Splice junction sequence |
TCGAGGATGCCATTACTCGCCATAACTCAGATTCGACTACAAAAGCAATGGCATTGGTTGCTCT ACTGAAGTTGTCATCCCGCTTTCCTTCTATTTCAGAgctggaaagtttgtgaaagatgatgtgt ggcatgcacttattgttgtcataagcaatgcatcagagcttcatggatatacagttagggcctt gtacaaat
|
Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
|
Full-length trsnacripts |
Transcript length: 347 Transcript exons: 8444715-8444837,8444923-8445018,8445145-8445272 GCTGGAAAGTTTGTGAAAGATGATGTGTGGCATGCACTTATTGTTGTCATAAGCAATGCATCAG AGCTTCATGGATATACAGTTAGGGCCTTGTACAAATCAGTCTTGACTTATTCGGAACAGGAGAC CCTTGTCCGAGTGGCGGTATGGTGCATTGGGGAATATGGTGATCTGTTGGTTAACAATGTGGGG ATGCTTGGTATTGAAGATCCAATAACGGTAACGGAATCTGATGCAGTGGACGTTATCGAGGATG CCATTACTCGCCATAACTCAGATTCGACTACAAAAGCAATGGCATTGGTTGCTCTACTGAAGTT GTCATCCCGCTTTCCTTCTATTTCAGA
|
Genomic sequence |
GCTGGAAAGTTTGTGAAAGATGATGTGTGGCATGCACTTATTGTTGTCATAAGCAATGCATCAG AGCTTCATGGATATACAGTTAGGGCCTTGTACAAATCAGTCTTGACTTATTCGGAACAGGTAGC TATTTTCTAATGTTAGATTGTGCTCAGTCCTCAATCAGTTGTAACCCTTTCTAATATGGTTTCG TTGAGATGATAACCAGGAGACCCTTGTCCGAGTGGCGGTATGGTGCATTGGGGAATATGGTGAT CTGTTGGTTAACAATGTGGGGATGCTTGGTATTGAAGATCCAATAACGGTGAGCATCACAATGG CAATCTTAATTCATTATTTGCTCCATGATAAATATGCAGATGCTTTTGCTTCTTGGGATTTCAT TTTTGCTTTGAAAAATATGCAACGAGTATGTGACTGCCTTGAGCAGGTAACGGAATCTGATGCA GTGGACGTTATCGAGGATGCCATTACTCGCCATAACTCAGATTCGACTACAAAAGCAATGGCAT TGGTTGCTCTACTGAAGTTGTCATCCCGCTTTCCTTCTATTTCAGA |