Plant Circular RNA Database

Detail information of Os02g0103800_circ_g.1

			
						 General Information
					
						CircRNA Name
						Os02g0103800_circ_g.1
					
						ID in PlantcircBase
						osa_circ_012634
					
						Alias
						Os02circ00436
					
						Organism
						
							Oryza sativa						
					
						Position
						
							chr2: 183986-184453  JBrowse»						
					
						Reference genome
						
							IRGSP-1.0.38						
					
						Type  
						
							ei-circRNA							
									
						Identification method
						CIRCexplorer, CIRI, PcircRNA_finder, SMALT, Segemehl, circRNA_finder, find_circ
					
						Parent gene
						
							Os02g0103850						
					
						Parent gene annotation
						
							Hypothetical protein. (Os02t0103850-00)
							
						Parent gene strand
						+
					
						Alternative splicing
						
							Os02g0103800_circ_g.2 Os02g0103800_circ_g.3 Os02g0103800_circ_g.4 Os02g0103800_circ_g.5 Os02g0103800_circ_g.6 						
					
						Support reads
						97/68
					
						Tissues
						leaf and panicle/shoot, root, seed, pistil
					
						Exon boundary  
						
							Yes-Yes							"Exon boundary" shows whether the splicing sites are on the boundary of exons or not. For example, "Yes-No" represents the donor splicing site is on the exon boundary and the accepter is not on the exon boundary.

						Splicing signals  
						
							CT-AC							The splicing signals of the circRNA. For example, "AG-GT" represents that the donor and the accepter splicing signal is "AG" and "GT", respectively.

						Number of exons covered
						Os02t0103800-03:1
Os02t0103800-01:1
Os02t0103800-02:2
Os02t0103800-03:1
Os02t0103800-01:1
Os02t0103850-00:1
Os02t0103800-02:2

General Information
CircRNA Name	Os02g0103800_circ_g.1
ID in PlantcircBase	osa_circ_012634
Alias	Os02circ00436
Organism	Oryza sativa
Position	chr2: 183986-184453 JBrowse»
Reference genome	IRGSP-1.0.38
Type	ei-circRNA
Identification method	CIRCexplorer, CIRI, PcircRNA_finder, SMALT, Segemehl, circRNA_finder, find_circ
Parent gene	Os02g0103850
Parent gene annotation	Hypothetical protein. (Os02t0103850-00)
Parent gene strand	+
Alternative splicing	Os02g0103800_circ_g.2 Os02g0103800_circ_g.3 Os02g0103800_circ_g.4 Os02g0103800_circ_g.5 Os02g0103800_circ_g.6
Support reads	97/68
Tissues	leaf and panicle/shoot, root, seed, pistil
Exon boundary	Yes-Yes "Exon boundary" shows whether the splicing sites are on the boundary of exons or not. For example, "Yes-No" represents the donor splicing site is on the exon boundary and the accepter is not on the exon boundary.
Splicing signals	CT-AC The splicing signals of the circRNA. For example, "AG-GT" represents that the donor and the accepter splicing signal is "AG" and "GT", respectively.
Number of exons covered	Os02t0103800-03:1 Os02t0103800-01:1 Os02t0103800-02:2 Os02t0103800-03:1 Os02t0103800-01:1 Os02t0103850-00:1 Os02t0103800-02:2

			
						 Experimental Information
					
						Sanger sequencing for BSS  
						
							Yes							Sanger sequencing for back-splicing site (BSS) validation. "Yes" represents Sanger sequencing has been performed to valid the back-splicing site, "No" represents the opposite, "NA" represents "not available".

						PCR primers for BSS   
						
							F: TTGAACTTGTAGTCGTCGTGCT
 R: AGTTCGAGCGGATGAAGGAG
PCR primers used in back-splicing site (BSS) validation.

						Sanger sequencing for FL   
						
							NA							Sanger sequencing for full-length (FL) sequence validation of circRNAs. "Yes" represents Sanger sequencing has been performed to valid the full-length of circRNA, "No" represents the opposite.

						PCR primers for FL   
						
							NA							 PCR primers used in full-length (FL) sequence validation.

