Splice junction sequence |
TTGGTTAATGGTACCTATAAGTCAACTGTCCATACATATCTTGATTCTGCCATTCTCCAACATC AGCTACAGAGGTTAAGCGAGCACAACTCGCTCAAAGaagttatagaagaagaggctgaagctaa attacaagatacaatcagagagagattctcatcttttggcgaggtatgctggatttctcttaga atgcactg
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 230 Transcript exons: 15847286-15847356,15850591-15850688,15850706-15850766 AAGTTATAGAAGAAGAGGCTGAAGCTAAATTACAAGATACAATCAGAGAGAGATTCTCATCTTT TGGCGAGGTTGTCATTATCAGAGGATCCTGCCTTGATGATGGCATTTTCAATGGCACGTCGTGC AGCTGCAGTCCCACTTCTGTTGGTTAATGGTACCTATAAGTCTTGATTCTGCCATTCTCCAACA TCAGCTACAGAGGTTAAGCGAGCACAACTCGCTCAAAG
Transcript length: 753 Transcript exons: 15847286-15847356,15847933-15848035,15848407-15848546,15 848753-15848911,15848993-15849096,15850591-15850766 AAGTTATAGAAGAAGAGGCTGAAGCTAAATTACAAGATACAATCAGAGAGAGATTCTCATCTTT TGGCGAGAATTACCATGCAGTAGATATCCTATTGGCAGAGATTGATGTATACGAACTTTTTGCC TTCAAGCATTGTGTTGGAAGAAGGGTACAGCTTGCCCTTTGCAAAGAACTTGATGAGAGAATGC ATGATCTGAAAAGTGAACTGGAGGGTTACAATACTGGAGATTCGGATGATATTAATAAGAAGAA AGCTCTTGATGCATTGAATAGGATGGAAAAGTGGAACTTATTTAAAGATGTTCCAGAGGAACAT CATAGTTACACTGTGGCTCGCGATTCATTCCTCGCACACCTTGGTTCCGTGTTATGGGGTTCTA TGAGTCATGTAATTGCTCCTTCTGTTTCTCATAGGGCTCACCATTACTATGATAAGTTGTCGTT TCAACTGTACTTTGTGACACAAGAGAAAGTCAGGAACATGAAGCAGTTTCCTGTTAATGTAAAA TCAGTAACAGAGGGCCTTAGTTCTGTGTTACTACAATTCCAGAAGCCAATGTTCAGTCAACGCA TGTTGTCATTATCAGAGGATCCTGCCTTGATGATGGCATTTTCAATGGCACGTCGTGCAGCTGC AGTCCCACTTCTGTTGGTTAATGGTACCTATAAGTCAACTGTCCATACATATCTTGATTCTGCC ATTCTCCAACATCAGCTACAGAGGTTAAGCGAGCACAACTCGCTCAAAG
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Genomic sequence |
AAGTTATAGAAGAAGAGGCTGAAGCTAAATTACAAGATACAATCAGAGAGAGATTCTCATCTTT TGGCGAGGTATGCTGGATTTCTCTTAGAATGCACTGGATATTATTATTTTATTCATTTATAAAT TATTTTTTACTACTCAATCTCATAGGCTAAATGATGGTACTTATTCTTGTAATCTCCATGTTAG GCACCATAGATTTTCAAGGTGCACATGTTGCTTATGCAAATTCCTTTTCTTTCTCTTGCCCCTA GCTCTTATTTTTGAGGGTTGTTGTAAAGTTCAATTGAGATCAGTAGAGTGAGAGCTTTGAGATC AGAACTGTAGAGAAGAGAGGGTGTAGAAATATTTTGGCAGCTTGGAAATATTTTGCTCTGCATT GTACTCAATACATTTTTTTGCTAGACCTGTTGACGATTCAATATACAAGTGGTCCATAAGTCAT TATAACTAGCACGTCACTGGCAACGATATTCCACAACATAGTGGCATCCCAAGACCCCACTGAT GTTAATCACTATAGACAACAAGTTTCCTCTTGCAATCTTGTTTGCTGTGTAACTTTCCCTTTTG TTTCTGTATATTGTTATGACATCTTGAACTAGCTCTTGACTTGTTTATCTGATGCCATTTTTGG GGTTCAGAATTACCATGCAGTAGATATCCTATTGGCAGAGATTGATGTATACGAACTTTTTGCC TTCAAGCATTGTGTTGGAAGAAGGGTACAGCTTGCCCTTTGCAAAGGTACTTTTGATGGCCATA AATTTGGGTGTTCCTTTTAATTATTCACATTACTACATAGTGGTAGACTTTACTTGTAGTTGAT ATTTCTAAGTTATATGCACTTGAGCTACTGTTTGTACCATACATGAAAGACATTCCTTATGTTT CTCTCCAATCATTACAGCATTCTTCGCTCTTTTTTTATTGTTTTGTCCTTTGCCCATGTTTTCT