Splice junction sequence |
ATCATGAAAAATCTACCTTCAGAGGAGAAGCTTATTCAAAATGGTAATGGCAGTGCAAGTGGAG ACGATGGGAAGTTCAAGGAGATCTCAACAGCTTGAGgtggatgatatgagtgctgatcttatca tcagccaactcttgctgctggatgctgaggataaaactaaggacatcaaattgtttattaactc acctggag
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 667 Transcript exons: 17748023-17748137,17750709-17750884,17751214-17751309,17 751395-17751674 GTGGATGATATGAGTGCTGATCTTATCATCAGCCAACTCTTGCTGCTGGATGCTGAGGATAAAA CTAAGGACATCAAATTGTTTATTAACTCACCTGGAGGCTCCATAACAGCAGGAATGGGAGTTTA TGATGCCATGAAATTTTGCAAGGCTGATATATCAACTGTCTGCTTTGGACTGGCGGCTTCCATG GGTGCATTTTTGCTAGCTGCTGGGACAAAGGGGAAGAGATTTTGCATGCCTAATGCGAGAATTA TGATCCATCAACCATCAGGGGGTGCTGGTGGGAAGGTCACAGAGATGGGATTACAGATACGAGA GATGATGTATGAGAAGATAAAGATCAACAAAATACTGTCAAGAATCACCGGGAAGCCTGAAGAG CAGATTGATGAGGATACAAAGTTTGACTATTTCATGAGTCCTTGGGAAGCCAAGGATTATGGCA TAGTTGACAGCGTTATAGATGAAGGGAAGCCGGGGTTGGTTGCTCCTTTGGCAGGAGCTGTGCC ACCTCCAAAATCGCGTGTGTGGTACTTATGGAATGCTTCAGGACCAACTAGAAAAATCATGAAA AATCTACCTTCAGAGGAGAAGCTTATTCAAAATGGTAATGGCAGTGCAAGTGGAGACGATGGGA AGTTCAAGGAGATCTCAACAGCTTGAG
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Genomic sequence |
GTGGATGATATGAGTGCTGATCTTATCATCAGCCAACTCTTGCTGCTGGATGCTGAGGATAAAA CTAAGGACATCAAATTGTTTATTAACTCACCTGGAGGCTCCATAACAGCAGGTATGTGTTCTCA ACCTCTTATTGTAATAACTTGTGCCTTGTGCTCTTTGTGTTGATAGAGAGAAATTGACTAACTT CATTTTAAGTATCTTGTAACGTAAATGCCTTGCAGATTATATTTGATGAAAAGTTTTGGATCCT TTGCTGTAACACTACAAGATTTATCTAACCTTAAATGCCAATGATTTTTAAGAACCTTTACCTT TTTTGCTACTATTTCCTGATTTCTGTTAGTCAAACAGTAATGAAACTGTGCAAAGATCATTTTG CCCTGACTATCCAAATTTTGCCTTCTTTTTTATCAAGAGCCTTTACCTTATTCGCTATTATTTC CCAATTTCTGTTAGTCAAGCAGTGATGGAGCTGTGCAAAGATCATTTTGTCCTGACTATACTAT ATACCCTCTTTTTTATTTGGCCAGCCGCACATGACATTCTGTCCTACATCTTTCTTCTTCCTCT CCAATGGAGGGCATCAGTTCATCCTGTTATTGTGGTAGATGATGAGTTCCGAGTTTCTTTTTCT TTTCTTTTCTTTTCCTTTTGGGGTGGGAAGAGTTCAGTTTTATCATTGATTGGCTCAGGTATAA TGTGTCTTTGTGCCCTTAATCTAGTGGATTCTAAGGTGGCTGCAAAACAGAAAGAATAACAAGT TTACATGTGAATGAACTGATTTATGATACCAAGCTCGCTGATTAACAGGACCAAGGTTGGCTGT TTGGCCGAGTTGACTTTAAAAAGAAGATTTTCTTGCTAATTTTGAGGAAGAATACGCAGATACC ATTCCCCTTACATTGGTAATCAAATGGAATTTACAATAGTAGCAAGTAGATAGAAGGGTAAGAT TTTGATTTTTCAAAAGGCAGTGGCATATAAAGTAGTGTTGGTTTTGGCATTTTGCTGTGTCAAT TTAAGGGTCCTTGTATATAATAAACTGGCCTCTTATCTGATTGGGTTATGCGGCATTGGTGATG CATTCAGTTACAAATGTCTCTGGTCTACATATCTGCCTATGAGTTCTTTATATTACTTGGAGAA AATTGCACTTTACTCATGTTGAAGATCGCTTTGTTTCGTTTTATGCCATGTTTTGCACCAGGAT ATGTTGAAATAAATTTCACTTTGCATCACGGGGTGTTCTGAAATTCCAGCGAAACCTTGTGAAA