Experimental Information
Sanger sequencing for BSS	Yes Sanger sequencing for back-splicing site (BSS) validation. "Yes" represents Sanger sequencing has been performed to valid the back-splicing site, "No" represents the opposite, "NA" represents "not available".
PCR primers for BSS	F: TTGAACTTGTAGTCGTCGTGCT R: AGTTCGAGCGGATGAAGGAG PCR primers used in back-splicing site (BSS) validation.
Sanger sequencing for FL	NA Sanger sequencing for full-length (FL) sequence validation of circRNAs. "Yes" represents Sanger sequencing has been performed to valid the full-length of circRNA, "No" represents the opposite.
PCR primers for FL	NA PCR primers used in full-length (FL) sequence validation.

			
				
						 Sequences
					

				
						Splice junction sequence  
						
							GTGCCCAGCATGATGATGGTGGCGTTGGGGTCCTTGGGCATCAGCATCTCCTTCCCCACTGGCC
CCGTGATCTTCACGTCCGAACCAGGCTTCAGGTCACcgtcttttgcagcgaggtcgatcatgat
gtcgtcgatgcctttctccatgcccttgaggccgcacatgtagacgtaggtgttgtccttcttg
agcagctc

									
								

					

						Assembled circRNA sequence  
						
							Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).

					