CACAAGTTGTGGATGCCAATAAGCTAATAAGTGTTCTTTTCTTTGCTGAGATCTTCAGTTTATG GTAGCTGCTGGACAGCCTTGTACTGTTCACGAATTTGCTTTGCTTTATCAGAAAGACCTTCCCT TTAACTAGAACCTTATTTTTTCTTCAAATGTAGAACTTGATGAGAGAATGCATGATCTGAAAAG TGAACTGGAGGGTTACAATACTGGAGATTCGGATGATATTAATAAGAAGAAAGCTCTTGATGCA TTGAATAGGATGGAAAAGTGGAACTTATTTAAAGATGTTCCAGAGGTTAGCTTTGTCCAGCAGC TTCTACTACACAACATAAAAGGAACATTGTAAAATCAGTTTCTATAGCAAAACATTTTCCCTAA TAAGCAGGATAACTAAAAACACATATTCACTGCGCATGCAATTGCTGAAGTCTAATATTTATTT GTTAAGTTAACAGAATTTTAATCATACTTCTAATGACGAAGTCCAATCACTTGTGCCAGGAACA TCATAGTTACACTGTGGCTCGCGATTCATTCCTCGCACACCTTGGTTCCGTGTTATGGGGTTCT ATGAGTCATGTAATTGCTCCTTCTGTTTCTCATAGGGCTCACCATTACTATGATAAGTTGTCGT TTCAACTGTACTTTGTGACACAAGAGGTAAGTTCAAGGGGCAACTTTTCTGTTGCTTATATTCG AATGCAATACAGTTATCTCAACATGTTTTTTAACGTAATGCAGAAAGTCAGGAACATGAAGCAG TTTCCTGTTAATGTAAAATCAGTAACAGAGGGCCTTAGTTCTGTGTTACTACAATTCCAGAAGC CAATGTTCAGTCAACGCATGTATGTAACCTTCATCCTGTAAATTTTGGTTTGTAGTCCTGCTTA ACTTACCAGGGGTTTAATATTCATATTGGAAGTTATATGTGAAAGTCATCTGCACCTGGCTAGT TTTTTATTGTAGCAGTCTGACTTCCTAATTCCTATCGTATGTCTGCATGTCCAATATAATACTG GATCAAACTTGTTTAGAGCACAATATTGATCATAAAAGTATTAGAAAGATTGGACCACGCCAAT GATTTGTATCCATTTAGTGTTTGATTTTTTGATACTTATGCTGTGCACTGAGCCACTGACCCTG TGGGTAAATGACCTAAAGTCTGTATGGTGGTGGTCAATATGGCTATGATTCACGAAGGCAGAAG GAACAGATAATCACAGTGCAGGGGATGGGTGCATCTGAAATCAGGAGAGATTAGAACTGAGGGA GTTCAGATATCACTTGAAAGCTGTACCCTTTATAGGCCCTAATAAACAATATCTAATACATGGA AATCAACTGGCAAGTCTTATGTCTAAGTGGCTCAAGTCCAAAGCAAGGAGCTAACACGAAACTC GAAACTCACTGTTGCTGAGCTGTTGCCTTCGACACCCTGGCCACATGAGCGACCGCAGACAACT CAGTTCTCTACCCAAACAAGCCAATGGGCGGTGGATTGGGATTGTAATTCTTTGGTTTCGTTTG GAAGATGAAAACAGTTACTTAGTATGCTTTCTATTAGTGACTGGTCTAATCATGTAAAGTGCTC TATCTTCCATGATTATAATTCTTGTAGAATTTTAGGAGTGACCTAAGCAAAATTACTTGCATAT TCAATAAACATGTGTGCGTGAGTAGTTTGTATTCAATAAGCCCTAGTCTATCTTGAATAATTTC ATAAAGGCTTATAGATGTAAGCTAAGGACAATTCTATCTATTGGATGAATGATACTTTATTTCT GTTCGACATATACAAGTTACTCATATACACACTACAAGTTATTTTGTATAAGTTGTCTGATGGA TTTGTTCTATCAGTCTTTTACCAACATTACTAGTAATTCTTACATTGCAAAGTTGCAAGTTGTT ATGGATACCCTTACAGGTTGCTAACTAATTTATTAATCATATGTACTTAGTTCAGTTAGTTACA AATCAATCATCTGCAGTGGCGGAGCCAGGATTTAGACTTGGGATTGGGATGGGCCTATGAGTCT TGGACGGGGCCTAATACACTATTACTTAAGTTAATTACCTAATTAGTTAGGTGATTATGTGTGA AAAGAAATCGTTGTAGGGGGCCAGGCCACTGGCCGTCCCCCCTGTCTCTGACATGGATCTTCTG TGCATAGAATTTAGTTGCGTCATTTAATTTAGTAGAACCTTGTAAGCTTATTATAGAGTGCAAT ACCTAGAAGGGAGTTAAATGTACTTACAAGATATATTATATCCTCTATAAACTAAATATGTAAT TATTTTTTCCAGTCTAATTTGTTATGGTTGTTGATATATAGGTTGTCATTATCAGAGGATCCTG CCTTGATGATGGCATTTTCAATGGCACGTCGTGCAGCTGCAGTCCCACTTCTGTTGGTTAATGG TACCTATAAGTCAACTGTCCATACATATCTTGATTCTGCCATTCTCCAACATCAGCTACAGAGG TTAAGCGAGCACAACTCGCTCAAAG |