Splice junction sequence |
TTCATCTCAATGGATTTTGCCTTCTGGTGCTTGCACGTGATGAAGCAAACATTGTCCTGAAAGA ATCCAAGGTTCATGAAGCTATCCGATGCTTCTTCAGgagcagacattcggttttatttcatcta tgtttttgcggaggctacttcaaccaggagtgaatcacagttctgctctacgtgaaaccttgtt ggagcaca
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 1559 Transcript exons: 2337700-2337882,2337989-2338181,2338279-2338847,2339252- 2339414,2340157-2340419,2340532-2340719 GAGCAGACATTCGGTTTTATTTCATCTATGTTTTTGCGGAGGCTACTTCAACCAGGAGTGAATC ACAGTTCTGCTCTACGTGAAACCTTGTTGGAGCACAAGAGATTTCTATCCGATTCTTATTTCCA ATCACTTACAACTAGTGGACTACGGAAAGAAATATTATCCACCATAGAACAAGAGGGAAGTTCA CAGACTGCAAGTTCGACTGCTTATCATTGGAAAAAGTTTTCTGCACGGTATCTCCACAATTGGT GCTGGAACAATAGGCCATATGGGTTACTTCTTGATACTAACAGAGAAGTTTTTGGTTTAATAAG AAAGGGTTCATTTTCTCTCTTCCGTTGTTTGGAGGGCATGGAGCAGTTTATTTATGGTTCCTCT GATGACCTGCGCAATCTTGATATCCTTGGGGTGAACCCATCGGATAATATATCTCAGTCTGAAA TCCTCATTGAAGTTCTAAGGTGCATGGATCATATAAGCCATCTGCTGGGGAGATCTGCTGCTGC AATATATCATGAATCCCTCATCAGTTCTGTTATATCACCTGATGAAATTGTTTCTCAGATCTTA AAGATTCTGGGCACTGGTTTCAGTCCTCAGTCTCCCTCAGCCCTCATTACATTATTTGGAACAG ATGCTTATGCAGAAAGAAGGCAGACCGCTCACAAGAGTCAGAGGAAGTTTTCTGTTGAAATGTT ACTATCTTTTCGTAAATTGCAATCAAAGTCGACATCCTGGTCAGCAGTATTTGATGTGATTGAG AACTTCATGAAGTATTTGAACACAAACGTGACCATCCAAGAGTATGAGCTGAAGAGAGTTTGCA ATGTGAATACTGCGTTATTGGTTCAAGCTACTTCACAGGTAGCAAGAACAATGTTCGAGTCCAC TTTTGATCTATATCTGTTCCTCAATTATCTGGTCTCCATTGGTGGGCAGGTCTCCTTGTCACAA AATGATATTGCCAGAATAAAACTGAAGTTGTTCCCAGTGATTCAAGATATACTGGGACAGTGGA TTGTCCTCCACTTTGTAGGAATTTCACCTACTACACCACCAACTATTGAGGATTTCAGCTATCA GCTTTCTTCTCTCCAGCTAGGAAAAGCTGATGACCTGTCTTTGCACAGAAAGTTTGGCTGCTCT TATTTTACATTGGCTTGTTTACTTGATTTTCCAAAATCTGCTGACGGGGATGTTCTCTCACCCT GGTTTCCTAATCCAACTGAGTTGGTCAACTTGGTAAGGAGGTTTAGTGGCTCAATTATGAGTGA AAATATTGCTGGAAATGCTGACTGTTTCTTGAGTTCCACAATTAATCTGGCAGCAGTTCTTGTT CGCCATGGTCAATATGAAGCTGCTCAGAGTCTTCTGGGCATTCTCGACACACACATGAACTATG TGAAAGCATCTCAAGCTGACCAGGATACAGATCTTGCACGCTCATCATGCCTTCATCTCAATGG ATTTTGCCTTCTGGTGCTTGCACGTGATGAAGCAAACATTGTCCTGAAAGAATCCAAGGTTCAT GAAGCTATCCGATGCTTCTTCAG
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Genomic sequence |
GAGCAGACATTCGGTTTTATTTCATCTATGTTTTTGCGGAGGCTACTTCAACCAGGAGTGAATC ACAGTTCTGCTCTACGTGAAACCTTGTTGGAGCACAAGAGATTTCTATCCGATTCTTATTTCCA ATCACTTACAACTAGTGGACTACGGAAAGAAATATTATCCACCATAGAACAAGAGGTGGTTTCC CTTTTCTTTTTACTCATTTCTTTGTTTCTATCAGGCTTCATGATTTCTAGTTCTAGCATGTGGC TTGACTGAATTTTCATATATCTCATTCTTTTAGGGAAGTTCACAGACTGCAAGTTCGACTGCTT ATCATTGGAAAAAGTTTTCTGCACGGTATCTCCACAATTGGTGCTGGAACAATAGGCCATATGG GTTACTTCTTGATACTAACAGAGAAGTTTTTGGTTTAATAAGAAAGGGTTCATTTTCTCTCTTC CGTTGTTTGGAGGGCATGGAGCAGTTTATTTATGGTTTGTTACCTTTTTCTAGTATTTAATAAT