						Full-length trsnacripts
						
							Transcript length: 240
Transcript exons: 183986-184101,184330-184453
CGTCTTTTGCAGCGAGGTCGATCATGATGTCGTCGATGCCTTTCTCCATGCCCTTGAGGCCGCA
CATGTAGACGTAGGTGTTGTCCTTCTTGAGCAGCTCCCACAGCTCGTCCTTGCTGAAGGGCGCG
ATGCCGGTGCCGGTGCCCAGCATGATGATGGTGGCGTTGGGGTCCTTGGGCATCAGCATCTCCT
TCCCCACTGGCCCCGTGATCTTCACGTCCGAACCAGGCTTCAGGTCAC
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CGTCTTTTGCAGCGAGGTCGATCATGATGTCGTCGATGCCTTTCTCCATGCCCTTGAGGCCGCA
CATGTAGACGTAGGTGTTGTCCTTCTTGAGCAGCTCCCACAGCTCGTCCTTGTACTCCGCCATC
CGCGTCTGGATGTACATCTTCTCCCCCGCCGCGTTCGTCGCGCGATGCCGGTGCCGGTGCCCAG
CATGATGATGGTGGCGTTGGGGTCCTTGGGCATCAGCATCTCCTTCCCCACTGGCCCCGTGATC
TTCACGTCCGAACCAGGCTTCAGGTCAC
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CGTCTTTTGCAGCGAGGTCGATCATGATGTCGTCGATGCCTTTCTCCATGCCCTTGAGGCCGCA
CATGTAGACGTAGGTGTTGTCCTTCTTGAGCAGCTCCCACAGCTCGTCCTTGTACTCCGCCATC
CGCGTCTGGATGTACATCTTCTCCCCCGCCGCTCGAAGAACATCTTCCACAGGAAGGACCTGAA
GGGCGCGATGCCGGTGCCGGTGCCCAGCATGATGATGGTGGCGTTGGGGTCCTTGGGCATCAGC
ATCTCCTTCCCCACTGGCCCCGTGATCTTCACGTCCGAACCAGGCTTCAGGTCAC
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CGTCTTTTGCAGCGAGGTCGATCATGATGTCGTCGATGCCTTTCTCCATGCCCTTGAGGCCGCA
CATGTAGACGTAGGTGTTGTCCTTCTTGAGCAGCTCCCACAGCTCGTCCTTGTACTCCGCCATC
CGCGTCTGGATGTACATCTTCTCCCCCGCCGCGTTCGTCTGCTCCCGGCTCACCGCGAAGTCCA
GGGCGCGATGCCGGTGCCGGTGCCCAGCATGATGATGGTGGCGTTGGGGTCCTTGGGCATCAGC
ATCTCCTTCCCCACTGGCCCCGTGATCTTCACGTCCGAACCAGGCTTCAGGTCAC
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CATGTAGACGTAGGTGTTGTCCTTCTTGAGCAGCTCCCACAGCTCGTCCTTGTACTCCGCCATC
CGCGTCTGGATGTACTTGTAGTCGTCGTGCTCCTCGAAGAACATCTTCCACAGGAAGGACCTGA
AGGGCGCGATGCCGGTGCCGGTGCCCAGCATGATGATGGTGGCGTTGGGGTCCTTGGGCATCAG
CATCTCCTTCCCCACTGGCCCCGTGATCTTCACGTCCGAACCAGGCTTCAGGTCAC
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CATGTAGACGTAGGTGTTGTCCTTCTTGAGCAGCTCCCACAGCTCGTCCTTGTACTCCGCCATC
CGCGTCTGGATGTACATCTTCTCCCCCGCCGCGTCGTGCTCCTCGAAGAACATCTTCCACAGGA
AGGACCTGAAGGGCGCGATGCCGGTGCCGGTGCCCAGCATGATGATGGTGGCGTTGGGGTCCTT
GGGCATCAGCATCTCCTTCCCCACTGGCCCCGTGATCTTCACGTCCGAACCAGGCTTCAGGTCA
C
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CATGTAGACGTAGGTGTTGTCCTTCTTGAGCAGCTCCCACAGCTCGTCCTTGTACTCCGCCATC
CGCGTCTGGATGTACATCTTCTCCCCCGCCGCGTTCGTCTGCTCCCGGCTCACCGCGAAGTCCA
GCCGGAACCTCTCCGGCGCGATCTCCTTCACGGTGCCCAGCATGATGATGGTGGCGTTGGGGTC
CTTGGGCATCAGCATCTCCTTCCCCACTGGCCCCGTGATCTTCACGTCCGAACCAGGCTTCAGG
TCAC
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CATGTAGACGTAGGTGTTGTCCTTCTTGAGCAGCTCCCACAGCTCGTCCTTGTACTCCGCCATC
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CCACAGGAAGGACCTGAAGGGCGCGATGCCGGTGCCGGTGCCCAGCATGATGATGGTGGCGTTG
