Splice junction sequence |
GCTTGGAATGGTGGTACACCAAGTGATATCTTTGATGCAGGAGTATTTAAACAGGTTTTGAGCA TATTCATAACTGCTGCAATACTGAAATTGGGTCAAGtgctcaactcactaaagcttaccaaact gctgccgtcctgtttgaggtcctcaaagccgtcaatgtctcccagaaaattgaagttgatcaag cggtaatc
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 1208 Transcript exons: 35790942-35791035,35791118-35791228,35791316-35791432,35 791532-35791624,35791724-35791815,35791905-35792031,3579 2509-35792646,35792724-35792827,35792944-35793037,357932 46-35793368,35793465-35793579 TGCTCAACTCACTAAAGCTTACCAAACTGCTGCCGTCCTGTTTGAGGTCCTCAAAGCCGTCAAT GTCTCCCAGAAAATTGAAGTTGATCAAGCGATTTTGGAGACACACAACCAAGTCGAGGAAAAGA AAAAACTTTATCTCCCTTACAACATCCTCCCGCTTGACCCTGACAGCGCTAATCAGGCTATCAT GCGATATCCTGAGATTCAAGCTGCTTTTCACGCTCTTCGTAATACAAGAGGACTACCGTGGCCC AAGGATCATGAAAAAAAGCCTGATGCTGATCTTCTTGGTTGGCTTCAGGCGATGTTTGGATTTC AGAAAGATAACGTGTCCAACCAAAGGGAACACCTCATACTCTTACTTGCCAACGTCCATATAAG GCAGATTCCCAAGCCCGACCAACAACCCAAGTTGGATGACCGAGCACTGGACACAGTCATGAAG AAGCTATTTAAGAACTACAAGAGATGGTGCAAGTACCTTGGCCGCAAAAGCAGCTTATGGTTGC CAACTATTCAACAAGAAGTGCAGCAGCGTAAGCTCCTCTATATGGGTCTTTATCTTCTCATCTG GGGTGAGGCGGCTAACCTGAGATTTATGCCGGAATGTCTATGCTACATCTATCATCACATGGCT TTTGAACTATACGGTATGTTGGCTGGAAATGTGAGTCCAACGACAGGTGAAAATGTTAAACCGG CTTACGGTGGTGATGAAGAAGCCTTTTTGAAGAAAGTTGTGACTCCAATATACAAAGTCATCGA GAAGGAAGCTGAAAGGAGTGAAAGTAGTGAAAGGAGCGAAAGGAGCAAGACAACAAAATCTAAG CACTCACATTGGAGAAATTATGATGATCTAAATGAGTACTTTTGGTCAAGAGATTGTTTCAGAT TAGGATGGCCTATGAGAGCTGATGCAGATTTTTTTAAGACCCCAGATTATGCTTATCATGATGA AGTGAGCGGAGAGAACAGAAGAGTTGGTAGTGGCCAGTGGATGGGAAAAGTAAATTTTGTTGAG ATAAGGTCATTTTGGCACATCTTCCGCAGCTTTGACAGGATGTGGAGCTTCTTAATTTTATCTT TACAGGCCATGATTATAATTGCTTGGAATGGTGGTACACCAAGTGATATCTTTGATGCAGGAGT ATTTAAACAGGTTTTGAGCATATTCATAACTGCTGCAATACTGAAATTGGGTCAAG
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Genomic sequence |
TGCTCAACTCACTAAAGCTTACCAAACTGCTGCCGTCCTGTTTGAGGTCCTCAAAGCCGTCAAT GTCTCCCAGAAAATTGAAGTTGATCAAGCGGTAATCTTCTTAACTATAACTTGATTATGCATTT CTTCATTTTCTTCTTCTACTAACTTGTAATAAATAACCTCTCTTGCAGATTTTGGAGACACACA ACCAAGTCGAGGAAAAGAAAAAACTTTATCTCCCTTACAACATCCTCCCGCTTGACCCTGACAG CGCTAATCAGGCTATCATGCGATATCCTGAGGTTCCCATTCTTCTCAAACCCTACCTATCTTAA TCTTACGTATCTTTTCCAACTCATTCTGCATTTTTTATTCTCCTCATTTTACAGATTCAAGCTG CTTTTCACGCTCTTCGTAATACAAGAGGACTACCGTGGCCCAAGGATCATGAAAAAAAGCCTGA