Splice junction sequence |
ACTAGACACCGAGTGGGATTGTCTTCTAGGTACCCAGGAGAGTGGTCTAATGCCATCAAAACCT TTTGTGTCAAAGCATCTCAGCACTACACTTTCAGATttatgggttacctctggaaaccatccat tcagatttcaagtctggtctagaaggccttctgaaggagaagcccaccaaagcaattttcattg gcacaaga
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 1018 Transcript exons: 5088875-5088992,5089136-5089218,5089300-5089359,5089600- 5089845,5090276-5090372,5091263-5091313,5091391-5091471, 5092103-5092174,5092300-5092362,5093307-5093453 TTATGGGTTACCTCTGGAAACCATCCATTCAGATTTCAAGTCTGGTCTAGAAGGCCTTCTGAAG GAGAAGCCCACCAAAGCAATTTTCATTGGCACAAGAATTGGTGATCCAAATGCGGTTGGTCAAG AACAGTTCTCTCCTAGTTCACCTGGCTGGCCTCCTTTTATGAGGGTGAATCCAATCTTGGATTG GTCATACAGGGATGTTTGGTCTTTTCTAATAACATGTAAGGTCAAATACTGCAGCCTTTATGAT CAAGGGTATACTTCCATTGGGAGCATACACGATACTGTTCCAAATGCACTCCTTAGTGATTCAT CATCTGAGAAAAGTTTTAGACCAGCATACATGCTAACTGATGGAAGGCTTGAAAGAGCTGGTAG AACAAAAAAGATTAATCCTAAAGTAGAAATGAATTCTGCTGCAAGCAATGGCATCAACGATACT GAGGGAGGACGGATGATCTCACGGGCGGCATCAATCATTGTAGTCGGTGATGAAATTTTGTTTG GTACAACTGAGGATAACTTAGGAGCAGCCTTGTGCAAGAAGCTTCATGCAATTGGCTGGCGGGT TTCTCATGTAGCAGTTGTTCGCAATGAGATTGATTCTGTTGCTGAAGAAGTTGAACGTTGTAAA TCTACTGATGACATGGTGTTTATTTTTGGTGGACTCGGGCCGCTACATTCAGACGTTTCTTTGG CTGGTGTCGCGAAAGCATTTGGAGTTCGTCTGGCTCCTGATGAAGAATTTGAAGATTACCTTAG TCAACTCATGGGAAACAATTACACTGGTGACCGAAATGAGATGGCACAGTTGCCAGAAGGTATT ACAGAATTACTGCATCACAAAACGCTACCATTGCCATTGATCAAATGTAGAAATGTCATTGCTC TTGCTGCAACCAATATGGATGAACTAGACACCGAGTGGGATTGTCTTCTAGGTACCCAGGAGAG TGGTCTAATGCCATCAAAACCTTTTGTGTCAAAGCATCTCAGCACTACACTTTCAGAT
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Genomic sequence |
TTATGGGTTACCTCTGGAAACCATCCATTCAGATTTCAAGTCTGGTCTAGAAGGCCTTCTGAAG GAGAAGCCCACCAAAGCAATTTTCATTGGCACAAGAATTGGTGATCCAAATGCGGTGATTTTCT TTTACCATTGCTCATTTGTTGTTAACAACCCCTTGCACCTATTGTACGCAATGATTATGCCCAT GGTGTTCCCAGTTCCTTACAGTTTTGGTATCTCACTGAACTTTGAGTAAACACAATTTTGAAAT GATAGGTTGGTCAAGAACAGTTCTCTCCTAGTTCACCTGGCTGGCCTCCTTTTATGAGGGTGAA TCCAATCTTGGATTGGTCATACAGGTTTTTCTCCTGATCATGTAACAAATCAAGCCTTTCTAGT ATGCCTGTTCAGATGCTAAGGAGCATTATTTTCTGTGCCAGGGATGTTTGGTCTTTTCTAATAA CATGTAAGGTCAAATACTGCAGCCTTTATGATCAAGGGTAGGTTCTTATTTTTATGTTCAAGAC