Splice junction sequence |
TTACCGCTGCAGTCTGATCCTTACCTTTTCTTCCTTCAGTGAGGGCAAAGTGAGCATAGTCAAA ATTCATCGCTGATCTGTTCGGTATGAACCTGTCCAGttgacggttggatgcagaatcccacagc tggacttcagagttgttgagtccaactgcaacatgacgaccatcaggagcccagttgatacttg tgacaggt
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 1098 Transcript exons: 16042132-16042401,16042504-16042782,16045456-16045725,16 045828-16046106 TTGACGGTTGGATGCAGAATCCCACAGCTGGACTTCAGAGTTGTTGAGTCCAACTGCAACATGA CGACCATCAGGAGCCCAGTTGATACTTGTGACAGGTCCCTTCTCCTCATCAATGGTCACAAGCT CAGATGTAGAACCAGTGGAAGCATCCCACAAGTAGACAGTGTGGTCCAACGCTATGGCTAAGAC ATTTGCACTTCCCCAGTCCAGCAAGTTGAGGTAGAAATCGTCAACAATGTCAGGTGCATCCAAG GTTCTCTCAGAAGTCTGAGGAATGTATCGACGAGGCTTTACAGATTTGGGTTGTTGGTGAAGAG AAGCAGAGTGATTGCTCGGAAGCAGTTCGACAGGAGCCTGAGGTTTGTTTCTGAAGGCGAGAAT CCTTGTGTGGTTCAAGTTCATGGTCTCAGCCAATTGCTTCCTGTAGGCCTCTTTGGATGGTGAA CTTACCGTTGCAGATTGATCCTTACCTTTTCTTTCTTCAGTGAGGGCAAAGTGAGCATAGTCAA AATTCATCGCTGATCTATTCGGTATGAACCTGTCCAGTTGACGGTTGGATGCAGAATCCCACAG CTGGACTTCAGAGTTGTTGAGTCCAACTGCAACATGACGACCATCAGGAGCCCAGTTGATACTT GTGACAGGTCCCTTCTCCTCATCAATGGTCACAAGCTCAGATGTAGAACCAGTGGAAGCATCCC ACAAGTAGACAGTGTGGTCCAACGCTATGGCTAAGACATTTGCACTTCCCCAGTCCAGCAAGTT GAGGTAGAAATCGTCAACAATGTCAGGTGCATCCAAGGTCCTCTCAGAAGTCTGAGGAATGTAT CGACGAGGCTTTACAGATTTGGGCTGTTGGTGAAGAGAAGCAGAGTGATTGCTGGGAAGCAGTT CGACAGGAGCCTGAGGTTTGTTTCTGAAGGCGAGAATCCTTGTGTGGTTCAAGTTCATGGTCTC AGCCAATTGCTTCCTGTAGGCCTCTTTGGATGGTGAACTTACCGCTGCAGTCTGATCCTTACCT TTTCTTCCTTCAGTGAGGGCAAAGTGAGCATAGTCAAAATTCATCGCTGATCTGTTCGGTATGA ACCTGTCCAG
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Genomic sequence |
TTGACGGTTGGATGCAGAATCCCACAGCTGGACTTCAGAGTTGTTGAGTCCAACTGCAACATGA CGACCATCAGGAGCCCAGTTGATACTTGTGACAGGTCCCTTCTCCTCATCAATGGTCACAAGCT CAGATGTAGAACCAGTGGAAGCATCCCACAAGTAGACAGTGTGGTCCAACGCTATGGCTAAGAC ATTTGCACTTCCCCAGTCCAGCAAGTTGAGGTAGAAATCGTCAACAATGTCAGGTGCATCCAAG GTTCTCTCAGAAGTCTGTTAATCACAACAGAAAGTTTAGCAACAGATCAATACAACTCTAATGC