GGGTCCTTGGGCATCAGCATCTCCTTCCCCACTGGCCCCGTGATCTTCACGTCCGAACCAGGCT
TCAGGTCAC
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GCCGGAACCTCTCCGGCGGGGCGCGATGCCGGTGCCGGTGCCCAGCATGATGATGGTGGCGTTG
GGGTCCTTGGGCATCAGCATCTCCTTCCCCACTGGCCCCGTGATCTTCACGTCCGAACCAGGCT
TCAGGTCAC
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CATGTAGACGTAGGTGTTGTCCTTCTTGAGCAGCTCCCACAGCTCGTCCTTGTACTCCGCCATC
CGCGTCTGGATGTACATCTTCTCCCCCGCCGCGTTCGTCTGGTCGTGCTCCTCGAAGAACATCT
TCCACAGGAAGGACCTGAAGGGCGCGATGCCGGTGCCGGTGCCCAGCATGATGATGGTGGCGTT
GGGGTCCTTGGGCATCAGCATCTCCTTCCCCACTGGCCCCGTGATCTTCACGTCCGAACCAGGC
TTCAGGTCAC
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CATGTAGACGTAGGTGTTGTCCTTCTTGAGCAGCTCCCACAGCTCGTCCTTGTACTCCGCCATC
CGCGTCTGGATGTACATCTTCTCCCCCGCCGCGTTGAACTTGTAGTCGTCGTGCTCCTCGAAGA
ACATCTTCCACAGGAAGGACCTGAAGGGCGCGATGCCGGTGCCGGTGCCCAGCATGATGATGGT
GGCGTTGGGGTCCTTGGGCATCAGCATCTCCTTCCCCACTGGCCCCGTGATCTTCACGTCCGAA
CCAGGCTTCAGGTCAC
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CATGTAGACGTAGGTGTTGTCCTTCTTGAGCAGCTCCCACAGCTCGTCCTTGTACTCCGCCATC
CGCGTCTGGATGTACATCTTCTCCCCCGCCGCGGTTGAACTTGTAGTCGTCGTGCTCCTCGAAG
AACATCTTCCACAGGAAGGACCTGAAGGGCGCGATGCCGGTGCCGGTGCCCAGCATGATGATGG
TGGCGTTGGGGTCCTTGGGCATCAGCATCTCCTTCCCCACTGGCCCCGTGATCTTCACGTCCGA
ACCAGGCTTCAGGTCAC
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CATGTAGACGTAGGTGTTGTCCTTCTTGAGCAGCTCCCACAGCTCGTCCTTGTACTCCGCCATC
CGCGTCTGGATGTACATCTTCTCCCCCGCGCCAGGCCGTTGAACTTGTAGTCGTCGTGCTCCTC
GAAGAACATCTTCCACAGGAAGGACCTGAAGGGCGCGATGCCGGTGCCGGTGCCCAGCATGATG
ATGGTGGCGTTGGGGTCCTTGGGCATCAGCATCTCCTTCCCCACTGGCCCCGTGATCTTCACGT
CCGAACCAGGCTTCAGGTCAC
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CATGTAGACGTAGGTGTTGTCCTTCTTGAGCAGCTCCCACAGCTCGTCCTTGTACTCCGCCATC
CGCGTCTGGATGTACATCTTCTCCCCCGCCGCGTTCGTCTGCTCCCGGCTCACCGCGAAGTCCT
GCTCCTCGAAGAACATCTTCCACAGGAAGGACCTGAAGGGCGCGATGCCGGTGCCGGTGCCCAG
CATGATGATGGTGGCGTTGGGGTCCTTGGGCATCAGCATCTCCTTCCCCACTGGCCCCGTGATC
TTCACGTCCGAACCAGGCTTCAGGTCAC
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Transcript exons: 183986-184141,184259-184453
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CATGTAGACGTAGGTGTTGTCCTTCTTGAGCAGCTCCCACAGCTCGTCCTTGTACTCCGCCATC
CGCGTCTGGATGTACATCTTCTCCCCCGGGAAGAGCCACGCCAGGCCGTTGAACTTGTAGTCGT
CGTGCTCCTCGAAGAACATCTTCCACAGGAAGGACCTGAAGGGCGCGATGCCGGTGCCGGTGCC
CAGCATGATGATGGTGGCGTTGGGGTCCTTGGGCATCAGCATCTCCTTCCCCACTGGCCCCGTG
ATCTTCACGTCCGAACCAGGCTTCAGGTCAC
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Transcript exons: 183986-184161,184277-184453