TTCATATTTCTAGTTGCCTGTTTGCAATTTGCATACCTTGTATAGCTAAATGTTCCCTAAAAAG GACCAGTCCCCTCCTTTGTTTGAATGAGCATTTTTGTTACCTAGTCCACTTATTTTTCAGCTCA TTTTGTGAATCCACTGCAGAAGTATTCTGGTCTTCGATATTAACTTTGCAATATAACTTACATC TATCATATATACTGATTTCAGGTATACTTCCATTGGGAGCATACACGATACTGTTCCAAATGCA CTCCTTAGTGATTCATCATCTGAGAAAAGTTTTAGACCAGCATACATGCTAACTGATGGAAGGC TTGAAAGAGCTGGTAGAACAAAAAAGATTAATCCTAAAGTAGAAATGAATTCTGCTGCAAGCAA TGGCATCAACGATACTGAGGGAGGACGGATGATCTCACGGGCGGCATCAATCATTGTAGTCGGT GATGAAATTTTGTGAGTGGTCCCTTCTAGTTATCACATTTGATGTAATTCTGTTATGCTTCAGG TTCTTACGCTTGGAGTAGTTCATGATAGTAATGGAACCCATGATCTTTTTTTTGTTTACTTGAA ATTTATGCCCCATCCTGCAAACTCTTTCATCTCTGGTTTTGCTTTTTGGATGGATGATTGGATT ATATAAATTGATAATCTGGACACTTCAGAGAGATAAGAGAACTAGAGAAGTGTAGCCAGACATT CTGAAGTATAGATATACATTTTGTGTTAGTCATTTTATTTAATAATGTCAGACAACTTAATGTT GCTACACTATTTCATATTCTTTCATGTTTCCTGAAATCCATTAAAATATTTGATGGATAACCAA ACTTATTAACCTTTAGATTTAACATGTAGTCCATACCTATCCATTTTGATTCTTCAGGTTTGGT ACAACTGAGGATAACTTAGGAGCAGCCTTGTGCAAGAAGCTTCATGCAATTGGCTGGCGGGTTT CTCATGTAGCAGTTGTTCGCAATGAGGTAAATATAAATCACTTATTGAAATACTCTTCTGGTCC CTTTTAGAAGGCTTACCGACAATTTTGTCAAGTCCATTATAGAAGGCACTCCTTAGGCCTGGGC CCCATTAACAAAGTTGACCAAAAAAATGAGATACAAGCAGTAATTGGTGTGCGCACCGAGTAGT AGGAATATAAAGTTGTTTTTGCATGCATGTCTATTCAGTTCATTCATTTTTGACAACCGCATGC ATAACCACATGTAGAAGTCATCCAAAAGGAGCGCTGCACCCGGTGAAAATCAAATACATGTCTT TGCATTCTAACTTTTAGTATGCCTTCTAAAAGGGACAGGGTGGATTATACTATGACCCTGGACC ACTTTGGGACGCGGGAAATTTTCATGTTTCCTTCATTTTTCCTTGAATTTAAACTGATTCGCCA ACGCACTCACAGTGCAGTGGTGGATCCTCCTGTTTCGGAGGCCACCCGCCCAGGTTCGATTCCC AGTCTTGTGATTGGCCGGGTGTGGCACTGGGGTTTTACTTTCCCTTTTCCCTTGAGGGACCTGA ACAGCATGTGTGGGTATTGTGTGTGTATGTGTGCGGTGTGCCCGGTTGACGTGTTCTGAGATCT CTTGGGCAGTCTCACCTGTATTTGAGTGTGTGCCTGTGCGGTTGGTATACGTGTCCAATACGAG TCTTACATGATATGCTAGTGCTCCTGGCAGTGTTAAAAAATGATTATTGGGAAATTTCTGGACA ATTCCTGTGAAATTCCTACCCTCTAAAGGAGGCCTAAATGCATGACCCAGCTCACATTGGCTTA ATAGATTGCTATGTTTTTTGGTATACTGCCACTGTCATGTTGTTCTTTCTCAAATACTACTGGC ATATCTGTGTGGCCTTGCAGATTGATTCTGTTGCTGAAGAAGTTGAACGTTGTAAATCTACTGA TGACATGGTTAGTGTCTATATAGGCTATTTAATTGTATAAAGTTTTCAAGCTAGATGTGTAATG AAATCCATGTTGTATTTAAGGTGTTTATTTTTGGTGGACTCGGGCCGCTACATTCAGACGTTTC