TGCTGATCTTCTTGGTTGGCTTCAGGCGATGTTTGGATTTCAGGTAATCACACCGCCCTCAGGC TCACCCACTAACTTAACCATTATTTTCCTTCTCTTCACCTATCTGTCACTTATTTGCAATTCAA CTATCACTCTGCAGAAAGATAACGTGTCCAACCAAAGGGAACACCTCATACTCTTACTTGCCAA CGTCCATATAAGGCAGATTCCCAAGCCCGACCAACAACCCAAGGTCTCACTCTTACTCAACGTC CATATCGGTGCTTGTGTCATTCTGGTGGTGCTTGTGTCATTCTGGTGTTTACTCTTTTCTTTTT CCTCACATTTTCAGTTGGATGACCGAGCACTGGACACAGTCATGAAGAAGCTATTTAAGAACTA CAAGAGATGGTGCAAGTACCTTGGCCGCAAAAGCAGCTTATGGTACGATATTTAATCTAAAAAT ACGAATATGCACAAGGTCTCTCAAGCTTGCTTGATGTATCACTATCAGATGGTCATTTCCTTTC CAGGTTGCCAACTATTCAACAAGAAGTGCAGCAGCGTAAGCTCCTCTATATGGGTCTTTATCTT CTCATCTGGGGTGAGGCGGCTAACCTGAGATTTATGCCGGAATGTCTATGCTACATCTATCATC ACGTATGGCTGATCCCTTCCATTTTTCCCCTTAAAATTAGTATATGGTTTTTACCAAGCTAGTA GGCCTGGATCTTAAAGTTGCGCAAGCTTCTTACCTGAATACCCAATGATGGTCTGGTCACAATA AAATTGACTTATCGGACCTTTTTCTTTGTACAAAGCTATTTCCAATTTGCCATATTTGGTTTCT ATCTACAAAGTAGTTAGCTGGATCTTAATGGAGTCCAGGCTCCAATGCTGATGATGTTCCTGGC CATAATAACATTGACTTACCTGACAATATATGAGAGTTGCACACAGCTATTGCCATACACAAAG AATCACATTCTGCTCACGTTGATAATATGAGGAAGCATATCTTGGATGGAATTCATCTTTCCCC ATCATGTCAATTATGATGGGATATTTCTGTATTTGTAACTCTTGTGATGAGATTATTTTGGTGA GTGCTGACTGTGTAATATTGTTTTCTCATAGATGGCTTTTGAACTATACGGTATGTTGGCTGGA AATGTGAGTCCAACGACAGGTGAAAATGTTAAACCGGCTTACGGTGGTGATGAAGAAGCCTTTT TGAAGAAAGTTGTGACTCCAATATACAAAGTCATCGAGAAGGTACCCCCCACCCCCCCAAAAAA AGTATATCTCTGTTTCCAGCTCCATCAACTTATACACTCAAGCCTTTTACATAGGAAGCTGAAA GGAGTGAAAGTAGTGAAAGGAGCGAAAGGAGCAAGACAACAAAATCTAAGCACTCACATTGGAG AAATTATGATGATCTAAATGAGTACTTTTGGTAAGCACTAGCCTAATTTATTCTGAGCTACTTT TATGAGTTTTAGTTTGTTGTTTCAAATTTATGAGCTACTTTTCTAAGGAAACCTGTGTGATTAT TTCTGCATTTATTCTCAGGTCAAGAGATTGTTTCAGATTAGGATGGCCTATGAGAGCTGATGCA GATTTTTTTAAGACCCCAGATTATGCTTATCATGATGAAGTGAGCGGAGTAAGTCCCTTATGAT ACATACCTACCTATATTACTTTCATGAAGAACCTTCAGCTTAGTAATACTTCTGTTAGTATTCC ATTCATGAATCACATAGGTGGTAAAACAGGTCTATATTATTTTTTATAACAAACCAAAACAATT TTGTAGTATACGTCTTCATAGGGTATTCTTGGCACTGATTTTTTTTAAAAAACTTGTGGTCCAG GAGAACAGAAGAGTTGGTAGTGGCCAGTGGATGGGAAAAGTAAATTTTGTTGAGATAAGGTCAT TTTGGCACATCTTCCGCAGCTTTGACAGGATGTGGAGCTTCTTAATTTTATCTTTACAGGTTAA TTGCCAATCCATGCCTTCTATTGCTCATGTTTTCTTGGTTGTATGGCTTATTAGAAAATATAAA TGTTTGCTGTTTTTATGTTTCATGCAGGCCATGATTATAATTGCTTGGAATGGTGGTACACCAA GTGATATCTTTGATGCAGGAGTATTTAAACAGGTTTTGAGCATATTCATAACTGCTGCAATACT GAAATTGGGTCAAG |