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CATGTAGACGTAGGTGTTGTCCTTCTTGAGCAGCTCCCACAGCTCGTCCTTGTACTCCGCCATC
CGCGTCTGGATGTACATCTTCTCCCCCGCCGCGTTCGTCTGCTCCCGGCGTTGAACTTGTAGTC
GTCGTGCTCCTCGAAGAACATCTTCCACAGGAAGGACCTGAAGGGCGCGATGCCGGTGCCGGTG
CCCAGCATGATGATGGTGGCGTTGGGGTCCTTGGGCATCAGCATCTCCTTCCCCACTGGCCCCG
TGATCTTCACGTCCGAACCAGGCTTCAGGTCAC
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Transcript exons: 183986-184178,184292-184453
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CATGTAGACGTAGGTGTTGTCCTTCTTGAGCAGCTCCCACAGCTCGTCCTTGTACTCCGCCATC
CGCGTCTGGATGTACATCTTCTCCCCCGCCGCGTTCGTCTGCTCCCGGCTCACCGCGAAGTCCA
GCGTCGTGCTCCTCGAAGAACATCTTCCACAGGAAGGACCTGAAGGGCGCGATGCCGGTGCCGG
TGCCCAGCATGATGATGGTGGCGTTGGGGTCCTTGGGCATCAGCATCTCCTTCCCCACTGGCCC
CGTGATCTTCACGTCCGAACCAGGCTTCAGGTCAC
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Transcript exons: 183986-184135,184248-184453
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CATGTAGACGTAGGTGTTGTCCTTCTTGAGCAGCTCCCACAGCTCGTCCTTGTACTCCGCCATC
CGCGTCTGGATGTACATCTTCTGGGCACCCCGAGGAAGAGCCACGCCAGGCCGTTGAACTTGTA
GTCGTCGTGCTCCTCGAAGAACATCTTCCACAGGAAGGACCTGAAGGGCGCGATGCCGGTGCCG
GTGCCCAGCATGATGATGGTGGCGTTGGGGTCCTTGGGCATCAGCATCTCCTTCCCCACTGGCC
CCGTGATCTTCACGTCCGAACCAGGCTTCAGGTCAC
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Transcript exons: 183986-184178,184287-184453
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CATGTAGACGTAGGTGTTGTCCTTCTTGAGCAGCTCCCACAGCTCGTCCTTGTACTCCGCCATC
CGCGTCTGGATGTACATCTTCTCCCCCGCCGCGTTCGTCTGCTCCCGGCTCACCGCGAAGTCCA
GGTAGTCGTCGTGCTCCTCGAAGAACATCTTCCACAGGAAGGACCTGAAGGGCGCGATGCCGGT
GCCGGTGCCCAGCATGATGATGGTGGCGTTGGGGTCCTTGGGCATCAGCATCTCCTTCCCCACT
GGCCCCGTGATCTTCACGTCCGAACCAGGCTTCAGGTCAC
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Transcript exons: 183986-184178,184280-184453
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CGCGTCTGGATGTACATCTTCTCCCCCGCCGCGTTCGTCTGCTCCCGGCTCACCGCGAAGTCCA
GTGAACTTGTAGTCGTCGTGCTCCTCGAAGAACATCTTCCACAGGAAGGACCTGAAGGGCGCGA
TGCCGGTGCCGGTGCCCAGCATGATGATGGTGGCGTTGGGGTCCTTGGGCATCAGCATCTCCTT
CCCCACTGGCCCCGTGATCTTCACGTCCGAACCAGGCTTCAGGTCAC
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Transcript exons: 183986-184178,184278-184453
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CATGTAGACGTAGGTGTTGTCCTTCTTGAGCAGCTCCCACAGCTCGTCCTTGTACTCCGCCATC
CGCGTCTGGATGTACATCTTCTCCCCCGCCGCGTTCGTCTGCTCCCGGCTCACCGCGAAGTCCA
GGTTGAACTTGTAGTCGTCGTGCTCCTCGAAGAACATCTTCCACAGGAAGGACCTGAAGGGCGC
GATGCCGGTGCCGGTGCCCAGCATGATGATGGTGGCGTTGGGGTCCTTGGGCATCAGCATCTCC
TTCCCCACTGGCCCCGTGATCTTCACGTCCGAACCAGGCTTCAGGTCAC