AGCAACCAGTAAGTGAGCTTTAAGGATCAAACGCAATAAATACAGTACATACCTGAGGAATGTA TCGACGAGGCTTTACAGATTTGGGTTGTTGGTGAAGAGAAGCAGAGTGATTGCTCGGAAGCAGT TCGACAGGAGCCTGAGGTTTGTTTCTGAAGGCGAGAATCCTTGTGTGGTTCAAGTTCATGGTCT CAGCCAATTGCTTCCTGTAGGCCTCTTTGGATGGTGAACTTACCGTTGCAGATTGATCCTTACC TTTTCTTTCTTCAGTGAGGGCAAAGTGAGCATAGTCAAAATTCATCGCTGATCTATTCGGTATG AACCTGTCCAGCTGGTAGAAGATAAAAGCAAATCAGTACAATTCATTCGATATCACAAATCCAA TTTATGCAAGAAACAATCAATCAATTGGAAAGACATGATTTTTCTTATAACAAAACCAACAATT CGTTCATACAGTATCTGAATAAAGATTCATCAATGATATGGGTCAAACAATTTTGGATTCAGAT GAACAAGTTGTTAATCAAAACACTAATTCTGTATCATAAACATGGTATTGAATCTGAAAAATTA AAGAGCACCCACACAATTCGAATCCTGATTCTCAACAGAGTACGGAAACAGGTCAAATCTGAAT GATTGAAGAAGGATACTTACATTTTCCTTGGAATTTTTTCTGGGAAGAAAGTGTTCTTGAAGTG GGCACCGATTCAAACCTGCATCCATTATCACTAAACACAAAGAAAATCCCAAAATACAAACAAA CAGAAAACAAGAATAGCGATAGTATACGAAACGGATTAGAAGATATAATGAGTAAACGAAATTA GATAAAGATGAGCCTGCAGAGAAGGGATCGTTAGTAAATTCGAGCAGAGAGATCAGAGCAGAGA GAGCGAAGAATTGTTGGTGGCTGATGATTGATGAGAGATGAGAGAGCAGATTGATGAAGTGAGT GAAAAGGTACGAAATTTTGGGTTGCTTATAAAGGGGTAGAGCCAATTTAGGGTTTTGGAGGACT CTAATTTCTATAATCGGAAAGTCGGTAACGGCTATATTTCTGAGAGAGCCGTTGATCAATTACG GAAAATGCCCTCTTTCCCTGAAACAATTAGCTTTTTTATGTCTCATTTTAACATTTGTCTATTA GACAAAAACAGAGACATGTAACAAAAATAAAAAAACATTAAAATACTTATAGATATTATACAAA ACAAATAAAACACTGCTTACCACTCACTCAAAAAAGATACTGAAATAACTATTGGTACAAAAAA GAGGTTAACACTCACATAAATACCACAATTACCTTTAATCTAGAATTATTACTGAAAAAAAACA AATACAATAGTGAAAAAGTTTCATACGGTAAATAGACCATAATAACAATTTATCATCTACCTAA TACCATCCAAAATTAGTTTCAAATTGTATACGAGAACCATCCAACGTATTTCGATGTATGGTCC TTGTAAATAATAATTTTTGTATTAACCTCGATAATATTTGGTTAGGTTATTGTGTGATTGAATA TTTGCTTTATGGTTAAATAATGGTTATTGTGTGATCGGTATTTTTCACCTATAATATTGTTTTA GTATTATTTTAATCATATAAAAAATTTATATCCAAAAAAAGCATTTGTTAATCAATTCATTAAC CTGAAAACATAACAAGTGGTTTAAAAACATAAAACCAAAATCTTCTAAAATCCCTGAAATTACA TAAGCTAGCGGAAAAAATAAAATCTTCCAAAATCCCTAATCGAACACATGTTTCTACACACTAA