ACACATGAGTGAAATCTTGTGAGCTCTAAATGGTGCATGTGACATACCACTCAGTGCACATAGA TTATGGGAATGAATCAAGAATTAGTTAACGAAATCAATTCAAGTTCAACTTCTCTGATAGAACT TTTAAACCACAGCCATGGTTCAGAAATCGAAAAATAACTATACTCACTTTTTTCGTTGGACAGG TCTTGTGTAATAGAAACACTAAACATGCACATGAAATGTAGAACTGATGGACTGTATTTTGATT TTTGTTTAGTTAATTTATATTTTCTGCATAATTTTGATTTCTTATTCTTTACCTGTCCTTTTAA TCTTTGGTGTGTCAAATATGCTGATGATAATCTGGCAATAACAAAATGATAAGTTTTATGCTAC ATGATAATGGCATCAACTTGATAACTATCCAAGCCAATTATATGCAATACGATGTTTTGCATAT AAGGAAATGCGTGCTCCAACATTAGGAATTTGAAAAAAGCTCCTATTTTCTCTCTAGTGAAGTC TTATGCTGCATACTTTTTGCTGATGCATTTACCAAATTCATACATACTGAAAAGGTGCTGTACA AGTTCATCAAATACAAGAAAATTAAACCTGAAGTTTAATAATCTGTTCTCTTTTTTCGTTTCAA GATTTACACATGCTTTTTGTGGAGTCTCTTTTTTATACCTAGGATCTGCATTCATAATCATTCT AAAGCGCTTTAATGTCAGCAATAGAACAACTTTAACTTTCCTGAGATTGTTCATGAGTGAACAG TGTACAGTGCCGAGCTCAACAGTAACAGTGATAAATGGTTTCAGGTTCAGCACCTTAGATTGGA TCTTATGCATGTTGTGCAATATCTCCATGAAAATCATGATTTTATATATTATATAACCTGTGTT TGATAAACCTTATGCCTTTAGGAGACACTGGGGGCTGTTCACTGTTTGTGCCACATTGCTGTAC ATGTTTAATTCTGATATGAACCCAATCTTATCAGTTCGTTATCACCAATCCATGCAAACTTGGG AATAAATTGCAGAATATCTCAAAACATCTAGAATATTTACTGAAATATGAAAGTGAATCCATCT TGTAACATAATTCCAATATAGTGGCTTAAATCTTTTACTGTCTTCCCAATCTGCTTCACTCAAG TTCACCAAAACCTAGTCAGTTCAATCAGCTCTGTTTCTTTTATATTTGACCCTTTTAAGCCCCT TACCGTTTTAGGCTCTTTGTACTTGAGTTTTTAAAGTCCAACTGCCTAAACTGAACTGGACTCA TGTTCCTGAATGTACAATTATTCTTGATAACTTTTATGCCGATCACCAGAGAAATATTTAGTTT TGTGTTAATGCTGCCATACTGGTATCGTATGATGCAATAAACATGCCCACATCAATATACAGGA ATGGGAGTTTATGATGCCATGAAATTTTGCAAGGCTGATATATCAACTGTCTGCTTTGGACTGG CGGCTTCCATGGGTGCATTTTTGCTAGCTGCTGGGACAAAGGGGAAGAGATTTTGCATGCCTAA TGCGAGAATTATGATCCATCAACCATCAGGGGGTGCTGGTGGGAAGGTAAGCTTTTTTATGTTG TTTAACTCTTTTACTAGACGAACTTGCTCGGAAATTGCCTAAGGAATCGTGGGAAACAATTGGA AGCTTTGGCTTCAACCAAACACTCCTGAAATAAAATCATAACCTCCATTTTATATGATAATATC ATATTAAGACTAAAATCATAACTATCAATATTGCTTTTTGAAAAGAATAATTCTCGGTTGGCTT AATTTCTGACCATTGTGCCCTATGGCAATATATGTGCTACCATGAAATGCAATGCTACTTTCAG AAATGGGTCATCCTTTTTTTTTCAATAGAATATGTTAATTTGTGCCATCTGGCAGGTCACAGAG ATGGGATTACAGATACGAGAGATGATGTATGAGAAGATAAAGATCAACAAAATACTGTCAAGAA TCACCGGGAAGCCTGAAGAGCAGGTACTCCTTGACAACTTGTTACTGATGTATTGCTTTAGCAC AAAAGTTTGCTGTTCTCTGATCTACTGCATGCTGTTTATTTTAGATTGATGAGGATACAAAGTT TGACTATTTCATGAGTCCTTGGGAAGCCAAGGATTATGGCATAGTTGACAGCGTTATAGATGAA GGGAAGCCGGGGTTGGTTGCTCCTTTGGCAGGAGCTGTGCCACCTCCAAAATCGCGTGTGTGGT ACTTATGGAATGCTTCAGGACCAACTAGAAAAATCATGAAAAATCTACCTTCAGAGGAGAAGCT TATTCAAAATGGTAATGGCAGTGCAAGTGGAGACGATGGGAAGTTCAAGGAGATCTCAACAGCT TGAG |