Splice junction sequence |
TCCAGTGCATTCTAAGAGAAATCCAGCATACCTCGCCAAAAGATGAGAATCTCTCTGATTGTAT CTTGTAATTTAGCTTCAGCCTCTTCTTCTGTAACTTctttgagcaagttgtgctcgcttaacct ctgtagctgatgttggagaatggcagaatcaagatatgtatggactgttgacttagagaaacca ttaaccaa
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 648 Transcript exons: 20678113-20678288,20680670-20680773,20680854-20681012,20 681226-20681365,20682410-20682478 CTTTGAGCAAGTTGTGCTCGCTTAACCTCTGTAGCTGATGTTGGAGAATGGCAGAATCAAGATA TGTATGGACTGTTGACTTAGAGAAACCATTAACCAACAGAAGTGGGACTGCAGCTGCACGACGC GCCATTGCAAATGCCATAATCAAGGCTGGATCCTCTGATAACGACAACATGTGTTGACTGAACA TTGGCTTCTGGAATTGTAGTAGCACAGAACTAAGGCCCTCTGTGACTGATTTTACATTAACAGG CAACTGCTTTATGTTCCTGACTTTCTCTTGTGTCACAAAGTACAACTGAAACAACAACTTATCA TAGTAATGGTGAGCCCTATGAGAAACAGAAGGAGCAATTACATGCCTCATAGAGCCCCATAACA CGGAACCAAGGTGTGCGAGGAATGAATCACGAGCCACAGTGTAACTATGATGTTCCTCTGGAAC ATCTTTAAATAAGTTCCACTTTTCCATCCTATTCAATGCATCAAGAGCTTTCTTCTTATTAATA TCATCCGAATCTCCAGTATTGTAACCCTCCAGTTCACTTTTCAGATCATGCCTTCTCTCATCAA GTTCTCGCCAAAAGATGAGAATCTCTCTGATTGTATCTTGTAATTTAGCTTCAGCCTCTTCTTC TGTAACTT
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Genomic sequence |
CTTTGAGCAAGTTGTGCTCGCTTAACCTCTGTAGCTGATGTTGGAGAATGGCAGAATCAAGATA TGTATGGACTGTTGACTTAGAGAAACCATTAACCAACAGAAGTGGGACTGCAGCTGCACGACGC GCCATTGCAAATGCCATAATCAAGGCTGGATCCTCTGATAACGACAACCTATATATCAACAACC ATAACAAATTAGACTGGAAAAAATAATTACATATTTAGTTTATAGAGGATATAATATATCTTGT CAGTACATTTAACTCCCTTGTAGGTATAGCACTCCATAATAAGCTTACAAGGTACTACTAAATT GTAAATGATGCAGCTAAATTCTAAGCACAGACTATCCGGGGGGGGCAGCGGCCTGGCCCCCTAC AACGATTTTCTTTTCACACAAAATCACCTAACTAAGTAGGCAATACTATCTTACTATAAAGTTA TAACCCACTAATTCTAAAGCTCAACATGCACACATGCCACCTCATCATCCACTACCAGTAATTA CATACAAAACTTAAGCATGCATGCAACGTCATCTATAATTCATTGAATTCTACAAATCAACATC CAATCATCTTCCTTCACATTATTTTTCACAATATTATTAACATATATATATATATATATATATT CATCATTTTTATAGTACTTAGCATACATTCATCCATATAATCAAAGTGCGGGATATCATATTTC ATTTACAATCTCATATAATCTAAATGTATCTCTCTAAACATAGTTTAACAAACCGGTTTTATTT GTTGTTAATATCTAATATAATTTTTACTTTTACCTCAATTATTAAAAAAATATTAAAAGTTACT TAGAAATTTCCACAGCAAAACGCAGGGAATCACCTAGTTAACTTAAGTAATACTCCATCCGTCC CAAAATCCCTCTTATATTATGGGATGGAGGTAGTAGTGTATTAGGCCCCCTCCAAGACTCGTAG GCTCCTCCCAAGTCAAAATCCTGGCTCCGCCACTGCAAATGATTGATTTGTAACTAACTAAACT AAGTACATATGACTAATAAATTAGTTTGCAACCTGTAAGGGTATGCATAACAACTTGCAACTTT GCAAGTACATAAGAATTACTAGTAATGTTGGTAAAAGACACAGAAGAACAAATCCATCAGACAA CTTATATAGGTGCTGTACCACTAGTGAGAATGTATGTATATGTTCTTTACATGGTTATACAAAA TAACTTGTATTTTTTATACATGAGTAACTTGTATATGTCAAACAGAAATAAAATATCATTCATC CAATAGATAGAATTGTCCTTAGCTTACATCTATAAGCCTTTATGAAATTATTCAAGATAGAATA GGGCTTATTGAATACAAACTTCTCACGTACACATGCTTATTGGTCTTCTATGATCACTTATACC TACCCAAGTTCAACAAGTGTAATGAGACAAAATGGTTTGGTACCAACAGAACGTACATTCCATA TTCAAATATGCAAGTAATTTTGCTTAGGTCACTCCTAAAATTCTACAAGAATTATAATGATGGA AAAAGAGAGCACTTTACATGATTAGACCAGTCACTAATAGAGAGTATACTAAGTAACTGTTTTC