Splice junction sequence |
TAACTCTTGACTTTGACAGGTTGTCAGTAACCCAGAGAAGACACCGCTACATACCTTCTTCTGC AACTATGATTTGAGTGACATGCCTGCTGGAACCAAGgactctgatctgatctattggaatggtt catcccaggttccttgttgcttgttcaggctccaaattgtgcttcatctccaattgttgcagta actattgg
|
Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
|
Full-length trsnacripts |
Transcript length: 1859 Transcript exons: 19770575-19772100,19772199-19772450,19772844-19772924 GACTCTGATCTGATCTATTGGAATGGTTCATCCCAGGTTCCTTGTTGCTTGTTCAGGCTCCAAA TTGTGCTTCATCTCCAATTGTTGCAGTAACTATTGGAACATGATTGGTGGTGGGATGGTGAAAT CATTAGTGCTGATGGGGTTCGATTCAGAAGCCACATTGTAGTTTTAGCCTTCTTGTGTCATCAT AGTTTAGCTGATTATTACTGGAACAATTGCTAGAGACTTTGTTGCTGAAAATAAGAGGCTGAAA TGGATCATGGTAAAATCTGAATAGGAACAAAGTGTGGGCAAGAGGAAAATTGGTTTCCTTTTGC TGGAGTAACTCTAGTGAGATGGGTTTGCCTCAGGTTCCTGCAATCAAGGAGGAAGTGCTTCCTA CAATGAGTGCATCTCTTATTGTTCGTCCTCATTTTGCGGGGAATAGCACCTGTCATTTGGGTAA GCTTCCTGCAGAAAGCTCAAGTAACAGGGCATCTCCATGCTCATACATCAGTGATTTCAAGAGA AATGATGTTTTAGATTCTTTGAATGGATTTGATGGCAATTTTAGAGCCAGCCATGCTGCTTATG GGCCTGCAGGCTTCCAAGGTCTAAAACCTGATACAGGGGATGTAGGTTCCAGATCAGGCCCTAA ATTGGGATCAAATGTTCAGATGCCTGCAATGAGGATTGTTGGCTTTGAATCAGGTTTTGCTAAT TCCACTGGAGGTCCTGATACGATGGTAGCTGACAATACGGATTCACCTTTAGTTATTGATAATT GCCATTCATTGATTGAACAGCATGGGCCTCATGCGAGGAAAAGGGTGTTGTCGCCTTTGAACAA TGCGCTCCCTGGACATTTCCGAGGTGATGCCCTGAATATTGGTTCTGGTGATGCCAAAATTCAG CATTCTGATTGTGCTAGGAGACTTTATACTTCTGGCTTTCAAGATCGTAAAAAGGCAAATACTG CAATTCTTGATTCTTTTGAGGCACCTACATGGCCAGCTTCGAGATACTCCAACTGGAGTACAGA GCAGGGTGTCGATAAATTTAGTGGTAGTACATTCACTGATGGTCCTTTGCTTGAGAGCAGGGAG TCATTTCCTTGTTCAGATCACCTGGAAGCTCTTGAAAGTGTTGCTGTTCCACTTGCAAAATTGG CACATCCTCCTCTGCTTAATCTGTCTCCTCTTGGCCCAACATGGATGCATGGAACAAATACTGT AGGATCTCATGGAGAATCATTGAGAGAAACTGAAGGTTCAACCTGTGAAGGGTATTCAGAAGGT CATGGTAGGTCAAGGATAAGAGATGCGTTTGAAAAAACTAATATCTTACATGATGACTTTGATA TGAGGATCCCTAAGAAGAGTTCAGATAGAAAATCTCAAAACTGGGGCCCGGAATCTGCCTCTGT ATCCCCACGCATTGGATGTATTCGGAGTATTGGTCTCCTTCCTGTACGAAGGTCGTTAATTGGC TCTTTTGAGGAATCTCTTTTATCTGGTCGCTATTCCTGTGGAAAAGACAATCAGAATATTGACG GTTTCCTTGCTGTCCTGAATGTGACTGGTGGTAACTTCTCTCCCCCAACTCAGAAGCTTCCATT TTCAGCTACCAGCATTGATGAGAACAGCTCCTTACTCTACTATTCATCGATCGATCTTGTGGGG AGGCTGCCTATGAGCAGTAGCAAAAGCCCAAAGCTCAAAAGAAGCCTGAGTAATCATGATTCAC GATCAGCGAAGAGTCGGTTACGTATCCCAGTTAAAGGGCGTGTGCAGCTGGTTGTCAGTAACCC AGAGAAGACACCGCTACATACCTTCTTCTGCAACTATGATTTGAGTGACATGCCTGCTGGAACC AAG
|
Genomic sequence |
