Splice junction sequence |
GCGAGTGATGAAGGTAGGATGGAAGCGCCAAGCTGCTGTGAACAACTGAGGGAAAATTCAGGTG TAATTTCCTCTCTAGTCTCTAGAATTACAAGGCAAGatgggctcggagaggtgatgtttgggaa gcagaggacttgatgaagcagatgaaagaagatggtgtccctcctaacatccatacttatacct cctatata
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Assembled circRNA sequence |
Yes
The sequence of a circRNA based on assembly using circseq-cup (Ye et al., 2016) or CIRI-full (Zheng and Zhao, 2018) or CIRCexplorer2 (Zhang et al., 2016).
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Full-length trsnacripts |
Transcript length: 284 Transcript exons: 34965141-34965270,34969693-34969846 ATGGGCTCGGAGAGGTGATGTTTGGGAAGCAGAGGACTTGATGAAGCAGATGAAAGAAGATGGT GTCCCTCCTAACATCCATACTTATACCTCCTATATAAATGCATGCTGCAAGGCAGGAGACATGC AGCTATAAAATGATGTTCCGATTGCTGTTAATTACCTGGAAACTGTACTGTACTGGGCGAGTGA TGAAGGTAGGATGGAAGCGCCAAGCTGCTGTGAACAACTGAGGGAAAATTCAGGTGTAATTTCC TCTCTAGTCTCTAGAATTACAAGGCAAG
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Genomic sequence |
ATGGGCTCGGAGAGGTGATGTTTGGGAAGCAGAGGACTTGATGAAGCAGATGAAAGAAGATGGT GTCCCTCCTAACATCCATACTTATACCTCCTATATAAATGCATGCTGCAAGGCAGGAGACATGC AGGTACGAGAATTTTGCATTGGAATACTTAGTTTCTTACTTATTGTGAGTTGTAACCGTGTAGT GGAGATAGCCTGATTTTGATAGGATATGTGCACATGTTTTAAGGTAGCTGACCAAAATATTTTA CAATGCCATGACTATATGCCCGAATTATTTCAGCACTACAGATTTACCTAGGTGGCTACATATT CAAATTTGGCACTTGTGAATGGAGAAGTATTCTCTTGGGGCCTTCTTGTAATCTATCCAATTAT TTTTTTTTATAAAATGATTTGTTTGTAGAGAGCAGAAAAGGTGATTGAAGAAATGGTAGATGTT GGACTAAAACCTAATGTCAAGACATATACTACCTTGATTAAAGGTTGGGCAAGAGTGTCACTTC CAGACAGGGCATTGAAATGCTTTGAGGAGATGAAACTTGCTGGGTTGAAACCTGATGAGGCTTC TTATCATTGCTTGGTGACTTCACTTCTGTCAAGGGCAACTGTAATGGAGGGAAGTACCTACACA GGAATCATTAGTGTCTGTAGAGAAATGTCTGAGAATGATTTGACTGTTGATCTTCGCACTGCTG TTCACTGGTCTAGATGGCTTCACAAGATTGAGAGGACTGGAGGGGCACTAACAGAAGCGCTTCA GAGAATATTTCCTCCTGATTGGAATTCATTAGAATTTTTAGGAGAGCCATCCAGTTCTATAAGC ATGGGGGAGTCTGATGATTACAGTGATTCAGATTTTAGCGGTGATGAAGATGAGGATCATAATA