGATATTCTTCGCCCCTTTCTGGTTT CTTTGAGGTGAGATTGGTCAACAAGGAGTCTAGATATGTGGAAGGTATATAATCTCTTGTGTTT TGTTGATTTTGCAACTCCTTCTGAAGCTCGTGCTGCTCTGGAGACTCTGCAAG
Transcript length: 1075 Transcript exons: 20619376-20619453,20619526-20619694,20619821-20619882,20 619976-20620054,20620489-20620748,20620819-20621165,2062 1253-20621332 ATATGCCTTCTGGAACAGGGAAATGGCCTCTTCCATGAATGAATGAGCCCCCTCTATAGCCATC ACTTGAATGATCAGTTGCAGATGTCTTATGTTGCTGGTACTAACCAAAGTGCGATTCCACTTGG TGGGATGGCCAGATATTCAGTGGGCATGGACAGTGGAATCCATGGCGCTACAAGAACTGAATCA AGAACTCTCTATGTGGAAGGACTACCTTCGAACTGCACAAAGAGAGAGGTTGCACATATTTTTC GCCCCTTTTCTGGTTTTCGTGAGGTGAGATTGGTCAACAAGGAGTCTAGGCATGCTGGAAGCTG TAACCTCTTGTGTTTTGTTGATTTTTCATCTCCTCCTGAAGCTCGTGCTGCTCTGGAGACTCTG CAAGGCTATAAGTTTGATGAACATGACCATGAGTCTTCCAACCTGCGCACACAATTCTCTCTCA CTCCTCGCAGGAGGTCAATTGGTGGGCCTTGTGTTAGAAACTAAGTTTCTTGGGTGGAGTTGAA TTAATAATGCAGAGCAAAATTTGTGGAGAATCTCTAGGGAGACTTGTATACAATGCTAGACCAA ACTTGACTCTAGGGAAACAGCCTCTTCCACGAAGCAATGAGCCCCCATTATGTCCATCGCTTGA ACAATCAGATGTCCTATGCTGCTGGTGCTAACCAAAGTGCTATTCCACTTGGTGGGATGGCCAC ATATTCAGCGGGCATGGACAGTGGAAACCATGGCGCTACAAGGACCGAATAAAAAACTCTATGT GGAAGGACTACCTTCGAACTGCACAAAGAGAGAGGTTGCACATATCCTTTTTATGCCTGTAAAC TAAAATCACATTTTCCTAGCTATAATTAGTCTAGGTATCTTTTGCGATGTAATTCATGTTACAC CTCCTAGGTGCTTTTGCCCTTAACCCTGTCTTCTTCAGATATTCTTCGCCCCTTTCTGGTTTCT TTGAGGTGAGATTGGTCAACAAGGAGTCTAGATATGTGGAAGGTATATAATCTCTTGTGTTTTG TTGATTTTGCAACTCCTTCTGAAGCTCGTGCTGCTCTGGAGACTCTGCAAG
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Genomic sequence |
ATATGCCTTCTGGAACAGGGAAATGGCCTCTTCCATGAATGAATGAGCCCCCTCTATAGCCATC ACTTGAATGATCAGGTAGCATATTGATTATAAGTTTGTTGATTTGAGGCTAGCAACTTTTTTAC CAACATAGTAATTATCTTCCAGTTGCAGATGTCTTATGTTGCTGGTACTAACCAAAGTGCGATT CCACTTGGTGGGATGGCCAGATATTCAGTGGGCATGGACAGTGGAATCCATGGCGCTACAAGAA CTGAATCAAGAACTCTCTATGTGGAAGGACTACCTTCGAACTGCACAAAGAGAGAGGTTGCACG TATCCTTTTCTATGCTTGTAAACTAAAATCACATTTTCCTAGCTATAATTAGTCTAGGTATCTT TTGCGACGTAATTCATATTACACCTCCTAGGTGCTTTTGCCCTTAACTCTTTCTTCTGCAGATA TTTTTCGCCCCTTTTCTGGTTTTCGTGAGGTGAGATTGGTCAACAAGGAGTCTAGGCATGTAAG TTAAATGCTACCTGTGATCCAAATTTTCCCTGTTATTTTTTGCAAAGCCAAGCATGCTTACATG TCAAATCCCCTCTCTGTTTTGCAGGCTGGAAGCTGTAACCTCTTGTGTTTTGTTGATTTTTCAT CTCCTCCTGAAGCTCGTGCTGCTCTGGAGACTCTGCAAGGTAATTATAACATCATATTTTCTGC ATCCATATGCATTGTACTTATGTTGCCAATTTCGTTAGATAGTGCTTGCGCACAGTTTCATTCT TTTATGTTTGTGTGCCTTTAGTCTTTTTAAAAATCTGTTTATTTTTCTGAATATTTTTCCCTTT GTCCCACATCCAGTAGGTTTTAGTGTGATGACTGAACTAAAACTAAGATTGTTATTTCGAAATA TCATATTTTTTCCTTGTTCCACTTTGAAACCAGCTTACTGTCATTCTATGTGTGCTATATCATA TGTAATAATATTTGTGTGCACATCAACTTTAGTGCTTTCCATCATAAAACTAGACGTTTCATTG GTAGGGAGAGAATAAACTTTGAGCTTCTAATACTTGTTCAGGTTATAAGCTTGAATTTGGCTCT GAAATTATGACGTTTTACTTTGCAGGCTATAAGTTTGATGAACATGACCATGAGTCTTCCAACC TGCGCACACAATTCTCTCTCACTCCTCGCAGGAGGTCAATTGGTGGGCCTTGTGTTAGAAACTA AGTTTCTTGGGTGGAGTTGAATTAATAATGCAGAGCAAAATTTGTGGAGAATCTCTAGGGAGAC TTGTATACAATGCTAGACCAAACTTGACTCTAGGGAAACAGCCTCTTCCACGAAGCAATGAGCC CCCATTATGTCCATCGCTTGAACAATCAGGTATTATATCAATTATAAGCTTGTTAATTTAAGGA TAGCAACTTTCTTACTAACATAGTGCTGGTTGCAGATGTCCTATGCTGCTGGTGCTAACCAAAG TGCTATTCCACTTGGTGGGATGGCCACATATTCAGCGGGCATGGACAGTGGAAACCATGGCGCT ACAAGGACCGAATAAAAAACTCTATGTGGAAGGACTACCTTCGAACTGCACAAAGAGAGAGGTT GCACATATCCTTTTTATGCCTGTAAACTAAAATCACATTTTCCTAGCTATAATTAGTCTAGGTA TCTTTTGCGATGTAATTCATGTTACACCTCCTAGGTGCTTTTGCCCTTAACCCTGTCTTCTTCA GATATTCTTCGCCCCTTTCTGGTTTCTTTGAGGTGAGATTGGTCAACAAGGAGTCTAGATATGT AAGTTAAATGCTACTTATGAACCAAAACTTCCCTGTTCATATTTTGTAAAGCCTAGCATTGCTT ATATTTTGTTCTCTTTTGCAGGTGGAAGGTATATAATCTCTTGTGTTTTGTTGATTTTGCAACT CCTTCTGAAGCTCGTGCTGCTCTGGAGACTCTGCAAG |