GACTCTGATCTGATCTATTGGAATGGTTCATCCCAGGTTCCTTGTTGCTTGTTCAGGCTCCAAA TTGTGCTTCATCTCCAATTGTTGCAGTAACTATTGGAACATGATTGGTGGTGGGATGGTGAAAT CATTAGTGCTGATGGGGTTCGATTCAGAAGCCACATTGTAGTTTTAGCCTTCTTGTGTCATCAT AGTTTAGCTGATTATTACTGGAACAATTGCTAGAGACTTTGTTGCTGAAAATAAGAGGCTGAAA TGGATCATGGTAAAATCTGAATAGGAACAAAGTGTGGGCAAGAGGAAAATTGGTTTCCTTTTGC TGGAGTAACTCTAGTGAGATGGGTTTGCCTCAGGTTCCTGCAATCAAGGAGGAAGTGCTTCCTA CAATGAGTGCATCTCTTATTGTTCGTCCTCATTTTGCGGGGAATAGCACCTGTCATTTGGGTAA GCTTCCTGCAGAAAGCTCAAGTAACAGGGCATCTCCATGCTCATACATCAGTGATTTCAAGAGA AATGATGTTTTAGATTCTTTGAATGGATTTGATGGCAATTTTAGAGCCAGCCATGCTGCTTATG GGCCTGCAGGCTTCCAAGGTCTAAAACCTGATACAGGGGATGTAGGTTCCAGATCAGGCCCTAA ATTGGGATCAAATGTTCAGATGCCTGCAATGAGGATTGTTGGCTTTGAATCAGGTTTTGCTAAT TCCACTGGAGGTCCTGATACGATGGTAGCTGACAATACGGATTCACCTTTAGTTATTGATAATT GCCATTCATTGATTGAACAGCATGGGCCTCATGCGAGGAAAAGGGTGTTGTCGCCTTTGAACAA TGCGCTCCCTGGACATTTCCGAGGTGATGCCCTGAATATTGGTTCTGGTGATGCCAAAATTCAG CATTCTGATTGTGCTAGGAGACTTTATACTTCTGGCTTTCAAGATCGTAAAAAGGCAAATACTG CAATTCTTGATTCTTTTGAGGCACCTACATGGCCAGCTTCGAGATACTCCAACTGGAGTACAGA GCAGGGTGTCGATAAATTTAGTGGTAGTACATTCACTGATGGTCCTTTGCTTGAGAGCAGGGAG TCATTTCCTTGTTCAGATCACCTGGAAGCTCTTGAAAGTGTTGCTGTTCCACTTGCAAAATTGG CACATCCTCCTCTGCTTAATCTGTCTCCTCTTGGCCCAACATGGATGCATGGAACAAATACTGT AGGATCTCATGGAGAATCATTGAGAGAAACTGAAGGTTCAACCTGTGAAGGGTATTCAGAAGGT CATGGTAGGTCAAGGATAAGAGATGCGTTTGAAAAAACTAATATCTTACATGATGACTTTGATA TGAGGATCCCTAAGAAGAGTTCAGATAGAAAATCTCAAAACTGGGGCCCGGAATCTGCCTCTGT ATCCCCACGCATTGGATGTATTCGGAGTATTGGTCTCCTTCCTGTACGAAGGTCGTTAATTGGC TCTTTTGAGGAATCTCTTTTATCTGGTCGCTATTCCTGTGGAAAAGACAATCAGGTCCGTAGAA TTTATACGCTCCTAATTTAGCTTTTAGTGGTGTACCATAAGTTGATATTTTTCGAGTGATGCCA GTTGATATTTCTCCTAAAGTGCAGAATATTGACGGTTTCCTTGCTGTCCTGAATGTGACTGGTG GTAACTTCTCTCCCCCAACTCAGAAGCTTCCATTTTCAGCTACCAGCATTGATGAGAACAGCTC CTTACTCTACTATTCATCGATCGATCTTGTGGGGAGGCTGCCTATGAGCAGTAGCAAAAGCCCA AAGCTCAAAAGAAGCCTGAGTAATCATGATTCACGATCAGCGAAGAGTCGGTTACGTATCCCAG TTAAAGGGCGTGTGCAGCTGGTACCATATTCTTGACTTTGAGATTTGCATTAATTCACTGTATT TTGCTCGATTGTTCATGATGCATTGGTGTGTATATATGTTAGTGCATATGCATGTGGGCGACAT GCATATGCATGTACCAATTATGCACCACAAGTCTAGTTATTTATCATGGGATATTTACTCTCAT ACCATTATGGGTACTGGGGAAGCTATATTTGTAATGATACTTTTACTACTCTGCATCATGTCTC ATTTTATGCCCTCCTGTCATGGATAGCTTTCTTTGGACTTAATTGCTTATTCTCAAATGGTTCT TCCATTATTTAGTCTTTTAAAAGATTTGTTGAATTGTCATATGCTTCGATGATGTGTCTATTTC ACCAGAAGCATAACTCTTGACTTTGACAGGTTGTCAGTAACCCAGAGAAGACACCGCTACATAC CTTCTTCTGCAACTATGATTTGAGTGACATGCCTGCTGGAACCAAG |