TTTGGCTGGTGTCGCGAAAGCATTTGGAGTTCGTCTGGTGCGTCCAATAACATTTTCTTGCTGC AAAAGTGAATTTTCGCAGTATTTCTCCATTTATGAGTTATGAATTATGAGAGCAACTCCAAGAG ATTATCTAAAAAGACTAGCCAAATTTACTGATTTAGCTACTCTCTAAAATAGATTTTAGAGAAA AAGTGTAGCCTAATCCAACAAAATCGGTAAACCTACGGACTGAATAGAGAGTGAAGCAGACTAT CAAAAAATGGAGAGCGAAGATGGAGAAATAGAGAGCCACTAAATTTGAAGAGTCGTTTACAGAG TCTATTGGATACAATTTTCTTTTAATATTAGCTAAATTTACCTTTACAAAACCATATACATAGT CTCTTGGAGTTGCTCTGATCTTTTCTATATAAATTCTCACTATTATAATATTGTGCGGTGTATT TTCTGCATTTTTGATTCTACAATGAAGAAAAGCTTGTGCATTGACCTATAGGGCTGCATTAGTG TCACAAGAAAACCATGTTGTGGATGCATTATGAAATGTAGGATCCTCTCAATTGCATAACTATG AATTGTTGTTGTACCAAATGGTTATTTCATTATTAAACTGACAAAAATGCCATTTTTTAGTATC AACTTATCTTTGCTTTGAATTAGCGTAGGCTCCTGATGAAGAATTTGAAGATTACCTTAGTCAA CTCATGGGAAACAATTACACTGGTGACCGAAATGAGGTAACATGGGCTTCAAGTATTAAACTTC TTGAATGTACATTACTACATTGGTTTGTGATTGCATGTGCTTATTCTAACAAAGAGCACTCTTT TTACGAGTTAACTTTTTTCTATTTCTTTCCCAGATGGCACAGTTGCCAGAAGGTATTACAGAAT TACTGCATCACAAAACGCTACCATTGCCATTGGTATGTTCTTTAGCTTGGTGCATTTGTCTGTT TTGAACTCTGAAGCCACAATTTCTTTTTTTTGGGTTTCCTAAGGACCTAGTAGGTTCTATGATA TAATTCTGACACAGCAACAGTCAAGTCCCTATAATTTTCTGCTCATAAAAATGGTACCTATTCT TAACTTGGAAGCTTATGGGGGCATGCGGGAATGTAAAGTTGGCATTGAACCAACATCTGGTAAG AAAATCAACAATATCAACAACGACAACAAAGCCTTTTAGTCCTAAGCAAGTTGGAGTAGGTTGG AGTTGAAATCTAACGGAAGCCACAAGTCAAGGTTTAGACACATGTATAGCTGTTTGTTACACTC TTTTTTTTCTCGAACACGCAGGAGATCTGTTTGTCATGCACTCTTATTCAGCGCTAAATCTTTG GGTATATTCATCATTTCAAGACTTCTTTTACTGTCTCTTTCTATGTTAATTTTGGTCTTCCTCT ACCTCTCTTTTCATTACTATTGCACTGGTGCCTCTAGAGGTCTCCGTTATACATGTACAAACCA TCTCAACGGGCGTTGGATAAGCTTTTCTTCAATTAGTGCTACCTCTAGCCTATCACACATATCA TCCTTTTAGACTCGATCCCTTCTTGTATGGCCACAAATCCAACGTAGCATAAGCATTTTCGCAA CACTTATCTGCTAAACATCACTGTTCTTAAGGCGGTACGGTGAGCAAGTAAAATGACCACCGCC TTAACGCCTAGGCATCCAGGCGCTCGGGTAATTCTAGGCGACGCCTTAAAAACACTGCTAAACA TGCCATCTTTTTTAGACCAACATGTTGCACCATACAACATAGCTAATAAGAAAATACATACAGA TATTTTGAAGTTCTCTCCATGCTTTTTAAAGCTTGTAATCAATTTTGTATTATTGCCTTATGAT ATTTTTTCTTATGCAGATCAAATGTAGAAATGTCATTGCTCTTGCTGCAACCAATATGGATGAA CTAGACACCGAGTGGGATTGTCTTCTAGGTACCCAGGAGAGTGGTCTAATGCCATCAAAACCTT TTGTGTCAAAGCATCTCAGCACTACACTTTCAGAT |