Splice junction sequence |
TTGGACCAGGAAACAAGATTGTAGACATGATTACAGGACCATACAAACTGGTTAGACGCTGTGA AGTGACTGCAATTCTTATCCTATATGGCCTTCCAAGatgaggtagatattgatcatcgtttaca tgaagatgaacaacttgcacgggctctacaagagagtctgaatgatgaacctcctcgtcagaat gttccagt
|
Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
|
Full-length trsnacripts |
Transcript length: 889 Transcript exons: 23857813-23857984,23859489-23859609,23859688-23859771,23 859864-23859983,23860294-23860506,23860587-23860646,2386 0739-23860857 ATGAGGTAGATATTGATCATCGTTTACATGAAGATGAACAACTTGCACGGGCTCTACAAGAGAG TCTGAATGATGAACCTCCTCGTCAGAATGTTCCAGTAAAAGATGTTCACTCAGAGAGTACTCCA GCAACTTTCATGCCCCCATATATATTCCCTTCAACTGGATTAAGGGTTTGTGCTGGATGTAAAA CTCCAATCGGTCAAGGACGGTTTCTTAGTTGCATGGATTCTGTTTGGCACCCCCAGTGCTTCAG GTGTTTTGCTTGTGATAGGCCAATATCAGAATATGAGTTTGCAGTTCATGAAGGTAACCCATAC CATCGATCCTGCTATAAGGAGCTTTTCCATCCAAAATGTGATGTCTGCAAGAACTTTATTCCAA CAAACAAAGATGGCCACATTGAATATCGGGCCCATCCTTTCTGGATGCAGAAGTATTGTCCTGC CCATGAAACTGATCGTACTCCTAGGTGCTGCAGTTGTGAACGAATGGAGCCAAAGGATAGTAAG TACATAACATTAGATGATGGCCGGAAACTCTGTTTGGAATGCCTGAATACTTCAATAATGGACA CAGACGAATGCCAACCACTATATATTGATATTCAAGAATTCTATGAGGGTTTGAACATGAAAGT GGAACAACAAATTCCCTTGCTGTTGGTTGAGCGACAAGCTTTAAATGAAGCCATGGAGGCCGAG AAAACTGGACATCACCTTGCTGAAACCAGAGGTCTCTGCCTATCTGAAGAGCAAATTGTCCGAA CTATACTAAGAAGACCAGTAATTGGACCAGGAAACAAGATTGTAGACATGATTACAGGACCATA CAAACTGGTTAGACGCTGTGAAGTGACTGCAATTCTTATCCTATATGGCCTTCCAAG
|
Genomic sequence |
ATGAGGTAGATATTGATCATCGTTTACATGAAGATGAACAACTTGCACGGGCTCTACAAGAGAG TCTGAATGATGAACCTCCTCGTCAGAATGTTCCAGTAAAAGATGTTCACTCAGAGAGTACTCCA GCAACTTTCATGCCCCCATATATATTCCCTTCAACTGGATTAAGGTATTTGTTATAATAGCACA TTATCATGCTGGCCTCTCCTTCCAATTTAATAAACCTTTATATGCCAATTCAGAAGAAGGCCTC TTTTTTTTTTTTTTTTAACAGACACTAGTCAGTTAAATGTGCATTGCATGCCACGTTAATGAGA TTATGAGAGGTAGTAAAAGAAAGTTTGGTACAGAACATGTGGTATTTTTTTTATTGTGGAGCTA ACTGTACAGTCAGTCAGTGTCATATGTGTTAAACTTCGATCTGTTGCTATATTCTGGTAATCGC TCAAAAGAAAAAAAAGAACAAGATGGCAAAATTATTTGCGGGTTTGAATGTTTGATCCAGTATA TTAACTTGGGAGAGGAAGTATACAGTAAGATTGACGGTTTCACTGCATGAGATGAGGTCTGTAG GTAGCAAGTCTGTGGGCTGTGAACAAATCCTACATTATATTAAAACAGCAGCAAGTGCTTTTCT AGATATTGGCTGCCAGGATTGATTAAACAAGGCCCGAACTCTCGTAGCATCAGAAGATTGCTAT GTCTGCTTCTCTATTTAGCTGTACCACTACTCCAAATGTAGCATTCCTTATCTTTTGTTCTTTT CCAGTACCACATTACTTCCCTTGAGTAATTTGTCCCTGGCACCTGAGCCCACTCTCTACCAAGA