TATATTAAAATTATTTTCAACTATCATTATGAGCTATTCGGTAACGCCTATGAGCATTATACAT CAGGTTCCTCTGATGACCTGCGCAATCTTGATATCCTTGGGGTGAACCCATCGGATAATATATC TCAGTCTGAAATCCTCATTGAAGTTCTAAGGTGCATGGATCATATAAGCCATCTGCTGGGGAGA TCTGCTGCTGCAATATATCATGAATCCCTCATCAGTTCTGTTATATCACCTGATGAAATTGTTT CTCAGATCTTAAAGATTCTGGGCACTGGTTTCAGTCCTCAGTCTCCCTCAGCCCTCATTACATT ATTTGGAACAGATGCTTATGCAGAAAGAAGGCAGACCGCTCACAAGAGTCAGAGGAAGTTTTCT GTTGAAATGTTACTATCTTTTCGTAAATTGCAATCAAAGTCGACATCCTGGTCAGCAGTATTTG ATGTGATTGAGAACTTCATGAAGTATTTGAACACAAACGTGACCATCCAAGAGTATGAGCTGAA GAGAGTTTGCAATGTGAATACTGCGTTATTGGTTCAAGCTACTTCACAGGTAGCAAGAACAATG TTCGAGTCCACTTTTGATCTATATCTGTTCCTCAATTATCTGGTCTCCATTGGTGGGCAGGTAT GCCATATTTTTGTATTTTGATATTTCTGTCTGATGTGCATGTGTTTACTTAACTCGGCCACTGT GCTACCTCTGATACGTACTGCTATATAGTTCAATATTATATTTCTTTTAGGGAAGTTCACAGAC TGCTAGTTCGACTGCCATGCTATTACTCAAACTTGCTCCGGTTGGTCAGAACTGGCTAGGACAT CTGCAAATACTGATTAAGATGTTAAAGTGTTCTTGACTTGCATCAATTGGAAGATAGTAGACAT ATAACCATAAGATCCTTGTCAGACCTTTGTGTTGTTTGTGGTGTTAAACTGTAATTCAATGCTT CTTCATAGATACACACTATTCTTGACTGGTAAACGTCTTTCTTTTATCTGTTTCATTAATAAGA ACAATGTCCAAATCAGGTCTCCTTGTCACAAAATGATATTGCCAGAATAAAACTGAAGTTGTTC CCAGTGATTCAAGATATACTGGGACAGTGGATTGTCCTCCACTTTGTAGGAATTTCACCTACTA CACCACCAACTATTGAGGATTTCAGCTATCAGCTTTCTTCTCTCCAGCTAGGTCAGAACTTACA GTACATTTTGTTGCTCTCTTACTTTTACTTTTGTTCTTTGATATGTATTCTCTTGAATGGGGAC CCTTCCTCTACAGTATGTTTCCCGCTGTATTATGACAAGGCAACGAGTCCATACAGATAAAAAC TGATATGCCAATGTTGGGAATAATTAACTATTTGCCACTCTTACGAGTGGTTCTAAAGGATTTG CCACTGGACCCACATGTTGGTATGCTGTATTCAATAATGGCTTAAATGGAAAGTGGGTGCACAT GATACTTGTCTCATTAGAGACTAAAATCACTAGATCAATTCATCTTCAATTGCTTAATTGCTAA TGTATCATGTTACCCATTTCATGGGAATGGCTTGACTTGACCCCTAAGAAACAATCTGTATCTC TAAGTTAGTTTGTTTCTAATATATGGAATGTATCTACATGGAGGAACTCAACTAAACAATGAAA CTAATTATTATTTTTATCTCTTATTGCCAAGTAATAGCATGGCAGGAGGCCCATGGGAACAGTG CACTGCGGCCACAGGGTACTGTTCACACGAAAATTTTCTGCACTTGCCATGGGTCTGGGTGCAC CACAAATGATTCTAAAATCTAAATGCAATGCACACCTAGCCTCTTATGATATATGGGATCTTAT ATTCACACTTGGCTTAATATTTATAATGCCACTTTCTTGTGCTTTTCTTGATAAAGAAAGAACA CGTCCTCATTACTTCATTCTCACAGGAAAAGCTGATGACCTGTCTTTGCACAGAAAGTTTGGCT GCTCTTATTTTACATTGGCTTGTTTACTTGATTTTCCAAAATCTGCTGACGGGGATGTTCTCTC ACCCTGGTTTCCTAATCCAACTGAGTTGGTCAACTTGGTAAGGAGGTTTAGTGGCTCAATTATG AGTGAAAATATTGCTGGAAATGCTGACTGTTTCTTGAGTTCCACAATTAATCTGGCAGCAGTTC TTGTTCGCCATGGTCAATATGAAGCTGCTCAGGTATCTTTCTTGTTGGTGCCCCTTAAATTCAT TAAACGTTTATTGTTTGATGTGGTTCTACCATTCTATTTACAATAAATATGACAACCATTATCC TTATTTCTTCTGAAAGAGTCTTCTGGGCATTCTCGACACACACATGAACTATGTGAAAGCATCT CAAGCTGACCAGGATACAGATCTTGCACGCTCATCATGCCTTCATCTCAATGGATTTTGCCTTC TGGTGCTTGCACGTGATGAAGCAAACATTGTCCTGAAAGAATCCAAGGTTCATGAAGCTATCCG ATGCTTCTTCAG |