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Transcript exons: 183986-184161,184259-184453
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CATGTAGACGTAGGTGTTGTCCTTCTTGAGCAGCTCCCACAGCTCGTCCTTGTACTCCGCCATC
CGCGTCTGGATGTACATCTTCTCCCCCGCCGCGTTCGTCTGCTCCCGGGGAAGAGCCACGCCAG
GCCGTTGAACTTGTAGTCGTCGTGCTCCTCGAAGAACATCTTCCACAGGAAGGACCTGAAGGGC
GCGATGCCGGTGCCGGTGCCCAGCATGATGATGGTGGCGTTGGGGTCCTTGGGCATCAGCATCT
CCTTCCCCACTGGCCCCGTGATCTTCACGTCCGAACCAGGCTTCAGGTCAC
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Transcript exons: 183986-184153,184240-184453
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CATGTAGACGTAGGTGTTGTCCTTCTTGAGCAGCTCCCACAGCTCGTCCTTGTACTCCGCCATC
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AGCCACGCCAGGCCGTTGAACTTGTAGTCGTCGTGCTCCTCGAAGAACATCTTCCACAGGAAGG
ACCTGAAGGGCGCGATGCCGGTGCCGGTGCCCAGCATGATGATGGTGGCGTTGGGGTCCTTGGG
CATCAGCATCTCCTTCCCCACTGGCCCCGTGATCTTCACGTCCGAACCAGGCTTCAGGTCAC
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Transcript exons: 183986-184183,184267-184453
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CATGTAGACGTAGGTGTTGTCCTTCTTGAGCAGCTCCCACAGCTCGTCCTTGTACTCCGCCATC
CGCGTCTGGATGTACATCTTCTCCCCCGCCGCGTTCGTCTGCTCCCGGCTCACCGCGAAGTCCA
GCCGGACACGCCAGGCCGTTGAACTTGTAGTCGTCGTGCTCCTCGAAGAACATCTTCCACAGGA
AGGACCTGAAGGGCGCGATGCCGGTGCCGGTGCCCAGCATGATGATGGTGGCGTTGGGGTCCTT
GGGCATCAGCATCTCCTTCCCCACTGGCCCCGTGATCTTCACGTCCGAACCAGGCTTCAGGTCA
C
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Transcript exons: 183986-184210,184293-184453
CGTCTTTTGCAGCGAGGTCGATCATGATGTCGTCGATGCCTTTCTCCATGCCCTTGAGGCCGCA
CATGTAGACGTAGGTGTTGTCCTTCTTGAGCAGCTCCCACAGCTCGTCCTTGTACTCCGCCATC
CGCGTCTGGATGTACATCTTCTCCCCCGCCGCGTTCGTCTGCTCCCGGCTCACCGCGAAGTCCA
GCCGGAACCTCTCCGGCGCGATCTCCTTCATCCGTCGTGCTCCTCGAAGAACATCTTCCACAGG
AAGGACCTGAAGGGCGCGATGCCGGTGCCGGTGCCCAGCATGATGATGGTGGCGTTGGGGTCCT
TGGGCATCAGCATCTCCTTCCCCACTGGCCCCGTGATCTTCACGTCCGAACCAGGCTTCAGGTC
AC
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Transcript exons: 183986-184172,184254-184453
CGTCTTTTGCAGCGAGGTCGATCATGATGTCGTCGATGCCTTTCTCCATGCCCTTGAGGCCGCA
CATGTAGACGTAGGTGTTGTCCTTCTTGAGCAGCTCCCACAGCTCGTCCTTGTACTCCGCCATC
CGCGTCTGGATGTACATCTTCTCCCCCGCCGCGTTCGTCTGCTCCCGGCTCACCGCGAACCCGA
GGAAGAGCCACGCCAGGCCGTTGAACTTGTAGTCGTCGTGCTCCTCGAAGAACATCTTCCACAG
GAAGGACCTGAAGGGCGCGATGCCGGTGCCGGTGCCCAGCATGATGATGGTGGCGTTGGGGTCC
TTGGGCATCAGCATCTCCTTCCCCACTGGCCCCGTGATCTTCACGTCCGAACCAGGCTTCAGGT
CAC
Transcript length: 388
Transcript exons: 183986-184178,184259-184453
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CATGTAGACGTAGGTGTTGTCCTTCTTGAGCAGCTCCCACAGCTCGTCCTTGTACTCCGCCATC