TGCACAATAAAATAAAATATCAATATGTAGGGCCTGTTTGGTACAGCTCCAACTCCTAAATTTA ACTCCAGGAGTTGAGTCTGGAGTGGAGTTGTGGAGCTGCCTAAACCCAGCTCCACAACTCTAGT ACATTTTGTGAGAGAGCTCCACCCAACTCCACTCCCAGTTTTAGTGGAGCTGAAACTGTTTGGC TGAGCTCCAGCTCCACCCCTCCTGGAGCTGGAGCTGGAGTTGTGCCAAACAGGCCCGTAGTCCC TCATACAGAAGAACACTCGAGCAAGCGCATCGGTATATATATTTTCACATCCTTGAAAAAGTGA TGTGGCTGAAAGCTTATCAGTGTTTCCGATATGTCTTTTTTTGCATATGTAGAAGATCATTGTG TGAGAGCCAACATTTGGTTGGGGTGATGAGCAGGGTTCACAATTTTGGTACGCAAAAACATTTT CAGTGGGCGCGAGGGGCTGAAATTTGGAAATTTTGAGTTAGCAATCTAGAATTTTGAACAATTT CTTGCTGAATATGATCGATTGTTTTTTCTAAATTCCCAACAAAATTCGAAATTCTCGACCGGAA AAATGTCCTACTGGAAGACCTGCTAGTAGACCTGAAATTCAAAAATTACGTTGTGGAATTGTGA ACCCAAATTATTAGCACTGAATATATGTACTATCTTATAATCATCTTGATTGGGTAGGGTATGG GTATGAAAATTATAAACGCATTCATAGTTTTAACTGGTATCTTCTTCATGTCTGTTCTACTTGG GTTCTCACCCTGTTCTAGTGCATGCGGTGGAACCCTTAGGGTTCTCTGATTCTCATGTACCACA TTGACGGTGTAGGGTTTGTGCTGGATGTAAAACTCCAATCGGTCAAGGACGGTTTCTTAGTTGC ATGGATTCTGTTTGGCACCCCCAGTGCTTCAGGTGTTTTGCTTGTGATAGGCCAATATCAGAAT ATGAGGTAAAGAGACCTAGCATATTTCAACATAACATGCTTTAAGTAAATGAGATAACTGACAT TATCCATTCATTTGGGAAGTTTGCAGTTCATGAAGGTAACCCATACCATCGATCCTGCTATAAG GAGCTTTTCCATCCAAAATGTGATGTCTGCAAGAACTTTGTAAGAATTCATGTTGGATGAGCAT GAGAATTTAGTAATAGCTACTTTTTAACTTTATCTGTTGAGTTGTGCTAATGACATTTGATGAT CAGATTCCAACAAACAAAGATGGCCACATTGAATATCGGGCCCATCCTTTCTGGATGCAGAAGT ATTGTCCTGCCCATGAAACTGATCGTACTCCTAGGTGCTGCAGTTGTGAACGAATGGAGGTTTG TGCTATCCTATAAAAAAGTTATACATGTAGTGATTCAAATGGAAGTGTCAGGATGTAACTAACA CTTCGGCATGTTCCCTCAACAAAAAAAATAGAAGTTTGGCATGTAGCTTCTGTTACCACCCTTA CAAATTTTTTTTCGAAATCACCCTTACAATTTAAATGTGTTTGTTTTCAATATGTGCCTATGCA CATGCATTTGATGATTTCATAGCAATGTCCATTCGTAGTGAAAACGTATTTTAATTATGAATTG GTGAATCTAATGACTTCCCTTCTTTTCTTTTGTTTAATCTCAATGCTAGCCAAAGGATAGTAAG TACATAACATTAGATGATGGCCGGAAACTCTGTTTGGAATGCCTGAATACTTCAATAATGGACA CAGACGAATGCCAACCACTATATATTGATATTCAAGAATTCTATGAGGGTTTGAACATGAAAGT GGAACAACAAATTCCCTTGCTGTTGGTTGAGCGACAAGCTTTAAATGAAGCCATGGAGGCCGAG AAAACTGTAAGTGAAATGATCATTTTATAATATTCTAACAGTAATGTACATTATTTAACTTATT GTTCCTTTGACCTCCTTAATAGGGACATCACCTTGCTGAAACCAGAGGTCTCTGCCTATCTGAA GAGCAAATTGTCCGAACTGTACGTTCTTAAAAATAATGCCTTGCTTTAGTTATCTATTGAATAT GTGAACTTGATACCTGGCTTATGGCTAAATAACATAATATATGCAGATACTAAGAAGACCAGTA ATTGGACCAGGAAACAAGATTGTAGACATGATTACAGGACCATACAAACTGGTTAGACGCTGTG AAGTGACTGCAATTCTTATCCTATATGGCCTTCCAAG |