ATCTTCCAAACGAAACCAAAGAATTACAATTCCAATCCACCGCCCATTGGCTTGTTTGGGTAGA GAACTGAGTTGTCCGCGGTCGCTCATGTGGCCAAGGTATCAAAGGCAACAGCTCAGCAACAGTG AGTTTCGACTTTCGTGTTAGCTCCTTGCTTTGGCCTTAAGCCACTTAGACATAAGACTTGCCAG TTGATTTCCATGTACTACCTCCGTTTTTTAAATAGATGACGCCGTTAACTTTTTCTCACATGTT TGACCATTCGTCTTATTCAAAAAATTTACGTAATTATAATTTATTTTGTTATGAGTTGTTTTAT TACTCATAGTACTTTAAGTGTGATTTATATCTTATATATTTGCAAAAAAAATTTGAATAAGACG AATGGTCAAACATTTGAGAAAAAGTCAACGGCGTCATCTATTAAAAAACGGAGGGAGTATTAGA TATTGTTTATTAGGGCCTCATAAAGGGTACAGCTTTCAGTGATCTCTGAACTCCCTCAGTTCTA ATATCTCCTGATTTCAGATGCACCCATCCCCTGCACAGTGATTATCTGTTCCTTCTGCCTTCGT GAACCATAGCCATAGCCCCAAGCCTTAGTTTTTATCAAATTGACCACCCACCATACAGACTTGA GATCATTTACCCACAGGGTCAGGGCACAGCACAAGTATCAACAAATCAAACACTAAATGGATAC AAATCATTGGCGTGGTCTAATCTTTCTAATACTTTTATGATCAGTATTGTGCTCTAAATGAGTT TGATCTAGCATTATATTGGACTTGCAGACATACAATAGGAATTAGGAAGTCAGACTGCCACAAT AAAAAACTAGCCAGGTGCAGATGACATTCACATATAACTTCCATTATGAATATTATTAAACCCC TGGTAAGTTAATTGCTTTGCAGGACTACAAACCAAAAATTTACAAGATGAAGGTTACATACATG TGTTGACTGAACATTGGCTTCTGGAATTGTAGTAGCACAGAACTAAGGCCCTCTGTGACTGATT TTACATTAACAGGCAACTGCTTTATGTTCCTGACTTTCTGCATAACGTTAAAAAATGTGAGAGA TAACTGTATTGAATTAGAATATAAGCAACATAAAAGTTGCCCCTTGAACTTACCTCTTGTGTCA CAAAGTACAACTGAAACAACAACTTATCATAGTAATGGTGAGCCCTATGAGAAACAGAAGGAGC AATTACATGCCTCATAGAGCCCCATAACACGGAACCAAGGTGTGCGAGGAATGAATCACGAGCC ACAGTGTAACTATGATGTTCCTGGCACATGTGATTGAACTTCGTCATTAGAAGTACGATTAAAA TTCTGTTATCTTAACAATTAAATATTAGACTTCAGTAATTGCATGCACAATTGCACAGTGAATA TGTGTTTTTAGTTGTCCTGCTTATTAGGGAAATGTTTTGCTATAGAAACTGATTTTACAATGTT CTTTTTATGTTGTGTCGTAGAAGCTGTTGGACAAAGCTAACCTCTGGAACATCTTTAAATAAGT TCCACTTTTCCATCCTATTCAATGCATCAAGAGCTTTCTTCTTATTAATATCATCCGAATCTCC AGTATTGTAACCCTCCAGTTCACTTTTCAGATCATGCCTTCTCTCATCAAGTTCTACATTTGAA GAAAAATAAAGGTTCTAGTTAAAAGGGAAGGTCTTTCTGATAAACCCAATTAAATTTTATGAAC AGTACAAGGCTGCCCAGCAACTACCATAAACTGAAGATCTCAGCAAAGAAAAGAACACTGAATA GCTTATTGGCATCAACAACTTGTGAGAAAACATGGCCAAAGGACAAAACAATAAAAACAATGTT GTAATGATTGGAGAGAAACATAAGGAATGTCTTTCATGTATGGTACAAACAGTAGCTCAAGTGC ATATAACTCAAAAATATCAACTACAAGTAAAGTCTACCACTATGTAGTAATGTGAATAATTAAA AGGAACACCCAAATTTATGGCCATGAAAAGTACCTTTGCAAAGGGCAAGCTGTACCCTTCTTCC AACACAATGCTTGAAGGCAAAAAGTTCGTATACATCAATCTCTGCCAATAGGATATCTACTGCA TGGTAATTCTGAACCCCCAAAATGGCATCAGATAAACTAAGTCAAGAGCTAGTTCAAGATGTCA TAACAATATACAGAACCAAAAGGGAAAGTTACACAACAAACAAGATTGCAAGAAGAAACTTGTT GTCTATAGTGTTAACATCAGTTGGGACTTGGGATGCCACTATTTTGTGGAATATCGTTGCCAGT GATGTGCTAGTTGTAATGATTAATGGGACCACTTGTATTTTGAATCGTCAATAGGTCTAGCAAA AAAAGGTATTTAGTAGAATACAGAGCAAAATATTTCCAAGCTGCCAAAATATTTCTGCATCCTC TCTTCTCTACAGTTCTGATCTCAAAGCTCTCACTCTACTGATCTCAATTGAACTTTACAACCAC CCTCCAAAATAAGAGCTAGGGGCAAGAGAAAGAAAAGGAATTGGTATAAGCAACATGTGCACCT TGAAAATCTACGGTACCTAACATGGAGATTACAAGAATAAGTACCATCATTTAGCCTATGAGAT TGAGTAGTAAAAAATAATTTATAAACGAATAGATTGTTAATATCCAGTGCATTCTAAGAGAAAT CCAGCATACCTCGCCAAAAGATGAGAATCTCTCTGATTGTATCTTGTAATTTAGCTTCAGCCTC TTCTTCTGTAACTT |