TTGATGATAGCTGAAAAACTCTAGATTCCAGAGCCTGTTTTTCTTGTTCTGTGCCCTCACTTTT TGTCCTTTGGTTCTGCCAGAGTGGATGACCGAACAAGGTATTATGTGTTGAACTGTTAATATGT GTTTAATATGCCATTTCCTTTTGGTGATGTTTCTAAAAAGCACACATAATAATTCTTGAAAAGG AGTCTGCCAACAATCATTTGTCATTACTCATTGCCACTTTTTGGAGTTCCTGGAAATTGCATTG AACTAACACTCTTTGTTTCCATGGCAGCAATGTCTTTGATCAAACTGTGCCCTCACATTCAGAC ACCAGTGGCTTGTGGACTATCCAAGAGCGTTTGGAATCTTATAGTGCAATAAGCGTGAGCTGGC TGGCCTCTGCTGCGTTTCTTCAAGAGCAACAGTCAGTAACAGTTCTACTGGGACTGAAGACACA GGCTGTCAATGCAACAGACGAAGCTTACTCAGTTATGCGTGTAGCTGTACATATCAATGGCTGG CACAGGTAAATATTCTTGAGATATTGACAGATTCAATTGTTGTTTCTCTCCATCCTTTCAGTAT AGTCCAACTTGATATAAAATCCAATTCCATATATATGTGTATAAATGCAAGTAAAGCTATACCA CGTTACCAGTTACCACCCACACCCCTTCTTGGCTTGCCTTTTGTAGTGTGCCATGTGAAATGTA CCGACCATGATAGAGCCTGCGTGCCCATTTTTCAACATCCAAATGTTAGGAGTGGTAGGAGCGC TTATAGGCATATGCTTGAACACCACTTTGATTGGCAGAATTTTGTAGGGGCAGCACAGTGTGCC TACAAGGTTTGGTTTTGTAACCACATCCCTGGACAAGCCGTTCGATGCTTATTTGAATACTAGT ACGACAAACCAATCTGTGTCGTGGTGCTCGTAAAAGCTGAGATCATTTAAACTTGTAAGTAGAA AGTTGGACGAGCTTTTTTCTCTTCGAGAGAATGCACAGGCCCTCATGTTCTTTGTTTTGATGAT CTTAAAAAAACCATAGTCAAGGTAAATAGGAGCAAAGATTGGTATCTTGCACATTATTGCGGGT TGGGCTTATTCAATGGGGGAATTCCCTATTGAAACTGAAGTACAAGTCCAATCAAGTGCTAGAT GATGACTGTTTTCTCATTTAAGGTTTGGCATCTTCCAGTACAGCAGCTTCAATCAAATGGGCCT TAACGTAGCTCAGCCCGATTCAATATTACTTGGAATTGCACGCCTCTGTCCAAGCTGAAAGCTT TTACTAGTAGGACACTTGAATGCCTGCACAAGACGGCATTAATGCTGTGCTTATGAGCCCGATT TCTTGAGACTGGTGTTGAGTTTGTGCGTATGTGTGTGCTATGAGCTGCGAATCTTAGCTGGCCG GTATCTTTCATTGAATCGAAAGTGGCCTCCCCATTCAAGTCTTGCCCACAAGATAAAACAGTGC TTCATTTATGCCTGTTATTTAATTTTGCTTAGCTGCATCTCGCTTCTCCATTCATACACCATAA ATTCTTTCAAAGAAATCTTGATTGTATTAGTGTTGTATTAGGCCTTTGTTCGGAGAGAAAATTT CATAGTACCAATTACCCCCTCCATCCCAAAATATAATAACTTCTATCACTAAGAGTTTGTTCCA AAATAAAATAACTTATCCACCAACATTCTCTTCCTAACTAATCATAACCCTGCACCATTTAATT TTTCCATCTACCTCCACTTCTCAACCAATCACAATATCATCATATTTAATTCTATCTACTTTCT TAATAATTGTGTTTAATCCTAAAATTTCTTATGTTCTGGGACGGAGATAGTAGCATGTATGAAC AGTATGAAGTACTACAATGTAAATATTTTGCCTGAAACATGCTTTGTTTTTTTTCATGCCAAAT