TGTGATTAGGTTAGTGTGGTTTCAATGTCTATTTTGATGTAGTTACAATTATCATCTTACAGTT TACAGTACTTAATGCTCCTGCTTCTTGTATCATCTGACATATATAATCAAGATCTTTCTTTCTA TTCAAATGCAAGCAAATAAGTTTGACTCAACAATATATATCATTTACATATATATAATTGTACA ATATGCACTTTTCTTGTCACTACAATTCATGAAGAATGAATCAGATGCAAAAAAAATGAATATT TTGCATCTGTATCATGGGTTTCCTTGTCCGTCAGTCTTCACAGCTTCAACGAATACGATTCACG TGAGAAAATGGCTCGGAAACTGCTTTTGGAGCAGCTTTTTTGGCGGTCTCTGGTACTCCAAAAA CATTCCAGAACCTCAGAGTCTCATCTCCTGCTGCTGAAGCTACGGTACAACCATCTGGACTCTG TAAGAAATACAACACAAACAACACAAGTTTTAGGACTAAAGACCTCAAACATCTCCAACTACTT TCAACAGTTAAAAATTGATTTAGTTGTTTTCCTTTACCTGGGCCATATATAGAACTCTTGATGT ATGACCAGTGAGCTCAGCCATTTTCACCATGGATGGATACTTCCAAAGTGTGAGCTGATTCTGT GTAAACCCGTGTGAGCTAAGCAACTCTCTTTCATTCTTGCTCCATAACAACGAACAAACTTGGG AACCAGTGTCTACTGAATTCAAGCAAGCCCCAGTGTGAGTATTCCAGAACTTGATCGTCCTGTC TCCTCCACCACCACCAGTTGCAAGCAAATTCGCTTGGAAAGGGCACCACGCAAGAGCCTTCACA GCAGATGTATGTTCCTCAAGCCTGTGCAGCCATTGTGTGGTTGAGTTTGAGGAAGCGACAGAAC GATCCCAGATGTGTACCACATTGTCGTTGCCACCACTTGCTAGTTGTTGTCCAGATCCTGACCA CTTGAGCCCACAAACTTCTTGAGTGTGACCTCTGTAAGTTTCCACAATGGGTGATCTGATCCTC ACATCATTGTTGATGATCAGTCCATCCATTCCTCCAGTAGTAAGGATGTGATTGTTCCATGCCA GTGATCCTACTCGTGACTGGTGACCACCCTTCAATGTTCTCAGCTGCAAGTATATGATAAAACA CATGAGACTAAGAACACCGGATATTATATCTCAACATAAAAGAGAGAGAGTAGTAATTACTTGA CGGTTGGATGCAGAATCCCACAGCTGGACTTCAGAGTTGTTGAGTCCAACTGCAACATGACGAC CATCAGGAGCCCAGTTGATACTTGTGACAGGTCCCTTCTCCTCATCAATGGTCACAAGCTCAGA TGTAGAACCAGTGGAAGCATCCCACAAGTAGACAGTGTGGTCCAACGCTATGGCTAAGACATTT GCACTTCCCCAGTCCAGCAAGTTGAGGTAGAAATCGTCAACAATGTCAGGTGCATCCAAGGTCC TCTCAGAAGTCTGTTAATCACAACAGAAAGTTTAGCAACAGATCAATACAACTCAAAAGCAGCA ACCAGTAAGTGAGCTTTAAGGATCAAACGCATTAAATACAGTACATACCTGAGGAATGTATCGA CGAGGCTTTACAGATTTGGGCTGTTGGTGAAGAGAAGCAGAGTGATTGCTGGGAAGCAGTTCGA CAGGAGCCTGAGGTTTGTTTCTGAAGGCGAGAATCCTTGTGTGGTTCAAGTTCATGGTCTCAGC CAATTGCTTCCTGTAGGCCTCTTTGGATGGTGAACTTACCGCTGCAGTCTGATCCTTACCTTTT CTTCCTTCAGTGAGGGCAAAGTGAGCATAGTCAAAATTCATCGCTGATCTGTTCGGTATGAACC TGTCCAG |