CGCGTCTGGATGTACATCTTCTCCCCCGCCGCGTTCGTCTGCTCCCGGCTCACCGCGAAGTCCA
GGGAAGAGCCACGCCAGGCCGTTGAACTTGTAGTCGTCGTGCTCCTCGAAGAACATCTTCCACA
GGAAGGACCTGAAGGGCGCGATGCCGGTGCCGGTGCCCAGCATGATGATGGTGGCGTTGGGGTC
CTTGGGCATCAGCATCTCCTTCCCCACTGGCCCCGTGATCTTCACGTCCGAACCAGGCTTCAGG
TCAC
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Transcript exons: 183986-184196,184254-184453
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CATGTAGACGTAGGTGTTGTCCTTCTTGAGCAGCTCCCACAGCTCGTCCTTGTACTCCGCCATC
CGCGTCTGGATGTACATCTTCTCCCCCGCCGCGTTCGTCTGCTCCCGGCTCACCGCGAAGTCCA
GCCGGAACCTCTCCGGCGCCCCGAGGAAGAGCCACGCCAGGCCGTTGAACTTGTAGTCGTCGTG
CTCCTCGAAGAACATCTTCCACAGGAAGGACCTGAAGGGCGCGATGCCGGTGCCGGTGCCCAGC
ATGATGATGGTGGCGTTGGGGTCCTTGGGCATCAGCATCTCCTTCCCCACTGGCCCCGTGATCT
TCACGTCCGAACCAGGCTTCAGGTCAC
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Transcript exons: 183986-184197,184252-184453
CGTCTTTTGCAGCGAGGTCGATCATGATGTCGTCGATGCCTTTCTCCATGCCCTTGAGGCCGCA
CATGTAGACGTAGGTGTTGTCCTTCTTGAGCAGCTCCCACAGCTCGTCCTTGTACTCCGCCATC
CGCGTCTGGATGTACATCTTCTCCCCCGCCGCGTTCGTCTGCTCCCGGCTCACCGCGAAGTCCA
GCCGGAACCTCTCCGGCGCGACCCCGAGGAAGAGCCACGCCAGGCCGTTGAACTTGTAGTCGTC
GTGCTCCTCGAAGAACATCTTCCACAGGAAGGACCTGAAGGGCGCGATGCCGGTGCCGGTGCCC
AGCATGATGATGGTGGCGTTGGGGTCCTTGGGCATCAGCATCTCCTTCCCCACTGGCCCCGTGA
TCTTCACGTCCGAACCAGGCTTCAGGTCAC
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Transcript exons: 183986-184150,184199-184453
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CATGTAGACGTAGGTGTTGTCCTTCTTGAGCAGCTCCCACAGCTCGTCCTTGTACTCCGCCATC
CGCGTCTGGATGTACATCTTCTCCCCCGCCGCGTTCGTCTCCTTCATCCGCTCGAACTCCTCCC
TGTACAGCAGCGTGCTGCTGGTGGGCACCCCGAGGAAGAGCCACGCCAGGCCGTTGAACTTGTA
GTCGTCGTGCTCCTCGAAGAACATCTTCCACAGGAAGGACCTGAAGGGCGCGATGCCGGTGCCG
GTGCCCAGCATGATGATGGTGGCGTTGGGGTCCTTGGGCATCAGCATCTCCTTCCCCACTGGCC
CCGTGATCTTCACGTCCGAACCAGGCTTCAGGTCAC
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Transcript exons: 183986-184218,184265-184453
CGTCTTTTGCAGCGAGGTCGATCATGATGTCGTCGATGCCTTTCTCCATGCCCTTGAGGCCGCA
CATGTAGACGTAGGTGTTGTCCTTCTTGAGCAGCTCCCACAGCTCGTCCTTGTACTCCGCCATC
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GCCGGAACCTCTCCGGCGCGATCTCCTTCATCCGCTCGAACGCCACGCCAGGCCGTTGAACTTG
TAGTCGTCGTGCTCCTCGAAGAACATCTTCCACAGGAAGGACCTGAAGGGCGCGATGCCGGTGC
CGGTGCCCAGCATGATGATGGTGGCGTTGGGGTCCTTGGGCATCAGCATCTCCTTCCCCACTGG
CCCCGTGATCTTCACGTCCGAACCAGGCTTCAGGTCAC
Transcript length: 468
Transcript exons: 183986-184453
CGTCTTTTGCAGCGAGGTCGATCATGATGTCGTCGATGCCTTTCTCCATGCCCTTGAGGCCGCA
CATGTAGACGTAGGTGTTGTCCTTCTTGAGCAGCTCCCACAGCTCGTCCTTGTACTCCGCCATC
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						Genomic sequence
						