AATTCAGTGTGATATTTGGTAATTCATACAGTATTCCTTCCTTTTATACCCACTCTAGTTTCAA ATACTTGTCACTAGTTACTACTTACTACTAGCTTTTTTCCCTAAAAAAGTTACTAGCTTTTTAG CTTTGATCACTCGCCCTTTTTGCAAAAATGAAACATATGTATACTTAAAATATGTTGCATTAGC GATGTGTGTTCCATAAATACAACCAGACAACTTTCACTAATAATAACTTAATCTTTAAAAGTTA TTAATGGTTAAAGGTGAAACATTATGGTTAACATTGACAAGTAAATAAAGATGGAAGGAATACA TATTTTCTAAAGATAGGTACGGTCCTACAGGCTTTGTCCAGCAAAAAAAAAAGGACAGTTCTGC AGAACAAAAATATTTTGGTGGAGTTTTTAAACATTGCATCCAACAGAAGCCTTATGGTATATTT TTTTTCTATGATAAGAGAATTTATTCTGGTTTTTTACTTAAAAGAAGCTGCAACCAATTATTAT AGAATTTGCAGAATGAATAGCTGCGGATTACAAAATTATGAAACACAAAGTAGAAAACTACTAA GAATACCACCCTTAAAACAAAGATCTACATCTATGGTTAGTCAGAGGGGAGTAGATTCTAATCC CTCGAGGGGATATCCCTTCGTATATCTTTTTCTTCCAAATTCGATGCAAATAGTTGTGAAAAAT TCTGAAAAAAATTGACAACGTAGAGTATAATGATACCTACTAGTCCACCAAAATTCATGTTCAA ATTCGATCTACACATCGAGAAACAAAAAAGACAAATTTAGATATAAACAGTACGTTACTATTCA TACGCTGAATTTGTCTTTTTTATATCTCGACGTGGGAGTTGAGTTTGGACTTAAGATTTTGTGA AGTTGTATATATGTGTTGTATGAATGTTGTCAAATTTTTCCAGAATTTTTCATAACCGTTTAGA TGGTTTTTGAGCAAACGAGCGAACATCCCCTCGAGGGATTAGAATAGTTTCCCTTAGTCAGAGT ATGTTTAACGTTGTTTGCTCCAATGGTTATAAGTTGTACAGTCTCTGAAACCAGCAGCCGATCT TTGTCGATCGAATTTCGATCCCATCACTGCCGATGAACTGACATTGAACCAAAACGGAAGAAGC CTTATGGTATGGGTGGAGAATGAAAATAGGAAAGAGACAGGAAACATCTTTATTCCTAAACTAG TACTCCCTCCGTCCCATAATATAAGGGATTTTAGAGGTATGTGATGTTTCCTCGGACTACGAAT CTAGATCACATCCCTCTAAAATCCCTTATATTATGGGATGGAGAGAGTAACAATTAATAGGAAA TGACACAACAGGATAGCAGAAACTGAAAACTTCCTTTCATTTTCTGGGGAAAAAAGGGGAAATT TGACGTTTGGAGCTCATCTGTAGTGGAGATTTAACTGTTCCAAAAGTTTAGAATAGTGGCAGCT ATGTTGATACAGCACTATGTTATCTTTTCTCAGCAGACGTGCTGGTAAAAAAAATTTAGTGCGA AGGGACCATTGCTAGTTGGCCCTTACTTTTATATTACTGTAACTGATCCAGAATTAAATTTCTA CCTATTTTCTTTGAAAGAGCACGAAAGCACATATCAATAATTTTGGTAATATTATTCATTTATC ATAATCTATTTTGCTATACGCTCCGACCACTGCACAATGACAGTATTTATTTCGCAGAGAGGCC AACAGGAGCTATAAAATGATGTTCCGATTGCTGTTAATTACCTGGAAACTGTACTGTACTGGGC GAGTGATGAAGGTAGGATGGAAGCGCCAAGCTGCTGTGAACAACTGAGGGAAAATTCAGGTGTA ATTTCCTCTCTAGTCTCTAGAATTACAAGGCAAG |