Splice junction sequence |
GTTTGACATGCTACGTCGGCAATCTCTCCGCCCAGACCACATTAAGATGTTTGTGCTGGATGAA GCTGATGAGATGCTCTCCCGTGGTTTCAAGGATCAGccatggcaggaatggcacccgaaggctc ccagtttgatgctaagcactatgacagcaagatgcaggaactactgtaagccatcgttctattc taccgtat
|
Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
|
Full-length trsnacripts |
Transcript length: 611 Transcript exons: 2558792-2558864,2558995-2559101,2559187-2559617 CCATGGCAGGAATGGCACCCGAAGGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCA GGAACTACTGCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGAGAGT TTTGATGACATGGGCCTCCAAGAGAACCTTCTCAGAGGCATCTATGCTTATGGTTTTGAGAAGC CATCAGCTATTCAGCAAAGGGGGATTGTTCCCTTCTGCAAAGGGCTTGATGTGATTCAGCAGGC TCAATCTGGAACAGGAAAAACTGCTACCTTCTGTTCTGGGATCCTGCAGCAACTTGACTATGGA TTGGTGGAGTGCCAATCCCTGGTCCTTGCACCAACACGTGAGCTTGCCCAGCAAATTGAAAAGG TCATGCGTGCTCTTGGTGACTACTTAGGTGTCAAGGTGCATGCCTGTGTTGGTGGAACCTCTGT CCGTGAGGACCAAAGGATTCTTGCTAGTGGTGTGCATGTTGTTGTTGGCACACCTGGACGTGTG TTTGACATGCTACGTCGGCAATCTCTCCGCCCAGACCACATTAAGATGTTTGTGCTGGATGAAG CTGATGAGATGCTCTCCCGTGGTTTCAAGGATCAG
|
Genomic sequence |
CCATGGCAGGAATGGCACCCGAAGGCTCCCAGTTTGATGCTAAGCACTATGACAGCAAGATGCA GGAACTACTGTAAGCCATCGTTCTATTCTACCGTATTTGTAATCTTAGTAGCAGCTAATGGATG TTTGATTTCTCATTTGCACCACTCGTTATGCTATATGGGTTTCATTATGGACTTTGTGTCTCTC GCAACATGCAGGCACCAAGGTGACAATGAGGAATTCTTCACTTCATATGATGAAGTTTTTGAGA GTTTTGATGACATGGGCCTCCAAGAGAACCTTCTCAGAGGCATCTATGCTTATGGTATACAAAA AGTCTTATCCCTTTTCCATTGTTTCAACAACACATATTTTGGTGATGTTACAAATCCCTGTACT TTGATGTGTAGGTTTTGAGAAGCCATCAGCTATTCAGCAAAGGGGGATTGTTCCCTTCTGCAAA GGGCTTGATGTGATTCAGCAGGCTCAATCTGGAACAGGAAAAACTGCTACCTTCTGTTCTGGGA TCCTGCAGCAACTTGACTATGGATTGGTGGAGTGCCAATCCCTGGTCCTTGCACCAACACGTGA GCTTGCCCAGCAAATTGAAAAGGTCATGCGTGCTCTTGGTGACTACTTAGGTGTCAAGGTGCAT GCCTGTGTTGGTGGAACCTCTGTCCGTGAGGACCAAAGGATTCTTGCTAGTGGTGTGCATGTTG TTGTTGGCACACCTGGACGTGTGTTTGACATGCTACGTCGGCAATCTCTCCGCCCAGACCACAT TAAGATGTTTGTGCTGGATGAAGCTGATGAGATGCTCTCCCGTGGTTTCAAGGATCAG |