Splice junction sequence |
AATTAATTAATTAATCAAAATGTGCATGCAACGCAGCATTATATTTCAAGCATTATTGAATGTG CTTAATTACGTACGTTCTGAGACCCTGGCTGAGGTAgagctcacactggaaggattttccctga cccttgcctccccagatacccaggatgagtgggaccttgatgttggggagggtcatgaagttct tggagatg
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 192 Transcript exons: 28935254-28935422,28939054-28939076 GAGCTCACACTGGAAGGATTTTCCCTGACCCTTGCCTCCCCAGATACCCAGGATGAGTGGGACC TTGATGTTGGGGAGGGTCATGAAGTTCTTGGAGATGTGGACGACGAGCTTGTCCATGAAAGCAG GGGCGATGTAGAAGCCTCCCATGGTGTTGTCGAAGTCGTACGTTCTGAGACCCTGGCTGAGGTA
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Genomic sequence |
GAGCTCACACTGGAAGGATTTTCCCTGACCCTTGCCTCCCCAGATACCCAGGATGAGTGGGACC TTGATGTTGGGGAGGGTCATGAAGTTCTTGGAGATGTGGACGACGAGCTTGTCCATGAAAGCAG GGGCGATGTAGAAGCCTCCCATGGTGTTGTCGAAGTCGTACCTGGAGGTATGTATGCATATATC CAGTCAGTCAATTCGATTCAATTCAGCATATATATGAATATGATGAATAAAATCGATTGGTGTG GTGTACAAATTAGATTTAGTACGTACGTTCTGAGACCCTGGCTGAGGTACTCGTAGGAGCTGAG GACGGCCTCGTGGGTGCCATCACCCGTGGGAGCCTGGAAAAGGGAGTCGACGAAACCCTTCCCC CTGGTGATGTCCTGCTGGTCATCGGAGATGTCGTAGGCGAGACCCTTCCACCTGTCCTGGTCGG TCTGCTTGCCCTCGTCCAGCTCCTTGGCCATCACCTTGAACCTGTTGATGTTGGAGCTCTTGCC ATGGTAGTTCACCGCCGATGTCACCTGCTTCTTCAGCTTCTTCCCCAGGAAGTTGGTCGGAGTG GACGCCTGCACATCCATTAATCTCGCAAGTAAGTATCCTCATTTAATTTGCAGCAAAAACATGT ACTTATCAAGCTAGCTAGCTAGCTGCGTATGTATGTGTACCGGAGCTCCAACGGTGGAGGAGAA GGCAGCAGCCATCTTAATTTGCTGAAAGTCGATGATTGTAGAGGATCACTGATGATGGCCGGCC GCTGCTGCTCAAAGTGTAGAGGCCGAGCTGCGGTAGGCCTTAAATAATACAATAGAATTGGACG TCGCCATGGAAGTTGGAGGCTGTGAGAGGCACACACTCGTCCCTGTGGATCAGCTTCCAGATCC TCCACAGGCCACACGCTGAAGATTGGGTTCTGCACACGTGGCGCAATCTCGGCCGGCCGATCCA CAGCATAGCATGACTTGGACCTGGATCGGAGTCTGTGAGCGAGTTAGGAGTATATTGTATTAGT GTAGGTAGGAAGGATCTCTTGGCTTCAGTTCCTTGACCTTTCCTCACCACAGAATTCACCCATT TCTGATCAACTCTTTCTCTCTGTTTTTTCTTTTCTTTCCTTGCCTCACATTCGTCTCCCGGCCG GCAGCTAGCGACCAGTTGCTTCATCAGCTCAGCTACTACATAACCTCTTCATTTTGCATCACCA CAGAAAAGCCTTTTGCTGCCTCTCGTTGCCCGGCTTCTTGGATGAGGCATGGCATGCAAATTGT ATTCTAGTTGGACTACCACAAATATTTTGCTCTGCTACCTGCACATATTCTGCTTTCTCGATAA CCATCAGGCTAGGACTGTCATTTGGCACCACACAAACTTCTCTTAACATACAACATAAGCATTG TACGTTTTTTCCCCTTTGATGGTTTCCGTTACCACAAAAATACAAAAATTCTAATTTTGCACTG CTGTTGATATTGTTTTTTGGTGAAGCATCAATCGGAGGCAGCTAAATCTGCAGCAGTGCCTTAA GATGAATTTATTTGTGGTTCATAGCTTTCGTTCCTCCTAAGCCTCTATATTGCTTTTCGTAACT