Splice junction sequence |
CCCGGTCAAAGTCTGGATTCTTCACCCAATGAGGAACCTCAGGAAGCATGCTTTCTAGAGATTT TGTATCAAGTTCAACAAGTGGCCTGATTACAGGGTCcttggaatgtataccgatgcttggtggt ctgctaatgacttcaatttgcattttatcatttatgggtggttcctcgcagacaaactgaaatt cttgctcc
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 1377 Transcript exons: 14531337-14531465,14531601-14531954,14532035-14532281,14 532373-14532449,14532792-14532866,14532939-14533040,1453 3184-14533302,14535643-14535766,14535846-14535896,145360 11-14536109 CTTGGAATGTATACCGATGCTTGGTGGTCTGCTAATGACTTCAATTTGCATTTTATCATTTATG GGTGGTTCCTCGCAGACAAACTGAAATTCTTGCTCCCAACGTGGATCACGATTCTTCTTAATAT GCTTGGTCTTCCTTTCTTCACCTCTAAACACAATTCTTACATATGGATTAGTGTGGTGCTTTCC TTCAACGTCTTGTGCTTCATGAACGATAACTACCAGCAAACCACCACCTTCCGGTGTGCCATCA GGGGCTTTTTCAATGGTGCCAGATTCATCACTTGTATCAACATCAGAATCACCTTCCTTGAAAG GCTTATATGTTACATCAACAGTGAGCTGCCCCCGGAACTTGTCATTTGCTGGGTCATTAGCATC CATAGTCTTGTGTAAGTCAAGTGTAAGTGACTTTGCCTCATCAGGAATAAGCTCTTTCAATGGG ATAACACTCATTCCAATCTTGTCGTGCTTCCCAACCTGCTCCCAATCGTAAACAGTAAGCTCAA GAGCCTGAGATTCTGGGTCTTTGACAACTAATTTGAAATCTTCATTCCATTCAGGGTTCAAGTT GCTTCGCTTCACTGACGTTTTCTTTGATGGGAGTTTTTCCTCTGTTAGCTTTAACTTCACATAT GGATCCGATTTTCCCAGAAAATCCTTTTTGGTGAGTTTGACAGCCCGTACGATGTTAACATGCA AAATTCCAACAGGCTTCTTTTGTGCTTTTGCTGGATCCATGATTGGCACCTCAAGTACTTTTGG CCACAAGTACATGTTTGCTACCTGAGTCTTGATAATCTCCTGAACAAATACATAGAGACCTGGA ATTGCCATGAGATCTGCTCCTAAGAGTTTCAGACCAAAATCAACATGTGGCTTCTCCATAAGTG AAACAACTATTTTAGCAAAACAAGGAAAGCTAGGCACCAAGGGCTTCAACGTTATGCGTGGTAG AGCAAAAACATGCAAATCAATAACCTGTGCAGTTGCTTTTAGCCCAAATGCTTTGACAACAACA GTGATATTCGGATTTCCAGCCCACTTGATGGAAGGTTCCATTATAAGTTCTTGCTCATCTGTGG TGTAGACCTTCATCCCTTGAAATGTTGGTGGTAATGAACCTAATGTTAATGTCTCAAATTCAAC CGAATCAATCTTATACTTGGCAGTGTTCTCAGCAATAATTGGCTTAGCGATTTCCTTTGCAGTT TTACATATTGCCTTGTCAAGATAAGGCCAAATGTTTTCGACAAACTTGTTAAGCCAATCAATCC GGTCAAAGTCTGGATTCTTCACCCAATGAGGAACCTCAGGAAGCATGCTTTCTAGAGATTTTGT ATCAAGTTCAACAAGTGGCCTGATTACAGGGTC
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Genomic sequence |