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GCCGGAACCTCTCCGGCGCGATCTCCTTCATCCGCTCGAACTCCTCCCTGTACAGCAGCGTGCT
GCTGGTGGGCACCCCGAGGAAGAGCCACGCCAGGCCGTTGAACTTGTAGTCGTCGTGCTCCTCG
AAGAACATCTTCCACAGGAAGGACCTGAAGGGCGCGATGCCGGTGCCGGTGCCCAGCATGATGA
TGGTGGCGTTGGGGTCCTTGGGCATCAGCATCTCCTTCCCCACTGGCCCCGTGATCTTCACGTC
CGAACCAGGCTTCAGGTCAC
						
					

			
		

Sequences
Splice junction sequence	GTGCCCAGCATGATGATGGTGGCGTTGGGGTCCTTGGGCATCAGCATCTCCTTCCCCACTGGCC CCGTGATCTTCACGTCCGAACCAGGCTTCAGGTCACcgtcttttgcagcgaggtcgatcatgat gtcgtcgatgcctttctccatgcccttgaggccgcacatgtagacgtaggtgttgtccttcttg agcagctc
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						 Conservation Information
					
						Conserved circRNAs
						
							osi_circ_003572* osi_circ_011756 						
					
						PMCS
						0.738762586

Conservation Information
Conserved circRNAs	osi_circ_003572* osi_circ_011756
PMCS	0.738762586

			
						 Functional Information
					
						Coding potential
						Y
					
						Potential coding position
						
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184402-183988(-)
						
						Potential amino acid sequence
						
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SDVKITGPVGKEMLMPKDPNATIIMLGTGTGIAPFRSFLWKMFFEEHDDYKFNGLAWLFLGVPT
SSTLLYREEFERMKETNAAGEKMYIQTRMAEYKDELWELLKKDNTYVYMCGLKGMEKGIDDIMI
DLAAKDGDLKPGSDVKITGPVGKEMLMPKDPNATIIMLGTGTGIAPFRSFLWKMFFEEHDDYKF
NGLAWLFLGVPTSSTLLYREEFERMKETNAAGEKMYIQTRMAEYKDELWELLKKDNTYVYMCGL
KGMEKGIDDIMIDLAAKDGDLKPGSDVKITGPVGKEMLMPKDPNATIIMLGTGTGIAPFRSFLW
KMFFEEHDDYKFNGLAWLFLGVPTSSTLLYREEFERMKETNAAGEKMYIQTRMAEYKDELWELL
KKDNTYVYMCGLKGMEKGIDDIMIDLAAKD(-)
						
						Sponge-miRNAs
						
							NA						
					
						circRNA-miRNA-mRNA network
						 VISUALIZATION
					
						Potential function description
						NA

Functional Information
Coding potential	Y
Potential coding position	184343-184053(+) 184402-183988(-)
Potential amino acid sequence	MPVPVPSMMMVALGSLGISISFPTGPVIFTSEPGFRSPSFAARSIMMSSMPFSMPLRPHM*(+) MLMPKDPNATIIMLGTGTGIAPFRSFLWKMFFEEHDDYKFNGLAWLFLGVPTSSTLLYREEFER MKETNAAGEKMYIQTRMAEYKDELWELLKKDNTYVYMCGLKGMEKGIDDIMIDLAAKDGDLKPG SDVKITGPVGKEMLMPKDPNATIIMLGTGTGIAPFRSFLWKMFFEEHDDYKFNGLAWLFLGVPT SSTLLYREEFERMKETNAAGEKMYIQTRMAEYKDELWELLKKDNTYVYMCGLKGMEKGIDDIMI DLAAKDGDLKPGSDVKITGPVGKEMLMPKDPNATIIMLGTGTGIAPFRSFLWKMFFEEHDDYKF NGLAWLFLGVPTSSTLLYREEFERMKETNAAGEKMYIQTRMAEYKDELWELLKKDNTYVYMCGL KGMEKGIDDIMIDLAAKDGDLKPGSDVKITGPVGKEMLMPKDPNATIIMLGTGTGIAPFRSFLW KMFFEEHDDYKFNGLAWLFLGVPTSSTLLYREEFERMKETNAAGEKMYIQTRMAEYKDELWELL KKDNTYVYMCGLKGMEKGIDDIMIDLAAKD(-)
Sponge-miRNAs	NA
circRNA-miRNA-mRNA network	VISUALIZATION
Potential function description	NA

			
						 Other Information
					
						References
						Lu et al., 2015;Chu et al., 2017

circRNA

Detail information of Os02g0103800_circ_g.1

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