TTTGAAAATTAATTGTTTGCTCATGTCATGTCAGTAGTAATCTTTTATGCAAGTCATGTGAAAT TTCTCCTAGCTAGCTTGTCCCTACTAAGACGTTTGAGATGGAGGCAAGTGATTGGTAACGACAC TTGTAAGGTCGAGTCTCCAGTACATTGGAAAATAACAGTCATCTCACTAGGCAAGTACTAGCGC ACATATTGGAATTGGATAACATTCCCCAACTTGTGCATCATTACAGATTTACAGTGATACGCTA ATTGTTATCGTGCAACATGATGAATAGCACAGGAACTTTGATATAGCATGCATCTGTAGTAACA AATGCAACCCGCAAGTTGAGAATACATCCATATATAGGGAAGTGGATTTGGATCCCTCAAGGAA ATATTCCCTCGTTGATTGCATGTCACTCAAGTGGTTATGAAAAAAATTGAGAAGATATATTAAC ATGTGATATATCACTCTACAAACATGCAAATAAAAATTCAACTTCGACATCTCGTAACGAAAAA AACAAATTTAACTCTGAATATACATTAACTAGCTGTTGTTTAATTTGTATTTTTCATTACAATT TGTAGAAGTTGAACTTGAACTTGTATATTTGTGGAGTGTTATATCACATGTTAATAGACCTTCT CAATTTTTTTTCAAATTTTTTTATAATCATTTGAATGACATGCAAATAACTAGGGGATATCCCC GTATATAGTCAGCATGTGTATATATCAATCAGCGATATGATGGCACATCCACAGTATCCAGAGA TCGTACGTATCGTTGCATATGCATACAGTACTGCTAGTACACTAGTGGATAATTAATGAACTAT GTGACAAACGATTGGATTATGTGCAAAAATACTAATAATGTATTAGTATATGACAAGTGTAATT TCACCACATATCACATACTTCGAGGTATTAAAATTTGTAGTGTAAAATTTTAGTATGTACTATA CTTTAAAAATTCTCATACGATTAATTTAAATAATACTAGTTAATTTGGGTGCAGTAGTGACAAA TTAAACGTTCCTCTTTGTTAAGGGTACAGGCTATATAGGGTGCGAAGTACAAGGAAGCATATCG ATGGTGTTCATATATATATATATATATATATTCATTAATCAAGTGCAAAATTAAGAAGCTGGTG GTGAATTGGTGATGGATTGAGTTCAGTTGTAGACGCAGCTGCCGTCGTCGCTCCTGGCGGTAGG GTCGTAGTTGGCGGCGCGTTGGTCGGTGCATCCCGCCGGCACGGGGACGGGCGACTGCTGCTCG GCCTTGCCGTAGAACTCGCCGGAGTCGTGGTTGGCGTCTCCGAGCGCCGCCTCGCTGAGGTACT TATCGGCGAGCCGCACCCTCTTGACGTTCTCCTGCTCCCTCACCAGCATGTGCCGGCCCGTACT CCATCAGCTTGTCGATCGTCATCTTGGGCTGCTCCAACTCGATCCGGCGGAGTTCACCAGCCTC CTGCCGATGTTCTCCACCCCGATCTCCGCCACCCACCGCCGCACCTCGTCGCCGTACACCCGCG CCCGCAGCGCCCCGAAGAAGTCGATGGGAACGCGTCGGGGACCTTGTCGCTGCGGAAGATGCCC CTGCACACGCCAATGCGGTCCTCGCGGGTGGGAGCCCAGTAGAACTTGTCCATGCGCCCGTCGC GGATGAGCGGGAGAAGTCGTTGCCGGTGACGATGATGGGGACGGGGGTTGTACATCCCTGGGAG CTGCACGTTGGTGGGGTTGTCCGCGATGTTCATCAGCGTCGCGTTCACCATCTGGTTGTTCACC GTGTACTGCGTCGTGCCGCCCCGCGTCCAGGTCGTTGATGAACAGCACGCACATCTTCCCCTTG TTGATCATGTCCGCCGCCTCGCGGTACCGCTGCCGGATCAGCTTCGCGGGCTCTCCGGCGCTCA TCATGATGAGGCTGCATGCATGCAGTTGTACTACTATTACAACACACGCAGCATGCAATGCAGT TGTACTTCCTACTCTCACTTGATCCCCATCTTGGCGAAGACGAGATCACACTGGAACGACTTGC CCTGGATGTTGGGCAGCTTCATCAAGTTCTTGGAGATGTGTCCATGGTGTTGTCCAGGTTGTAC CTGCAGCAATTAATTAATTAATTAATCAAAATGTGCATGCAACGCAGCATTATATTTCAAGCAT TATTGAATGTGCTTAATTACGTACGTTCTGAGACCCTGGCTGAGGTA |