CTTGGAATGTATACCGATGCTTGGTGGTCTGCTAATGACTTCAATTTGCATTTTATCATTTATG GGTGGTTCCTCGCAGACAAACTGAAATTCTTGCTCCCAACGTGGATCACGATTCTTCTTAATAT GCTGCATAAACAGTATTACAAGATCAAACATTATATTTTATAATGTAGTGACTAAAACTACCCA TTGATTTCAAAATTTCCTACAGTAAATGTTATTGGTGAAAGTTTATTACACATTTAAACCTGTT TTTCATACCTTGGTCTTCCTTTCTTCACCTCTAAACACAATTCTTACATATGGATTAGTGTGGT GCTTTCCTTCAACGTCTTGTGCTTCATGAACGATAACTACCAGCAAACCACCACCTTCCGGTGT GCCATCAGGGGCTTTTTCAATGGTGCCAGATTCATCACTTGTATCAACATCAGAATCACCTTCC TTGAAAGGCTTATATGTTACATCAACAGTGAGCTGCCCCCGGAACTTGTCATTTGCTGGGTCAT TAGCATCCATAGTCTTGTGTAAGTCAAGTGTAAGTGACTTTGCCTCATCAGGAATAAGCTCTTT CAATGGGATAACACTCATTCCAATCTTGTCGTGCTTCCCAACCTGATAAGAAAATTTTATGTAG GATTGAAAGCATCTGGATTAAACAGCTCAGGAGGATATTTAAAATTATTAACCATTACCTGCTC CCAATCGTAAACAGTAAGCTCAAGAGCCTGAGATTCTGGGTCTTTGACAACTAATTTGAAATCT TCATTCCATTCAGGGTTCAAGTTGCTTCGCTTCACTGACGTTTTCTTTGATGGGAGTTTTTCCT CTGTTAGCTTTAACTTCACATATGGATCCGATTTTCCCAGAAAATCCTTTTTGGTGAGTTTGAC AGCCCGTACGATGTTAACATGCAAAATTCCAACAGGCTTCTTTTGTGCTCTTCAATTCAATGTT ATAAAAAGAAGATACCAAATTAGCAACCAGAAGGACATGCCTTGCAAAATAGTAGATAGATTAT AGCATGCATTACTTTGCTGGATCCATGATTGGCACCTCAAGTACTTTTGGCCACAAGTACATGT TTGCTACCTGAGTCTTGATAATCTCCTGCAAGGTAGGGAAAAGTCAACAGTTGCCGACATGTCA CCATCAACATTTGTGAAGAAAAAACGCCACAGATTAAGTTAGAGTAGACAGGTGAAAATTTAGG CTAAAATGTAGTAGTGGAATAATCAAAGAAAACCGGATGAATAGGCACTTAAGCAGAAAACTGC GAGTGGTTTAGTGGAGTTTATGTTCTACTTAATCTTTCTCTTATAAGGGATACGTCAAATCATT CATTATTCTATAATTCATGAACACCAGAAATGCAATTGAGATAAATGAAATATAACCCTATGGG ATATATCAGTATATCCTAAATATTTGATGATATGGAAACTATGTTACCTGAACAAATACATAGA GACCTGGAATTGCCATGAGATCTGCTCCTAAGAGTTTCAGACCAAAATCAACATGTGGCTGCAA AGAAGAATACAAGCATTGACGATTCCATCAGTAATTACCAGAATGAATATATGCTTGAGTGTTT ACCTTCTCCATAAGTGAAACAACTATTTTAGCAAAACAAGGAAAGCTAGGCACCAAGGGCTTCA ACGTTATGCGTGGTAGAGCAAAAACATGCAAATCAATAACCTACAATATTAGACATATAATACT GGATCAATATAACTTTTGAATAGAATTATAAGTCTGCAAATTAGCCTAATCCCATCAGGACGGA ATCAAAAAAATATATATTTCCTTTAATTTTCACACTTTCTCTTAAATGGTTGTACCTGTGCAGT TGCTTTTAGCCCAAATGCTTTGACAACAACAGTGATATTCGGATTTCCAGCCCACTTGATGGAA GGTTCCATTATAAGTTCTTGCTCATCTGTGGTGTAGACCTTCATCCCTATATGGAAAGTTACGG AAATGCGATATCATCTCATCATATACAAAAACACATCAGTCAGACACAATAACATCATCTAGGT GCTTAAGAGAAATATTTAGAATTAGGTAGAATTAGGTAATGCAGAGCAGAGTTATGTACTCTGA AATTATTGTGTATTTCAGGTAATGCGGAACTATCATAGTGGAAACATGCTGGTACAGATAGTAA ACCTTGAATTCATATGTAGCACCATATGTTCATGCGCTTGACTTAGCGAGTAGTAATGAGATAA GTTCATATAGATACTACAACACAATGGCATATATTCATACAGAGCTTAGTACTTATCGTAAATT TTGTTTCACAATGGTAAATGAACTGTCAGATGGCTTGTTGGTTTGCATCTGATCCGAGGGAGGA GAGCAGGAGGTCATGATTACCCGGCTAGCACCGTTTGTTTAGATTGCTCACATGGGAAGCGTTG GGACATTTCGCGTTGGGGTCTGGCACATGAGTTCATGGTCGACAACTCTGGGATAAATTGGGCC TGGTCATTTGGGGCTAGCAGAATTCCAGATGAATACAGTACACTGAAGCAACGGTTGGTAGAAC