Splice junction sequence |
ATCCGGTAACAGGAACTTTGAGGGGCGTGTTCATCCACTAACAAGAGCCAATTACCTTGCATCT CCTCCGTTGGTGGTTGCCTATGCTCTTGCTGGCACGggttttgctatacctaaagaggcacaag aaaaagtggtaaatttttcgttcgatggacaaccagcagagcttaaacatggaagtgtggtgat tgctgcaa
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 495 Transcript exons: 2144143-2144328,2144411-2144478,2144571-2144689,2144802- 2144923 GGTTTTGCTATACCTAAAGAGGCACAAGAAAAAGTGGTAAATTTTTCGTTCGATGGACAACCAG CAGAGCTTAAACATGGAAGTGTGGTGATTGCTGCAATCACAAGCTGTACTAATACATCAAATCC CAGCGTCATGCTTGGTGCTGGTCTTGTTGCAAAGAAGGCTTGTGACCTTGGGCTACAGGTTAAG CCTTGGATAAAGACAAGTCTTGCTCCAGGCTCAGGAGTTGTTACAAAATACTTATTAAAGAGTG GATTGCAAGAATATCTGAATGAACAGGGTTTCAATATTGTCGGCTACGGGTGCACTACATGCAT CGGGAATTCTGGGGAAATTAATGAATCAGTGGGAGCTGCTATTACCGAAAATGACATTGTGGCG GCTGCTGTGCTATCCGGTAACAGGAACTTTGAGGGGCGTGTTCATCCACTAACAAGAGCCAATT ACCTTGCATCTCCTCCGTTGGTGGTTGCCTATGCTCTTGCTGGCACG
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Genomic sequence |
GGTTTTGCTATACCTAAAGAGGCACAAGAAAAAGTGGTAAATTTTTCGTTCGATGGACAACCAG CAGAGCTTAAACATGGAAGTGTGGTGATTGCTGCAATCACAAGCTGTACTAATACATCAAATCC CAGCGTCATGCTTGGTGCTGGTCTTGTTGCAAAGAAGGCTTGTGACCTTGGGCTACAGGTTGGT TTCACGAGAGCAAACTAGAAATCTATCTGATGCCTCGACATTTTCTGATCCCTTTTTCAAAAAC TTGCCTCTGTAGGTTAAGCCTTGGATAAAGACAAGTCTTGCTCCAGGCTCAGGAGTTGTTACAA AATACTTATTAAAGAGGTATGTCGTATTTTTATCTAGTTCTTCGTTGTTAAAGGCTAATTCTTT CTTATGTGATGGTAAATTTAAGTGTAACATCTTACTCCATGCAGTGGATTGCAAGAATATCTGA ATGAACAGGGTTTCAATATTGTCGGCTACGGGTGCACTACATGCATCGGGAATTCTGGGGAAAT TAATGAATCAGTGGGAGCTGCTATTACCGAAAATGGTATTATTGAGATTCCCAACTAAACTTAC TTTGGACTTTCCATCCTTTATATTACTATTATATATAAGTAAGTAGCTGATTTGTTTTCAATAT TTGTGTTGCTTGGTTTTAGACATTGTGGCGGCTGCTGTGCTATCCGGTAACAGGAACTTTGAGG GGCGTGTTCATCCACTAACAAGAGCCAATTACCTTGCATCTCCTCCGTTGGTGGTTGCCTATGC TCTTGCTGGCACG |