AGTGAAACCATTTCAGGCTTCGTATATGGCTGGTTATACTATTTACCATTTCCAGGTGATTAGG TCGGTATAAATCAAAACAAGCGTCAATTGGTCAGGAATCTCTGTGTCATTTGCACTCCTATCAT CACACGACCAATGTACAACTTAAGAGTCTACCTGGCAGATTTACAAAATCATTGTCACCCAATT TGGCCTAACATAATCTTAGGGGCAATTATATAAGCAGATTTATATAAGCTGATGGTAGGATCAA GTGGATAACATATCTTGCTATAGATTTATATGAGAAGCTAAAAGCCCATTTCAGCATAGAACCT TAAGCCACATTGTAGATTTGAAGAATTGCATGTTCAAAAACTTACAAGTCAAGTGTCCAACGAA AGTATACATAACATTTTGGGTGGTATATTCGATAAGTGGATCTACTTGGCTTATCTATACTCCT TATAAAAGGGAGTAGTGGTGGTGGTGGTTCTTCCACCACCCCAACTACCAACTCCCAACTTTTT TAAGAAAAGAAAATGATATGTGGGGCTAGAGGGGCCACATCTCAACTACTCCCACCAACTCTCT ACTTTTCGTGGGAAGGAAAAAGGATTTATGCGGGACTAAAAAGGTCCACATGTGATTAACAAAT ATGTTCAACAATTAAGAGATATTAATAACATGTTAATGATAATTTTCTTTGATTAAAATTCCGT TGCAACGCACAGGCAATATGCTAGTATGCTATAACTCCGCTAACATACATTTTTTCTTTTTAAG CTAGGTCGAAGAGAGCTTTATCACAAAAGTGCTTAATTGGCACCATAATCCTGCACGTTTCTCA TTGACGCGGAAATGAGTGTTCAAACTTCAAATAGGTTTACCTGGATTGGATGCCTAAGTTAAGC TAGGCAGTTACTTTATTTTTGGTTTCATTTTATTAGTGATTATTGATAATCCAAATCCAGATAG AAGCCTGAGTGCTTGAGCAAGAGTAGGGCCAATAACATGAGTTTGTTAGGAACATAAGTGGGCT GGGCTGGCTCCGTCGCTTCCAAAGCCTAGCCCGAGAGGAGAGGAACTACAAAACAACAGAGTAT GCACTTCTAGGGGGAGATCGATCGAGCAATCGGCGAATGGCGAACGGTGGCGGCGACCTGGTGG CCGGTTGGCACCTTGTCGATCTTCTTCCTCCCTACCTTCCTTCTTCCTCTTCCTTCCAGAAGTT TCTGGCATCTTCCACCAGTTGAATTCCCTTAGTTCATCCTCCTCTCCACCTCTATTTACTGGAG TTTGGTTGCTATTGCACTGGATGCTTGCATATTTGAGTGGAATTGAGATTGGAAGTCTCGGTTG CTAACAGAGTTGTAAGACTGGAATGTACACCTAAACAACTTGCTGTTGCTAGGTATACTCACAT TTGGCACATAAGCTATAAATTCAATAAAGTAACTTTAAAAATAATATAAACTAAGTGTAACTGG CCCTTTGGGCCATACTCTTTCTATTCTGACAAAGGACTATGTAGTTTCATAACTGACTCTTCAA CAAAAATGTGATATTTCACATAAAGTTCATAAATATAGTTGTTTCAATTAGCCGTGGATCTGAA TCTTCCATGGTTACTTGATCAAATTAGTTAGGCATTCTTAGCATGAAAAGTCTTTTTACGATGT AGCAACTTTTGGCTAAAAAGTACTTCTGTGTAATTAAATTGATCCAAAATGTCTGCAACTAAGA TATAAGAGTAGAACTAACCTTGAAATGTTGGTGGTAATGAACCTAATGTTAATGTCTCAAATTC AACCGAATCAATCTTATACTTGGCAGTGTTCTCAGCAATAATTGGCTTAGCGATTTCCTTTGCA GTTTTACATATTGCCTGTAAAAGACAATATTTACAAAACAGTGCCAAATAAAAACTTGGACAAA TAATATTGCACTAGCTTGTATGAGCCAACCTTGTCAAGATAAGGCCAAATGTTTTCGACAAACT TGTTAAGCCAATCAATCTTCATAAACAAAAAGTTAAAATCAGTAACGTTAGACTATAGGCCTAT TAAAATAGAAACTTAAGATGGCATGACAAAATATAAGCTTCACGTTCACCCAAAGAGTAAGCAT ACCCGGTCAAAGTCTGGATTCTTCACCCAATGAGGAACCTCAGGAAGCATGCTTTCTAGAGATT TTGTATCAAGTTCAACAAGTGGCCTGATTACAGGGTC |